Departamento de Genética DEPARTAMENTO DE GENÉTICA: perspectivas.

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Departamento de Genética

DEPARTAMENTO DE GENÉTICA:perspectivas

DEPARTAMENTO DE GENÉTICA

Unidade de Citogenética

Unidade de Genética Médica

Unidade de Genética Molecular

Unidade de Bioquímica

Genética

Unidade de Investigação e

Desenvolvimento

Núcleo deApoio

Departamento de Genética

Núcleo de Apoio

• Articulação com as assessorias de apoio técnico especializado

• Gestão de recursos humanos do Departamento

• Gestão do plafond financeiro atribuído ao departamento

• Melhoria contínua da qualidade

• Registo de bases de dados

• Colaboração com o site do INSA, coordenação da formação (…)

• Apoio administrativo e laboratorial (…)

Funções:

Departamento de Genética

Recursos Humanos

Recursos humanos por carreira

Auxiliar7%

Administrativa6%

Enfermagem2%

Técnico de diagnóstico e terapêutica

20%

Técnica Superior de Saúde+Técnica

superior25%

Médica Hospitalar4%

Investigação Cientifica

6%Bolseiros, estagiários

e voluntários30%

Distribuição por carreira e área geográfica

05

101520253035

InvestigaçãoCientifica

MédicaHospitalar

TécnicaSuperior de

Saúde+Técnicasuperior

Enfermagem Técnico dediagnóstico eterapêutica

Administrativa Auxiliar Bolseiros,estagiários evoluntários

Lisboa Porto

Departamento de Genética

Genética Médica-Patologia genética-Diagnóstico pré-natal,…

Nutrição Psicologia Assistente Social

Enfermagem

Unidade de Genética Médica

Unidade de Genética MédicaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Citogenética clássica:cariotipos Hibridação in situ

(FISH)

Hibridação Genómica Comparativa (CGH)

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X

Ex.: Trissomia 21

MLPA

Unidade de Citogenética Alterações cromossómicas: da convencional à molecular

Departamento de Genética

Unidade de CitogenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Unidade de Citogenética Oferta de serviços

Departamento de Genética

• Estudo cromossómico na população e no feto (DPN cromossómico);

• Estudo cromossómico de neoplasias (tumores sólidos e doenças hematológicas malignas);

• Análise molecular rápida de aneuploidias permite uma tomada de decisão terapêutica mais precoce;

• Estudos por hibridação in situ (FISH) contribuem para uma caracterização mais precisa em muitos casos de anomalia citogenética constitucional e oncológica.

Unidade de CitogenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

1 - Realizar testes genéticos de base molecular em diferentes doenças genéticas, no período pré-natal e pós-natal; Testes de diagnóstico, preditivos e de rastreio populacional

2 – Participação em programas de avaliação externa da qualidade laboratorial, prestação de assessoria científica e técnica

3 – Participação em actividade de formação e disseminação da cultura científica

4 – Implementação/manutenção da certificação de qualidade e acreditação dos ensaios laboratoriais

5 - Valorização científica dos resultados dos testes genéticos em conjugação com outras Unidades do DG, predominantemente com a I&D

Objectivos / Missão

Unidade de Genética Molecular

Departamento de Genética

Unidade de Genética MolecularFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Cancro da mama Cancro do cólonDiferenciação sexual e Inf. masculinaDoenças hemorrágicas hereditárias Doenças priónicasFactores genéticos de risco trombóticoFibrose quísticaHemocromatoseHemoglobinopatiasMalignidade hematológicaNeuroblastomaSíndrome de Lowe e doença de NorrieSíndrome de imunodef. por hiper IgMTrombofilias hereditárias,…

PortoLisboa

Atrofia muscular espinhalCardiomiopatiasDistrofias muscularesDeterminação de zigotiaHipertermia malignaHipotiroidismo congénitoMiopatias congénitasNeuropatiasAtraso mental ligado ao cromossoma XRastreio rápido de aneuploidiasSínd. Schwachman-Bodian-DiamondSínd. de Gilbert e de Crigler-NajjarSínd.de Cornélia de Lange,…

Departamento de Genética

Unidade de Genética MolecularFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Unidade de Genética Molecular

PortoLisboa

Departamento de Genética

Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da missão: Prestação de Serviços

