Microbiologia Clínica

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2012

ANA MARIA DIAS

BIOMEDICINA

07/02/2012

MICROBILOGIA CLÍNICA



INTRODUÇÃO À MICROBILOGIA CLÍNICA

Trata de questões relacionadas à microbiologia básica, coleta,transporte e processamento de amostras, identificação de microrganismos

de importância clínica, antibióticos, padrões de sensibilidade, interpretaçãoe resultados de provas e tendências em doenças infecciosas.

REVISÃO MICROBIOLOGIA BÁSICA

BACTÉRIA PROCARIOTA UNICELULAR

COLORAÇÃO DE GRAM - Para que as bactérias possam ser vistas aomicroscópio precisam passar pelo processo de coloração. O Método de

Gram é feito a partir de um esfregaço bacteriano, fixado em calor e coradocom cristal violeta, lugol, ácool e fucsina. Este método permite diferenciar abactéria em Gram negativa ou Gram positiva, de acordo com sua parede

celular.

Parede Gram – negativa:

Parede celular mais complexa.

Formada por camadas de peptídeoglicano e por membrana externa

Espaço periplasmático que contém alta concentração de enzimasdegradadoras juntamente com proteínas de transporte.

Membrana externa composta por uma camada dupla de lipídeos, alémde apresentar o lipopolissacarídeo (LPS), o qual é constituído por umlipídeo A que está ligado ao antígeno O. (O LPS é considerado uma endotoxina,



por ser tóxico provocando diversas vezes respostas fisiológicas, como a febre no

homem). Quando coradas apresentam uma coloração rosada.

Parede Gram – positivas

Parede celular constituída por peptideoglicano, além de proteínas eácidos teicóicos (Os ácidos teicóicos são dividos em dois tipos: os acídos

teicóicos de paredes que estão ligados ao peptideoglicano e os ácidos lipoteicóicos

(LTA) que estão ligados aos lipideos da membrana plasmática; estes ácidos

apresentam diversas funções).

Quando coradas apresentam uma coloração roxa ou azul.

Corantes:

A – Cristal Violeta Corante bastante roxo que fica na parede de peptideoglicano

B – Lugol Fixador

C – Álcool – cetona Dissolve a membrana ext. / descora a parede delgada da gram –

D – Fucsina Corante rosa – Contra corante

MORFOLOGIA e ESTRUTURA BACTERIANA

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TAXONOMIA MICROBIANA E CLASSIFICAÇÃOFENOTÍPICA DE MICRORGANISMOS.

SISTEMÁTICA MICROBIANA

A sistemática microbiana é o estudo da diversidade dos organismos esuas relações.

Ela associa a filogenia, a taxonomia, a qual caracteriza, nomeia eposiciona os organismos em grupos, de acordo com suas relaçõesnaturais.

A taxonomia era baseada em análise fenotípica, porém, com dados de

sequenciamento, várias relações filogenéticas estão sendo revistas. A taxonomia polifásica abrange, portanto a análise de :

1) Análise genotípica;2) Análise fenotípica3) Filogenética

Taxonomia:

Ciência da descoberta, descrição e classificação das espécies e grupo deespécies, com suas normas e princípios.

Táxon (plural taxa, em latim) = unidade taxonômica, essencialmenteassociada a um sistema de classificação.Ex.: reino, gênero, etc..

Filogenia:

Filogênese = grego: phylon = tribo, raça e genetikos = relativo à gênese,origem.

Termo comumente utilizado para hipóteses de relações evolutivas,relações filogenéticas de um grupo de organismos.

As relações evolutivas entre os microrganismos são, portanto, o tema dafilogenia.

As relações filogenéticas entre as células podem ser deduzidascomparando-se a informação genética presente no DNA ou em suas

proteínas. Utilizam-se como base moléculas de ribossomos ou rRNA.



OS TRÊS DOMÍNIOS DA VIDA

Bacteria e Archaea ( procariotos) e Eukarya ( eucariotos).

Acredita-se que os domínios divergiram de uma ancestral comum.

Todos os procariotos NÃO exibem estreita relação filogenética.

Archaea e Eukarya estão mais estreitamente relacionados do que aBacteria.

EVOLUÇÃO E SISTEMÁTICA MICROBIANA

A vida microbiana na Terra remota está documentada através dosestromatólitos, que são massas microbianas fossilizadas deaproximadamente 3,5 bilhões de ano.

A história evolutiva de um grupo de organismos é chamada filogenia. Afilogenia é deduzida indiretamente, pela análise de nucleotídeos.

ARVÓRES FILOGENÉTICAS - CLASSIFICAÇÃO DOS SERES VIVOS

Uma árvore filogenética, por vezes também designada por Árvore

da Vida, é uma representação gráfica, em forma de uma árvore, dasrelações evolutivas entre várias espécies ou outras entidades quepossam ter um ancestral comum. Em uma árvore filogenética, cadanodo (ou nó) com descendentes representa o mais recenteantepassado comum, e os comprimentos dos ramos podemrepresentar estimativas do tempo evolutivo. Cada nodo terminal échamado de "unidade taxonômica".

http://pt.wikipedia.org/wiki/Filogen%C3%A9tica







1979C. Woese desenvolve um sistema de classificação em base a

organização celular dos organismos (célula procariótica ou célulaeucariótica )

Classificou os organismos em três Domínios ou Supra-Reinos:

1) Bacteria ( as paredes cotem peptideoglicanos).2) Archaea ( as paredes celulares se presentes não contem

peptideoglicanos).3) Eukarya :

- Protistas (fungos gelatinosos), protozoários, algumas algas.- Funghi (leveduras, bolores e cogumelos)- Plantae (musgos, samambaias, coníferas e plantas com flores)- Animalia ( esponjas, vermes, insetos e vertebrados).

