Bioquímica I – Agronomia
Prof. João M. Cordeiro
3 h/semana: sextas feiras às 13:00h
Dias de aula no presente semestre (2/16):
set: 26 02 09 16 23 30 out: 07 14 21 nov: 04 11 18 25 dez: 02 09 16
O sábado deverá ser utilizado para eventuais reposições, conforme a necessidade de cada disciplina.
PROGRAMA
1. Aspectos importantes da química orgânica
2. Estrutura e propriedades dos carboidratos2.1. Funções dos carboidratos2.2. Classificação e nomenclatura dos carboidratos2.3. Fórmula de Haworth, Fischer2.4. Propriedades dos monossacarídeos2.5. Oligossacarídeos2.6. Principais dissacarídeos2.7. Polissacarídeos2.8. Estrutura dos principais polissacarídeos
3. Estrutura e propriedades dos aminoácidos e proteínas3.1. Classificação dos aminoácidos3.2. Propriedades dos aminoácidos3.3. Ligação peptídica e classificação dos peptídeos3.4. Funções das proteínas3.5. Estrutura das proteínas
3.6. Desnaturação das proteínas3.7. Comportamento iônico de peptídeos e proteínas3.8. Proteínas conjugadas, proteínas de membranas
4. Estrutura e propriedades dos lipídeos4.1. Funções dos lipídeos4.2. Classificação dos lipídeos4.3. Ácidos graxos4.3.1. Classificação e nomenclatura dos ácidos graxos4.3.2. Ácidos graxos essenciais4.3.3. Propriedades dos ácidos graxos
5. Ácidos nucleicos e seus componentes5.1. Estrutura geral dos nucleotídeos5.1.1. Bases nitrogenadas5.1.2. Açucares5.1.3. Ácido fosfórico5.1.4. Nucleosídeos5.1.5. Nucleotídeos5.2. Ácidos Nucleicos5.2.1. Desnaturação do DNA
6. Energia bioquímica (Bioenergética)6.1. Conceitos de energia livre6.1.1. Primeira e Segunda Leis da Termodinâmica6.1.2. Energia Livre6.2. Variação na energia livre-padrão de reações químicas6.3. Reações exergônicas e endergônicas6.4. Compostos ricos em energia6.5. Reações acopladas, energética das reações de oxidorredução (redox)7. Enzimas7.1. Cinética enzimática7.2. Especificidade enzimática7.3. Inibição enzimática, determinação experimental das constantes cinéticas
7.4. Efeitos alostéricos, efeitos homo e heterotrópicos, centro ativo das enzimas7.5. Classificação das enzimas
8. Vitaminas e coenzimas8.1. Conceito de vitaminas8.2. Classificação das vitaminas8.3. Vitaminas com funções de coenzimas; grupo prostético e cofator.8.4. Vitaminas sem verdadeira funções de coenzima
BIBLIOGRAFIA
BÁSICA:ALLINGER, C.L. Química Orgânica. 2.ed. Rio de Janeiro,
Guanabara Dois, 1978. 961p.BENNET/FRIEND Tópicos Modernos de Bioquímica
2.ed. São Paulo, Edgard Blucher, 1971. 175p.CONN, E.E. e STUMPF, P.K. Introdução à Bioquímica.
3.ed. São Paulo, Edgard Blucher, 1975. 447p.LEHNINGER, A.L. et al Princípios de Bioquímica. São
Paulo, Elsevier, 1995-839p. STRYER, L. Bioquímica - Rio de Janeiro: Guanabara
Koogan, 1992-881p.
QUÍMICA GERAL
RUSSELL, J.B., Química Geral. 2. ed. V. 1 e 2. São Paulo, Makron Books (1994) e edições que seguem.
BROWN, T.L., LEMAY, H.E., BURSTEN, B.E., Química, a Ciência Central. 9 ed. São Paulo, Pearson Prentice Hall ( 2005) e edições que seguem.
MASTERTON, W.L., SLOWINSKI, E.J., STANITSKI, C.L., Princípios de Química, Editora Guanabara (1990) e edições que seguem.BRADY, J.E. E HUMISTON, G.E. Química Geral. 2.ed. Rio de Janeiro, Livros Técnicos e Científicos, 1986 e edições que seguem.O’CONNOR, R. Introdução à Química. Harper & How do Brasil.QUAGLIANO, J. V. e VALLARINO, L. M. Química. São Paulo, Guanabara Koogan e edições que seguem.
Datas de avaliação da aprendizagem
1a Aval: 30/set2a Aval: 18/nov 3a Aval: 16/dez
Recuperação: ?
As avaliações têm nota máxima 8,0
Serão consideradas as duas melhores notas das avaliações
1 nota de trabalho (Nt), valor máximo 2,0, oriunda da média das notas de trabalhos que forem feitos.
Critério de avaliação:
Média para aprovação: M = M P + (N t .
M P
8 )
Condição para aprovação: M ≥ 5,0
http://www.feis.unesp.br/#!/departamentos/fisica-e-quimica/docentes/relacao-de-docentes/joao-m-m-cordeiro/material-didatico/bioquímica/
Sugestão: http://www.youtube.com/watch?v=RrqjSSgbwIQ
http://revistaepoca.globo.com/Revista/Epoca/0,,EMI247981-15230,00.htm
1. Aspectos importantes da química orgânica
Todas as substâncias que vamos estudar são substâncias moleculares.
Átomos: núcleo positivo (prótons + nêutrons) eletrosfera negativa (elétrons)
O núcleo é extremamente pequeno comparativamente ao tamanho da eletrosfera
A maior parte da massa do átomo está no núcleo (prótons e nêutrons têm massa 2.000 me-)
Para se identificar um átomo é necessário conhecer o:no atômico Z no de prótons no núcleo = no de elétrons na eletrosfera
TABELA PERIÓDICA
A formação das moléculas se deve à distribuição dos elétrons pela eletrosfera dos átomos.
Distribuição eletrônica
Os elétrons que circulam o núcleo não têm todos a mesma energia. É conveniente então dividir os elétrons nos grupos de energia (níveis energéticos). O primeiro nível (de menor energia), contém, no máximo, dois elétrons. O segundo nível contém, no máximo, 8 elétrons, o terceiro nível, 18 elétrons e o quarto 32.
Dentro dos níveis energéticos há subníveis, que definem a localização dos elétrons (orbitais). Os orbitais tem uma
Elétrons de valência
Em função das moléculas que estudamos em bioquímica há um conjunto de átomos da TP q são mais a fim com a matéria. Quais são eles?
C, N, O, H, S, etc
Distribuição eletrônica no carbono: Z=6
Como o 1º nível pode ter no máximo 2 elétrons e o segundo 8, os elétrons do carbono ocuparão dois níveis. O nível 2 tem dois subníveis.
1s2
2s2 2p2
O subnível p tem 3 orbitais (regiões do espaço ocupadas pelos elétrons).
Os orbitais tem uma certa geometria (estão distribuidos espacialmente de uma forma determinada.
Os orbitais p são perpendiculares entre sí – px, py, pz.
O que importa na distribuição eletrônica são os elétrons de valência – os elétrons mais externos na distribuição eletrônica.
Ligação Covalente
Conceito chave: compartilhamento de elétrons entre os átomos.
As moléculas tem uma determinada geometria.
A geometria das moléculas é consequência da geometria dos orbitais atômicos em que se encontram os elétrons que participam da ligação covalente.
Caso 1 – molécula de H2SCaso 2 – molécula de H2O
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