Bioestatística Aula 1 -...

BioestatísticaAula 1

Anderson Castro Soares de Oliveira

Anderson Bioestatística 1 / 57

Apresentação do CursoOs conteúdos estarão disponíveis no sitewww.andersoncso.webnode.com.brSerão realizadas 3 avaliações: duas avaliações escritas e um se-minário, sendo:

Avaliação PesoAvaliação Escrita 1 0,35Avaliação Escrita 2 0,35

Seminário 0,30

Programa das aulasIntrodução a estatística - Noções básicas: população, amostra,tipos de variáveisIntrodução o planejamento de pesquisa: hipótese, planejamento,observações, análise e conclusões.Construção de tabelas e gráficosMedidas de Posição e DispersãoNoções de ProbabilidadeConceito de variáveis aleatórias discreta e continuaDistribuições de probabilidade: Binomial, Normal, t-student, Qui-quadrado e F-SnedecorAmostragem: plano amostralPrincipais tipos de amostragem: Amostragem Aleatória Simples,Amostragem Estratificada, Amostragem por ConglomeradoCalculo do tamanho de amostra

Programa das aulasPrincípios de Estimação: Estatísticas e ParâmetroIntervalos de confiança para a média, proporção, diferença entreduas médias e diferença entre duas proporçõesTeste de hipótese: Procedimento Geral do Teste de Hipóteses;Testes para a média; Testes para a proporção.Regressão: definição; estimativa de parâmetros; fontes de varia-ção na Análise de Regressão; critérios para a seleção de modelos.Medidas de associação: teste de hipóteses de associaçãoTipos de estudos epidemiológicos: Estudo de prevalência, Estudocaso-controle e Estudo de coorteMedidas de efeito (Medidas de risco): Razão de Prevalência, Ra-zão de chance (odds ratio) e Risco Relativo.

Bibliografias

BERQUÓ E.S.; SOUZA J.M.P.; GOTLIEB S.L.D. Bioestatística.EPU. São Paulo, 1984.CALLEGARI-JACQUES, S. M. Bioestatística: princípios e aplica-ções. Porto Alegre: Artmed, c2003. 255 p.MOTTA, V. T. Bioestatística. 2. ed. Caxias do Sul: EDUCS, 2006.190 p.PAGANO, M.; GAUVREAU, K. Princípios de Bioestatística. 1. ed.São Paulo: Cengage Learning, 2004. xv, 506 p.PETRIE, A. Estatística em ciência animal e veterinária. São Paulo:Ed. Roca. 2009, 248p.SAMPAIO, I.B.M. Estatística aplicada à experimentação animal.3a. ed. Belo Horizonte: Editora da UFMG. 2007, 265p.

Sites importantesR - www.cran.r-project.org.

O que é EstatísticaA palavra estatística vem do latim STATUS - que significa estado.Estatística é um conjunto de conceitos e métodos científicos paracoleta, organização, descrição, análise e interpretação de dadosexperimentais, que permitem conclusões válidas e tomadas de de-cisões razoáveis.

Utilização EstatísticaA utilização da Estatística é cada vez mais acentuada em qualqueratividade profissional.Nos seus diversificados ramos de atuação, as pessoas estão fre-quentemente expostas à Estatística, utilizando-a com maior oumenor intensidade.Pak & OH (2010) a fizeram um levantamento de 129 do Journal ofVeterinary Clinics no periodo de 2006 a 2007.