Doenças Hereditárias do Metabolismo (DHM)

lisossomal peroxissomal energético intermediário

Mucopolis-sacaridoses

Biogénese Défices da cadeia

respiratória mitocondrialAminoacidopatias

Oligos-sacaridoses

Défice enzimático ou de

proteínaGlicogenoses

Acidúrias orgânicas e défices da beta-oxidação

Esfingo-lipidoses

Défices da glicosilação

LipidosesDéfices da biosíntese do

colesterol

Défices do metabolismo dos neurotransmissores

Caracterização genotípica, haplotipica e fenotípica

Rastreio neonatal para terapêutica de restrição dietética

Diagnóstico pós-natal para terapêutica de suplementação enzimática

Estabelecimento de repositório de linhas celulares de DHM

Unidade de Bioquímica Genética

Departamento de Genética

Laboratório de Proteómica

Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da Missão: Prestação de serviços

(em implementação)

IP: Deborah Penque

Laboratório de Proteómica

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

InvestigaçãoInvestigação

• Doenças Crónicas Pulmonares (Fibrose quística, Asma, DPOC) (Projectos FCT: POCTI/MGI/40878/2001, POCI/ESP/44720/2002, POCTI/SAU-MMO/56163/2004))

• Doenças Hepáticas (Projecto APDF, Projecto FCT: POCTI/SAU-IMI/55112/2004 )

• Colabora em outros projectos (externos/internos ao INSA)

Serviços (em implementação)Serviços (em implementação)

• Análise de proteínas por gel 2D

• Identificação de proteínas por MALDI/TOF/TOF

• Diagnóstico/Prognóstico de doenças pela proteómica (Projecto QCAIII, Saude XXI/2005)

Modelos biológicos

Linhas celulares

Plataforma TecnológicaPlataforma TecnológicaPlataforma TecnológicaPlataforma Tecnológica

Soro/plasma

Fibrose Quística, Asma, DPOC

Sistema

respiratório

Identificar proteínas diferencialmente expressas nestas doenças como potenciais biomarcadores de diagnóstico/prognóstico ou alvos terapêuticos alternativos

Identificar proteínas diferencialmente expressas nestas doenças como potenciais biomarcadores de diagnóstico/prognóstico ou alvos terapêuticos alternativos

Geís 2D/ MSGeís 2D/ MS SELDI-TOFSELDI-TOF LC/MSLC/MS

Modelos animais

Material biológico nativo

Departamento de Genética

Estratégias utilizadas no Estudo de Doenças Pulmonares Crónicas pela Proteómica

Unidade de Bioquímica GenéticaFunção para cumprimento da Missão: Prestação de serviços

(em implementação)

Unidade de Investigação e Desenvolvimento (I&D)

Departamento de Genética

• Compreender a acção dos genes, as interacções entre si e com o ambiente, como se expressam e regulam e como contribuem para a variação fenotípica normal e patológica.

• Estabelecer correlações genótipo/fenótipo, visando descobrir novos biomarcadores com potencial valor diagnóstico, prognóstico ou terapêutico e proceder à respectiva validação analítica e clínica.

• Esclarecer os mecanismos moleculares e celulares do cancro, assim como os efeitos genotóxicos associados à exposição ambiental, ocupacional ou acidental a agentes físicos, químicos e biológicos.

• Estudar a genética da susceptibilidade a doenças frequentes.

• Realizar estudos de epidemiologia genética nas populações residentes em Portugal ou outras populações de interesse.

• Identificar e priorizar necessidades de I&D em genética, de acordo com as prioridades estratégicas nacionais e internacionais.

Unidade de Investigação e DesenvolvimentoFunção para cumprimento da missão: Laboratório de Estado

• Estabelecimento de plataformas instrumentais de análise multiplex e mecanismos analíticos recorrendo a nanotecnologias

• Aplicação de inteligência artificial na gestão do processo analítico e no diagnóstico diferencial

• Genotipar SNP para identificação do Varioma humano nas doenças hereditárias do metabolismo – contribuição para o registo e criação de bases de dados de nível global e de consulta universal

• Metabolómica na identificação de biomarcadores em fluidos fisiológicos humanos

• Proteómica na identificação de proteínas, modificações pós-translacionais, análise de péptidos e moléculas, no estabelecimento de mecanismos patofisiológicos em modelos in vitro (culturas celulares)

• Estudo da disfunção celular na etiologia das formas variantes ou atípicas versus formas clássicas das doenças

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da missão: Laboratório de Estado

IP: Lucia Lacerda

Doenças Hereditárias do Metabolismo

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Estudo dos mecanismos fisiopatológicos primários e secundários de doenças lisossomais de sobrecarga (DLS)

