MAGNITUD Y ESTRUCTURA DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA DEL GERMOPLASMA DE QUÍNOA DEL NOROESTE ARGENTINO...
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MAGNITUD Y ESTRUCTURA DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA DEL
GERMOPLASMA DE QUÍNOA DEL NOROESTE ARGENTINO Y SU PERSPECTIVA
DE USO.
COSTA TÁRTARA Sabrina M1* CURTI R.2,3, MANIFESTO MM4, SERGIO J.
BRAMARDI 5, BERTERO HD2.
1 Departamento de Tecnología, Universidad Nacional de Luján, Buenos Aires,
Argentina.
2 Departamento de Producción Vegetal, FA-UBA, Capital Federal, Buenos Aires,
Argentina.
3 Cátedra de Diseño Experimental FCN-UNSa, Sede Regional Metán-Rosario de la
Frontera, Salta, Argentina.
4 Instituto de Recursos Biológicos, INTA Castelar, Buenos Aires, Argentina.
5 Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales UNLP, La Plata, Buenos Aires,
Argentina.
6 Facultad de Ciencias Agrarias UNComahue, Neuquén, Argentina.
*Autor para correspondencia, [email protected] – [email protected]
Germoplasma nativo de la región del Noroeste en el contexto del resto de Sudamérica…
Caracterización molecular de 22 regiones microsatélites en 80 entradas de quínoa.
Procedencia Número de entradas
Argentina 35
Bolivia 22
Chile 10
Colombia 1
Ecuador 2
Perú 8
Colecta de germoplasma NOA
35 entradas seleccionadas cubriendo el rango de
cultivo.
Estrategia de trabajoCaracterizac
ión molecular QAAT 050
ADN de 10
plantas por
población
22 loci de
microsatélites
De acuerdo a la distancia genética entre las poblaciones se identificaron cuatro grupos genéticos
Puna
Valles secos
Valles húmedos
Transición
Costa Tártara et al. (2012) Conservation Genetics
Distancia genética promedio: 0,80
Entre regiones
18%Entre poblaciones40%
Intrapoblacional42%
Varianza molecular Estadísticos F de Wright
Stat Value P(rand >= data)
Frt 0,183 0,001
Fsr 0,472 0,001
Fst 0,568 0,001
Fis 0,628 0,001
Fit 0,839 0,001
Diversidad genética promedio = 0,29 (0,01)Rango de valores 0 a 0,71
% de loci polimórficos 62,12 (4,87) en promedio
Diferenciación entre poblaciones; magnitud y distribución de la diversidad genética
Costa Tártara et al. (2012) Conservation Genetics
Transición
Valles húmedos
Valles secos
Puna
Análisis factorial de Correspondencias
- Representación simultánea de la variabilidad alelica y las poblaciones.
360 Alelos totales 97
alelos privados
Visualización del agrupamiento de las poblaciones
ChileBolivia
Salta
Jujuy
Catamarca
G3
G2
G1G4
Variabilidad alélica de quínoa del Noroeste de Argentina
N=12
N=10
N=5N=8
UHe=0,42
UHe=0,27
UHe=0,25 UHe=0,16
Gradiente de diversidad en dirección Oeste-Este
Costa Tártara et al. (2012) Conservation Genetics
El R2 fue moderado (0,49) y negativo
BIO1 = Annual Mean TemperatureBIO11 = Mean Temperature of Coldest
Quarter
BIO2 = Mean Diurnal Range (Mean of monthly
(max temp - min temp))BIO12 = Annual Precipitation
BIO3 = Isothermality (BIO2/BIO7) (* 100)BIO13 = Precipitation of Wettest
Month
BIO4 = Temperature Seasonality (standard
deviation *100)BIO14 = Precipitation of Driest Month
BIO5 = Max Temperature of Warmest MonthBIO15 = Precipitation Seasonality
(Coefficient of Variation)
BIO6 = Min Temperature of Coldest MonthBIO16 = Precipitation of Wettest
Quarter
BIO7 = Temperature Annual Range (BIO5-BIO6) BIO17 = Precipitation of Driest Quarter
BIO8 = Mean Temperature of Wettest QuarterBIO18 = Precipitation of Warmest
Quarter
BIO9 = Mean Temperature of Driest QuarterBIO19 = Precipitation of Coldest
Quarter
BIO10 = Mean Temperature of Warmest
Quarter Altitud
Regresión lineal múltiple (RLM)
Base de datos Bioclim (Hijmans et al. 2005).
Estructura de germoplasma: resultados de la caracterización conjunta
Valles secos
Transición
Altiplano
Valles orientales húmedos
Análisis de Procrustes Generalizado
Costa Tártara et al. 2011 GAB; Curti et al. 2012
Accesiones de Valles interandinos
- Mayor altura- Ciclo de madurez intermedio o tardío
- Mayor diámetro de tallo- Hojas con mayor superficie
Accesiones de Puna- Menor altura- Ciclo corto
- Hojas con menor superficie
CHEN420CHEN426CHEN431
CHEN212CHEN456
CHEN058CHEN060CHEN182CHEN231CHEN252CHEN414
Población
Na UHe %PNº de alelos
privados
Valles secos
CHEN 60b 280,09
(0,03)27,27 1
CHEN 231b 41
0,27 (0,06)
59,09 1
CHEN 252b 44
0,29 (0,06)
59,09 6
CHEN 414b 39
0,34 (0,05)
68,18 3
CHEN 58b 600,42
(0,05)86,36 4
CHEN 182b 57
0,45 (0,06)
81,82 2
Valles húmedo
s
CHEN 212b 26
0,03 (0,01)
18,18 2
CHEN 456 320,16
(0,05)40,91 -
Puna
CHEN 420 310,10
(0,04)31,82 -
CHEN 431b 45
0,24 (0,05)
63,64 1
CHEN 426 600,45
(0,05)86,36 -
Accesiones incluidas en experimentos G x E
Valles secos
Transición
Altiplano
Valles orientales húmedos
Conclusiones y proyecciones
Argentina
Bolivia
Chile El germoplasma de quinoa colectado en el
NOA, puede considerarse nativo.
La distribución de la variabilidad genética mostró una marcada estructuración genética de las poblaciones y de las mismas en los diferentes ambientes del NOA.
Los resultados sugieren que la variabilidad genética entre las poblaciones locales es consecuencia de más de un proceso de ingreso de germoplasma procedente de regiones ecológicas diferentes.
La caracterización conjunta amplia las herramientas disponibles para los fitomejoradores, siendo la puerta de entrada para estudios de asociación.
El nivel diferenciado de diversidad de las poblaciones seleccionadas para ensayos GxE ofrece un amplio rango de respuesta en los distintos ambientes.
Muchas gracias