I 94 dos artigos tinham estatísticaI 66 dos artigos tinham erros na estatística utilizada

aPak & OH (2010). Statistical Issues in the Articles Published in the Journalof Veterinary Clinics. Journal of Veterinary Clinics 27(2) : 170-174

Abusos da EstatísticaSão muitos os abusos da estatística, quando os dados são apre-sentados de forma enganosa.Há três tipos de mentira: as mentiras, as mentiras sérias e a esta-tística. (Benjamin Disraeli)Algumas pessoas usam a estatística "como um bêbado utilizaum poste de iluminação - para servir de apoio e não para ilumi-nar"(Andrew Lang)"É fácil mentir com estatística, difícil é dizer a verdade semela"(Darrell Huff no livro Como Mentir com Estatística)

Ramificações da estatísticaEstatística descritiva - tem por objetivo organizar, apresentar e sin-tetizar dados observados de determinada população por meio detabelas, gráficos e medidas descritivas, sem pretenções de tirarconclusões de caráter extensivo.Estatística Inferencial - Métodos que tornam possível a estima-ção de características de uma população baseada nos resultadosamostrais no intuito de tirar conclusões.

Ramificações da estatística

Estatística

ww ''Descrevendo

��%%

FazendoInferências

�� %%Gráficose

Tabelas

Resumosnuméricos

EstimandoParâmetros

Testandohipóteses

Conceitos BásicosPopulação (N) - Conjunto de todos os elementos relativos a umdeterminado fenômeno que possuem pelo menos uma caracterís-tica em comum, a população é o conjunto Universo.Amostra (n) - um subconjunto da população, a amostra deve serselecionada seguindo regras e deve ser representativa, de modoque ela represente todas as características da população como sefosse uma fotografia desta.

Conceitos BásicosCenso - atividade de inspecionar (observar) todos os elementosde uma população, com o objetivo de conhecer, com certeza suascaracterísticas;Amostragem - É o processo de formação de informações dos"n"elementos amostrais, no qual deve seguir um método criteriosoe adequado (tipos de amostragem).

Conceitos BásicosVariável: é toda característica que, quando observada, pode variarde um indivíduo para outro e podendo assumir valores numéricosou não-numéricos.Definir bem as variáveis de interesse é muito importante, pois es-sas vão determinar o tipo de análise estatística.Pode-se classificar as varáveis para o estudo estatísticos em Qua-litativas e Quantitativas

Variáveis QualitativasVariáveis Qualitativas (ou categóricas) - são as características quenão possuem valores quantitativos, mas, ao contrário, são defini-das por várias categorias, ou seja, representam uma classificaçãodos indivíduos

I Variáveis nominais: não existe ordenação dentre as categorias.Exemplos: sexo, Cor, Raça,Procedência, doente/sadio, etc.

I Variáveis ordinais: existe uma ordenação entre as categorias.Exemplos: Classificação quanto a porte (grande, médio, pequeno),estágio da doença (inicial, intermediário, terminal), mês de observa-ção (janeiro, fevereiro,..., dezembro).

Variáveis QuantitativasVariáveis Quantitativas - são variáveis que podem ser medidas emuma escala quantitativa, ou seja, apresentam valores numéricos

I Variáveis discretas: são aquelas variáveis que pode assumir so-mente valores inteiros num conjunto de valores. É gerada pelo pro-cesso de contagemExemplos: número de filhos, números de placas com a bactérias,Número de análises realizadas pelo laboratório

I Variáveis contínuas: são aquelas variáveis que podem assumir umvalor dentro de um intervalo de valores. É gerada pelo processo demediçãoExemplos: pressão arterial, peso de animais; volume de gás produ-zido por um biodigestor; etc

Método Científico

Formulaçãode

hipóteses

��Desenvolvimento

da Teoria

Obtenção dasobservações

nnTeste dashipóteses

Método CientíficoTodo estudo estatístico pode ser decomposto em pelo menos duasfases:

I Reunião ou coleta dos dados estatísticosI Análise e interpretação de dados.

A coleta de dados pode ser realizada de duas formasI estudo observacional - por simples observação dos fenômenos em

que se tem interesse - ;I estudo experimental - por experimentação, ou seja, provocando-se

voluntariamente a aparição de certos fenômenos controlados

Método CientíficoAs pessoas tentam solucionar uma vasta gama de problemas utili-zando o pensamento estatístico.