Departamento de Genética

IP: Sandra Alves

Substrato

Produtos

1

2

Resultados:• Caracterização das variações genéticas causais de DLS na população portuguesa: Mucopolissacaridoses tipo II, IIIA, IIIB e IIIC, Mucolipidoses II e III, Sialidose e Galactosialidose;• Impacto das mutações encontradas ao nível do RNA mensageiro e na estrutura e função da proteína;• Correlações genótipo-fenótipo;• Desenvolvimento de métodos analíticos para detecção de alelos mutantes com vista à implementação de estratégias de diagnóstico molecular (Ex: diagnóstico pré-natal molecular e rastreio de portadores nas famílias em risco).

Bases celulares e bioquímicas das doenças de sobrecarga lisossomais 1. Enzima lisossomal com actividade catalítica reduzida ou mesmo nula.2. Falhas no transporte de enzimas lisossomais do complexo de Golgi para o lisossoma.

Objectivo: Estudar os factores genéticos que afectam a formação e/ou transporte de enzimas lisossomais – estudos moleculares, bioquímicos e funcionais

Alves S et al. (2006) J Inherit Metab Dis, 29:743-54.

Mangas M et al. (2008) Clin Genet, 73:251-6.

Coutinho MF et al.(2008) Clin Genet, 74:194-5.

Investigação em doenças raras: Doenças lisossomais de sobrecarga

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Olga Amaral

Dvir et al; Premkumar et al

Mutações com origens comuns em doenças raras? Fundadores portugueses?

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Portugal

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Objectivo: >compreender mecanismos patogénicos > potencial para novas abordagens > melhorar a capacidade de prognóstico e de resposta

• Caracterizar as mutações encontradas nos genes dos doentes e a disfunção proteica originada• Epidemiologia genética

Investigar as disfunções a nível proteico

Esclarecer mecanismos patológicos e permitir prever as consequências fenotípicas

Frisch et al, 2004 ; Diaz et al, 2000 e 1999; Colombo, 2000 ; Amaral et al, 1997, 1999 e 2000; Marí et al, 2001

Investigação na Lipofuscinose Ceróide Neuronal

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Maria Gil Ribeiro

COPII

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CLN1/ CLN2/ CLN5/ CLN7/ CLN10

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CLN2/ CLN3/ CLN6/ CLN5/ CLN8LR

Grupo de doenças genéticas neurodegenerativas progressivas e fatais que apresentam semelhanças clínicas e patológicas (acumulação de um lipopigmento no lisossoma)

Estas doenças estão associadas a 8 proteínas (lisossomais e não lisossomais) com função celular desconhecida

Estudo dos mecanismos moleculares patogénicos primários e análise funcional:

Caracterização de mutações e estudos de expressão génica ao nível do RNA e proteína (processamento, modificações pós-traducionais, localização, tráfego intracelular e interacção com outras proteínas CLN)

Bessa et al. (2008) Mol Genet Metab 93:67-73

Identificação de alterações moleculares secundárias (ao nível da transdução de sinal mediada por lípidos) com importância fisiopatológica e/ou terapêutica

Teixeira et al. (2006) Biochim Biophys Acta 1762:637-646

Objectivo:

Ferramentas:- Análise in silico- PCR, RT-PCR, qRT-PCR, Sequenciação- Silenciamento de genes (RNAi)- Análise por Western blot- Imunocitoquímica- Análise lípidos (TLC e microscopia de fluorescência) - Análogos lipídicos fluorescentes

Golgi

Endosomes

C

CLN6

Grupo heterogéneo de doenças clínicas, que têm na sua origem alterações do metabolismo energético celular

autosómica recessiva autosómica dominante

X-linked maternal

esporádica

A cadeia respiratória mitocondrial é o resultado da interacção de dois genomas física e funcionalmente separados, ADN nuclear (nADN) e ADN mitocondrial (mtADN)

Estas doenças afectam pessoas em qualquer idade, com quaisquer sintomas e qualquer modo de hereditariedade

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Doenças Mitocondriais

Departamento de Genética

IP: Laura Vilarinho

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Polineuropatia Amiloidótica Familiar

