PubMed (Medline)

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PESQUISA BIBLIOGRÁFICA: PUBMED (MEDLINE) Denise Giacheti Bibliotecária [email protected] Bauru 2017

Transcript of PubMed (Medline)

PESQUISA BIBLIOGRÁFICA:

PUBMED (MEDLINE)

Denise Giacheti Bibliotecá[email protected]

Bauru

2017

National Center for Biotechnology Information (NCBI) National Library of Medicine (NLM) National Institutes of Health (NIH)

www.ncbi.nlm.nih.govVáriosRecursos

disponíveis

National Library of MedicineIndexa literatura biomédica desde 1879, auxiliando os profissionais de saúde no acesso a informação para pesquisa, cuidados de saúde e educação

Index Medicus (impresso até 2004)Índice com citações de revistas biomédicas do mundo todo, torna-se um banco de dados conhecido como MEDLINE.A partir de 1996, o acesso gratuito ao MEDLINE está disponível ao público on-line através do PubMed (artigos a partir de 1946)

PubMedSistema de recuperação baseado na Web desenvolvido pelo NCBI na NLM que integra:Sequências de nucleotídeosSequências de proteínas, estruturas macromoleculares, genomas inteiros e MEDLINE

National Center for Biotechnology Information (NCBI) National Library of Medicine (NLM)

PubMed

Portanto....

Medline

PubMedRecurso gratuito que fornece acesso ao MEDLINE;

Registros de artigos em fase de indexação, informações sobre os editores de revistas, MeSH® (Vocabulário Controlado NLM);

Contém citações e resumos de periódicos, cobrindo mais de 27 milhões de registros;

A maioria dos registros PubMed são citações do MEDLINE.

MedlineÉ a principal base de dados da National Library of Medicine.

RECUPERANDO A INFORMAÇÃO

 AO SER INDEXADO EM UMA BASE DE DADOS, O ARTIGO PODE SER RECUPERADO POR:

Autor; Título do trabalho;Título da Revista, volume, número, ano; Assunto (Descritores de assunto);Identificador único (UI / DOI)

FASES DA PESQUISA BIBLIOGRÁFICA

Definição do tema e delimitação;

Delimitação do período;

Definição das bases de dados;

Seleção dos descritores e palavras-chave;

Execução da pesquisa;

Seleção dos artigos relevantes e solicitação.

DESCRITORES X

PALAVRAS-CHAVE

DESCRITORES Termos organizados em estruturas hierárquicas, com um controle rígido de sinônimos, significado e importância.

PALAVRAS-CHAVE

Não obedece a nenhuma estrutura. É retirada de textos de linguagem

livre.

PARA LOCALIZAÇÃO DO DESCRITOR PERTINENTE A PESQUISA,

CONSULTAR:

http://decs.bvs.br/

DESCRITORES

DESCRITORES EM CIÊNCIAS DA SAÚDE

Clique em “Consulta ao Decs”.

DIGITAR O DESCRITOR

Digitar o decritor e clicar em “consulta”.

VERIFICAR O DESCRITOR

Verificar: Descritores / Sinônimos / Categoria / Hierarquia.

ACESSANDO O PUBMEDhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

http://pubmed.gov

Tutoriais e atualizações Ferramentas e Buscas específicas.

CRIANDO UMA CONTA NO PUBMEDhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

http://pubmed.gov

Criar e gerenciar pastas, armazenando referencias na sua conta (My Bibliography)

Criar alertas de estratégias de buscas para receber atualizações de interesse em seu email (Saved search)

Personalizar marcadores, limites e filtros (Search Filters).