I Agricultura (qual variedade cresce melhor ?)I Economia (como estão mudando os padrões de vida ?)I Pesca (as cotas atuais de peixe, impostas à indústria pesqueira

são apropriadas ?)I Psicologia (como estão relacionadas a timidez e a solidão ?)I Meteorologia (o aquecimento global é uma realidade ?)

Planejamento da PesquisaO que é uma pesquisa?

I Processo de investigação científica com o objetivo de comprovar oucontestar uma teoria;

I Uma forma do Pesquisador tentar compreender um fenômeno, atra-vés de um processo lógico de investigação

O planejamento e a execução de uma pesquisa fazem parte de umprocesso sistematizado que compreende várias etapas

Etapas do planejamento de uma pesquisa1) Escolha do tema;

I Qual o meu interesse?I O que vou pesquisa?

2) Revisão de literatura;I O que já foi publicado sobre o tema?

3) Justificativa;I Por que estudar o tema?

4) Formulação do problema/hipóteses;I O que resta de dúvida sobre o tema?I O que ainda está em aberto?

5) determinação de objetivos;I O que pretendo alcançar?

Etapas do planejamento de uma pesquisa6) Metodologia;

I Como se procederá a pesquisa?I Quais os métodos para obtenção dos resultados?

7) Resultados e Impactos Esperados;I Quais as possíveis implicações?I Como será a divulgação e a disseminação do conhecimento (artigo

científico, dissertação ou tese)?

Pesquisa Quantitativa × QualitativaUma vez definido o tema da pesquisa, deve-se escolher entre rea-lizar uma pesquisa qualitativa ou uma quantitativa.A pesquisa qualitativa é caracterizada por ser exploratória, e é uti-lizada quando se busca percepções e entendimento sobre a natu-reza geral de uma questão, abrindo espaço para a interpretação.Ela não depende de análise estatística para suas inferências.Tipos de pesquisa qualitativa

I Estudo de CasoI Observação participante

Pesquisa Quantitativa × QualitativaA pesquisa quantitativa é um estudo estatístico que se destina adescrever as características de uma determinada situação, me-dindo numericamente as hipóteses levantadas a respeito de umproblema de pesquisa.O pesquisador deve possuir um conhecimento razoável de estatís-tica para desenvolver uma pesquisa quantitativa ou, então, consul-tar um estatístico para auxiliá-lo

Pesquisa EstatísticaUma pesquisa estatística consiste em um trabalho de identifica-ção, reunião, tratamento, análise e apresentação de informações(dados) para atender uma certa demandaA realização de uma pesquisa estatística envolve a coleta e o re-sumo de informações das características de interesse de unidadesde uma população, com o objetivo de estimar características dapopulação e testar hipóteses.

Pesquisa EstatísticaNo planejamento da pesquisa estatística deve-se definir:

I População alvoI Variáveis e a forma de coleta de dadosI Métodos para resumo e análise dos dados.

Definição da População de PesquisaUma parte importante do delineamento de qualquer pesquisa é adefinição da populaçãoA definição da população dependerá obviamente dos objetivos dapesquisa, das características a mensurar, dos recursos disponí-veis.População alvo: população para a qual se deseja obter informaçãoPopulação de pesquisa: população realmente coberta pela pes-quisa

I Pequisas:Estatísticas do Febre Aftosa em Mato GrossoI População alvo: Bovinos das propriedades rurais do Estado de Mato

Grosso.I População de pesquisa: Bovinos das propriedades rurais do Estado

de Mato Grosso que participam do programa de vacinação.

