Projeto de Imagens BiomédicasParte I

Bruno Otilio

Felipe Hideki

Paulo Marques

Prof. Matheus Cardoso

•Problemática

•Métodos aplicados

•Resultados

•Conclusão

•Bibliografia

ICT - UNIFESP 2

Sumário

17/06/2016

Objetivos

ICT - UNIFESP 3

Segmentação

Avaliação estatística

VP%, FP%, FN%, OD% e OR%

17/06/2016

Problemática

ICT - UNIFESP 4

Estudo do Lúmen arterial é uma etapa importante no diagnóstico e prognóstico de diversas doenças

http://www.theplc.net/MI.shtml

Lúmen preservado

Aberturas e bordas nãobem definidas

Reflexo e aberturas

17/06/2016

Métodos aplicados

ICT - UNIFESP 517/06/2016

ICT - UNIFESP 6

Parte I – Original Parte II Parte III Parte IV

IOCT_012

Graythresh (Otsu) bwareaopen Imopen

Medfilt2

Métodos aplicados

17/06/2016

ICT - UNIFESP 7

Métodos aplicados

A escolha do filtro medfilt2, comoetapa de pré-processamento, decai sobre o fato de permitir a retirada

de pontos extremos, indicados pelas setas; tais artefatos podem

interferir durante o processo de abertura e fechamento.

Medfilt2

IOCT_01

17/06/2016

ICT - UNIFESP 8

Métodos aplicados

Parte III Parte IV

Aplicando a função “imopen” o

artefato do cateter, que antes

estava conectado a borda, foi

desacoplado.

17/06/2016

ICT - UNIFESP 9

Métodos aplicados

Parte V Parte VI Parte VII Parte VIII

bwareaopen

Imclose ImcoplementImerode

imdilate

bwselect

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ICT - UNIFESP 10

Métodos aplicados

Verdadeiros_positivos: 99.7273Falsos_positivos: 1.4999

Falsos_negativos: 0.2727Overlap_Dice: 99.1191Overlap_Ratio: 1.9678

Raw IOCT_12 Segmentada IOCT_12 Padrão Ouro IOCT_12

17/06/2016

Resultados

ICT - UNIFESP 1117/06/2016

A tabela preenchida se encontraem anexo.

Conclusão

• A função medfilt2 mostrou como a melhor opção de pré-filtragem

• Usando funções como Graythresh, bwareaopen, Imcoplement, Imerode e

Imdilate permitiu o ajuste optimo para aplicação de das funções de abertura e

fechamento.

• O código apresentado mostrou-se eficaz na segmentação de lumen com

bordas definidas ou não.

ICT - UNIFESP 1217/06/2016

Bibliografia

• MathWorks – MatLabhttp://www.mathworks.com/

ICT - UNIFESP 1317/06/2016

Obrigado!

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ICT - UNIFESP 1517/06/2016

Anexo