Importante: Vírus

Não possui metabolismo próprio (DNA ou RNA envolvido por capaproteica, alguns lipoproteicos).

Penetram na célula hospedeira e assumem o comando da máquinacelular hospedeira para autorreplicação.

AVALIAÇÃO DA DIVERSIDADE MICROBIANA

Por que os estudos de diversidade usam o rRNA ?

Sequências de rRNA são extremamente importantes em estudosfilogenéticos porque são conservadas (evoluiram lentamente)participando na síntese da estrutura dos ribossomos e de

proteínas. Partes destas sequencias são conservadas para a maioria dos

seres vivos: contem o passado metabólico do último acestralcomum.

As regiões variáveis são usadas na taxonomia – filogenética

CLASSIFICAÇÃO TAXONÔMICA

O genótipo de um organismo é sua composição genética, a informaçãoque codifica todas as características particulares do organismo.



O fenótipo refere-se as propriedades reais expressas. O fenótipo,então, é a manifestação do genótipo.

Genótipo todo o seu DNA

Fenótipo coleção de proteínas

Nos microrganismos, a maioria das proteínas é enzimática (catalisamreações particulares) ou estrutural (participam de grandes complexosfuncionais como as membranas ou ribossomos).

A classificação fenotípica de microrganismos (morfologiamacroscópica e microscópica, propriedades bioquímicas, composição

antigênica) está sendo substituída por análises genotípicas (homologia deDNA, sequenciamento de RNA)

Detecção e identificação de microrganismos nãocultiváveis.

Taxonomia

Sistema formal de organização, classificação e nomenclatura.

Divide-se em 7 níveis:

Reino

Divisão

Classe Ordem

Família



Gênero

Espécie

Nome Científico:

Gênero (1ª minúscula)

Espécie (1ª minúscula)Ex.: Saccharomyces cerevisiae

Nomenclatura:

O sistema atual de nomenclatura segue proposta de Linnaeus:

- É binomial composto por nomes escritos em latim oulatinizados.

- o primeiro nome refere-se ao gênero e deve ter a inicial comletra maiúscula, ex.: Canis

- o segundo nome é o epíteto específico e deve ser escrito cominicial minúscula, ex.: familiaris

- Canis familiaris = cão doméstico

- Os nomes científicos devem ter grafia diferenciada no texto:negrito, itálico ou grifado.

CLASSIFICAÇÃO TAXONÔMICA DAS BACTÉRIAS

As eubactérias estão distribuídas em pelo menos onze divisões,

incluindo cinco com microrganismos de importância clínica.Ex.:

1. Divisão: Proteobacteria

Subdivisão: Subclasse gama

Subgrupo 2

Familia. Enterobacteriaceae Genero. Salmonella

Genero. Shigell



Família. Vibrinonaceae

Genero. Vibrio

2. Divisão: Bactérias “gram-positivas”

Subdivisão 3: Bactérias com baixa % mol de G + C

Ordem. Bacillales

Familia. Bacillaceae

Gênero. Staphylococcus

Familia. Streptococcaceae

Gênero. Streptococcus

Família. Lactobacillaceae

Genero. Lactobacillus

3. Divisão: Espiroquetas

Ordem. Spirochaetales

Familia. Spirochaetaceae

Genero. Treponema

Familia. Leptospiaceae

Genero. Leptospira

4. Divisão: Bacilos aeróbicos e anaeóbicos na superfamília V de

RNA

Subgrupo 1

Familia. Bacteroidaceae

Genero. Bacteroides

Genero. Prevotella

Classificação incerta

Genero. Fusobacterium

5. Divisão: Chlamydiae

Ordem. Chlamydiales

Família. Chlamydiaceae

Genero. Chlamydia



CLASSIFICAÇÃO TAXONÔMICA DOS VÍRUS HUMANOS

- Vírus sem envoltório, RNA de cadeia Simples (vírus da febre aftosa, Vírusda hepatite A)

- Vírus com envoltório, RNA de cadeia simples

- Vírus sem envoltório, DNA de cadeia simples (rotavírus)

- Vírus sem envoltório, DNA de cadeia dupla (papilomavírus)

- Vírus com envoltório, DNA de cadeia dupla

Família Hepadnaviridae: Hepatite B

Família Herpesviridae: Herpes e Varicela-Zoster

Família Poxviridae: Varíola

CLASSIFICAÇÃO TAXONÔMICA DOS FUNGOS

• Divisão: Zygomycotina(fungosinferiores)

Classe. Zygomycetes

Ordem. Mucorales (Mucor,Rhizopus)

• Divisão: Ascomycotina (fungossuperiores)

Classe. Ascomycetes

Ordem. Endomycetales(Saccharomyces)

• Divisão: Basidiomycotina

• Divisão: Deuteromycotina (fungos imperfeitos) (Candida, Cryptococcus,

Histoplasma, Paracoccidioides)



COLETA, TRANSPORTE E PROCESSAMENTO DE AMOSTRAS.

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