NCE/12/00161 — Apresentação do pedido - Novo ciclo de estudos · A7. Número de créditos ECTS...

21/12/2018 PERA/1819/1200161 — Apresentação do pedido

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PERA/1819/1200161 — Apresentação do pedido

I. Evolução do ciclo de estudos desde a avaliação anterior1. Decisão de acreditação na avaliação anterior.

1.1. Referência do anterior processo de avaliação. NCE/12/00161

1.2. Decisão do Conselho de Administração.

Acreditar com condições

1.3. Data da decisão.

2013-06-19

2. Síntese de medidas de melhoria do ciclo de estudos desde a avaliação anterior, designadamente nasequência de condições fixadas pelo CA e de recomendações da CAE.

2. Síntese de medidas de melhoria do ciclo de estudos desde a avaliação anterior, designadamente na sequência de condições fixadaspelo CA e de recomendações da CAE (Português e em Inglês, PDF, máx. 200kB).

2._MTIM_REC_CA.pdf

3. Alterações relativas à estrutura curricular e/ou ao plano de estudos(alterações não incluídas no ponto 2).

3.1. A estrutura curricular foi alterada desde a submissão do guião na avaliação anterior? Não

3.1.1. Em caso afirmativo, apresentar uma explanação e fundamentação das alterações efetuadas.

<sem resposta>

3.1.1. If the answer was yes, present an explanation and justification of those modifications.

<no answer>

3.2. O plano de estudos foi alterado desde a submissão do guião na avaliação anterior?

Não

3.2.1. Em caso afirmativo, apresentar uma explanação e fundamentação das alterações efetuadas.

<sem resposta>

3.2.1. If the answer was yes, present an explanation and justification of those modifications.

<no answer>

4. Alterações relativas a instalações, parcerias e estruturas de apoio aos processos de ensino e aprendizagem(alterações não incluídas no ponto 2)

4.1. Registaram-se alterações significativas quanto a instalações e equipamentos desde o anterior processo de avaliação? Sim

4.1.1. Em caso afirmativo, apresentar uma breve explanação e fundamentação das alterações efetuadas.

Na altura da proposta de novo ciclo de estudos (2012), ia ser inaugurado na UA o “Edifício da Saúde”, albergando a Escola Superiorde Saúde da UA (ESSUA), a Secção Autónoma de Ciências da Saúde (SACS), hoje Departamento de Ciências Médicas (DCM), e aUnidade de investigação iBiMED.

Para além das instalações e equipamentos mencionados na proposta de 2012, hoje o Edifício da Saúde disponibiliza aos estudantesdo Mestrado em Tecnologias da Imagem Médica, laboratórios de imagiologia com equipamento de aquisição de imagem diagnóstica(Radiologia digital com tecnologia CR, Ecografia, Mamografia), laboratórios de processamento de imagem equipados com softwareprofissional (Siemens) e semi-profissional, equipamento para controlo de qualidade em imagiologia (objetos de teste para váriasmodalidades e dosímetros), consolas de planeamento dosimétrico em Radioterapia (Varian), laboratórios de microscopia óticaconvencional.

Os estudantes do MTIM podem contar também com as instalações e equipamentos das unidades de investigação ligadas aosdepartamentos envolvidos:

- i3N (Instituto de Nanoestruturas, Nanomodelação e Nanofabricação): laboratórios de Física das radiações e detetores de radiação,equipamento PET pré-clínico para pequenos animais (EasyPET)

- IEETA (Instituto de Engenharia Eletrónica e Telemática de Aveiro): infraestrutura de arquivo e comunicação de dados imagiológicosdesenvolvido para suporte à lecionação e investigação na área da imagem médica (PACS-ESSUA)

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- iBiMED (Instituto de Biomedicina): equipamento de microscopia ótica avançada, nomeadamente, microscopia confocal (Zeiss LSM510M).

4.1.1. If the answer was yes, present a brief explanation and justification of those modifications.

In 2012, at the time of the first course proposal, was going to be opened the new “Health Building” of the University of Aveiro, hostingthe UA School of Health Sciences (ESSUA), the Health Sciences Autonomous Section (SACS), now Department of Medical Sciences(DCM), and the research unit iBiMED.

Besides the facilities and the equipment mentioned in the 2012 proposal, today the Health Building offers to the sudents of the MSc inMedical Imaging Technologies, imaging laboratories for diagnostic image acquisition (digital radiology with CR technology,Ultrasound, Mammography), image processing laboratories equipped with professional (Siemens) and semiprofessional software,equipment for medical image quality control (phantoms for different imaging modalities and dosimeters), laboratory equipped withworkstations for dosimetry planning in Radiotherapy (Varian), laboratories of conventional optical microscopy.

The students of the MSc in Medical Imaging Technologies can also count on facilities and equipment of the research units linked to thecollaborating departments:

- i3N (Institute of Nanostructures, Nanomodelling and Nanofabrication): laboratories of radiation Physics and radiation detectrs, pre-clinical PET equipment for small animals (EasyPET)

- IEETA (Institute of Electronics and Telematics Engineering of Aveiro): infrastructure for archive and communication of medicalimaging data, designed to support lecturing and research in medical imaging field (PACS ESSUA)

- iBiMED (Institute of Biomedicine): advanced optical microscopy equipment, namelly, confocal microscopy.

