DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS...
-
Upload
marcio-marques-martins -
Category
Education
-
view
220 -
download
13
description
Transcript of DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS...
![Page 1: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/1.jpg)
DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH
+TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE
MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE
Prof. Dr. Márcio Marques Martins digimarcio
http://digichem.orghttp://slideshare.netmarsjomm
![Page 2: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/2.jpg)
Onde encontrar o software?
O ChemSketch pode ser baixado de forma gratuita no endereço http://goo.
gl/XX9Q8j.
É necessário fazer um cadastro.
![Page 3: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/3.jpg)
Janela principal
![Page 4: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/4.jpg)
Barra de desenho
SELECIONAR/MOVER
![Page 5: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/5.jpg)
Barra de desenho
SELECIONAR/MOVER/REDIMENSIONAR
![Page 6: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/6.jpg)
Barra de desenho
ROTAÇÃO 3D
![Page 7: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/7.jpg)
Barra de desenho
lAÇO ON/OFF
![Page 8: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/8.jpg)
Alternando entre modos de desenho
DEsENHAR NORMAL - PRODUZ MOLÉCULAS
COM BAIXA PRECISÃOESTRUTURAL
![Page 9: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/9.jpg)
DEsENHAR CONTÍNUO - SIMILAR AO MODO NORMAL
Alternando entre modos de desenho
![Page 10: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/10.jpg)
DEsENHAR CADEIAS - cLIQUE E ARRASTE O MOUSE E UMA CADEIA CARBÔNICA SURGIRÁ COM O
TAMANHO QUE VOCÊ QUISER.
Alternando entre modos de desenho
![Page 11: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/11.jpg)
LIGAÇÕES ESTEREOQUÍMICAS
Tipos de ligações químicas
![Page 12: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/12.jpg)
vÁRIOS TIPOS DE LIGAÇÕES COORDENADAS
Tipos de ligações químicas
![Page 13: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/13.jpg)
LIGAÇÕES ESTÉREO INDEFINIDAS
Tipos de ligações químicas
![Page 14: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/14.jpg)
LIGAÇÕES DESLOCALIZADAS
Tipos de ligações químicas
![Page 15: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/15.jpg)
LIGAÇÕES DE MARKUSHLIGANTES EM POSIÇÕES INDEFINIDAS
Tipos de ligações químicas
![Page 16: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/16.jpg)
1º exemplo: desenho modo normal
![Page 27: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/27.jpg)
Utilizando templates
![Page 29: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/29.jpg)
Exercitando técnicas de pesquisa online com o auxílio do ChemSketch
Vamos apresentar algumas moléculas encontradas na internet e vocês terão que desenhá-las.
Com o desenho pronto, vamos salvar e pesquisar dados físico-químicos online.
![Page 30: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/30.jpg)
Molécula misteriosa 1
Que molécula é essa?
![Page 31: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/31.jpg)
Dica
Desenhe a molécula no ChemSketch e salve-a em formato .MOL
Se você quiser facilitar as coisas, o link abaixo contém a estrutura já desenhada.
http://goo.gl/4Twcw6 (formato mol)http://goo.gl/nxapqo (formato ChemSketch)
![Page 32: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/32.jpg)
Molécula misteriosa 1
![Page 33: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/33.jpg)
Molécula misteriosa 2
Que molécula é essa?
![Page 34: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/34.jpg)
Molécula misteriosa 3
Que molécula é essa?
![Page 35: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/35.jpg)
Molécula misteriosa 4
Que molécula é essa?
![Page 36: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/36.jpg)
RESPONDA
1) Qual das moléculas misteriosas é a preferida do Bob Marley?
2) Qual das moléculas misteriosas é chamada “droga do amor”?
3) Qual é a molécula da visão?
4) Qual é a molécula preferida de reis e imperadores?
![Page 37: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/37.jpg)
Como fazer para descobrir o nome?
http://digichem.org/2011/10/24/dica-de-site-chemspider/
![Page 38: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/38.jpg)
Como fazer para descobrir o nome?
![Page 39: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/39.jpg)
Usando a estrutura montada com ajuda do ChemSketch
![Page 40: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/40.jpg)
Buscando estruturas semelhantes
![Page 41: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/41.jpg)
Mistério 1 resolvido: ocitocina
É possível salvar a estrutura em 3D.
![Page 42: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/42.jpg)
Dados físico-químicos
Podem ser obtidos com mais detalhes nos seguintes sites:
1) http://chemicalize.org2) http://webbook.nist.gov
Saiba mais sobre o Chemicalize neste link:http://digichem.org/2012/03/12/dica-de-site-chemicalizeorg/
![Page 43: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/43.jpg)
Dados físico-químicos
No google, basta digitar o nome da molécula seguida de MSDS ou FISPQ.
MSDS: material safety data sheet
FISPQ: ficha de segurança de produtos químicos
![Page 44: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/44.jpg)
Dados biológicos de moléculas
Se você quer encontrar artigos sobre estudos químicos e bioquímicos das moléculas em questão, entre no site PubChem.http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
![Page 45: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/45.jpg)
Dados biológicos de moléculas
No exemplo, procurei por informações sobre o 11-cis-retinal.
![Page 46: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/46.jpg)
Dados biológicos de moléculas
Clicando em summary, descobre-se a ficha completa da molécula.
É possível obter um arquivo com a estrutura 3D da molécula.
![Page 47: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/47.jpg)
Dados biológicos de moléculas
O formato é SDF, e pode ser aberto com o software Avogadro.
![Page 48: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/48.jpg)
Dados biológicos de moléculas
Clicando no botão BioActivity summary, uma nova página com os dados biológicos surge.
![Page 49: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/49.jpg)
Dados biológicos de moléculas
Clicando no botão BioActivity summary, uma nova página com os dados biológicos surge.
![Page 50: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/50.jpg)
Respostas para os desafios
1) Ocitocina, também conhecida como droga do amor.
2) Púrpura de Tyrian, usada para tingir de púrpura as vestes de reis.
3) Tetrahidrocanabinol (THC), componente principal da maconha.
4) 11-cis-retinal, molécula envolvida na visão
![Page 51: DESENHO DE ESTRUTURAS QUÍMICAS COM O CHEMSKETCH + TÉCNICAS DE PESQUISA DE DADOS FÍSICO-QUÍMICOS DE MOLÉCULAS COM O AUXÍLIO DE BASES DE DADOS ONLINE](https://reader031.fdocumentos.com/reader031/viewer/2022013105/55659417d8b42a093a8b4b2d/html5/thumbnails/51.jpg)
E isso encerra nossa oficina...
http://www.myfunstudio.com/designs/pt/