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Apoio
Ferramentas de bases de dados de colecccedilotildees bioloacutegicas e dados de
observaccedilotildees
Seminaacuterio O Sistema Global de Informaccedilatildeo sobre Biodiversidade (GBIF) e a disponibilizaccedilatildeo de dados de biodiversidade da Guineacute-Bissau
Rui FigueiraNoacute Portuguecircs do GBIF
ruifigueiraisaulisboapt
bull Publicaccedilatildeo de dados atraveacutes do GBIFbull Porquecirc e como publicar dados atraveacutes do GBIFbull Padrotildees de dados e metadadosbull Artigos de dadosbull Qualidade de dados
Sumaacuterio
Motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo
Aumentar o impacto
Motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo
A disponibilidade dos dados da investigaccedilatildeo cientiacutefica decresce rapidamente com a idade
Vines Timothy H et al 2014 ldquoThe Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Agerdquo Current Biology 24 (1) 94ndash97 doi101016jcub201311014
Assegurar a preservaccedilatildeo e acessibilidade dos dados
Motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo
Aumentar a visibilidade da colecccedilatildeo bd
Motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo
Potenciar investigaccedilatildeo inovadora
Principais motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo de dados
Aumentar do impacto cientiacutefico
Aumentar a exposiccedilatildeo a niacutevel global valorizando
Facilitar a revisatildeo das colecccedilotildees por especialistas
Assegurar a preservaccedilatildeo dos dados
Responder ao interesse de comunidades especiacuteficas
Cumprir requisitos do financiador
Link para acesso aos documentos
1 Chapman A 2005 Princiacutepios e Meacutetodos da Limpeza de Dados Principles and Methods of Data Cleaning version 10 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 77 pp ISBN 87-92020-04-6
2 Hamer M Victor J Smith GF (2012) Guia de Boas Praacuteticaspara a Compilaccedilatildeo Manutenccedilatildeo e Disseminaccedilatildeo de Checklists de Espeacutecies Nacionais Best Practice Guide for Compiling Maintaining and Disseminating National Species Checklists version 10 released in October 2012 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 40 pp ISBN 87-92020-48-8
3 Frazier CK Wall J and S Grant 2008 Iniciaccedilatildeo de um projeto de digitalizaccedilatildeo de uma coleccedilatildeo Initiating a Natural History Collection Digitisation Project version 10 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 75 pp
Documentos a serem publicados proximamente
4 GBIF Sistema de Aumento de Capacitaccedilatildeo ldquoGBIF Capacity Enhancement Frameworkrdquo (httpwwwgbiforgresource80954)
5 Estrateacutegia de Comunicaccedilatildeo GBIF GBIF Communications Strategy (httpwwwgbiforgresource80926)
6 Guia de Auto-avaliaccedilatildeo para sistemas nacionais de informaccedilatildeo sobre a biodiversidade Capacity self-assessment guidelines for national biodiversity information facilities (httpwwwgbiforgresource82277)
Documentos a serem publicados proximamente
Tipos de dados de biodiversidade mediados atraveacutes do GBIF
Dados de ocorrecircncia originados por
ndash Informaccedilatildeo associada a espeacutecimes mantidos em colecccedilotildees bioloacutegicas
ndash Registos de observaccedilatildeo de espeacutecies na naturezandash Registos de ocorrecircncia com base em bibliografia
Checklists de espeacutecies e metadados associados Dados de amostragens ou inventaacuterios
O que pode ser publicado atraveacutes do GBIF
Termos definidos no Acordo de Partilha de Dadoswwwgbifptnode28
A publicaccedilatildeo de dados atraveacutes do GBIF apenas pode ser realizada por instituiccedilotildees ou organizaccedilotildees
No caso de bases de dados de colecccedilotildees assegurem o acesso agrave colecccedilatildeo