4.2. Registaram-se alterações significativas quanto a parcerias nacionais e internacionais no âmbito do ciclo de estudos desde o anteriorprocesso de avaliação?

Não

4.2.1. Em caso afirmativo, apresentar uma síntese das alterações ocorridas.

<sem resposta>

4.2.1. If the answer was yes, present a synthesis of those changes.

<no answer>

4.3. Registaram-se alterações significativas quanto a estruturas de apoio aos processos de ensino e aprendizagem desde o anteriorprocesso de avaliação?

Sim


Certificação do Sistema Interno de Garantia de Qualidade


<no answer>

4.4. (Quando aplicável) registaram-se alterações significativas quanto a locais de estágio e/ou formação em serviço, protocolos com asrespetivas entidades e garantia de acompanhamento efetivo dos estudantes durante o estágio desde o anterior processo de avaliação?

Não


<sem resposta>


<no answer>

1. Caracterização do ciclo de estudos.1.1 Instituição de ensino superior.

Universidade De Aveiro

1.1.a. Outras Instituições de ensino superior.

1.2. Unidade orgânica (faculdade, escola, instituto, etc.):

Universidade De Aveiro

1.2.a. Outra(s) unidade(s) orgânica(s) (faculdade, escola, instituto, etc.) (proposta em associação):

1.3. Ciclo de estudos.

Mestrado em Tecnologias da Imagem Médica



1.3. Study programme.

Medical Imaging Technologies

1.4. Grau.

Mestre

1.5. Publicação do plano de estudos em Diário da República (PDF, máx. 500kB).

1.5._Despacho_nº_10343_2013.pdf 1.6. Área científica predominante do ciclo de estudos.

Ciências e Tecnologias da Saúde

1.6. Main scientific area of the study programme.

Health Science and Technologies

1.7.1. Classificação CNAEF – primeira área fundamental, de acordo com a Portaria n.º 256/2005, de 16 de Março (CNAEF-3 dígitos):

725

1.7.2. Classificação CNAEF – segunda área fundamental, de acordo com a Portaria n.º 256/2005, de 16 de Março (CNAEF-3 dígitos), seaplicável:

725

1.7.3. Classificação CNAEF – terceira área fundamental, de acordo com a Portaria n.º 256/2005, de 16 de Março (CNAEF-3 dígitos), seaplicável:

<sem resposta>

1.8. Número de créditos ECTS necessário à obtenção do grau.

90

1.9. Duração do ciclo de estudos (art.º 3 DL n.º 74/2006, de 24 de março, com a redação do DL n.º 63/2016 de 13 de setembro):

3 Semestres

1.9. Duration of the study programme (article 3, DL no. 74/2006, March 24th, as written in the DL no. 63/2016, of September 13th):

3 Semesters

1.10. Número máximo de admissões.

20

1.10.1. Número máximo de admissões pretendido (se diferente do número anterior) e respetiva justificação.

<sem resposta>

1.10.1. Intended maximum enrolment (if different from last year) and respective justification.

<no answer>

1.11. Condições específicas de ingresso.

Licenciados em Radiologia, Radioterapia, Medicina Nuclear e Imagem Médica e Radioterapia, em Engenharias afins (designadamentedas áreas Biomédica, Eletrotecnia, Informática e Física). Os candidatos serão seriados com base em mérito curricular académicoe/ou profissional podendo ainda ser submetidos, caso a comissão científica do ciclo de estudos assim o entenda, a outros itens declassificação ao abrigo do atual Regulamento de Estudos da Universidade de Aveiro.

1.11. Specific entry requirements.

Candidates should hold at least a "licenciatura" degree or similar in Radiology, Radiotherapy, Nuclear Medicine, Medical Imaging andRadiotherapy or related Engineering degrees such as Biomedical, Electrical, Informatics and Physics. Candidates will be sorted uponCV evaluation. The executive scientific committee of this study cycle is free to request further classification itens under the currentgeneral regulations of the University of Aveiro.

1.12. Regime de funcionamento.

Diurno

1.12.1. Se outro, especifique:

Não aplicável

1.12.1. If other, specify:

Not applicable

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1.13. Local onde o ciclo de estudos será ministrado:

Campus Santiago, Universidade de Aveiro

1.14. Regulamento de creditação de formação académica e de experiência profissional, publicado em Diário da República (PDF, máx.500kB).

1.14._Reg_Credit_UA_2017_2.1.14.pdf 1.15. Observações.

Informação preliminar acerca da equipa docente:

Tratando-se dum curso intrinsecamente multidisciplinar ao nível científico e tecnológico a equipa docente reflete também adiversidade cientifica na graduação doutoral e ou de especialidade profissional. Tratam-se de elementos com curriculum longo erelevante na área do ciclo de estudos, tal como se apresenta nas fichas de docentes respetivas, pelo que podem ser consideradosDoutores especializados na área fundamental do CE (especificar os nomes). Devem referir-se os seguintes casos incluídos na tabela3.4.2 (ver fichas curriculares).

Augusto Marques Ferreira da Silva (área de doutoramento: Engrª Electrotécnica), Diretor de Curso Silvia De Francesco (área de doutoramento: Engrª Electrotécnica)

Luis Pedro Melo Freitas (Médico Especialista em Neurorradiologia, reconhecimento pelo Ordem dos Médicos e pelo European Boardof Neuroradiology da Sociedade Europeia de Neurorradiologia)

Serafim Filipe da Cunha Pinto, Especialista em Radioterapia com reconhecimento profissional, presentemente em plano doutoral noDepartamento de Ciências Médicas da Universidade de Aveiro.