Registro de dados pessoais

Preencher os dados

solicitados

ESTRATÉGIA DE BUSCA

Utilizando Palavra-ChaveBusca com termo livre

Utilizando o MeSHBusca com terminologia padronizada –

vocabulário controlado

Utilizando o HistóricoBusca com terminologia padronizada +

termo livre

Odontologia IdosoAND

/E

81.403

AND (relaciona e restringe)

NOT Exclui

Odontologia IdosoNOT

/Não427

OR soma e amplia

retirando a duplicidade de registros

OdontologiaIdoso

OR/

OU5.030.424

Operadores Booleanos (AND / OR / NOT) Palavras que informam ao sistema de busca como combinar os termos Devem sempre serem digitados em LETRA MAIÚSCULA para diferenciá-

los dos termos pesquisados.

Buscas Básicas FraseFrase AutorAutor TítuloTítulo Específica por artigo de revista Específica por artigo de revista

(periódico)(periódico) Título de revista (periódico)Título de revista (periódico) TruncagemTruncagem

BUSCA POR FRASE

Busca por frase: o termo deve ser colocado

entre aspas duplas

Frase não localizada: A busca é realizada por

mapeamento automática de termos

Detalhes da pesquisa realizada

Digitar o sobrenome do autor e até duasiniciais do nome (nome e prenome),

abreviado e sem pontuação.

Possibilidade de reclassificar os artigos para exibir os resultados da mais alta para a

mais baixa relevância.

BUSCA POR AUTOR

Detalhes da busca.

Digitar o título do artigoBUSCA POR TÍTULO

Detalhes da busca

Artigos similares.

Dados da revista (Título da revista/ volume /

fascículo / primeira página do artigo).

Single Citation

BUSCA ESPECÍFICA PARA ARTIGO DE PERIÓDICO.Selecionar

Single Citation

Base selecionada: JOURNALS.

BUSCA SIMPLIFICADA POR TÍTULO DA REVISTA

Digite o título do periódico (nome da revista).

INFORMAÇÕES DETALHADAS SOBRE A REVISTA

Indica a indexação ou nãono MEDLINE.

BUSCA POR TRUNCAGEM (ODONTOLOGIA)

Truncagem:

Encontrar termos que começam com determinada

sequência de palavras (máximo 600 termos)

Não é uma técnica recomendada para PubMed, pois é ignorado o mapeamento Automático de termos, e podem ser recuperados uma quantidade incontrolável de termos, além de exceder o tempo limite e dar erro.

Mas há momentos que atruncagem pode ser útil.

BUSCA POR TRUNCAGEM (FONOAUDIOLOGIA)

Truncagem:

Encontrar termos que começam com determinada

sequência de palavras (máximo 600 termos)

Não é uma técnica recomendada para PubMed, pois é ignorado o mapeamento Automático de termos, e podem ser recuperados uma quantidade incontrolável de termos, além de exceder o tempo limite e dar erro.

Mas há momentos que otruncamento pode ser útil.

EXEMPLO DE BUSCA AVANÇADA (ÁREA ODONTOLOGIA)

BUSCA AVANÇADA

Descritores de Descritores de AssuntoAssunto

Base selecionada: MeSH Database

BUSCA POR DESCRITORES (MeSH).

Base : MeSH

Digitação do termo descritor

SELEÇÃO DO TERMO PARA A PESQUISA

Selecionar o termo

Clicar

Clicar no operador

Clicar no pesquisar.

RESULTADO DA BUSCA COM O PRIMEIRO DESCRITOR

1º. Resultado.

ESPECIFICAÇÃO DA BUSCA - SELEÇÃO DO 2º. DESCRITOR

Selecionar o 2º. termo

Sinônimos e TermosQualificadores

Clic

ar n

o op

erad

or.

Digitação do 2º. termo

2º. resultado

RESULTADO DA BUSCA COM O SEGUNDO DESCRITOR

Clicar em Advanced para verificar as buscas e realizar

cruzamento de termos.

Buscas limitadas ao campo MeSH ou utilização de filtros

NÃO

Recuperam artigos recentes sem indexação!

ATENÇÃO

BUSCA AVANÇADA

Mapeamento Mapeamento Automático de TermosAutomático de Termos

Base selecionada: PUBMED

Digite o termo referente ao assuntoda busca em inglês

Clique em

“Search”.BUSCA POR MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMO

MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMO resultado e detalhamento

Mesmo ao fazer a busca por

palavra-chave, o sistema

localiza os descritores e

outros termos e

os acrescenta na pesquisa.

MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMO explosão automática de termos

Verificando o termo no MeSH Database, percebe se

que “Root caries” foi incluídona resposta da pesquisa.

Resultado recuperado via MeSH

RESULTADO DOS TERMOS LOCALIZADOS VIA MESH E MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMOS

Resultado recuperado via Mapeamento

CRUZAMENTO DE TERMOS

Estratégia com os descritores e mapeamento

automático

Clicar em Search.

Estratégia com os descritores e mapeamento automático

DETALHE DA PESQUISA.... Verificando a estratégia

Resultado

Medline: Citações indexadas com termos MeSH, tipo de publicação, nome de substâncias, e disponíveis no Medline.

Publisher: Artigos disponibilizados pelos editores, ou revistas não indexadas no Medline. Estes dados não são revisados.

Pubmednotmedline : Artigos de revistas não indexados no Medline ou estão fora do escopo ou artigos publicados no PubMed Central e ainda não recomendados para o Medline

Inprocess: Em processo.... Caso o artigo esteja no escopo do Medline, serão atribuídos os assuntos MeSH e incorporados ao Medline.

SITUAÇÃO DAS REFERENCIAS RECUPERADAS

DADOS BÁSICOS DE IDENTIFICAÇÃO

Autor (es) do Artigo Título do Artigo

Título do periódico, ano de publicação,

volume, fascículo, páginas e DOI.

IDENTIFICANDO FILTROS

Tipos de artigos

FILTROS

Por acesso ao texto

Por artigos comentados ou de tendência

Por delimitação de período

Por espécie

Por Gênero

Grupo de periódico.

FILTROS

Por Língua-

Por faixa etária

Por assunto pré definidos

Por campos específicos (tags)

FILTROS

FILTROS: Planejamento para inserção futura...

Revistas referenciadas nasbases de dados da

National Center for Biotechnology

Information (NCBI)

"Publicações PubMed / PMC“ e "Todos os periódicos MEDLINE”

Período

RESULTADO APÓS SELEÇÃO DOS FILTROS

Espécie

Resultado daPesquisa

Foram recuperados artigos relacionados a humanos,

nos últimos 10 anos.

Termos da busca

Dados do artigo

Link de acesso

ResumoArtigos similares

Informações relacionadas

Atividades recentes de pesquisa.

DETALHES DO ARTIGO

Situação do artigo na base

Link de compartilhamento

Permite que autores associadosque sejam autores com artigos

PubMed, comentem artigos

[Epub ahead of print] artigo com versão eletrônica

disponível antes da versão impressa

[Indexed for MEDLINE] artigo indexado e incluído no

no MEDLINE com todosdescritores atualizados pelo MeSH.

DETALHES DO ARTIGO

Descritores

Substâncias

Links externos: sites de periódicos eoutras fontes de informação.

DETALHES DO ARTIGO

Conflito de interesse: quando mencionado

pelo editor

Quando quiser pesquisar, acrescentar cois após a empresa Ex: Merck[cois].

DETALHES DO ARTIGO : conflitos de interesse

Sentenças Editoriais

Quando quiser pesquisar use:

hasexpressionofconcernfor = Para recuperar referencias que contenham a sentença

hasexpressionofconcernin = Para recuperar os artigos originais quecontenham a sentença.

DETALHES DO ARTIGO : sentenças editoriais

FORMAT para selecionar tipo de apresentação

OPÇÕES PARA DISPONIBILIZAR OS RESULTADOS

SORT BY ordem de apresentação

PER PAGE número de referencias por página.

FILE para salvar os resultados em arquivo

CLIPBOARD para criar uma lista temporária

E-MAIL para enviar os resultados por E-mail

OPÇÕES PARA ENVIAR OU SALVAR OS RESULTADOS

ORDER somente para associados, onde os artigossão encaminhados ao e-mail após o pagamentode taxa

COLLECTIONS Criar uma lista específica de artigos

CITATION MANAGER Enviar lista para um gerenciador de bibliografias Ex: endnote ...