Definição das VariáveisAo estudar um determinado fenômeno é necessário determinar ascaracterísticas quer serão analisadas: as variáveisAs variáveis são características que podem ser observadas ou me-didas em cada elemento pesquisado.As hipóteses serão formuladas no estudo a partir da definição dasvariáveisA mesma variável pode ser mensurada de diversas formas, le-vando a diferentes conclusões, assim deve-se definir:

I nível de mensuração - o quanto de informação cada variável apre-senta e se ela será qualititiva ou quantitiva

I nível de manipulação - como uma variável relaciona e com as outrasno estudo

Definição da Coleta dos DadosHá duas formas básicas de coletar os dados: por censo ou amos-tragemAlém da decisão por censo ou amostragem deve-se decidir se seráutilizado dados primários ou secundários.

I dados primários: são aqueles coletados pela primeira vez pelo pes-quisador;

I dados secundários: são dados existentes, coletados por outros pes-quisadores e disponíveis em relatórios ou publicações.

Outro ponto importante é a definição dos instrumentos de coletade dados

Definição da Coleta dos DadosOs instrumento de coleta de dados são as ferramentas que permi-tirão a coleta, o levantamento de dados, a produção de informa-ções.Os métodos de obtenção das informações são os mais diversos edependem de vários fatores, sendo os principais o objeto de es-tudo, o fenômeno a ser estudado e o alcance que se pretendeOs instrumentos podem ser questionários, experimentos ou obser-vações.

QuestionárioO questionário constitui-se num instrumento muito utilizado no pro-cesso de obtenção/coleta de informações.A elaboração de um questionário baseia-se em experiências ante-riores e no bom senso:É importante a realização de pré-teste do questionário e demaisinstrumentos de coleta;Ao aplicar um questionário pode-se cometer dois tipos de erros:

I Devido ao questionário: Tamanho, ordem da perguntas, redaçãodas perguntas, utilização de conceitos incorretos ou desatualizados.

I Devido ao entrevistador: Características do entrevistador, ansie-dade, registro incorreto das respostas;

Tipos de delineamento de pesquisaExistem várias formas se delinear uma pesquisa, estas diferem naforma como se obtem os dados.Podem-se definir dois tipos de estudos: experimentais e observa-cionais.Em um estudo observacional, observamos e medimos caracterís-ticas específicas, mas não tentamos modificar os sujeitos objetodo estudo.Em um experimento, aplicamos algum tratamento e passamos, en-tão, a observar seu efeito sobre os sujeitos. (Os sujeitos do expe-rimento são chamados unidades experimentais).

Fontes de Dados EstatísticosFontes de dados estatísticos referem-se às obras que divulgamdados quantitativos, numéricos, resultantes de compilações feitasde maneira sistemática, com periodicidade determinada, voltadasa informações comerciais, administrativas, científicas, industriais,entre outras.As fontes que divulgam dados estatísticos e podem ser diversos:Anuários Estatísticos, Relatórios Anuais, Bases de Dados, etc.

Fontes de Dados EstatísticosBases de dados:

I IBGE http://www.sidra.ibge.gov.br/I Organização Mundial de Sanidade Animal - http://www.oie.intI Panaftosa - www.panaftosa.org.br

O que é o R?R é uma linguagem e ambiente para computação estatística e gráficos,desenvolvido por Robert Gentleman e Ross Ihaka do Departamento deEstatística da Universidade de Auckland em Nova Zelândia

Robert Gentleman Ross Ihaka

O que é o R?Para entender o R é necessário saber que trata-se de uma lingua-gem;O R é compatível com quase todos os sistemas operacionais;O R é um programa com pouca interatividade.

Instalando o RA instalação do R pode ser feita através do sitehttp://cran.r-project.org/.Primeiro deve selecionar o sistema operacional: Linux, Mac ouWindows

Instalando o RPara Windows selecione o menu base que irá aparecer o link paradescarregar o instalador no computador.

Instalando o RNo instalador existem duas versões do R 32 e 64 bits.Se o sistema operacional for de 32 bits apenas a primeira versãoé instaladaSe o sistema operacional for de 64 bits as duas versões são insta-ladas.Após o término do download, comece a instalação selecionando oidioma e clique em Ok

Nas demais telas basta escolher a opção Avançar

Instalando o RQuando chegar na tela Selecionar componentes verifique sea opção Message translation está marcada.

