Gestão de dados em biodiversidade: uma perspectiva.

C R I S T I A N A A LV E S , A N A B U C H A D A S , J O Ã O H O N R A D O , C R I S T I N A R I B E I R O , Â N G E L A LO M B A

TAIL -Gestão de dados de investigação da produção ao

depósito e à partilha

Criação Armazenamento Gestão Partilha

INESC TEC

CIBIO-InBIO

Curadoria de dados, desenho de modelos de metadados para dados de investigação baseados em ontologias.

Definição de normas de metadados para a biodiversidade.

O TAIL tem como objectivo fazer a ponte entre os mandatos de dados com que os grupos de investigação se confrontam e

as ferramentas, fluxos de trabalho e modelos de descrição.

Objectivos

Apresentar uma perspetiva e evolução temporal dos trabalhos feitos em metadados

Comparar com os trabalhos em metadados em Biodiversidade.

Nos trabalhos em metadados mostrar as plataformas de recolha e partilha de dados em Biodiversidade.

Pesquisa Bibliográfica no “WEB OF SCIENCE” em Metadados

Pesquisa Biobliográfica - Metodologia

Palavras chave procuradas: "metadata“

Refinado por categorias do Web of Science:

Computer Science Information SystemsComputer Science Theory Methods, Computer Science Interdisciplinary Applications Computer Science Hardware Architecture Information Science Library Science Computer Science Software Engineering

Pesquisa Bibliográfica no “WEB OF SCIENCE” em Metadados

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2005 2006 2007 2008 2009 2010 2013 2014 2015 2016

Metadados

Anos de publicação Contagem de registo % of 10462

2005 599 5,73%

2006 642 6,14%

2007 713 6,82%

2008 757 7,24%

2009 814 7,78%

2010 596 5,70%

2013 600 5,74%

2014 670 6,40%

2015 838 8,01%

2016 854 8,16%

Pesquisa Bibliográfica no “WEB OF SCIENCE” em Metadados em Biodiversidade

Pesquisa Bibliográfica – Metodologia

Palavras-chaves procuradas: "metadata“ OR "Ontology-based approach“ OR “data managment” AND "Ecolog*" OR "Biodiversity"

Refinado por categorias do Web of Science:

Computer Science Information Systems

Computer Science Theory Methods,

Computer Science Interdisciplinary Applications

Computer Science Hardware Architecture

Information Science Library Science

Computer Science Software Engineering

Pesquisa Bibliográfica no “WEB OF SCIENCE” em Metadados em Biodiversidade

Grupo 1 Grupo 2 resultados

metadata 15360

"metadata" OR "Ontology-based approach“ 15981

"metadata" OR "Ontology-based approach“ OR “data managment” 15993

"metadata" OR "Ontology-based approach“ OR “data managment” OR “Manag* NEAR/1 data” 15993

"metadata" OR "Ontology-based approach“ OR “data managment” "Ecolog*" 288

"metadata" OR "Ontology-based approach“ OR “data managment”

"Ecolog*" OR "Biodiversity" 368

Refinado por áreas científicas 75

1 1 12

9

12

34

3

5

7

5

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7

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20

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16

Número de artigos em metadados emBiodiversidade por ano

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Global Biodiversity Information Facility (GBIF)

Tipos de dados Dados de biodiversidade

Objectivos

É uma infraestrutura de dados "Open- Acess"

financiada por estruturas governamentais ao nível mundial, cujo objectivo é prover a todos, acesso a

dados de todos as formasde vida na terra.

Modelos de metadados Darwin core

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

EOL (Encyclopedia of Life)

Tipos de dadosDados de espécies

(observações, ocorrências)

Objectivos

Conhecimento de todas as formas de vida, desde

animais a bactérias. Objectivo é agrupar toda

esta informação e disponibiliza-la.

Modelos de metadados Darwin Core

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

The Knowledge Network for Biocomplexity(KNB)

Tipos de dadosRepositório de dados

ecológicos e ambientais

Objectivos

Repositório de dados ecológicos e ambientais.

Partilhar, descobrir, aceder a dados

ecoloógicos.

Modelos de metadadosMetacat

EML

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Biodiversity - ecosystem functioning (BEF data) platform

Tipos de dadosDados de biodiversidade e serviços de ecossistema

Objectivos

Plataforma de dados de biodiversidade e serviços

de ecossistemas para partihar entre os investigadores.

Modelos de metadados EML

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

A new database for analyzing BIOdiversityresponses to Forest FRAgmentation (BIOFRAG)

Tipos de dadosDados de biodiversidade de

florestas fragmentadas

Objectivos

Base de dados de biodiversidade e

fragmentação

Modelos de metadados Inspire model

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Long Term Ecological Research (LTER)

Tipos de dadosDados de biodiversidade e ambientais.

Objectivos

Os vários sítios LTER pretendem compreender os padrões e os processos ecológicos em escalas temporais (e.g. diurno, décadas, Século) e espaciais (e.g. amostragens de metros quadrados, regional, continental).

Modelos de metadados EML

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Data Observation Network (Data One)

Tipos de dados

Dados observáveis da Terra e ambientais

Objectivos

Data One assegura a preservação, o acesso, o uso e re-uso de dados científicos ao nível multi-escalar, multidisciplinar, via a plataforma da Data One .

Modelos de metadados e.g. EML

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Intergovernmental Platform on Biodiversity and Ecosystem (IPBES)

Tipos de dadosDados de biodiversidade eserviços de Ecossistema

Objectivos

IPBES é uma plataforma cientifica-politica em

biodiversidade e serviços de ecossistema (é um corpo intergovernamental) que

avalia o estado da biodiversidade e dos

serviços de ecossistema.

Modelos de metadados e.g. Inspire model

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Intermittent River Biodiversity Analysis & Synthesis (IRBAS)

Tipos de dadosDados de biodiversidade e

ambientais em sistemas fluviais

Objectivos

IRBAS colecta dados em biodiversidade e ecologia de sistemas fluviais à volta do

mundo. A base de dados do IRBAS integra e providência acesso gratuito aos dados,

promovendo para o conhecimento global nestes

importante sistema ecológico.

Modelos de metadados Structure Query Language (SQL)

Plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Group on Earth Observations Biodiversity Observation Networks (GEO BON)

Tipos de dados

Dados de biodiversidade (espécies) e dados

ambientais (usos de solo, alterações climáticas)

Objectivos

Melhorar a aquisição,coordenação e entrega de

observações de biodiversidade para a

comunidade cientifica e Instituições

governamentais.

Modelos de metadadosEML, Darwin Core, ABCD,

Plinian core

Outras plataformas e bases de dados em Biodiversidade

Euro+Med plant base

Global Invasive Database

Florest Science Data bank

Dryad

Figshare

AlgaeBase

FishBase

Biogeoinformatics of Hexacorals

MycoBank

Fauna Europaea

Conclusões

Há uma maior preocupação com a gestão dos dados na comunidadecientifíca.

Um crescente aumento da partilha de dados de projectos e dos investigadores.

Nos projectos de investigação cientifíca começa a ser necessário um palono de gestão de dados e descrição de metadados.

Agradecimentos

TAIL – Gestão de dados de investigação da produção aodepósito e à partilha (PTDC/EEI-ESS/1672/2014/2014 – POCI-01-0145-FEDER-016736).

FARSYD – Os sistemas agrícolas enquanto instrumento de suporte a políticas de conservação e gestão de paisagens agrícolas de elevado valor natural (PTDC/AAG-EC/5007/2014 - POCI-01-0145-FEDER-016664).

A. Lomba é financiada pela FCT (SFRH/BPD/80747/2011).