Infra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidade Vanderlei Perez Canhos...
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Infra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidadeInfra-estrutura compartilhada de dados sobre biodiversidade
Vanderlei Perez CanhosVanderlei Perez [email protected]@cria.org.br
www.cria.org.brwww.cria.org.br
Coleções Biológicas e Sistemas de InformaçãoColeções Biológicas e Sistemas de InformaçãoBrasilia, DF, Julho de 2005 Brasilia, DF, Julho de 2005
dadosdados
informaçãoinformação
conhecimentoconhecimento
açãoação
Desafio: ampliaçao do uso de dados científicos sobre biodiversidade
mundo real mundo real
observaçõesobservações
Tomada de decisão• conservação• recuperação ambiental• gerenciamento de recursos
naturais• uso sustentável
Políticas e Estratégias
• governamentais• corporativas• individuais
Marco Legal: A Convenção sobre Diversidade BiológicaMarco Legal: A Convenção sobre Diversidade Biológica
• Clearing-House Mechanism: - Intercâmbio de informação e cooperação técnica
• 2010 Biodiversity Target– Redução da taxa de perda de espécies: depende de dados
sobre a ocorrência de espécies• Global Taxonomy Initiative
– Definição do ponto focal nacional e estratégias• International Pollinators Initiative
– Iniciativa do Brasil: coletas, taxonomia, checklists• Global Strategy for Plant Conservation
– Objetivo: conter a perda da diversidade de plantas– Objetivo específico: compreender e documentar a diversidade
de plantas
Sistemas de Informação: cenário internacionalSistemas de Informação: cenário internacional
• GBIF – Global Biodiversity Information Facility• IABIN – Inter-American Biodiversity Information
Network• Catálogo da Vida (Species 2000, ITIS)• Conabio (Remib) • IIAP (Siamazonia)• INBio• NYBG (repatriação)
Cenário Nacional – MCT programasCenário Nacional – MCT programas
• PROANTAR, PPG7, Revizee, Institutos do Milênio, Xingó, ... todos geradores de dados e informações - falta uma política para coleções de dados
• Inexistência de um sistema de avaliação coletiva dos projetos que envolvem a geração de dados e informações
• Inexistência de uma estratégia inter-agências explícita visando estruturar uma rede de dados e informações de acesso público
• Inexistência de uma política de disponibilização e compartilhamento dos resultados das pesquisas financiadas pelo MCT
• Necessidade de política para a recuperação de acervos históricos e de preservação e disseminação dos dados que já nascem digitais
• Recomendação: MCT desenvolva uma estratégia explícita para o desenvolvimento e manutenção de uma infra-estrutura de dados científicos para o país
biodiversity informatics
True bioinformatics …True bioinformatics …
“bioinformatics” ecoinformatic
s genomics
proteomics
Serviços Web tornam possível a integração de dados Serviços Web tornam possível a integração de dados estruturadosestruturados
ServiçosWeb
UsuárioUsuário
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Bancos de dadosheterogêneos
Dados Padronizados e
Estruturados
Interoperabilidade entre sistemas de informaçãoInteroperabilidade entre sistemas de informação
Com os desenvolvimentos recentes catalisados pelo GBIF, dados de fontes distribuidas podem ser integrados através de única busca. Informação compilada sobre
espécimens, genética e ecologia
Global Biodiversity Information Facity (GBIF)Global Biodiversity Information Facity (GBIF)
Provedores de informação
Specimen DataSpecimen DataLinks para outros dados
Specimen DataSpecimen DataListas de Nomes
Specimen DataSpecimen DataObservações
Specimen DataSpecimen DataEspécimes
Catálogo da Vida
Portal de Acesso a dados sobre Biodiversidade
Índice de Dados sobre
Biodiversidade
Serviço de
nomes taxonô-micos
Metadado
Metadado
Metadado
Metadado
Solicitação do usuário
Busca
Collections at Smithsonian, NMNH
Photos: Chip Clark
Dados sobre biodiversidadeDados sobre biodiversidade
Family: Pyralidae
Order: Lepidoptera
Class: Insecta
Genus: Ostrinia Hübner, 1825
Vernacular (FR): Pyrale du maïs
Vernacular (ES): Piral del maíz
Vernacular (DE): Maiszünsler
Vernacular (EN): European Corn-borer
Collection: DGH LepidopteraRecord id: DGHEUR_003217Country: FranceCoordinates: 03.047˚E 48.730˚NDate: 28 June 2003Collector: Donald Hobern
Dados sobre espécimes e observações de coleta
Nomes Taxonômicos
Species: Ostrinia nubilalis (Hübner, 1796)
Synonym: Pyralis nubilalis Hübner, 1796
Foodplant: Zea mais L. 1753
Interações Ecológicas
Locus: AAL35331Definition: acyl-CoA Z/E11 desaturase
1 mvpyattadg hpekdecfed...
Dados de Seqüências
Average RainfallLocation: 48.82°N 2.29°E Jan Feb Mar Apr ...182.3 120.6 158.1 204.9 ...
