Workshop - Drupal para BioInformática · PDF file 10 razões para escolher Drupal...

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    05-Jun-2020
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  • Workshop - Drupal para BioInformática

    José Fernandes

    [email protected] - www.josefernandes.pt - twitter.com/introfini - drupal.org/user/42293

    mailto:[email protected] http://josefernandes.pt/ http://josefernandes.pt/ http://twitter.com/introfini http://twitter.com/introfini http://drupal.org/user/42293 http://bloomidea.com/ http://drupal-pt.org/

  • Gestor de conteúdos / Framework

  • Como funciona?

    Drupal

    PHP

    Apache IIS, Nginx, lighttpd, etc

    MySQL PostgreSQL, Oracle, SQL

    Server, etc

    Sistema Operativo

  • http://opensource.com

    http://opensource.com/

  • http://drupal.org

    http://drupal.org/

  • A comunidade

     Mais de 500.000 membros

     Mais de 12.000 developers

     Membros em mais de 200 países

     Traduzido em 88 línguas

  • http://www.flickr.com/photos/nidhug/4923618478

  • Comunidade portuguesa

     Drupal Portugal: núcleos em Lisboa e no

    Norte http://drupal-pt.org

     A.D.P. - Associação Drupal Portugal

     3.600 membros portugueses registados http://drupal.org/profile/country/Portugal

    http://drupal.org/profile/country/Portugal http://drupal.org/profile/country/Portugal http://drupal.org/profile/country/Portugal http://drupal.org/profile/country/Portugal http://drupal.org/profile/country/Portugal http://groups.drupal.org/portugal

  • 10 razões para escolher Drupal

    1. Comunidade apaixonada e dedicada 2. Desenvolvimento rápido 3. Desenvolvimento flexível 4. Altamente extensível 5. Escalabilidade garantida 6. Construído para ser social 7. Aberto para a sua marca 8. Sem custos de aquisição ou de licenciamento 9. Segue os standards 10. Segurança máxima

  • Tipos de sites

     Comunidades

     E-commerce

     Institucionais

     Conferências

     Portais

     Páginas pessoais

     Jornais online

     Aplicações web

     Formação online

     Intranets

     Wikis

     Fóruns

     Marketing

     ...

  • Alguns prémios ganhos

  • Quem o usa?

  • http://www.mensa.org

    http://www.mensa.org/

  • http://www.ebi.ac.uk/

    http://www.ebi.ac.uk/

  • http://brix.crg.es/

    http://brix.crg.es/

  • http://www.pacbb.net

    http://www.pacbb.net/

  • http://biology.stanford.edu/

    http://biology.stanford.edu/

  • http://news.harvard.edu

    http://news.harvard.edu/

  • http://aribi.arizona.edu/

    http://aribi.arizona.edu/

  • http://www.bioinfo.wsu.edu/

    http://www.bioinfo.wsu.edu/

  • http://bisite.usal.es

    http://bisite.usal.es/

  • http://www.biology.umd.edu/

    http://www.biology.umd.edu/

  • http://www.ncbi.nlm.nih.gov

    http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

  • http://www.playboy.de

    http://www.playboy.de/

  • Quem mais o usa?

  • Emprego?

    http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html

    http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html

  • Drupal + Bioinformática

    http://www.bioinfo.wsu.edu/node/557

    http://www.bioinfo.wsu.edu/node/557 http://www.bioinfo.wsu.edu/node/557

  • O que vem incluído?

     Blogues, livros, comentários, fóruns

     Estatísticas de acessos e logins

     Pesquisa avançada  Sistemas avançados de

    performance  URL amigáveis  Menus multi-nível  Suporte multi-site  Gestão de utilizadores

     Gestão de permissões  Gestão de sessões  OpenID  Gestão de ficheiros e

    imagens  Feeds RSS  Sistema de notificações

    para actualizações  Perfis de utilizadores  Ferramentas de workflow  …

  • E muito mais!

     Mais de 12.000 módulos disponíveis

     Principais módulos: CCK, Views, Rules, Pathauto,

    Commerce, Google Analytics, Devel, Rules, Fivestar, VBO,

    Advanced Forum, Organic Groups, XML Sitemap, Features,

    Context, Panels, Flag, Feeds

    Lista completa: http://drupal.org/project/Modules

    http://drupal.org/project/Modules

  • Módulos para Bioinformática

     Bioinformatic Software Bench http://drupal.org/project/biosoftware_bench The Bioinformatic Software Bench for Drupal allows for a rapid and secure deployment of bioinformatic software. The BLAST, InterProScan, SSAHA2 and

    annot8r software are provided by default and plugins for new software can be readily written.

     GMOD Drupal Bioinformatic Server Framework

    http://drupal.org/project/gmod_dbsf

     Genes4all http://drupal.org/project/genes4all Genes4all is a package of modules for visualizing bioinformatic information using GMOD, BioPerl and Chado..

     Pubmed Integration http://drupal.org/project/pubmed_integration

     Entrez Database Import http://drupal.org/project/entrez

     Jbrowse http://drupal.org/project/Jbrowse

    http://drupal.org/project/biosoftware_bench http://drupal.org/project/biosoftware_bench http://drupal.org/project/gmod_dbsf http://drupal.org/project/gmod_dbsf http://drupal.org/project/genes4all http://drupal.org/project/genes4all http://drupal.org/project/pubmed_integration http://drupal.org/project/entrez http://drupal.org/project/entrez http://drupal.org/project/Jbrowse http://drupal.org/project/Jbrowse http://drupal.org/project/Jbrowse

  • http://insectacentral.org/bench/blastall

    http://insectacentral.org/bench/blastall

  • Como saber mais?

     Documentação no Drupal.org http://drupal.org/handbook

     API para developers http://api.drupal.org

     Vídeos com tutoriais http://drupal.org/node/124318

     IRC #drupal http://drupal.org/irc

     BioInformatics no Groups.Drupal http://groups.drupal.org/bioinformatics

     O meu blog http://josefernandes.pt/topicos/drupal

    http://drupal.org/handbook http://drupal.org/handbook http://api.drupal.org/ http://drupal.org/node/124318 http://drupal.org/node/124318 http://drupal.org/node/124318 http://drupal.org/irc http://drupal.org/irc http://groups.drupal.org/bioinformatics

  • Dezenas de livros

    ...

  • Mãos ao trabalho!

     Ter a stack (L/W/M)AMP a funcionar

     Fazer o download do Drupal

     Versão 6 ou 7 ?

     Que módulos usar?

     Desenvolver o 1º projecto!