Departamento de Genética

IP: Paulo Pinho e Costa

Foco

Epidemiologia PAF Outras amiloidoses hereditárias

Fisiopatologia Anemia e função renal

Novas abordagens Prevenção - DGPI Terapêutica – Ensaios Clínicos

Foco

Epidemiologia PAF Outras amiloidoses hereditárias

Fisiopatologia Anemia e função renal

Novas abordagens Prevenção - DGPI Terapêutica – Ensaios Clínicos

Investigadores Doutorados

Paulo Pinho e Costa, MD, PhD Luisa Lobato, MD, PhD

Outros Idalida Beirão, MD Luciana Moreira, MSc

Investigadores Doutorados

Paulo Pinho e Costa, MD, PhD Luisa Lobato, MD, PhD

Outros Idalida Beirão, MD Luciana Moreira, MSc

Internacionalização

U. Florença, IT P. Romagnani – Centro DENOthe

H. Univ. Charité, Berlim, DE C. Bachmann - Institut für Vegetative Anatomie

Internacionalização

U. Florença, IT P. Romagnani – Centro DENOthe

H. Univ. Charité, Berlim, DE C. Bachmann - Institut für Vegetative Anatomie

Colaborações Institucionais

Universidade do Porto UMIB – ICBAS F. Medicina

Centro Hospitalar do Porto HGSA

Colaborações Institucionais

Universidade do Porto UMIB – ICBAS F. Medicina

Centro Hospitalar do Porto HGSA

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional Numerosas comunicações em congressos

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional Numerosas comunicações em congressos

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Doenças crónicas e degenerativas de genética complexa

Departamento de Genética

IP: Paulo Pinho e Costa

Foco Doenças neurológicas, inflamatórias

e auto-imunes seleccionadas Esclerose Múltipla Epilepsia Lúpus Eritematoso Sistémico Artrite Reumatóide Dislipidemia e aterosclerose

Imunogenética MHC e extra-MHC

Biologia dos sistemas Análise de redes de interacção genética

Foco Doenças neurológicas, inflamatórias

e auto-imunes seleccionadas Esclerose Múltipla Epilepsia Lúpus Eritematoso Sistémico Artrite Reumatóide Dislipidemia e aterosclerose

Imunogenética MHC e extra-MHC

Biologia dos sistemas Análise de redes de interacção genética

Investigadores Doutorados

Berta Martins da Silva, PhD Paulo Pinho e Costa, MD, PhD

Outros Pedro Lacerda Cláudia Carvalho, MSc

Investigadores Doutorados

Berta Martins da Silva, PhD Paulo Pinho e Costa, MD, PhD

Outros Pedro Lacerda Cláudia Carvalho, MSc

Internacionalização SLE

Karolinska Institute, SE – Marta Alárcon U. Tel-Aviv, IL – Y. Schoenfeld

EM U. Cambridge, UK – Alastair Compston U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Epilepsia U. Utrecht, NL – Dick Lindhout

Bioinformática – Biologia dos sistemas U. Geneve, CH – José M Nunes, Alicia Mawas U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Internacionalização SLE

Karolinska Institute, SE – Marta Alárcon U. Tel-Aviv, IL – Y. Schoenfeld

EM U. Cambridge, UK – Alastair Compston U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Epilepsia U. Utrecht, NL – Dick Lindhout

Bioinformática – Biologia dos sistemas U. Geneve, CH – José M Nunes, Alicia Mawas U. Navarra, ES – Pablo Villoslada

Colaborações Institucionais Universidade do Porto

UMIB - ICBAS F. Farmácia

Centro Hospitalar do Porto HGSA

IGC

Colaborações Institucionais Universidade do Porto

UMIB - ICBAS F. Farmácia

Centro Hospitalar do Porto HGSA

IGC

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional 1 capítulo de livro Numerosas comunicações em congressos

Produção científica 2007-2008 3 artigos em revistas de circulação internacional 1 capítulo de livro Numerosas comunicações em congressos

Departamento de Genética

Investigação em Atraso Mental ligado ao cromossoma X

O atraso mental (AM) afecta ~2% da população mundial. Foram já identificados mais de 25 genes associados a formas de atraso mental ligado ao cromossoma X sindrómico (MRX) e não sindrómico (XLMR). Deste grupo salienta-se o gene FMR1 responsável pela Síndrome de X-Frágil e a Síndrome de ataxia e tremor (FXTAS). A maioria das formas de AM continua ainda por caracterizar molecularmente.