Dados Abióticos
Diagnosis: Wingspan 26-30mm; sexually dimorphic;male: forewings ochreous to dark brown; female: forewings pale yellow; …
Descrições Taxonômicas
Pheromones of Ostriniahttp://www.nysaes.cornell.edu/fst/faculty/acree/pheronet/phlist/ostrinia.html
Literatura Digitale Recursos Web
Instituto Virtual da Biodiversidade-Biota FAPESP (Março 1998)Instituto Virtual da Biodiversidade-Biota FAPESP (Março 1998)
Estudar e conhecer a biodiversidade do Estado de São Paulo e divulgar este conhecimento e sua importância
Ampliar a capacidade das organizações públicas e privadas no gerenciamento, monitoramento e utilização da biodiversidade
Subsidiar a tomada de decisão sobre projetos de desenvolvimento, especialmente os de desenvolvimento sustentável
Sistemas de Informação de apoio ao programa Sistemas de Informação de apoio ao programa Biota/FapespBiota/Fapesp
SinBiota
Revista Biota Neotropica
Rede speciesLink
acacia glomerosapyrostegia
IntegraçãoIntegração
speciesLink uma rede
de informação que
permite a integração
dinâmica, síntese e
visualização de dados
primários de coleções
biológicas
http://splink.cria.org.br
• integração dinâmica de dados distribuídos
• software livre e de código aberto
• equipamentos de baixo custo
• integra sistemas diversos de gerenciamento de coleções (sistema operacional, software,...)
• integra de dados de diferentes grupos taxonômicos
• rede integrada com outros sistemas e redes de informação (SinBiota, SICol, Species Analyst, GBIF)
Servidor Regional
Servidor Regional
Servidor Regional
Servidor Regional
Z M
MZB
B
Z
Z
Z
Z
B
B
B
B
B
M
M
Herbário do InstitutoAgronômico deCampinas
Herbário da UNICAMP,Campinas
Coleção de AcariMuseu de Zoologia,ESALQ, Piracicaba
Herbário do DepartamentoDe Ciências Biológicas daESALQ, Piracicaba
Herbário da USP,São Paulo
Coleção de PeixesMuseu de Zoologia da USP,São Paulo
Coleção de FungosInstituto de Botânica,São Paulo
Coleção de AlgasInstituto de Botânica,São Paulo
Coleção de FanerógamasHerbário do Instituto de Botânica,São Paulo
Coleção de PeixesDept. Zoologia e
Botânica, UNESP,São José do Rio Preto
Coleção de AcariDept. Zoologia e
Botânica, UNESP,São José do Rio Preto
Coleção de Peixes doLaboratório deIctiologia, USP,Ribeirão Preto
Col. Culturas de FitobactériasLab. De Bacteriologia Vegetal
Instituto Biológico,Campinas
SinBiotaSistema de InformaçãoAmbiental do Programa
Biota - Fapesp
Coleção de Microrganismos deAmbiente e Indústria, UNICAMPCampinas
ZColeção de Anfíbios
Dept. Zoologia eBotânica, UNESP,
São José do Rio Preto
ZColeção de Quirópteros
Dept. Zoologia eBotânica, UNESP,
São José do Rio Preto
Servidor Regional
Servidor Regional
BHerbário do Instituto de
Biociências, UNESP,Botucatu
Z
BHerbário do Instituto de Biociências, UNESPRio Claro
Coleção de Anfíbios doInstituto de BiociênciasUNESP, Rio Claro
BHerbário de Ilha Solteira, UNESPIlha Solteira
ZColeção do Museude Entomologia da FEIS/UNESPIlha Solteira
Coleção Científica de Aranhas do Dept. Zoologia
e Botânica, UNESP,Botucatu
Z
BHerbário Dom Bento Pickeldo Instituto Florestal,São Paulo
BHerbário do
Jardim Botânico doRio de Janeiro
Construção da infra-estrutura Construção da infra-estrutura compartilhada de dadoscompartilhada de dados
é um esforço coletivo.....
locality data
precipitation
topography
distributional prediction
temperature
alg
ori
thm
localidades amostradas
distribuição potencial
temperatura
precipitação
topografia
Byrsonima subterraneaByrsonima subterranea
Somente um registro de ocorrência
Inclusão na lista de espécies ameaçadas do Estado de São Paulo (1999)
Novo registro de ocorrência na Estação Ecológica de Assis
Uso da modelagem para auxiliar na localização da espécie
Classificação do Solo + Similaridade Ecológica + Manchas de Classificação do Solo + Similaridade Ecológica + Manchas de CerradoCerrado
Validação do Validação do modelomodelo no campo no campo
Previsão de distribuição de Acosmium subelegans no presente e no futuro (2055)
Área habitável em 2055 (+1% CO2)
Área habitável em 2055 (+ 0,5% CO2)
Previsão de riqueza (cenário Previsão de riqueza (cenário atual) para 162 espécies de atual) para 162 espécies de
árvores do Cerradoárvores do Cerrado
Áreas prioritárias para conservação da Áreas prioritárias para conservação da Biodiversidade do Cerrado e do Biodiversidade do Cerrado e do
Pantanal Pantanal
Conservation International do Brasil Conservation International do Brasil 19981998
As áreas circunscritas em azul e rosa correspondem as regiões mais indicadas para conservação segundo critérios baseados nas projeções climáticas futuras
Checklist Flora brasiliensis
Herbário Virtual
Aplicativos: Modelagem preditiva Protocolos de interoperabilidade Servidor de nome Servidor de localidades Banco de imagens Bancos de dados primários (pesquisa) Guias de campo dinâmicos Chaves interativas
Outras Floras Regionais
Outros Herbários na
Internet
Redes Temáticas
Resultado EsperadoResultado Esperado Croton urucuranaCroton urucurana
Dados Históricos
Exsicata em HerbárioExsicata em Herbário
Imagem no campoImagem no campo
Croton urucuranaCroton urucurana