Seminário de Informação em Biodiversidade no âmbito do MMA ... · Drupal (drupal.org) •...

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Sistema de Informações do Centro Nacional de Conservação da Flora:

Uma visão conceitual

Brasília - 14 e 15 de Outubro de 2009

Eduardo DalcinInstituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro

Diretoria de Pesquisas

Seminário de Informação em Biodiversidade no âmbito do MMA e instituições vinculadas

CNCFlora• OBJETIVOS GERAIS

– Coordenar a Lista de Espécies da Flora do Brasil– Coordenar a Lista Oficial de Espécies da Flora Ameaçadas de Extinção– Elaborar Programa de Pesquisas e Conservação em Ecossistemas de Montanhas do

Brasil– Contribuir para o alcance das metas nacionais da GSPC/CDB

• OBJETIVOS ESPECÍFICOS– Estabelecer um sistema integrado de bases de dados sobre biodiversidade de

plantas;– Estabelecer e coordenar uma base de dados de espécies da flora do Brasil;– Estabelecer e coordenar uma base de dados de conservação para espécies

ameaçadas de extinção;– Desenvolver uma estratégia nacional para conservação de espécies da flora

ameaçadas de extinção com base nas metas estabelecidas pelo GSPC/CDB;– Realizar inventários em áreas prioritárias para conservação– Propor um Programa Nacional de Pesquisas e Conservação em Ecossistemas de

Montanhas– Estabelecer parcerias e alianças com pesquisadores e instituições nacionais e

internacionais através de um esforço coordenado para a conservação de plantas

Estratégia

• Manejo do conhecimento: Organizar, refinar, sintetizar, disseminar e manejar dados, informações e conhecimentos em conservação para suportar os objetivos do CNCFlora, desenvolvendo ferramentas que permitam de forma rápida e simples, o acesso aos dados e informações sobre conservação.

“Projeto Banco de Dados de Conservação”

• “Estabelecer uma base de dados para conservação, através de um sistema de informação voltado para a conservação das espécies ameaçadas de extinção, apoiando a implementação da infra-estrutura em tecnologia da informação e na gestão da informação no âmbito do Instituto de Pesquisas JBRJ. A base de dados de conservação utilizará vários campos de informações necessárias a conservação, incluindo aquelas de outras áreas do conhecimento, e de ferramentas tecnológicas adequadas (bases cartográficas e biogeográficas digitais, data mining, data cleanner, entre outras); contribuir para a atuação do Centro dentro de um ambiente colaborativo e integrado com as iniciativas institucionais, nacionais e internacionais.”

Cenário atual e oportunidades

• Realização da Lista do Brasil– Coordenação do CNCFlora– Sistema colaborativo on-line desenvolvido pelo CRIA

• Convênio com CRIA• speciesLink

– 2.415.765 registros para plantas e fungos macroscópicos– 1.046.584 geo-referenciados

• JABOT– Ca. 440.000 registros

• TIC na Instituição– Infra-estrutura– Capacidade

Ficha de espécie

Dados complementares

Gerenciamento de colaboradores

Espécies(Lista do Brasil)

Espécies Ameaçadas

(Lista Oficial)

Indivíduos(testemunho)

ColeçõesPopulações

(obs. campo)

Locais(Biomas, Estados,

Ucs, etc)

Geoespacial

Ações de Conservação

Ameaças

Referências Bibliográficas

Metadados Geoespaciais(ISO 19115)

Catálogo de Metadados(Dublin Core)

Modelo Conceitual

Padrão de Metadados

Drupal(drupal.org)

• Sistema Gerenciador de Conteúdo (CMS)– Um software que auxilia a criação, manutenção e

administração de páginas publicadas na Internet– Dispensa programação

• “Content Framework System”• Requerimentos

– PHP– Apache– MySQL / PostgreSQL

• Open Source (GPL v2)• Em processo de homologação pela instituição

Drupal(drupal.org)

• Funcionalidades básicas de CMS incluídas– Notícias– Fórum– Páginas

• Customizável e Flexível– Módulos (mais de 6.000)– Sólida arquitetura e API (“hooks”)– Boa documentação

• Performance• Comunidade numerosa e ativa• Taxonomia (módulo incluído no “core”)

– Ferramenta de classificação de conteúdo poderosa– Permite a criação de vocabulários hierárquicos com definições

• Permite integrar a ferramenta do Portal com o Catálogo de Metadados (e outros módulos)

Catálogo de Metadados

Cadastra recursos de informação que podem ser posteriormente recuperados com base na definição de um escopo ou domínio

Definição do escopo espacial

Portal do CNCFlora

• Proposta inicial• Incorporação de atributos de metadados às referências• Editoração do conteúdo pelo setor de comunicação institucional• Avaliação de funcionalidades

Elemento de articulação entre os produtores de informação (“kowledge workers”), consumidores e informações sobre espécies ameaçadas da flora brasileira

2009

• Avaliação do Drupal como ferramenta de desenvolvimento do Portal e Catálogo de Metadados• Definição da estrutura, forma, funcionalidades, conteúdo e gestão do Portal CNCFlora• Finalização da Lista do Brasil• Contratação consultoria para elaboração das especificações do Sistema CNCFlora (documentação

formal)

1º Semestre 2010

• Workshop com “stakeholders”• Carga inicial no catálogo de metadados• Inauguração do Portal CNCFlora• Implementação do módulo pesquisa e relatórios na Lista do Brasil• Implementação do módulo CNCFlora na Lista do Brasil• Publicação da lista de espécies da flora do Brasil – disponível para classificação quanto ao status de

conservação

2º Semestre 2010

• Revisão on-line da lista de espécies do Brasil quanto ao status de conservação• Publicação da lista oficial de espécies ameaçadas revisada• Desenvolvimento dos módulos adicionais previstos nas especificações

Próximos Passos

Perspectivas

UDDI (originado do acrônimo inglês Universal Description, Discovery and Integration) é um protocolo aprovado como padrão pela OASIS e especifica um método para publicar e descobrir diretórios de serviços em uma arquitetura orientada a serviços (SOA).

Um serviço de registro UDDI é um Web Service que gerencia informação sobre provedores, implementações e serviços de metadados. Provedores de serviços podem utilizar UDDI para publicar os serviços que eles oferecem. Usuários de serviços podem usar UDDI para descobrir serviços que lhes interessem e obter os metadadosnecessários para utilizar esses serviços.

Life Science Identifiers (LSIDs) são identificadores únicos de recursos de informação baseados em nomes de entidades biológicas, permanentes e independentes de localização, que incluem nomes, conceitos, ocorrências, genes, ou proteinas, ou mesmo objetos que contem informações sobre estas entidades.

De forma simples, LSIDs são uma forma padronizada de se identificar e encontrar pedaços de informação biológica na Internet.

Obrigado!

Eduardo DalcinInstituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro

Diretoria de Pesquisasedalcin@jbrj.gov.br