No caso de bases de dados assegurem a gestatildeo estaacutevel da mesma
Concorda em disponibilizar os dados de forma livre e gratuita definindo os termos de utilizaccedilatildeo
A publicaccedilatildeo de dados natildeo pode ser efectuada por indiviacuteduos
Quem pode publicar dados atraveacutes do GBIF
1 Solicitar o registo no GBIFa) Contactar anteriormente o Noacute Nacional que seraacute responsaacutevel pelo avalNota apenas as organizaccedilotildees podem publicar dados Os particulares devem associar-se a
uma organizaccedilatildeo2 Rever os manuais de publicaccedilatildeo de dados e seleccionar ferramentas
a) Metadados dados de ocorrecircncia e checklists taxonoacutemicas
3 Preparar os dados publicar e registar no GBIFa) Organizar dados segundo o padratildeo e publicar com Integrated Publishing Toolkit (IPT) ou com GBIF Spreadsheet Processor
O IPT permite o registo automaacutetico dos dados pelo portal de dados GBIF
Constituir-se como publicador GBIF
DadosPadronizaccedilatildeo
(DwC)Descriccedilatildeo
(metadados)
Validaccedilatildeo
Publicaccedilatildeo de dados
Publicaccedilatildeo de metadados
(Artigos de dados)
Como partilhar dados atraveacutes do GBIF
Como partilhar dados atraveacutes do GBIF
Integrated Publishing Toolkit
Padrotildees de dados e metadados
Darwin Core
Padrotildees de dados e metadados
Darwin Core ndash Esquema em estrela com suporte a vaacuterios tipos de informaccedilatildeoGermoplasma multiplas determinaccedilotildees tipos e espeacutecimes nomes comuns identificadores alternativos perfil das espeacutecies referecircncias literatura descriccedilatildeo do taxon caracteriacutesticas multimeacutedia entre outros
GMP (GBIF Metadata profile)
EML (Ecological Metadata Language) bull Dataset (Resource) bull Project bull People and Organisations bull Keyword Set (General Keywords) bull Coverage
o Taxonomic Coverage o Geographic Coverage o Temporal Coverage
bull Methods bull Intellectual Property Rights bull Additional Metadata + NCD (Natural Collections Descriptions Data) Related
Metadados
Padrotildees de dados e metadados
httpwwwgbiforgresources2561
O objetivo geral para descrever a qualidade dos dados de um registo em concreto eacute descrever a adequaccedilatildeo do registo para um uso especiacutefico que o utilizador tenha em mente para esses dados
Chrisman 1991
Uma caracteriacutestica essencial e necessaacuteria nos dados eacute a sua ldquoaptidatildeo para o usordquo
A espeacutecie ldquoArdquo estaacute na Tasmacircnia
A espeacutecie ldquoArdquo estaacute na aacuterea de Conservaccedilatildeo do Patrimoacutenio da Tasmacircnia
O que eacute
Qualidade de Dados
Qualidade de Dados
httpwwwgbiforgresources2833httpwwwgbiforgresource80924
A Cadeia de Informaccedilatildeo e Perda de Qualidade
COLHEITA PLANIFICACcedilAtildeO DOCUMENTACcedilAtildeO DIGITALIZACcedilAtildeO CONTROLO DE QUALIDADE
PUBLICACcedilAtildeO NA INTERNET
CUSTO DA CORRECcedilAtildeO DE DADOS
Planificaccedilatildeo Informaccedilatildeo incompleta - Pouca experiecircncia dos colaboradoras
- Interpretaccedilatildeo errada- Base de dados- Coacutepias
- Exportaccedilatildeo errada- Conversotildees- Uso incorrecto dos
dados
Qualidade de Dados
Formaccedilatildeo online Curso online Qualidade de Dados
Projeto de Mentorato Espanha-Franccedila-PortugalAutoria TraduccedilatildeoAdaptaccedilatildeo
Qualidade de Dados - formaccedilatildeo
Rui FigueiraNoacute Portuguecircs do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbaacuterioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa Portugalruifigueiraisaulisboaptwwwgbifpt
httpcreativecommonsorglicensesby40
Obrigado
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a) Metadados dados de ocorrecircncia e checklists taxonoacutemicas
