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8 Novembro 2019
Gestão e acessibilidade de dados de coleções de história natural do Museu Nacional de História Natural e da Ciência
Luis Filipe Lopes
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CientíficoEstudos de biodiversidade, biogeografia, sistemática, evolução e genéticapopulacional.
Estudo de alterações ambientais, como impacto causados pelo Homem, alterações climáticas, degradação de habitat, poluição, etc.
Exposição/Educação
Cultura/ arte
Colecções História Natural
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Colecção de insectos
Cerca de 40K registos / 70k espécimes
Colecções privadas recentemente doadas ao museu:- Colecção Família Mendoça (>14K espécimes)- Colecção António Bívar de Sousa (>20K espécimes)- Colecção Passos de Carvalho (> 10K espécimes)- Outras doações
Amostras com milhares de espécimes a ser triadose preparados
Colecção IICT (> 70k espécimes)
> 200k espécimes
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Gestão de dados
Digitalização de dados
Validação de dadosInformação mínima para validar registos
Detecção de errosRegistos duplicados/triplicados, registos em falta, heterogeneidade de termos usados etc…
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Darwin Core (DwC)Modelo de metadados amplamente usado (Ex.: GBIF)http://rs.tdwg.org/dwc/terms/
Definição de regras e standards de forma melhorar a homogeneização e interoperabilidade dos dados
Expandido por campos não presentes no Darwin Core
Modelo de metadados DwC
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Melhoramento dos registos já digitalizados
Enriquecimento da informação:TaxonómicaGeorreferenciação dos dadosInclusão de informação mais detalhada sobre espécimes (campos de controlo e estatística, publicações e imagens associadas, medidas de conservação, etc.)
Melhoramento da qualidade de dados
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Dados taxonómicos
12847
5195
2744
12847
614
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
35000
40000
Order Family Genus Species Subspecies
2019
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Georreferenciação
8000 registos georreferenciados em 2014
12000 em 2016
18700 em 2018
28028 em Novembro de 2019 – teste de métodos de georreferenciação automática (Leonor Venceslau)
Dados de incerteza e autor da georreferenciação
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Digitalização de dados do catálogo em papel (fichas, livros de registo e etiquetas de espécimes)
Digitalização dos espécimes (fotografia, 3D, vídeo, etc.)
Digitalização da colecção
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Ciência cidadã - digitalização de dados
Contribuição voluntária da comunidade para a transcrição de dados das etiquetas de espécimes e determinação taxonómica.
Projecto desenvolvido na plataforma Zooniverse
Espécimes de traças (Lepidoptera, Sphingidae) da colecção Passos de Carvalho – informação unicamente nas etiquetas
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Acessibilidade dos dados de colecções HN
Disponibilização de dados à comunidade:
- Científica – bases de dados internacionais (GBIF)
- Repositório Institucional MUHNAC Digital (gestão de recursos digitais – museu, público geral)
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Definição de campos de metadados específicos – uso DwC sempre que possível
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Discussão
Acessibilidade dos dados (publicação online em acesso aberto) GBIF e MUHNAC DIGITAL
Divulgação e promoção do uso das colecções
Gestão da informação e conhecimento produzido na instituição
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Obrigado!
Luis Filipe Lopes
Global Health and Tropical Medicine (GHTM). Instituto de Higiene e Medicina Tropical, IHMT, Universidade Nova de Lisboa, UNL, Rua da Junqueira 100, 1349-008 Lisboa, Portugal.Centre for Ecology, Evolution and Environmental Changes (cE3c). Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.
Campo Grande 1749-016 Lisboa, Portugal.
FINANCIAMENTO
FCT for funds to GHTM – UID/Multi/04413/2013
FCT for funds to CE3C - UID/BIA/00329/2013
NanoCell2SEC PTDC/CTM-REF/30529/2017