1.15. Observations.

Preliminary information about the teaching staff To cope with the the broad scientific and technological scope of this study cycle the teaching staff reflects a diverse post-graduation

and or professional expertise background. There are members with a doctoral degree not in the health sciences area but with arelevant curriculum in the major areas of this study cycle. Others, although not having a doctorate degree, are properly recognized asclinical specialist in the area. Cases that are included in table 3.4.2 that deserve mention:

Augusto Marques Ferreira da Silva (PhD in Electrical Engineering), Study Cycle Director

Silvia De Francesco (PhD in Electrical Engineering), Study Cycle Vice-Director Luis Pedro Melo Freitas (MD, Senior Neuroradiologist by the Portuguese Medical Association and the European Board of

Neuroradiology Serafim Filipe da Cunha Pinto, Radiotherapy specialist with professional certification, currently enrolled in PhD program at the

Department of Medical Sciences, University of Aveiro

2. Estrutura Curricular. Aprendizagem e ensino centrados no estudante.2.1. Percursos alternativos, como ramos, variantes, áreas de especialização de mestrado ou especialidades dedoutoramento, em que o ciclo de estudos se estrutura (se aplicável)

2.1. Ramos, opções, perfis, maior/menor, ou outras formas de organização em que o ciclo de estudos se estrutura (se aplicável) /Branches, options, profiles, major/minor, or other forms of organisation compatible with the structure of the study programme (ifapplicable)

Opções/Ramos/... (se aplicável): Options/Branches/... (if applicable):

<sem resposta>

2.2. Estrutura curricular (a repetir para cada um dos percursos alternativos)

2.2. Estrutura Curricular - Estrutura única

2.2.1. Ramo, opção, perfil, maior/menor, ou outra (se aplicável). Estrutura única

2.2.1. Branches, options, profiles, major/minor, or other (if applicable)

Single structure

2.2.2. Áreas científicas e créditos necessários à obtenção do grau / Scientific areas and credits that must be obtained before a degreeis awarded

Área Científica / Scientific Area Sigla /Acronym

ECTS Obrigatórios /Mandatory ECTS

ECTS Mínimos Optativos / MinimumOptional ECTS*

Observações /Observations

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Ciências e Tecnologias da Saúde CTS 54 0Informática I 6 0Gestão GES 6 0Física FIS 6 0Electrotecnia/Física/Ciências eTecnologias da Saúde ELE/FIS/CTS 18

(5 Items) 72 18

2.3. Metodologias de ensino e aprendizagem centradas no estudante.

2.3.1. Formas de garantia de que as metodologias de ensino e aprendizagem são adequadas aos objetivos de aprendizagem(conhecimentos, aptidões e competências) a desenvolver pelos estudantes, favorecendo o seu papel ativo na criação do processo deaprendizagem.

Realização de procedimentos laboratoriais complexos, trabalhos em grupo ou individuais, aprendizagem baseada em problemas,visitas a laboratórios de investigação e centros de referência, etc permitem atingir os objetivos de aprendizagem do mestrado:

Conhecimentos Enquadramento dos componentes de imagem em sistemas de informação mais amplos

Impacto organizacional e económico das tecnologias da imagem médica Fundamentos matemáticos e físicos dos processos de formação de imagem

Processamento e análise de imagem Aptidões

Integrar equipas multidisciplinares em centros de referência Competências

Formular e análisar propostas de aquisição, instalação e manutenção de sistemas imagiológicos integrados Avaliar vantagens e limitações dos métodos de diagnóstico assistido por computador.

Usar processamento de imagem no suporte ao diagnóstico e terapêutica.

Aferição de resultados pelo sistema interno de qualidade, sgq.ua.pt, incluindo relatórios discentes, docentes e do diretor de curso.

2.3.1. Means of ensuring that the learning and teaching methodologies are coherent with the learning outcomes (knowledge, skills andcompetences) to be achieved by students, favouring their active role in the creation of the learning process.

A coherent set of activities is designed for each CU is proposed in a student centric approach to the learning process. Activities suchas laboratory procedures, group or individual works, problem based learning, working visits to clinical centers promote studentautonomy considering the overall objectives of the course:

Knowledge: Recognition of image related entities as components of broader clinical echosystems

Perception of organizational and economic impact of medical imaging technologies Fundamentals of mathematical and physical foundations of medical imaging systems

Fundamentals of medical image processing Skills

Elaboration and analysis of proposals for acquisition, installation and maintenance of medical imaging systems Apply image processing techniques in diagnosis and therapeutics instances.

Evaluation of CAD tools.

Learning outcomes are assessed within the internal quality control system, sgq.ua.pt, including reports from students, lecturers andthe course director.

2.3.2. Forma de verificação de que a carga média de trabalho necessária aos estudantes corresponde ao estimado em ECTS.

No sistema de Gestão da Qualidade implementado pela UA, no final de cada semestre os estudantes preenchem um inquérito noqual, entre outros aspetos, avaliam a carga de trabalho associada a cada Unidade Curricular frequentada. A carga de trabalhoestimada pelos estudantes é comparada com o número de ECTS da Unidade Curricular e, se estas não coincidirem, numa segundafase do ciclo de avaliação os docentes propõem ajustes a ser implementados no ano académico seguinte.

