Rui FigueiraNó Português do GBIF

ruifigueira@isa.ulisboa.pt

Apoios

Formação sobre uso do GBIF em Agrobiodiversidade15-16 de Setembro de 2016

O panorama geral e informática para a biodiversidade

Agrotraining - Proofing GBIF use on agrobiodiversity through needs assessment and training

Workshop Formação sobre uso do GBIF em Agrobiodiversidade – 15-16 Setembro 2016, ISA

Agrotraining - Proofing GBIF use on agrobiodiversity through needs assessment and training

Workshop Formação sobre uso do GBIF em Agrobiodiversidade – 15-16 Setembro 2016, ISA

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Observatório Global da Biodiversidade

GBIF EOL BHL

BOL COL

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A natureza da informação sobre a biodiversidade

Slide de Francisco Pando, http://www.gbif.es/ficheros/TallerCibertaxonomia2014/01-Cibertaxonomia-Intro-FP.pdf

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Dos conceitos às ferramentas

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Web semântica (dados ligados)

In addition to the classic “Web of documents” W3C is helping to build a technology stack to support a “Web of data,” the sort of data you find in databases. The ultimate goal of the Web of data is to enable computers to do more useful work and to develop systems that can support trusted interactions over the network. The term “Semantic Web” refers to W3C’s vision of the Web of linked data. Semantic Web technologies enable people to create data stores on the Web, build vocabularies, and write rules for handling data. Linked data are empowered by technologies such as RDF, SPARQL, OWL, and SKOS.

https://www.w3.org/standards/semanticweb/

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Web semântica (dados ligados)

Para ser possível ligar dados, precisa de:● Uma estrutura para expressar os dados ==> RDF

(Resource Description Framework), XML (XSD), JSONLD

● Identificar dos os objectos de uma forma global ==> GUID (Global Object Identifier)

● Dar significado aos dados ==> Ontologias

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Web semântica: triple (sujeito, predicado, objeto)

Para ser possível ligar dados, precisa de:● Uma estrutura para expressar os dados ==> RDF (Resource

Description Framework), XML (XSD), JSONLD

● Identificar dos os objectos de uma forma global ==> GUID

● Dar significado aos dados ==> Ontologias

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Ontologias

An ontology is a formal naming and definition of the types, properties, and interrelationships of the entities that really or fundamentally exist for a particular domain of discourse

https://en.wikipedia.org/wiki/Ontology_(information_science)

A ontologia inclui, normalmente as seguintes componentes:

● Indivíduos● Classes● Atributos● Relações

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NEON dataset. A directed graph representing of a subset of the NEON soil sampling data that was coded into RDF, according to the semantics of the Biological Collections Ontology (BCO). In this graph, an instance of the type obi:specimen collection called “Soil Sampling Process 1” occurs in “Location 1”, which is an instance of the class dwctype: Location. Blue ovals represent instances, green ovals ontology classes, and black ovals literals, whereas relations (a.k.a. properties) are represented as arrows

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Web services

http://www.lifewatch.be/en/e-lab

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Analysis workflows

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Rui FigueiraNó Português do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbárioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa, Portugalruifigueira@isa.ulisboa.ptwww.gbif.pt

http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/deed.pt

Obrigado!