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Paula Jorge

OBJECTIVOS

Criação/implementação de base de dados de doentes com atraso mental

Gene FMR1:• Análise do tripleto repetitivo [CGG];• Pesquisa de outras mutações;

Gene FMR2:• Caracterização dos alelos intermédios e pré-mutados na população Portuguesa;

Identificação de outros genesIn: Hagerman PJ and Hagerman RJ (2007) Fragile X-associated tremor/ataxia syndrome—an older face of the fragile X gene, Nat Clin Pract Neurol 3: 107–112

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Objectivo: Em células eucarióticas, o processo de expressão génica envolve múltiplos passos, desde a transcrição até às modificações pós-traducionais da proteína nascente, em que os RNA mensageiros (mRNAs) são o intermediário fulcral. O pré-mRNA é transcrito a partir do DNA e processado, com excisão dos intrões e adição da estrutura cap e cauda poli(A). O mRNA maduro é então transportado para o citoplasma, onde é traduzido para proteína e finalmente degradado. Sabe-se hoje que a maioria dos passos do processo de expressão génica, se não todos, podem ser regulados, o que permite o controlo espácio-temporal da expressão génica.

A grande complexidade da expressão génica torna o processo vulnerável a erros. No entanto, existem mecanismos celulares de controlo de qualidade que asseguram a fidelidade da expressão génica.

No âmbito das nossas actividades de I&D, estamos interessados em estudar um destes mecanismos - o mecanismo de nonsense-mediated mRNA decay, e de que modo este mecanismo reflecte a complexidade da maquinaria traducional.

Estudo do mecanismo de nonsense-mediated decay (NMD) do mRNA da a-globina humana

IP: Luísa Romão

Estudo do mecanismo de nonsense-mediated decay (NMD) do mRNA da a-globina humana

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Luísa Romão

Pereira FJC, et al. (2006). Brit J Haematol, 133: 98-102. Silva AL, et al. (2006), RNA, 12: 2160-2170.

Qual o efeito da sequência e comprimento da grelha de leitura do mRNA da a-globina Qual o efeito da sequência e comprimento da grelha de leitura do mRNA da a-globina humana no mecanismo de NMD? humana no mecanismo de NMD?

Resultados:

• Mutações nonsense perto do codão de iniciação da tradução inibem o NMD do mRNA da a-globin humana.

• A inibição da re-iniciação da tradução inibe parcialmente o NMD da a-globin humana, contrariamente ao que acontece com a b-globina.

• Os transcritos da a-globina humana portadores de uma mutação nonsense na região 3’ do exão 1, escapam parcialmente ao NMD,

supostamente devido a um efeito combinado da re-iniciação da tradução e do tamanho e sequência da grelha de leitura do transcrito.

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Objectivos: Aprofundar o conhecimento sobre a fisiopatologia das hemoglobinopatias e sobre os factores genéticos moduladores dos fenótipos hematológico e clínico.

A compreensão das relações genótipo / fenótipo pode contribuir para a tomada de decisão clínica, orientação de tratamento e adopção de medidas preventivas de algumas manifestações clínicas.

Exemplo de resultados:- Os doentes drepanocíticos que co-herdem um número elevado de

repetições TA no promotor do gene UGT-1A1 têm elevada probabilidade de desenvolverem hiperbilirrubinémia e colelitíase, mesmo em idade jovem.

- Concluímos que o polimorfismo de repetição TA no promotor UGT-1A1 representa um modificar importante das manifestações clínicas desta patologia.

Referências :Martins R et al . Early modification of sickle cell disease clinical course by UDP-glucurosyltransferase 1A1 gene promoter polymorphism. Journal of Human Genetics 2008, 53:524-8.

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Estudo de factores genéticos modificadores dos fenótipos das hemoglobinopatias (talassémias e drepanocitose)

Departamento de Genética

IP: Paula Faustino

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Estudo de epidemiologia molecular, de caracterização de novas mutações e de regulação da expressão de genes associados a Hemocromatose Hereditária

Objectivos: Aprofundar o conhecimento sobre a base molecular da Hemocromatose Hereditária em Portugal, efectuar estudos funcionais de novas mutações e contribuir para o conhecimento do envolvimento da HFE no metabolismo do ferro e, quando mutada, no desenvolvimento da patologia. Pretende-se, ainda, contribuir para o conhecimento dos mecanismos envolvidos na regulação génica pós-transcricional.

Exemplo de resultados:- A análise mutacional efectuada nos genes HFE, TFR2, HJV e

HAMP, num grupo de 215 indivíduos portugueses com hemocromatose hereditária não-clássica revelou algumas mutações novas nestes genes. Apesar disso, dada a sua baixa frequência, concluiu-se que a pesquisa dessas mutações na corrente prestação de serviços laboratoriais de apoio à clínica apresenta um baixo nível custo-benefício.