Até ao momento não se registaram casos que suscitassem ajustes significativos

2.3.2. Means of verifying that the required average student workload corresponds to the estimated in ECTS.

In the current Quality Control System of the University of Aveiro the students play a major role. By the end of the semester studentsare required to fulfill pedagogical inquiries. Thereafter, with statistical robustness, it is possible to infer if the estimated ECTS loadwas appropriately fitted. Eventual mismatches are promptly assessed and adjustments may then be proposed and implemented forsubsequent editions of the curricular units under scrutiny. So far there no cases where major adjustments were required.

2.3.3. Formas de garantia de que a avaliação da aprendizagem dos estudantes é feita em função dos objetivos de aprendizagem.

A avaliação da aprendizagem é feita de forma diferente consoante o perfil da UC, dos seus objetivos e forma de funcionamento.Desde testes escritos, até exercícios em computador, procedimentos laboratoriais, pequenos projetos e trabalhos ou monografiasem grupo ou individuais. Nalguns casos a avaliação realiza-se num único momento, noutras em vários momentos ou até de formacontínua.

No início de cada UC, os estudantes são informados acerca do modo de funcionamento e de avaliação da mesma, e esta informaçãoé registada no Dossier Pedagógico da Unidade Curricular.

Parar os estudantes internacionais ou em mobilidade Erasmus, a avaliação é adaptada tendo em consideração as capacidadeslinguísticas do estudante.

Os estudantes têm sempre acesso aos seus aos objectos de avaliação e respetiva correcção, podendo pedir a sua consulta ourevisão



Aferição de resultados é integrada sistema interno de qualidade, sgq.ua.pt, incluindo relatórios discentes, docentes e do diretor decurso.

2.3.3. Means of ensuring that the student assessment methodologies are aligned with the intended learning outcomes.

Learning assessment if proposed accordingly to the profile of each CU. The autonomous work of the student is prominent and soassessment is generally composed of multiple components. The traditional final written exam has normally a minor weight whereasthe contribution from computer based projects, written monographs, laboratory works is emphasized and preferably distributedevenly throughout the semester.

The assessment plan as well of the functional details about each CU is available in the pedagogical portfolio at the beginning of thesemester.

For international students the assessment is adjusted taking into account the language skills of each student. Students always have the opportunity to access their assessment objects as well as the respective corrections and are, if it is the

case, even granted to second opinion revisions. Learning outcomes are assessed within the internal quality control system, sgq.ua.pt, including reports from students, lecturers and

the course director.

2.4. Observações

2.4 Observações. NA

2.4 Observations.

NA

3. Pessoal Docente3.1. Docente(s) responsável(eis) pela coordenação do ciclo de estudos.

3.1. Docente(s) responsável(eis) pela coordenação do ciclo de estudos. Augusto Marques Ferreira da SIlva

Silvia De Francesco

3.3 Equipa docente do ciclo de estudos (preenchimento automático)

3.3. Equipa docente do ciclo de estudos / Study programme’s teaching staff

Nome / Name Categoria /Category

Grau /Degree

Especialista /Specialist Área científica / Scientific Area Regime de tempo /

Employment linkInformação/Information

Alexandra IsabelCardador de Queirós

ProfessorCatedrático ouequivalente

Doutor Ciências e Tecnologias da Saúde 100.00 Fichasubmetida

Ana Alexandra da CostaDias

Professor Auxiliar ouequivalente Doutor Ciências e Tecnologias da Saúde -

Especialização - Decisão Política 100.00 Fichasubmetida

Ana Maria Perfeito Tomé Professor Associadoou equivalente Doutor Doutoramento em Eng. Electrotécnica 100.00 Ficha

submetidaAugusto MarquesFerreira da Silva

Professor Auxiliar ouequivalente Doutor CTC da Instituição

proponente Engenharia Electrotécnica 100.00 Fichasubmetida

Daniel Ferreira Polónia Professor Auxiliar ouequivalente Doutor Engenharia Electrotécnica 100.00 Ficha

submetidaJoão Filipe Calapez deAlbuquerque Veloso

Professor Associadoou equivalente Doutor CTC da Instituição

proponente Física Tecnológica 100.00 Fichasubmetida

José Maria AmaralFernandes

Professor Auxiliar ouequivalente Doutor Doutoramento em Engenharia

Electrotécnica 100.00 Fichasubmetida

Luís Pedro Oliveira deMelo Freitas

Professor Adjunto ouequivalente Mestre Saúde Ocupacional 30.00 Ficha

submetidaMaria Beatriz Alves deSousa Santos

Professor Associadoou equivalente Doutor Engenharia Electrotécnica 100.00 Ficha

submetidaMaria da Piedade MoreiraBrandão

Professor Adjunto ouequivalente Doutor Ciências da Saúde - Epidemiologia 100.00 Ficha

submetidaMilton Rodrigues dosSantos

Professor Adjunto ouequivalente Doutor CTC da Instituição

proponente Ciências e Tecnologias da Saúde 100.00 Fichasubmetida

Nelson FernandoPacheco da Rocha

ProfessorCatedrático ouequivalente

Doutor Engenharia Electrotécnica 100.00 Fichasubmetida

Paula Maria Vaz Martins Professor Adjunto ouequivalente Doutor CTC da Instituição

proponente Ciências e Tecnologias da Saúde 100.00 Fichasubmetida

Pedro Miguel Ferreira de Professor Auxiliar ou Doutor Matemática 100.00 Ficha

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https://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/show/questionId/1edd9f80-6196-488a-e3d2-5bc5ad2c2767/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b/annexId/e746699a-bd75-e749-ac9b-5bf7e763763b

