Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência ...

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1 Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência Filogenética 1. Introdução 2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição 3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas 4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

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Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Objetivo: Compreender que a sistemática biológica é uma ciência histórica, comparativa e inferencial.

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3Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

Systematics is the branch of evolutionarybiology that aims to recover thegenealogical relationships underlyingorganic diversity.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo objetivo é recuperar as relações genealógicas subjacentes à diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

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4Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia

evolutiva cujo objetivo é recuperar as

relações genealógicas subjacentes à

diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

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5Arhat Abzhanov

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61. Sistemática biológica

Introdução

TempoEspaço

Diversidade

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EspaEspaççooTem

po

Tem

po

Descendência com modificação

1. Sistemática biológica

Introdução

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EspaEspaççoo

Tem

po

Tem

po

Descendência com modificação

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo

objetivo é recuperar as relações genealógicas

subjacentes à diversidade orgânica

1. Sistemática biológica

Introdução

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C. crassirostris

C. pallidaG. fortis

C. parvulus

G. magnirostris

G. conirostris

G. scandens

C. pauper

C. heliobates

C. olivacea

Ancestral comum

Introdução

1. Sistemática biológica

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10Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva

cujo objetivo é recuperar as relações

genealógicas subjacentes à diversidade

orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

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G. magnirostris

G. fortis

G. fuliginosa

G. scandens C. pallida

C. heliobatesG. conirostris C. crassirostris

C. parvulus C. pauper

C. olivacea T. obscura

Introdução

1. Sistemática biológica

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

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132. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

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A G

TC

2. Preservação e destruição da informação

Introdução

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População descendente População descendente

Sequênciasdescendentes

AA

CCTT

População ancestral

Sequência ancestral

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AC — ATGAACGT — CAA CGC — T — C

ACTGAACGTAACGC

ACTGA — T — GAC — GGTA A — G CGC

A AC ∗ AT TG GG ∗ AA AG ∗ CG GT ∗ CA AG ∗ AC CG GC C

Sequência ancestral

Sequênciadescendente 1

Sequênciadescendente 2

Sequênciasobservadas

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172. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

A G

TC

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

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EspaEspaççooTem

po

Tem

po

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203. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

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213. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

Dados de distribuição de caracteres

Métodos deinferência

Padrão filogenético+ →

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Histórica Comparativa Inferencial

A sistemática biológica éuma ciência

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233. Padrão e processo

Introdução

Matriz de caracteres alinhadosEvolução (não-observável)

CGACTTG

CCACATG

DADOS DE SEQUÊNCIAS

GC TAA

Análise filogenética

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

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Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas