Introdução aos Scratchpads:Aproveitando melhor seus dados

Laurence LivermoreNatural History Museum, London

l.livermore@nhm.ac.uk

BrazilNovember, 2012

O que é Scratchpads?

• Sítios prontos para dados de

biodiversidade, com apoio institucional

• Plataforma virtual para pesquisa e

publicação

• Acesso livre, fonte livre

• Modular e flexível

O que Scratchpads não é!

• Um banco de dados unitário de biodiversidade

• Restringido por tema, geografia ou táxon

• Uma ferramenta excluisiva aos taxonomistas

De onde vêm os recursos financeiros?

2007 2011 2014

ViBRANTVirtual Biodiversity Research

&

Exemplos de utilização:

Taxa(Classificações, pérfis de táxons, espécimes, literatura, imagens, mapas, conjuntos

de dados do fenótipo, genótipo, de morfometria, chaves, filogenias)

ProjetosConservação Regiões Sociedades

Quem usa Scratchpads?

• No. total de sítios: 400+

• No. total de usuários: 7,000+

• Usários ativos: 5,500+ (273 w / 759

m)

• Contéudo : 430,000+ (nodos)

Site

s Use

rs

ViBRANT SP 2

• Pesquisadores profissionais

• Naturalistas amadores

• Cientistas cidadão

• Indivídos, grupos e sociedades

eMonocot Scratchpads

• 15 sítios e crescendo

• 40+ usuários internacionais

• Scratchpads / eMonocot Portal

online!

Listagem dos sítios: http://about.e-monocot.org/list-emonocot-scratchpads

Por que Scratchpads?

A Ciência é global

• Precisa de padronização global

• Workflows globais

• Cooperação de institutos e

organizações de grande porte

Por que Scratchpads?

Ciência é realizada “locally”

• Por cientistas do local

• Em colaboração com infraestruturas locais

• Com apoio financeiro do local

Por que Scratchpads?

Isso resulta em :

• Uma paisagem complexa, fragmentada e de navegação

difícil

• Fontes dispersas de dados

• Dificuldades em coletar informações para pesquisa

Porque precisa mudar?

Problemas com dados publicados pela maneira tradicional:

• Maioria de descrições sob controle de reprodução (~1923)

• Acesso Livre limitado

• Ausência de mecanismo para atualização e correção

• Ausência (quase) de integração de dados (exceto citações)

• Ausência de mecanismos para engajar a comunidade

Porque precisa mudar?

Resultado:

• Grandes quantidades de “conhecimento” taxonômico não

publicado

• Conhecimento não publicado não pode ser mobilisado para

fins úteis

• Impact científico baixo (mas longa meia-vida)

O Conceito Scratchpad

Um Scratchpad é sítio que abriga dados para voce e sua comunidade

Seus dados Dados externos e serviços

O que pode fazer Scratchpads?

• Páginas de taxon (geradas a partir de conteúdo etiquetado)

• Mapas de distribuição (a partir de espécimes e regiões

TDWG - Brummitt, 2001)

• Registros de espécimes

• Matrizes de caracteres

Example Taxon Page

Example regional distribution

O que pode fazer Scratchpads?

• Gerência de bibliografia

• Imagens, video e som (importação em massa)

• Importação de planilhas Excel

Example Literature

O que pode fazer Scratchpads?

• Editação de dados em tabela

• Conteúdo específico ao

pedido de usuário

• Gerenciamento dos usuários

• Formulários (planilhas)

específico ao pedido de

usuário

• Medidas analíticas do uso do

sítio.

Medidas analíticas

O que pode fazer Scratchpads?

• Exportação de Darwin Core

Archive (links a eMonocot Portal e

EOL)

• Importação de dados de EOL

(taxonomia, informação sobre

espécies)

• Integração de mapas da

GBIF

Importação e exportação de dados de Scratchpads

Quais novas funções vêm logo?

• Chaves baseadas em matrizes (usando projeto de

caracteres)

• Ferramenta para publicação- submeter manuscritos pelo seu site

para Phytokeys ou Biodiversity Data Journal (NOVO)

• Checklists, apoio para linguagens múltiplas, outros!

Amostras do protótipo: ferramenta de publicação

ID Keypreview

Multi-figure plates Plate layout

ID Keybuilder

Manuscript preview

Apoio

• In-site Support- One click help within your site

• Wiki- Training manuals, videos & glossary

• Training Courses (12 in 2012)- UK (6), Sweden, (2) Greece (1),

Bulgaria (1), South Africa (1), Brazil (1)

• Ambassadors Programme- Enthusiastic experienced users- Local support

• Embedded Issues Queue- Bug reports- Feature requests

• Sandbox Site- http://sandbox.scratchpad.eu

http://scratchpad.eu/help

• Scratchpad technical development- Simon Rycroft, Ben Scott, Ed Baker, Alice Heaton & Katherine Boulton

• Scratchpad outreach- Irina Brake & Dimitris Koureas

• E-Monocot - Paul Wilkin & the Kew team, Charles Godfray & the Oxford team

• ViBRANT- Vince Smith, Dave Roberts & Lucy Reeve

• Our 7,000+ users

Agradecimentos