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Sá Couto equivalente submetida

Serafim Filipe da CunhaPinto

Professor Adjunto ouequivalente Licenciado

Título deespecialista (DL206/2009)

Ciências da saúde 100.00 Fichasubmetida

Sílvia de Francesco Professor Adjunto ouequivalente Doutor Engenharia Eletrotécnica 100.00 Ficha

submetida 1530

<sem resposta>

3.4. Dados quantitativos relativos à equipa docente do ciclo de estudos.

3.4.1. Total de docentes do ciclo de estudos (nº e ETI)

3.4.1.1. Número total de docentes. 16

3.4.1.2. Número total de ETI.

15.3

3.4.2. Corpo docente próprio do ciclo de estudos

3.4.2. Corpo docente próprio – docentes do ciclo de estudos em tempo integral / Number of teaching staff with a full time employment inthe institution.*

Corpo docente próprio / Full time teaching staff Nº de docentes / Staffnumber

% em relação ao total de ETI / % relativeto the total FTE

Nº de docentes do ciclo de estudos em tempo integral na instituição / No. of teaching staffw ith a full time link to the institution: 15 98.039215686275

3.4.3. Corpo docente do ciclo de estudos academicamente qualificado

3.4.3. Corpo docente academicamente qualificado – docentes do ciclo de estudos com o grau de doutor / Academically qualifiedteaching staff – staff holding a PhD

Corpo docente academicamente qualificado / Academicallyqualified teaching staff

Nº de docentes (ETI) / Staffnumber in FTE

% em relação ao total de ETI* / % relative tothe total FTE*

Docentes do ciclo de estudos com o grau de doutor (ETI) / Teaching staffholding a PhD (FTE): 14 91.503267973856

3.4.4. Corpo docente do ciclo de estudos especializado

3.4.4. Corpo docente do ciclo de estudos especializado / Specialised teaching staff of the study programme

Corpo docente especializado / Specialized teaching staffNº de docentes(ETI) / Staffnumber in FTE

% em relação ao totalde ETI* / % relative tothe total FTE*

Docentes do ciclo de estudos com o grau de doutor especializados nas áreas fundamentais do ciclo deestudos (ETI) / Teaching staff holding a PhD and specialised in the fundamental areas of the study programme 8 52.287581699346 15.3

Especialistas, não doutorados, de reconhecida experiência e competência profissional nas áreasfundamentais do ciclo de estudos (ETI) / Specialists not holding a PhD, w ith w ell recognised experience andprofessional capacity in the fundamental areas of the study programme

1.3 8.4967320261438 15.3

3.4.5. Estabilidade do corpo docente e dinâmica de formação

3.4.5. Estabilidade e dinâmica de formação do corpo docente / Stability and development dynamics of the teaching staff

Estabilidade e dinâmica de formação / Stability and tranning dynamicsNº de docentes(ETI) / Staff numberin FTE

% em relação ao total deETI* / % relative to the totalFTE*

Docentes do ciclo de estudos em tempo integral com uma ligação à instituição por um períodosuperior a três anos / Teaching staff of the study programme w ith a full time link to the institution forover 3 years

15.3 100 15.3

https://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/show/questionId/1edd9f80-6196-488a-e3d2-5bc5ad2c2767/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b/annexId/49ce6c96-437a-d892-f1e8-5bf7e76b4888

https://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/show/questionId/1edd9f80-6196-488a-e3d2-5bc5ad2c2767/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b/annexId/3ba9c11b-7dc6-2ec3-df1e-5bf7e7bf93aa

https://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/show/questionId/1edd9f80-6196-488a-e3d2-5bc5ad2c2767/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b/annexId/33b32e2b-67ca-f635-b073-5bf7e7c25018



Docentes do ciclo de estudos inscritos em programas de doutoramento há mais de um ano (ETI) /FTE number of teaching staff registered in PhD programmes for over one year

1 6.5359477124183 15.3

4. Pessoal Não Docente4.1. Número e regime de dedicação do pessoal não docente afeto à lecionação do ciclo de estudos.

5 elementos a 100%

4.1. Number and employment regime of the non-academic staff allocated to the study programme in the present year.

5 elements 100%

4.2. Qualificação do pessoal não docente de apoio à lecionação do ciclo de estudos.

Nautília Maia, Técnico Coordenador, Departamento de Eletrónica Telecomunicações e Informática, funções de coordenação

Ana Sofia Ribeiro, Técnico Superior, Departamento de Eletrónica Telecomunicações e Informática, apoio administrativo

Raquel Brito, Técnico Superior, Departamento de Ciências Médicas, funções académicas

Martina Fidalgo, Técnico Superior, Escola Superior de Saúde, apoio administrativo

Rui Silva, Técnico Superior, Escola Superior de Saúde, apoio informático

4.2. Qualification of the non-academic staff supporting the study programme.

Nautília Maia, Coordinator Officer, Electronics Telecommunications and Informatics Department, coordination duties

Ana Sofia Ribeiro, Superior Officer, Electronics Telecommunications and Informatics Department, administrative support

