IV WSF, Vilhena - Rogério Martins Gonçalves - Identificação e Diversidade Genética de...
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Identificação e Diversidade Genética de Populações
de Helicoverpa armigera do Brasil
Universidade Estadual de CampinasCentro de Biologia Molecular e Engenharia Genética
Rogério Martins Gonçalves
Mestrando em Genética e Biologia Molecular
Sumário
1. Introdução– Crise Fitossanitária
– Identificação Morfológica de Helicoverpa armigera
– Novas incursões da praga no Brasil
– DNA barcoding
2. Material e Métodos– Extração de DNA Total
– Amplificação por PCR
– Purificação e Sequenciamento
3. Resultados– DNA barcodes
– Análises Filogenéticas
– Rede de Haplótipos baseada no gene COI
– Diversidade Genética e Distribuição dos Haplótipos no Brasil
– Rede de Haplótipos baseada no gene Cyt b
4. Conclusões
1. Introdução
1. H. armigera x Crise Fitossanitária
• Praga de importância econômica no mundo:
- Mundo: custos anuais (controle + perda na produção) ~US$ 5 bilhões (Lammers & MacLeod, 2007).
- China (1992): perdas de US$ 1.3 bilhões na cultura do algodão, Norte da China (Sheng, 1993).
- India + China: 50% dos pesticidas usados para controlar H. armigera (Lammers & MacLeod, 2007).
- USA: 4.431 interceptações de H. armigera + Helicoverpa spp. desde 1985 em frutas, legumes e
plantas ornamentais (Venette et al., 2003).
- USA: 1.400 interceptações nos portos entre 2.000 e 2.004 (Passoa, 2004).
(Pogue, 2004)
1.2. Identificação Morfológica
1.3. Novas incursões da praga
Centro de Biologia Molecular eEngenharia GenéticaLaboratório de Genética e Evolução Animal
(Caterino et al. 2000; Hebert et al. 2003)
Sistema de identificação de espéciesempregando um segmento curto padronizadodo genoma (Hebert et al., 2003).
DNA barcoding
1. CATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTATCGAATAAACTGGGTGGGTTGTTGCTGTCCCTCTCGGGGGAACTGTGCACGCCTTACCTTTTTTGTTTTTCCA………….. Helicoverpa assulta
2. CATTATTGAATAAACTTGGTTAGGTTGCTGCTGGCTCCTTGGAGCATGTGCACACCTAGCACCNTTTTTACCACCTGTGCACCCTTTGTAGACCTGGATACCTCTCGAGGAAACTCGGTTTGAGGACTTTTTTCCA………….. Helicoverpa armigera
OU
1. …………………………………..…………………………………………………… Helicoverpa assulta2. ….…………………………………………………………………………………... Helicoverpa armigera
Detection and Genetic Diversity of a Heliothine Invader from Northand Northeast of Brazil (Mastrangelo et al., 2014, no prelo)
Journal of Economic Entomology
2. Material e Métodos
2.1 Extração de DNA Total
Método Fenol:Clorofórmio (Lyra et al. , 2009)133 amostras de 7 Estados (RO = 15; PI = 39 ;BA = 13; SP = 38; RR = 14 ; MT = 7; TO = 7)
2.1 Extração de DNA Total
Ressuspendidos em 100 µL de TE buffer Armazenados a -80 ºC
2.2 Amplificação por PCR
2.2 Amplificação por PCR
• Primers:
- COIF e COIR (Li et al., 2011)
- Cytb-F02 e Cytb-R02 (Behere et al., 2008)
• Mix para PCR:- 25 ng de DNA total
- 2,5 mM de MgCl2
- 0,25 mg/mL de BSA
- 100 µM de dNTPs
- 0,5 mM de cada primer (direto
e reverso)
- 1,5 U de TaqDNA polymerase
- 10 x TaqBuffer
- Volume final: 25 µL
GeneAmp®PCR System9700 thermal cycler
Condições94oC 3’
94oC 30”
35 Ciclos45 oC – COI
50 oC – Cyt b 30”
70 oC – COI72 oC – Cyt b
90”60”
70 oC – COI72 oC – Cyt b
7’10’
10oC forever
2 µL
Gel agarose 1% em 1 x TAE
2.3 Purificação e Sequenciamento
IllustraTMGFXTM kitABI3730xl DNA Analyzer sequencer
http://www.boldsystems.org/
http://blast.ncbi.nlm.nih.govBasic Local Alignment Search Tool
3. Resultados
3.1 DNA barcodes DNASP.V5 software
(Mastrangelo et al., 2014, no prelo)
3.2 Análises Filogenéticas – COI (658 pb)
3.3 Rede de Haplótipos – 150 sequências COIsoftware TCS versão 1.21
(Li et al., 2011)
17 sequências de Li et al., (2011) + 133sequências brasileiras = 23 haplótipos
3.4 Diversidade Genética das Populações e Distribuição dos Haplótipos – COI
‒ 11 haplótipos
‒ Alta diversidade de haplótipo (Ĥ) e baixadiversidade nucleotídica (π)
‒ Sem estrutura genética.
‒ Fluxo Gênico
Grande Capacidade de Dispersão
- Barreiras como o deserto do Sahara não impediram a migração
à longa distância de H. armigera (Nibouche et al., 1998).
• Esse padrão de variação genética é comum em
pragas capazes de se dispersar por longas
distâncias, como H. armigera (Daly & Gregg, 1985;
Zhou et al., 2000; Endersby et al., 2007) .
- Experimentos de marcação e recaptura
Mariposas de H. armigera podem voar 200-
300 km em uma única noite (Armes & Cooter,
1991).
(Pedgley, 1985)
3. Compatibilidade Reprodutiva entre H. armigera e H. zea
• Genes mitocondriais são informativos apenas quanto à herança maternal.
- Os 133 espécimes podem pertencer à linhagem original introduzida ou um híbrido
proveniente do cruzamento entre uma fêmea de H. armigera e um macho de H. zea.
-Nucleares: EF-1α, IDH, RpS5 (Wahlberg & Wheat, 2008).
Próximas etapas
(Pogue, 2004)
1.2. Identificação Morfológica
Cooperação Internacional
Austrália, China, Índia, Paquistão, Burkina Faso, UgandaUSA + Brasil
6 indivíduos de Mato Grosso
H. armigera
H. zea
26 haplótipos de Tay et al., (2013) + 38amostras do Brasil (RO, RR, MT, PI, BA e SP)
3.3 Rede de Haplótipos – sequências Cyt b
software TCS versão 1.21
4. Conclusões
1) Há fortes evidências genéticas de que as lagartas e adultos analisados dos sete
Estados brasileiros são Helicoverpa armigera.
2) Estudos combinando mtDNA e novos marcadores nucleares com linhagens puras e
híbridos de H. armigera e H. zea são necessários para a elaboração de protocolos de
identificação para essas duas espécies.
3) Sistemas de identificação baseados em mtDNA tem sido eficientes no diagnóstico e
análises geográficas complementando os dados morfológicos.
4) Há evidência de fluxo gênico entre as populações do Brasil.
Muito Obrigado !