MY BIBLIOGRAPHY Criar uma lista de artigos interessantes.

CLIPBOARD

Selecione as referencias de interesse e encaminhe para o Clipboard

(lista temporária)

O limite do Clipboard é de 500 registros e fica ativo por ate 8 horas

USO DO CLIPBOARD

As referencias selecionadas foram adicionadas ao Clipboard

Clique no número de itens para acessar as referencias selecionadas.

Caso selecione duas vezes a mesmareferência, esta entrará somente uma vez!

E as referencias ficarão marcadas que constam do Clipboard

REMOVENDO A REFERÊNCIA DO CLIPBOARD

As referencias podem ser removidasdo Clipboard uma a uma ou em lote.

SALVAR OS RESULTADOS (FILE)

Selecione o formato da lista de resultados

Selecione o parâmetro de ordenação de resultados

Clique.

ENCAMINHAR O RESULTADO POR E-MAIL

Ao selecionar Formato Abstracté possível ter acesso aos termos

MeSH e outros dados

Selecione o parâmetro de ordenação de resultados

Selecione o número máximode referencias (200 por vez)

Informe o e-mail

Digite texto para o envio (opcional).

EXEMPLO DE BUSCA AVANÇADA (ÁREA FONO)

BUSCA AVANÇADA

Descritores de Descritores de AssuntoAssunto

Base selecionada: MeSH Database

BUSCA POR DESCRITORES (MeSH)

Base : MeSH

Digitação do termo descritor

SELEÇÃO DO TERMO PARA A PESQUISA

Selecionar o termo

Clicar

Clicar no operador

Clicar no pesquisar.

RESULTADO DA BUSCA COM O PRIMEIRO DESCRITOR

1º. Resultado.

ESPECIFICAÇÃO DA BUSCA – VERIFICANDO O DESCRITOR

Digitação do 2º. termo

Selecionar oTermo para detalhes

Sinônimos e TermosQualificadores.

ESPECIFICAÇÃO DA BUSCA - SELEÇÃO DO 2º. DESCRITOR

Selecionar ostermos de interesse e acrescentar a busca

Clic

ar n

o op

erad

or.

RESULTADO DA BUSCA COM O SEGUNDO DESCRITOR

2º. resultado

Clicar em Advanced para verificar as buscas e realizar

cruzamento de termos.

Buscas limitadas ao campo MeSH ou utilização de filtros

NÃO

Recuperam artigos recentes sem indexação!

ATENÇÃO

BUSCA AVANÇADA

Mapeamento Mapeamento Automático de TermosAutomático de Termos

Base selecionada: PUBMED

Digite o termo referente ao assuntoda busca em inglês

Clique em

“Search”.BUSCA POR MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMO

MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMO Resultado e detalhamento

O mapeamento busca por palavra-chave e

descritores e os acrescenta à pesquisa

MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMO Explosão automática de termos

Verificando o termo no MeSH Database, percebe seque “Deafness” foi incluído

na resposta da pesquisa

Resultado recuperado via MeSH

RESULTADO DOS TERMOS LOCALIZADOS VIA MESH E MAPEAMENTO AUTOMÁTICO DE TERMOS

Resultado recuperado via Mapeamento

CRUZAMENTO DE TERMOS

Estratégia com os descritores e mapeamento

automáticoClicar em Search.

Estratégia com os descritores e mapeamento automático

automático

DETALHE DA PESQUISA.... Verificando a estratégia

Resultado

Medline: Citações indexadas com termos MeSH, tipo de publicação, nome de substâncias, e disponíveis no Medline.

Publisher: Artigos disponibilizados pelos editores, ou revistas não indexadas no Medline. Estes dados não são revisados.