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3 Frazier CK Wall J and S Grant 2008 Iniciaccedilatildeo de um projeto de digitalizaccedilatildeo de uma coleccedilatildeo Initiating a Natural History Collection Digitisation Project version 10 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 75 pp
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Checklists de espeacutecies e metadados associados Dados de amostragens ou inventaacuterios
O que pode ser publicado atraveacutes do GBIF
Termos definidos no Acordo de Partilha de Dadoswwwgbifptnode28
A publicaccedilatildeo de dados atraveacutes do GBIF apenas pode ser realizada por instituiccedilotildees ou organizaccedilotildees
No caso de bases de dados de colecccedilotildees assegurem o acesso agrave colecccedilatildeo
No caso de bases de dados assegurem a gestatildeo estaacutevel da mesma
Concorda em disponibilizar os dados de forma livre e gratuita definindo os termos de utilizaccedilatildeo
A publicaccedilatildeo de dados natildeo pode ser efectuada por indiviacuteduos
Quem pode publicar dados atraveacutes do GBIF
1 Solicitar o registo no GBIFa) Contactar anteriormente o Noacute Nacional que seraacute responsaacutevel pelo avalNota apenas as organizaccedilotildees podem publicar dados Os particulares devem associar-se a
uma organizaccedilatildeo2 Rever os manuais de publicaccedilatildeo de dados e seleccionar ferramentas
a) Metadados dados de ocorrecircncia e checklists taxonoacutemicas
3 Preparar os dados publicar e registar no GBIFa) Organizar dados segundo o padratildeo e publicar com Integrated Publishing Toolkit (IPT) ou com GBIF Spreadsheet Processor
O IPT permite o registo automaacutetico dos dados pelo portal de dados GBIF
Constituir-se como publicador GBIF
DadosPadronizaccedilatildeo
(DwC)Descriccedilatildeo
(metadados)
Validaccedilatildeo
Publicaccedilatildeo de dados
Publicaccedilatildeo de metadados
(Artigos de dados)
Como partilhar dados atraveacutes do GBIF
Como partilhar dados atraveacutes do GBIF
Integrated Publishing Toolkit
Padrotildees de dados e metadados
Darwin Core
Padrotildees de dados e metadados
Darwin Core ndash Esquema em estrela com suporte a vaacuterios tipos de informaccedilatildeoGermoplasma multiplas determinaccedilotildees tipos e espeacutecimes nomes comuns identificadores alternativos perfil das espeacutecies referecircncias literatura descriccedilatildeo do taxon caracteriacutesticas multimeacutedia entre outros
GMP (GBIF Metadata profile)
EML (Ecological Metadata Language) bull Dataset (Resource) bull Project bull People and Organisations bull Keyword Set (General Keywords) bull Coverage
o Taxonomic Coverage o Geographic Coverage o Temporal Coverage
bull Methods bull Intellectual Property Rights bull Additional Metadata + NCD (Natural Collections Descriptions Data) Related
Metadados
Padrotildees de dados e metadados
httpwwwgbiforgresources2561
O objetivo geral para descrever a qualidade dos dados de um registo em concreto eacute descrever a adequaccedilatildeo do registo para um uso especiacutefico que o utilizador tenha em mente para esses dados
Chrisman 1991
Uma caracteriacutestica essencial e necessaacuteria nos dados eacute a sua ldquoaptidatildeo para o usordquo
A espeacutecie ldquoArdquo estaacute na Tasmacircnia
A espeacutecie ldquoArdquo estaacute na aacuterea de Conservaccedilatildeo do Patrimoacutenio da Tasmacircnia
O que eacute
Qualidade de Dados
Qualidade de Dados
httpwwwgbiforgresources2833httpwwwgbiforgresource80924
A Cadeia de Informaccedilatildeo e Perda de Qualidade
COLHEITA PLANIFICACcedilAtildeO DOCUMENTACcedilAtildeO DIGITALIZACcedilAtildeO CONTROLO DE QUALIDADE
PUBLICACcedilAtildeO NA INTERNET
CUSTO DA CORRECcedilAtildeO DE DADOS
Planificaccedilatildeo Informaccedilatildeo incompleta - Pouca experiecircncia dos colaboradoras
- Interpretaccedilatildeo errada- Base de dados- Coacutepias
- Exportaccedilatildeo errada- Conversotildees- Uso incorrecto dos
dados
Qualidade de Dados
