Linux aula

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Linux – uma alternativa diferente Alessandra Faria Campos

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Linux – uma alternativa diferente

Alessandra Faria Campos

Page 2: Linux aula

Sistemas operacionais

Um programa governo

Controla a interação entre:Usuários e hardwareOs diversos usuários

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Sistemas operacionais

Sistema operacional

Programas do sistema e usuários

Hardware

impressoramouseteclado monitor

usuário1 usuário2 usuário n

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Sistemas operacionais

WindowsUNIXDOSMacOSOS2LINUX

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Linux – breve histórico

• Desenvolvido por Linus Torvalds – Universidade de Helsinki – Finlândia

• Aprimorado com a participação de usuários de UNIX através da internet

• Primeira versão oficial liberada em 1991

• X-windows

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Linux - Vantagens

• É um software livre: pode ser copiado de outro usuário, descarregado da internet ou comprado de uma empresa que montou um pacote (ex: Linux - Conectiva)

• Roda com requerimentos de hardware mínimos (pode rodar em um 486 – 4 M de RAM! – *Windows Millenium requerimento mínimo: 128 M de RAM)

• É muito poderoso: roda com boa performance mesmo com vários programas rodando ao mesmo tempo e várias janelas abertas - Raramente aparece a terrível mensagem: Esse programa executou uma operação ilegal e vai ser fechado!!!!!!

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Linux - vantagens

• Os programas rodam individualmente – falhas em um programa não interferem com os demais processos e não obrigam a reiniciar o computador

• Suporte, programas e documentação livre, de graça e em grande volume disponível na internet

• Pode ser instalado junto com outros sistemas operacionais

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Linux e bioinformática

• Poderoso o suficiente para ser usado para lidar com ferramentas de bioinformática que lidam com grande volume de dados

• Utilizado em centros de bioinformática ao redor do mundo

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NCBI –Servidor de ftp

• Descarregar os programas na forma compactada para Linux ou outra plataforma

• Montagem de banco de dados local• Execução dos programas de manipulação e análise

de sequências localmente: velocidade e personalização

• Em projetos genoma as sequencias são inéditas e não estão depositadas em bancos de dados públicos