Nas demais telas basta escolher a opção AvançarAnderson Bioestatística 40 / 57

Usando o RNo Windows o R apresenta uma interface gráfica com barra deferramentas no topo;Essa interface apresenta o Console e Script.Console onde se executam os comandosScript é um arquivo, onde você digita todas as análises e coman-dosPara executar os comandos digitados no script, seleciona-se otexto ou linhas de interesse e utiliza-se as teclas CTRL+R ou F5.

Instalando Pacotes no RO R em geral é instalado apenas as configurações mínimas paraseu funcionamento básico são instaladas (pacote base);Para realizar tarefas mais complicadas pode ser necessário insta-lar pacotes adicionais (packages ou library);A lista de todos os pacotes podem ser encontrados no sitehttp://cran.r-project.org/.Para instalar um pacote, deve estar conectado a internet, assim:

I Vá na barra de ferramentas Pacotes em seguida emInstalar pacote(s);

I Em seguida irá abrir uma janela de espelho do CRAN (base depacotes).

I Escolhido o espelho do qual irá baixar o pacote, irá aparecer umalista de pacotes, assim escolhe qual quer instalar.

Instalando Pacotes no RVá na barra de ferramentas Pacotes em seguida emInstalar pacote(s);

Instalando Pacotes no REm seguida irá abrir uma janela de espelho do CRAN (base depacotes).

Instalando Pacotes no REscolhido o espelho do qual irá baixar o pacote, irá aparecer umalista de pacotes, assim escolhe qual quer instalar.

Utilizando um Pacote InstaladoVá na barra de ferramentas Pacotes em seguida emCarregar pacote(s);

Utilizando um Pacote InstaladoIrá aparecer uma lista de pacotes instalados no seu computador,assim basta escolher qual irá utilizar.

Ajuda e Documentaçãosistema de ajuda;ajuda online;manuais e publicações eletrônicas trabalho sob a forma de livros,etc.

Sistema de ajudaO sistema de ajuda é uma coleção de páginas de manual quedescreve cada função para o usuário.Quando é instalado R é criado um diretório de ajuda", que constaalguns manuais básicos e manuais para os pacotes instaladosNa barra de ferramentas Ajuda em seguida em Ajuda Html;

Sistema de ajudaPara ver a ajuda relativa a uma basta utilizar os comandos:help("função")?função no lugar de função coloca-se o nomeda função que ser quer ajuda,ajuda sobre a média, utiliza-se help("mean")

Para ver informações relativa a um pacote utiliza-se o comandohelp(package ="nome pacote")

Ajuda on lineA ajuda online possui diversas informações relativos a funções eperguntas relativas a utilização do R.Para ver ajuda on line deve estar conectado a internet e utilizar ocomando: RSiteSearch("nome de algo pra ajuda")

Para obter ajuda on line sobre a média, utiliza-seRSiteSearch("mean")

ManuaisDocumentação mais completa está disponível por via electrônicaa partir da coleção dos manuais na pagina

http://CRAN.R-project.org/manuals.html

Ajuda on lineA ajuda online possui diversas informações relativos a funções eperguntas relativas a utilização do R.Para ver ajuda on line deve estar conectado a internet e utilizar ocomando: RSiteSearch("nome de algo pra ajuda")

Para obter ajuda on line sobre a média, utiliza-seRSiteSearch("mean")

ManuaisDocumentação mais completa está disponível por via electrônicaa partir da coleção dos manuais na pagina

http://CRAN.R-project.org/manuals.html

R CommanderO R Commander é um pacote complementar para o software es-tatístico R com interface gráfica.Para utilizar o R Commander é necessário carregar o pacoteRcmdr

R CommanderExistem vários menus na parte superior da janela doR Commander:

