Workshop - Drupal para BioInformática

José Fernandes

email@josefernandes.pt - www.josefernandes.pt - twitter.com/introfini - drupal.org/user/42293

Gestor de conteúdos / Framework

Como funciona?

Drupal

PHP

Apache IIS, Nginx, lighttpd, etc

MySQL PostgreSQL, Oracle, SQL

Server, etc

Sistema Operativo

http://opensource.com

http://drupal.org

A comunidade

Mais de 500.000 membros

Mais de 12.000 developers

Membros em mais de 200 países

Traduzido em 88 línguas

http://www.flickr.com/photos/nidhug/4923618478

Comunidade portuguesa

Drupal Portugal: núcleos em Lisboa e no

Norte http://drupal-pt.org

A.D.P. - Associação Drupal Portugal

3.600 membros portugueses registados http://drupal.org/profile/country/Portugal

10 razões para escolher Drupal

1. Comunidade apaixonada e dedicada 2. Desenvolvimento rápido 3. Desenvolvimento flexível 4. Altamente extensível 5. Escalabilidade garantida 6. Construído para ser social 7. Aberto para a sua marca 8. Sem custos de aquisição ou de licenciamento 9. Segue os standards 10. Segurança máxima

Tipos de sites

Comunidades

E-commerce

Institucionais

Conferências

Portais

Páginas pessoais

Jornais online

Aplicações web

Formação online

Intranets

Wikis

Fóruns

Marketing

...

Alguns prémios ganhos

Quem o usa?

http://www.mensa.org

http://www.ebi.ac.uk/

http://brix.crg.es/

http://www.pacbb.net

http://biology.stanford.edu/

http://news.harvard.edu

http://aribi.arizona.edu/

http://www.bioinfo.wsu.edu/

http://bisite.usal.es

http://www.biology.umd.edu/

http://www.ncbi.nlm.nih.gov

http://www.playboy.de

Quem mais o usa?

Emprego?

http://news.cnet.com/8301-13846_3-10458748-62.html

Drupal + Bioinformática

http://www.bioinfo.wsu.edu/node/557

O que vem incluído?

Blogues, livros, comentários, fóruns

Estatísticas de acessos e logins

Pesquisa avançada Sistemas avançados de

performance URL amigáveis Menus multi-nível Suporte multi-site Gestão de utilizadores

Gestão de permissões Gestão de sessões OpenID Gestão de ficheiros e

imagens Feeds RSS Sistema de notificações

para actualizações Perfis de utilizadores Ferramentas de workflow …

E muito mais!

Mais de 12.000 módulos disponíveis

Principais módulos: CCK, Views, Rules, Pathauto,

Commerce, Google Analytics, Devel, Rules, Fivestar, VBO,

Advanced Forum, Organic Groups, XML Sitemap, Features,

Context, Panels, Flag, Feeds

Lista completa: http://drupal.org/project/Modules

Módulos para Bioinformática

Bioinformatic Software Bench http://drupal.org/project/biosoftware_bench

The Bioinformatic Software Bench for Drupal allows for a rapid and secure deployment of bioinformatic software. The BLAST, InterProScan, SSAHA2 and

annot8r software are provided by default and plugins for new software can be readily written.

GMOD Drupal Bioinformatic Server Framework

http://drupal.org/project/gmod_dbsf

Genes4all http://drupal.org/project/genes4all

Genes4all is a package of modules for visualizing bioinformatic information using GMOD, BioPerl and Chado..

Pubmed Integration http://drupal.org/project/pubmed_integration

Entrez Database Import http://drupal.org/project/entrez

Jbrowse http://drupal.org/project/Jbrowse

http://insectacentral.org/bench/blastall

Como saber mais?

Documentação no Drupal.org http://drupal.org/handbook

API para developers http://api.drupal.org

Vídeos com tutoriais http://drupal.org/node/124318

IRC #drupal http://drupal.org/irc

BioInformatics no Groups.Drupal http://groups.drupal.org/bioinformatics

O meu blog http://josefernandes.pt/topicos/drupal

Dezenas de livros

...

Mãos ao trabalho!

Ter a stack (L/W/M)AMP a funcionar

Fazer o download do Drupal

Versão 6 ou 7 ?

Que módulos usar?

Desenvolver o 1º projecto!