Raquel Brito, Superior Officer, Medical Sciences Department, academic duties

Martina Fidalgo, Superior Officer, School of Health Sciences, administrative support

Rui Silva, Superior Officer, School of health Sciences, IT support

5. Estudantes5.1. Estudantes inscritos no ciclo de estudos no ano letivo em curso

5.1.1. Estudantes inscritos no ciclo de estudos no ano letivo em curso

5.1.1. Total de estudantes inscritos. 24

5.1.2. Caracterização por género

5.1.1. Caracterização por género / Characterisation by gender

Género / Gender %

Masculino / Male 10Feminino / Female 90

5.1.3. Estudantes inscritos por ano curricular.

5.1.3. Estudantes inscritos por ano curricular / Students enrolled in each curricular year

Ano Curricular / Curricular Year Nº de estudantes / Number of students

1º ano curricular 102º ano curricular 14 24

5.2. Procura do ciclo de estudos.



5.2. Procura do ciclo de estudos / Study programme's demand

Penúltimo ano / One before thelast year

Último ano/ Lastyear

Ano corrente / Currentyear

N.º de vagas / No. of vacancies 20 20 20N.º de candidatos / No. of candidates 25 23 29N.º de colocados / No. of accepted candidates 17 11 20N.º de inscritos 1º ano 1ª vez / No. of f irst time enrolled 15 9 13Nota de candidatura do último colocado / Entrance mark of the lastaccepted candidate 12 11 11.3

Nota média de entrada / Average entrance mark 13.3 12.7 13.6

5.3. Eventual informação adicional sobre a caracterização dos estudantes

5.3. Eventual informação adicional sobre a caracterização dos estudantes. A maioria dos estudantes tem um perfil de graduação politécnica na área da imagem médica e radioterapia.

Cerca de 50% dos estudantes são já profissionais na área que buscam atualização e formação complementar na forma de pós-graduação universitária.

5.3. Eventual additional information characterising the students.

Most of the students has a polytechnic graduation profile as radiographers or radiotherapists. More than 50% of the students already professionals in the area seeking update and complementary education through a post-

graduate university degree.

6. Resultados6.1. Resultados Académicos

6.1.1. Eficiência formativa.

6.1.1. Eficiência formativa / Graduation efficiency

Antepenúltimo ano / Two beforethe last year

Penúltimo ano / One before thelast year

Último ano / Lastyear

N.º graduados / No. of graduates 8 6 2N.º graduados em N anos / No. of graduates in N years* 8 6 2N.º graduados em N+1 anos / No. of graduates in N+1 years 0 0 0N.º graduados em N+2 anos / No. of graduates in N+2 years 0 0 0N.º graduados em mais de N+2 anos / No. of graduates inmore than N+2 years 0 0 0

Pergunta 6.1.2. a 6.1.3.

6.1.2. Apresentar relação de teses defendidas nos três últimos anos, indicando, para cada uma, o título, o ano de conclusão e o resultadofinal (exclusivamente para cursos de doutoramento).

Características de desempenho do MPGD THCOBRA a operar em Ar/CH4, 2016. Estágio na Lenitudes Medical Center & Research: contributos para a implementação de um serviço de imagiologia mamária, 2016.

Relatório de estágio na Lenitudes Medical Center & Research: início de operações do equipamento PET/CT Discovery IQ™, 2016. Aterosclerose da aorta torácica e risco de complicações após TAVI, 2016

Hipertrofia ventricular direita pelo eletrocardiograma e ecocardiograma, 2016 Ajuste da tensão no tubo baseado em medidas antropometricas do tórax em exames de angiografia coronária por TCMD, 2016.

Relatórios estruturados em imagiologia mamária, 2016 Análise da consistência de informação imagiológica: estudo exploratório no âmbito RIS/PACS, 2016

Estudo sistemático de cenários de teleradiologia em Portugal, 2017 Discovery IQ 4R: otimização da imagem PET-CT em ambiente clínico, 2017

Processamento e análise em tomografia computorizada pulmonar: doenças pulmonares obstrutivas, 2017 Processamento e análise em tomografia computorizada pulmonar: pneumonia, 2017

Procedimentos training em PET: implementação no sistema easyPET, 2017 Estudo exploratório dos valores de SAR em ressonância magnética, 2017

Análise de workflow imagiológico em contexto de urgência no âmbito da Via Verde AVC, 2018 Volumetria de estruturas cerebrais profundas com imagem RM, 2018

6.1.2. List of defended theses over the last three years, indicating the title, year of completion and the final result (only for PhD



programmes). Performance Characteristics of MPGD THCOBRA operating in Ar/CH4, 2016

Internship at Lenitudes Medical Center & Research: contributes to the implementation of a breast imaging service, 2016 Report of na internship at Lenitudes Medical Center & Research: start of operations of a PET/CT Discovery IQ™ equipment, 2016

Thoracic aorta atherosclerosis and complication risk after TAVI , 2016 Right ventricular hipertrophy in electrocardiography and echocardiography, 2016

Tube voltage adjustment based on thorax anthropometric measurements in MSCT coronary angiography Structured reports on breast imaging, 2016

Consistence analysis in imaging data: exploratory study in RIS/PACS environment , 2016

Systematic study of teleradiology scenarios in Portugal, 2017

Discovery IQ 4R: PET-CT image optimization in clinical environment, 2017 Processing and analysis of pulmonary computed tomography: obstructive pulmonary diseases, 2017

Processing and analysis of pulmonary computed tomography: pneumonia, 2017 Training procedures in PET: implementation in easyPET system, 2017

Exploratory study of SAR values in magnetic resonance, 2017

Imaging workflow analysis in emergency environment in Via Verde AVC context, 2018

Volumetry of deep cerebral structures with MR imaging, 2018

6.1.3. Comparação do sucesso escolar nas diferentes áreas científicas do ciclo de estudos e respetivas unidades curriculares.