Pubmednotmedline: Artigos de revistas não indexados no Medline ou estão fora do escopo ou artigos publicados no PubMed Central e ainda não recomendados para o Medline

Inprocess: Em processo.... Caso o artigo esteja no escopo do Medline, serão atribuídos os assuntos MeSH e incorporados ao Medline.

SITUAÇÃO DAS REFERÊNCIAS RECUPERADAS

DADOS BÁSICOS DE IDENTIFICAÇÃO

Autor (es) do Artigo Título do Artigo

Título do periódico, ano de publicação,

volume, fascículo, páginas e DOI.

IDENTIFICANDO FILTROS

Tipos de artigos.

FILTROS

Por acesso ao texto

Por delimitação de período

Por espécie

Por Gênero

Grupo de periódico

Por artigos comentados ou de tendência

FILTROS

Por Língua

Por faixa etária

Por assunto pré definidos

Por campos específicos (tags)

FILTROS

FILTROS: planejamento para inserção futura...

Revistas referenciadas nasbases de dados da

National Center for Biotechnology

Information (NCBI)

"Publicações PubMed / PMC" e "Todos os periódicos MEDLINE”

Termos da busca

Período

RESULTADO APÓS SELEÇÃO DOS FILTROS

Espécie

Resultado daPesquisa

Foram recuperados artigos relacionados a humanos,

nos últimos 10 anos sendo Revisões Sistemáticas.

Tipo

Dados do artigo

Link de acesso

Resumo Artigos similares

Atividades recentes de pesquisa.

DETALHES DO ARTIGO

Situação do artigo na base

Link de compartilhamento

Permite que autores associadosque sejam autores com artigos

PubMed, comentem artigos.

[Epub ahead of print] artigo com versão eletrônica

disponível antes da versão impressa

[Indexed for MEDLINE] artigo indexado e incluído no

no MEDLINE com todosdescritores atualizados pelo MeSH.

DETALHES DO ARTIGO

Descritores

Outras Informações:Apoio, Substâncias, Tipo de Publicações

Links externos: sites de periódicos eoutras fontes de informação

DETALHES DO ARTIGO

Conflito de interesse: quando mencionado

pelo editor

Quando quiser pesquisar, acrescentar [cois] após a empresa

Ex: Merck[cois].

DETALHES DO ARTIGO : conflitos de interesse

Sentenças Editoriais

Quando quiser pesquisar use:

hasexpressionofconcernfor = Para recuperar referencias que contenham a sentença

hasexpressionofconcernin = Para recuperar os artigos originais que contenham a sentença

DETALHES DO ARTIGO : sentenças editoriais

FORMAT para selecionar tipo de apresentação

OPÇÕES PARA DISPONIBILIZAR OS RESULTADOS

SORT BY ordem de apresentação

PER PAGE número de referencias por página.

FILE para salvar os resultados em arquivo

CLIPBOARD para criar uma lista temporária

E-MAIL para enviar os resultados por E-mail

OPÇÕES PARA ENVIAR OU SALVAR OS RESULTADOS

ORDER somente para associados, onde os artigossão encaminhados ao e-mail após o pagamento detaxa

COLLECTIONS Criar uma lista específica de artigos

CITATION MANAGER Enviar lista para um gerenciador de bibliografias Ex: endnote ...

MY BIBLIOGRAPHY Criar uma lista de artigos interessantes.

CLIPBOARD

Selecione as referencias de interesse e encaminhe para o Clipboard

(lista temporária)

O limite do Clipboard é de 500 registros e fica ativo por ate 8 horas

USO DO CLIPBOARD

As referencias selecionadas foram adicionadas ao Clipboard

Clique no número de itens para acessar as referencias selecionadas.

Caso selecione duas vezes a mesmareferência, esta entrará somente uma vez!

E as referencias ficarão marcadas que constam do Clipboard

REMOVENDO A REFERÊNCIA DO CLIPBOARD

As referencias podem ser removidasdo Clipboard uma a uma ou em lote.