Formaccedilatildeo online Curso online Qualidade de Dados
Projeto de Mentorato Espanha-Franccedila-PortugalAutoria TraduccedilatildeoAdaptaccedilatildeo
Qualidade de Dados - formaccedilatildeo
Rui FigueiraNoacute Portuguecircs do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbaacuterioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa Portugalruifigueiraisaulisboaptwwwgbifpt
httpcreativecommonsorglicensesby40
Obrigado
Motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo
Potenciar investigaccedilatildeo inovadora
Principais motivaccedilotildees para a publicaccedilatildeo de dados
Aumentar do impacto cientiacutefico
Aumentar a exposiccedilatildeo a niacutevel global valorizando
Facilitar a revisatildeo das colecccedilotildees por especialistas
Assegurar a preservaccedilatildeo dos dados
Responder ao interesse de comunidades especiacuteficas
Cumprir requisitos do financiador
Link para acesso aos documentos
1 Chapman A 2005 Princiacutepios e Meacutetodos da Limpeza de Dados Principles and Methods of Data Cleaning version 10 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 77 pp ISBN 87-92020-04-6
2 Hamer M Victor J Smith GF (2012) Guia de Boas Praacuteticaspara a Compilaccedilatildeo Manutenccedilatildeo e Disseminaccedilatildeo de Checklists de Espeacutecies Nacionais Best Practice Guide for Compiling Maintaining and Disseminating National Species Checklists version 10 released in October 2012 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 40 pp ISBN 87-92020-48-8
3 Frazier CK Wall J and S Grant 2008 Iniciaccedilatildeo de um projeto de digitalizaccedilatildeo de uma coleccedilatildeo Initiating a Natural History Collection Digitisation Project version 10 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 75 pp
Documentos a serem publicados proximamente
4 GBIF Sistema de Aumento de Capacitaccedilatildeo ldquoGBIF Capacity Enhancement Frameworkrdquo (httpwwwgbiforgresource80954)
5 Estrateacutegia de Comunicaccedilatildeo GBIF GBIF Communications Strategy (httpwwwgbiforgresource80926)
6 Guia de Auto-avaliaccedilatildeo para sistemas nacionais de informaccedilatildeo sobre a biodiversidade Capacity self-assessment guidelines for national biodiversity information facilities (httpwwwgbiforgresource82277)
Documentos a serem publicados proximamente
Tipos de dados de biodiversidade mediados atraveacutes do GBIF
Dados de ocorrecircncia originados por
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2 Hamer M Victor J Smith GF (2012) Guia de Boas Praacuteticaspara a Compilaccedilatildeo Manutenccedilatildeo e Disseminaccedilatildeo de Checklists de Espeacutecies Nacionais Best Practice Guide for Compiling Maintaining and Disseminating National Species Checklists version 10 released in October 2012 Copenhagen Global Biodiversity Information Facility 40 pp ISBN 87-92020-48-8
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Como partilhar dados atraveacutes do GBIF
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Integrated Publishing Toolkit
Padrotildees de dados e metadados
Darwin Core
Padrotildees de dados e metadados
Darwin Core ndash Esquema em estrela com suporte a vaacuterios tipos de informaccedilatildeoGermoplasma multiplas determinaccedilotildees tipos e espeacutecimes nomes comuns identificadores alternativos perfil das espeacutecies referecircncias literatura descriccedilatildeo do taxon caracteriacutesticas multimeacutedia entre outros
GMP (GBIF Metadata profile)
EML (Ecological Metadata Language) bull Dataset (Resource) bull Project bull People and Organisations bull Keyword Set (General Keywords) bull Coverage
o Taxonomic Coverage o Geographic Coverage o Temporal Coverage
bull Methods bull Intellectual Property Rights bull Additional Metadata + NCD (Natural Collections Descriptions Data) Related
Metadados