I Arquivo - para carregar e salvar arquivos de script, para salvar asaída do espaço de trabalho e R, e para sair;

I Editar - para editar o conteúdo do script e janelas de saída (Recor-tar, Copiar, Colar, etc);

I Dados - contem submenus com os itens do menu para leitura emanipulação de dados;

I Estatísticas - contem submenus com itens para uma variedade deanálises estatísticas;

I Gráficos - para criar simples gráficos estatísticos;I Modelos - para a obtenção de resumos numéricos, intervalos de

confiança, hipótese testes, diagnósticos e gráficos para um modeloestatístico;

I Distribuições - contém submenus relacionados com as distribui-ções de probabilidade;

I Ferramentas - para carregar pacotes R alheios ao pacote Rcmdr, epara a fixação algumas opções;

I Ajuda - para obter informações sobre o R Commander (incluindo omanual).

Carregando um Plug in(s)Muitos pacotes estão sendo desenvolvidos para integrar oR Commander, estes pacotes são chamados de Plug in(s).Para carregar um plug in utiliza-se o menu Ferramentas

I Ferramentas⇒ Carregar plug in(s) do RcmdrI Em seguida escolhe-se o plug in.

Importar Arquivo de DadosPara importar um arquivo de dados utiliza-se o menu: Dados

I Dados⇒ importar arquivos de dadosI Posteriormente escolhe o programa de onde os dados serão

importados

Importar Arquivo de DadosPara importar um arquivo de dados utiliza-se o menu: Dados

I Dados⇒ importar arquivos de dadosI Posteriormente escolhe o programa de onde os dados serão

importados

Importar Arquivo de DadosEm seguida escolhe um nome para o conjunto de dados a serimportado:

Depois escolhe o diretório e o arquivo que deseja importar.

Manipulando DadosVárias manipulações de dados podem ser feitas através do MenuDados

I Dados⇒Modificação de variáveis no conjunto de dados

Bioestatística Aula 1 -...

Documents

Transcript of Bioestatística Aula 1 -...

A estatística nas investigações cientificas em saúde: usos e abusos Ronir Raggio Luiz Instituto de Estudos em Saúde Coletiva (IESC/UFRJ) Faculdade de Medicina.

Bioestatística para iniciantes

Bioestatística - Resumos.net · Inferência estatística sobre a diferença entre os valores médios de duas populações que há evidência [O que é equivalente a perguntar se

Bioestatística quantitativa aplicada

Estatística descritiva básica: Medidas de associação · Estatística Descritiva. Universidade Federal da Bahia, Instituto ... Slides da disciplina CE701 – Bioestatística Avançada

Bioestatística residência

Abusos No Discipulado

Disciplina: Introdução á Bioestatística

Apostila de Bioestatística

Princípios de Bioestatística Inferência Estatística ...edna/pgf/PBio-Aula08.pdf · Aula 8 : Intervalos de Confiança para Média e Proporção. ... Cálculo do Tamanho da Amostra

Bioestatística - Padovani

UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS ... - tede.ufam.edu.br§ão... · Ao Departamento de Estatística, ao Laboratório de Bioestatística da UFAM, à Prof. Dra. Maria Ivanilde Silva

Bioestatística Maurício Cagy Depto. de Epidemiologia e Bioestatística Instituto de Saúde da Comunidade.

Asma Ocupacional FUNDAMENTOS DE MODELAÇÃO ESTATÍSTICA 22112 Mestrado em Bioestatística e Biometria Docente: Professora Teresa Oliveira Aluno: Fernando.

Artigo de Bioestatística

SEÇÃO DE BIOESTATÍSTICA METANÁLISE: UM GUIA PRÁTICO · SEÇÃO DE BIOESTATÍSTICA 1. Departamento de Estatística, Instituto de Matemática, Universidade Federal do Rio Grande

Aual i bioestatística

Bioestatística introdução

Narrativas e Abusos.

Introdução à Bioestatística