SALVAR OS RESULTADOS (FILE)

Selecione o formato da lista de resultados

Selecione o parâmetro de ordenação de resultados

Clique em Create File

ENCAMINHAR O RESULTADO POR E-MAIL

Ao selecionar Formato Abstract épossível ter acesso aos termos MeSH

e outros dados

Selecione o parâmetro de ordenação de resultados

Selecione o número máximode referencias (200 por vez)

Informe o e-mail

Digite texto para o envio (opcional)

BIBLIOGRAFIA

COLLINS, M. PubMed Updates March 2017. NLM Tech Bull., Bethesda, n. 415, p. e1, Mar./Apr. 2017. Disponível em: <https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma17/ma17_pm_update.html>. Acesso em: 22 mar. 2017.

COLLINS, M. Updated Algorithm for the PubMed Best Match Sort Order. NLM Tech Bull., Bethesda, n. 414, p. e3, Jan./Feb. 2017. Disponível em: <https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf17/jf17_pm_best_match_sort.html>. Acesso em: 22 mar. 2017.

COLLINS, M. Updated NLM catalog sidebar filters. NLM Tech Bull., Bethesda, n. 415, p. e1, Mar./Apr. 2017. Disponível em: <https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma17/ma17_pm_catalog_filters.html>. Acesso em: 22 mar. 2017.

NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE. MEDLINE®/PubMed® Resources Guide. Bethesda: National Center for Biotechnology Information, 2016. Disponível em: <http://www.nlm.nih.gov/bsd/pmresources.html>. Acesso em: 22 mar. 2017.

NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE. PubMed Help: NCBI help manual. Bethesda: National Center for Biotechnology Information, 2016. Disponível em: <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3836/>. Acesso em: 22 mar. 2017.

NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE. PubMed® Online Training. Bethesda: National Center for Biotechnology Information, 2016. Disponível em: <https://learn.nlm.nih.gov/rest/training-packets/T0042010P.html>. Acesso em: Acesso em: 22 mar. 2017.

NATIONAL LIBRARY OF MEDICINE. PubMed Subset Strategies. Bethesda: National Center for Biotechnology Information, 2017. Disponível em: <http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_subsets.html>. Acesso em: 22 mar. 2017.

OBRIGADA !

DENISE GIACHETI

Termos e Condições de Uso

Para a elaboração deste material foram consultados: manuais e tutoriais disponíveis nos sites de empresas fornecedoras de fontes de informação; material encaminhado diretamente pelas referidas empresas; manuais, folhetos, sites, apresentações etc. desenvolvidos por outras bibliotecas do SIBi/USP.

As bibliotecas do SIBi/USP e seus usuários têm direito à visualização, sem quaisquer restrições, ao armazenamento digital (download), à impressão e à cópia dos arquivos disponíveis para uso em suas atividades de ensino e pesquisa e uso individual.

É proibida a inclusão deste conteúdo em outra publicação, ou em qualquer outro site ou rede de computadores, ou em outra forma de produto ou mídia de armazenamento sem prévia autorização formal do Serviço de Biblioteca e Documentação da FOB-USP ([email protected]).

É expressamente proibida a exploração comercial, direta ou indireta, deste conteúdo.

Os nomes e marcas de bases de dados mencionados são marcas registradas e de propriedade das empresas fornecedoras.

CréditosProduzido por:Universidade de São PauloFaculdade de Odontologia de BauruServiço de Biblioteca e Documentação “Prof. Dr. Antônio Gabriel Atta”Serviço de Referência e InformaçãoSeção de Referência Especializada em Malformações Congênitas Craniofaciais

Elaborado por: Denise Ap. Giacheti Gillio

Revistado por:Cybelle de Assumpção Fontes

[email protected]@usp.br

Como citar:UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO. Faculdade de Odontologia de Bauru. Serviço de Biblioteca e Documentação. Serviço de Referência e Informação. Seção Especializada em Malformações Congênitas Craniofaciais. Pesquisa bibliográfica: PubMed (Medline). Bauru, mar. 2017. 1 arquivo Power Point.