Padrotildees de dados e metadados
httpwwwgbiforgresources2561
O objetivo geral para descrever a qualidade dos dados de um registo em concreto eacute descrever a adequaccedilatildeo do registo para um uso especiacutefico que o utilizador tenha em mente para esses dados
Chrisman 1991
Uma caracteriacutestica essencial e necessaacuteria nos dados eacute a sua ldquoaptidatildeo para o usordquo
A espeacutecie ldquoArdquo estaacute na Tasmacircnia
A espeacutecie ldquoArdquo estaacute na aacuterea de Conservaccedilatildeo do Patrimoacutenio da Tasmacircnia
O que eacute
Qualidade de Dados
Qualidade de Dados
httpwwwgbiforgresources2833httpwwwgbiforgresource80924
A Cadeia de Informaccedilatildeo e Perda de Qualidade
COLHEITA PLANIFICACcedilAtildeO DOCUMENTACcedilAtildeO DIGITALIZACcedilAtildeO CONTROLO DE QUALIDADE
PUBLICACcedilAtildeO NA INTERNET
CUSTO DA CORRECcedilAtildeO DE DADOS
Planificaccedilatildeo Informaccedilatildeo incompleta - Pouca experiecircncia dos colaboradoras
- Interpretaccedilatildeo errada- Base de dados- Coacutepias
- Exportaccedilatildeo errada- Conversotildees- Uso incorrecto dos
dados
Qualidade de Dados
Formaccedilatildeo online Curso online Qualidade de Dados
Projeto de Mentorato Espanha-Franccedila-PortugalAutoria TraduccedilatildeoAdaptaccedilatildeo
Qualidade de Dados - formaccedilatildeo
Rui FigueiraNoacute Portuguecircs do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbaacuterioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa Portugalruifigueiraisaulisboaptwwwgbifpt
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Obrigado
Tipos de dados de biodiversidade mediados atraveacutes do GBIF
Dados de ocorrecircncia originados por
ndash Informaccedilatildeo associada a espeacutecimes mantidos em colecccedilotildees bioloacutegicas
ndash Registos de observaccedilatildeo de espeacutecies na naturezandash Registos de ocorrecircncia com base em bibliografia
Checklists de espeacutecies e metadados associados Dados de amostragens ou inventaacuterios
O que pode ser publicado atraveacutes do GBIF
Termos definidos no Acordo de Partilha de Dadoswwwgbifptnode28
A publicaccedilatildeo de dados atraveacutes do GBIF apenas pode ser realizada por instituiccedilotildees ou organizaccedilotildees
No caso de bases de dados de colecccedilotildees assegurem o acesso agrave colecccedilatildeo
No caso de bases de dados assegurem a gestatildeo estaacutevel da mesma
Concorda em disponibilizar os dados de forma livre e gratuita definindo os termos de utilizaccedilatildeo
A publicaccedilatildeo de dados natildeo pode ser efectuada por indiviacuteduos
Quem pode publicar dados atraveacutes do GBIF
1 Solicitar o registo no GBIFa) Contactar anteriormente o Noacute Nacional que seraacute responsaacutevel pelo avalNota apenas as organizaccedilotildees podem publicar dados Os particulares devem associar-se a
uma organizaccedilatildeo2 Rever os manuais de publicaccedilatildeo de dados e seleccionar ferramentas
a) Metadados dados de ocorrecircncia e checklists taxonoacutemicas
3 Preparar os dados publicar e registar no GBIFa) Organizar dados segundo o padratildeo e publicar com Integrated Publishing Toolkit (IPT) ou com GBIF Spreadsheet Processor
O IPT permite o registo automaacutetico dos dados pelo portal de dados GBIF
Constituir-se como publicador GBIF
DadosPadronizaccedilatildeo
(DwC)Descriccedilatildeo
(metadados)
Validaccedilatildeo
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Qualidade de Dados - formaccedilatildeo
Rui FigueiraNoacute Portuguecircs do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbaacuterioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa Portugalruifigueiraisaulisboaptwwwgbifpt
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A Cadeia de Informaccedilatildeo e Perda de Qualidade
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