A visão das tecnologias da imagem médica que se procura transmitir neste curso é muito abrangente e está intrinsecamente ligadaao entendimento lato do ciclo de vida da imagem médica. Não há, para já evidência de insucesso escolar nas áreas científicas docurso assim como nas respetivas UCs regulares. Como seria de esperar registam-se mais dificuldades em áreas conceptualmentemais quantitativas e com contributos laboratoriais significativos. No entanto, como se pode ver em 6.1.2, é relevante constatar queos interesses dos alunos no que respeita a áreas do trabalho final se distribuem pelas diversas vertentes tecnológicas e científicasexploradas no curso.

A principal dificuldade regista-se com a conclusão do trabalho final de alguns alunos ao fim dos 3 semestres do ciclo de estudos. Háde fato alguns casos de alunos com a componente curricular concluída, mas que, na sua maioria, por restrições inerentes aatividades não académicas, não conseguiram até ao momento concretizar o trabalho final.

É de realçar que o nível académico das teses defendidas é francamente bom tendo dado algumas delas (6 casos) origem acomunicações e pubicações em congressos e até revistas em áreas científicas que integram o curso.

6.1.3. Comparison of the academic success in the different scientific areas of the study programme and the respective curricular units.

The vision of medical imaging technologies that is conveyed in this study cycle is broad and is closely coupled to the overallassessment of the life cycle of medical images. Therefore, the curricular units span also a broad range of scientific areas. There is noevidence of systematic lack of academic success in any particular scientific area as well as in the associated curricular units. Theresome expected difficulties with topics conceptually which are more prone to quantitative reasoning or require more experimentaltasks. However, as it can be seen in 6.1.2, students' interests in final project themes and quite diverse spanning the whole range ofscientific areas.

Concluding the thesis or final report shortly the 3 semester graduation cycle schedule seems difficult to achieve for most of thestudents. Given the typical student profile there are often external reasons due to non academic activities that impair the conclusionof the study cycle in due time frame.

The quality of the concluded thesis is in many cases worth mentioning. Several of them (6 cases) were further exposed to thespecialized audiences since they originated communications in well-known scientific meetings and or publications in peer-reviewedjournals in some of the areas of this study cycle.

6.1.4. Empregabilidade.

6.1.4.1. Dados sobre desemprego dos diplomados do ciclo de estudos (estatísticas da DGEEC ou estatísticas e estudos próprios, comindicação do ano e fonte de informação).

Cerca de 50% dos alunos são já profissionais na área das técnicas de diagnóstico por imagem. (Fonte, Serviços Académicos daUniversidade de Aveiro, 2018).

Há evidências informais de que alguns alunos (10) obtiveram emprego na área durante ou logo após a conclusão do curso. (Fonte:Comunicação pessoal ao Diretor de Curso)

6.1.4.1. Data on the unemployment of study programme graduates (statistics from the Ministry or own statistics and studies, indicating theyear and the data source).

Over 50% are already professionals in the area seeking scientific and technical graduation. (Source Academic Office - University ofAveiro, 2018).

There is informal evidence that some students (10) got employed in the area during or immediate conclusion of this study cycle.(Source: personal communication to the course Director)

6.1.4.2. Reflexão sobre os dados de empregabilidade.

NA

6.1.4.2. Reflection on the employability data.

NA



6.2. Resultados das atividades científicas, tecnológicas e artísticas.

6.2.1. Centro(s) de investigação, na área do ciclo de estudos, em que os docentes desenvolvem a sua atividade científica

6.2.1. Centro(s) de investigação, na área do ciclo de estudos, em que os docentes desenvolvem a sua actividade científica / ResearchCentre(s) in the area of the study programme, where the teachers develop their scientific activities

Centro de Investigação /Research Centre

Classificação (FCT) /Mark (FCT)

IES /Institution

N.º de docentes do ciclo de estudos integrados/ No. ofintegrated study programme’s teachers


IEETA Good University ofAveiro 8

I3N Outstanding Univesity ofAveiro 1 Lab.Assoc

iBiMED Excellent University ofAveiro 2

Pergunta 6.2.2. a 6.2.5.

6.2.2. Mapa-resumo de publicações científicas do corpo docente do ciclo de estudos em revistas internacionais com revisão por pares,livros ou capítulos de livros, ou trabalhos de produção artística, relevantes para o ciclo de estudos.

http://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/scientific-publication/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b 6.2.3. Mapa-resumo de outras publicações relevantes, designadamente de natureza pedagógica:

http://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/other-scientific-publication/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b 6.2.4. Atividades de desenvolvimento tecnológico e artístico, prestação de serviços à comunidade e formação avançada na(s) área(s)

científica(s) fundamental(ais) do ciclo de estudos, e seu contributo real para o desenvolvimento nacional, regional e local, a culturacientífica e a ação cultural, desportiva e artística.