Referências :Mendes A. I. et al . Non-classical hereditary hemochromatosis in Portugal: novel mutations identified in iron metabolism-related genes.Ann Hematol 2008, in press (DOI 10.1007/s00277-008-0572-y)

H63D

C282Y

Y230F

(adaptado de Fleming & Sly, 2002)

Representação esquemática da proteína HFE e localização de uma das mutações novas encontradas (Y230F)

Departamento de Genética

IP: Paula Faustino

Departamento de Genética

Sinalização em células tumorais

GrowthFactor

Receptor

ReceptorFactor

Crescimento

EG

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Ras

B-RafMEK

ERK1/2

Rasmut

BRafmut

Rac1b

adenoma carcinoma

adenoma serreado carcinoma

Via clássica de progressão tumoral

Via alternativa de progressão tumoral

Proliferação celular

Foi identificado um novo subgrupo de tumores do cólon ( ~15%) que contem uma mutação oncogénica em BRAF associada à sobre-expressão da GTPase Rac1b (Matos et al. (2008) Gastroenterology, in press). A combinação destas alterações constitui uma via de tumorigénese alternativa à via clássica do oncogéne KRAS e representa um alvo terapêutico específico para este subgrupo de tumores.

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Peter Jordan

Departamento de Genética

Toxicologia Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Maria João Silva

Projectos

Metafase mostrando uma translocação recíproca, um cromossoma dicêntrico e um fragmento acêntrico ()

• Caracterização dos efeitos mutagénicos da deficiência da poli(ADP-ribose) polimerase em ratinhos transgénicos

• Minas de urânio e seus resíduos. Efeitos genotóxicos na população e influência de polimorfismos genéticos

• Avaliação dos efeitos na saúde associados à exposição crónica a contaminantes da água com potencial genotóxico

• Exposição ambiental ao fumo do tabaco em estabelecimentos de restauração: efeitos genotóxicos e mecanismos moleculares subjacentes a doenças respiratórias

Micronúcleos em linfócitos com bloqueio da citocinese ()

Lesões no DNA evidenciadas pelo “comet assay”

Equipa 1 investigador, 1 TSS, 2 estudantes mestrado, 1 estudante doutoramento

Análise aprofundada de mutações no gene CFTR • Caracterização das mutações encontradas no gene CFTR• Estratégias para recuperar a função da CFTR mutada• Identificação de proteínas com um papel no tráfego e activação da CFTR

Análise da CFTR ao nível celular e fisiológico• Caracterização de mutações do gene CFTR (localização, tráfego e actividade)

Dase de dados para Mutações no CFTR (EuroCareCF)

Estudo do “Folding proteico” utilizando C. elegans• Produção de linhas trangénicas de nematodos (identificação de factores responsáveis pela degradação/”folding da CFTR)• Rastreios por RNAi do genoma completo• Construção de proteínas humanas quiméricas (ex. CFTR e proteínas multi-resistentes a drogas )• Identificação de ortologos humanos

Controlo de qualidade proteica• “Folding” e tráfego da proteína CFTR• Tráfego membranar• Degradação pelo proteassoma

DNA chips• Extracção, purificação e amplificação• Sensor magnético para detecção por single nucleotide polymorphism (SNP)

Ferramentas Genéticas e Moleculares-“Microarray” / análise in silico-Mutagénese-Silenciamento de genes (RNAi)-PCR & RT-PCR

Ferramentas ao nivel celular e fisiológico-Confocal e Vídeo Fluorescence Mic-Imunohistoquímica-Electrofisiologia (patch-clamp e câmaras de Ussing)

Investigação em Fibrose Quística

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

IP: Margarida Amaral

Investigação em Patologias do Desenvolvimento Sexual

Departamento de Genética

Unidade de I&DFunção para cumprimento da Missão: Laboratório de Estado

Infertilidade masculina: caracterização do padrão de metilação das regiões CpG dos genes DAZL(3p24) e DAZ(Yq11.23) em espermatozóide provenientes de homens normozoospérmicos e oligozoospérmicos.

Projectos a decorrer:

Diferenciação sexual: pesquisa de alterações moleculares no gene CYP11B1 em doentes com hiperplasia supra-renal congénita e com suspeita de deficiência em 11 beta-hidroxilase.

IP: João Gonçalves

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