Colaboração protocolada com centros de excelência clínica e/ou de investigação: CHVNG/Espinho

Lenitudes Medical Research Center ICNAS – Fac. Medicina da Universidade de Coimbra

IPO - Coimbra IPO - Porto.

Apoio e participação no XI Congresso Nacional de Neurorradiologia, Aveiro, 2015

Apoio e participação no XIII Congresso Nacional de Neurorradiologia, Aveiro, 2017 Apoio e participação no 1º Congresso Medical Imaging and Radiotherapy Aveiro Meeting, MIRAM 2017

Acolhimento de alunos em iniciativas da Academia de Verão da Universidade de Aveiro, 2016 a 2018 Palestra sobre imagem médica no programa Ciência Viva - Aveiro, 2016

6.2.4. Technological and artistic development activities, services to the community and advanced training in the fundamental scientificarea(s) of the study programme, and their real contribution to the national, regional or local development, the scientific culture and thecultural, sports or artistic activity.

There are collaboration protocols with leading clinical and research: CHVNG/Espinho

Lenitudes Medical Research Center, S. M. Feira ICNAS – Fac. Medicine, University of Coimbra

Portuguese Institute of Oncology - Porto Portuguese Institute of Oncology - Coimbra

Support and participation on the XI Portuguese Congress of Neuroradiology, Aveiro, 2015

Support and participation on the XIII Portuguese Congress of Neuroradiology, Aveiro, 2017 Support and participation on the first congress Medical Imaging and Radiotherapy Aveiro Meeting, MIRAM 2017

Medical Imaging events with students under the Summer School activities at the University of Aveiro, 2016 - 2018 Medical Imaging talk within Ciência Viva program in Aveiro, 2016

6.2.5. Integração das atividades científicas, tecnológicas e artísticas em projetos e/ou parcerias nacionais e internacionais, incluindo,quando aplicável, indicação dos principais projetos financiados e do volume de financiamento envolvido.

Alguns projetos em curso relacionados com a imagem médica no âmbito das atividades da unidades de investigação que suportameste curso

IEETA: Multimodal Information Retrieval in Medical Imaging Repositories, FCT, PTDC/EEI-ESS/6815/2014, 157285€

Image Analysis and Machine Learning Platform for Innovation in Diabetic Retinopathy Screening, Carnegie-Mellon - Portugal / FCT,CMUP-ERI/TIC/0028/2014, 156504€

European Health Data & Evidence Network, IMI2 806968, H2020 / IMI-JU, 626,250€ ESSUA

3R (Revitalizar a Reabilitação Respiratória) CENTRO-01-0145-FEDER-023926 (SAICT-POL/23926/2016), 63354€ I3N

Sistema de larga area para imagiologia por Fluorescencia de Raios X, PTDC/FIS-AQM/32536/2017, FCT Dual-ended Readout Innovative Method for Positron Emission Tomography,POCI-01-0145-FEDER-016855, PT 2020

EASYPET - PET pré clínico de alto desempenho com método simples de aquisição, CENTRO-01-0247-FEDER-017823, PT 2020,116.329,52€

http://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/scientific-publication/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b

http://www.a3es.pt/si/iportal.php/cv/other-scientific-publication/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b



6.2.5. Integration of scientific, technologic and artistic activities in projects and/or partnerships, national or international, including, whenapplicable, the main projects with external funding and the corresponding funding values.

Some Medical Imaging related projects included in the activities of the supporting research units: IEETA:

Multimodal Information Retrieval in Medical Imaging Repositories, FCT, PTDC/EEI-ESS/6815/2014, 157285€ Image Analysis and Machine Learning Platform for Innovation in Diabetic Retinopathy Screening, Carnegie-Mellon - Portugal / FCT,

CMUP-ERI/TIC/0028/2014, 156504€ European Health Data & Evidence Network, IMI2 806968, H2020 / IMI-JU, 626,250€

ESSUA 3R (Revitalizing Respiratory Rehabilitation) CENTRO-01-0145-FEDER-023926 (SAICT-POL/23926/2016), 63354€

I3N Large Area X-Ray Fluorescence Medical Imaging System , PTDC/FIS-AQM/32536/2017, FCT

Dual-ended Readout Innovative Method for Positron Emission Tomography, POCI-01-0145-FEDER-016855, PT 2020 Preclinical EASY-PET with high performance and simple acquisition method, CENTRO-01-0247-FEDER-017823, PT 2020, 116.329,52€

6.3. Nível de internacionalização.

6.3.1. Mobilidade de estudantes e docentes

6.3.1. Mobilidade de estudantes e docentes / Mobility of students and teaching staff

%

Alunos estrangeiros matriculados no ciclo de estudos / Foreign students enrolled in the study programme 3Alunos em programas internacionais de mobilidade (in) / Students in international mobility programmes (in) 1Alunos em programas internacionais de mobilidade (out) / Students in international mobility programmes (out) 1Docentes estrangeiros, incluindo docentes em mobilidade (in) / Foreign teaching staff, including those in mobility (in) 0Mobilidade de docentes na área científ ica do ciclo de estudos (out) / Teaching staff mobility in the scientif ic area of the study (out). 1

6.3.2. Participação em redes internacionais com relevância para o ciclo de estudos (redes de excelência, redes Erasmus).

6.3.2. Participação em redes internacionais com relevância para o ciclo de estudos (redes de excelência, redes Erasmus). Um docente em mobilidade ERASMUS

6.3.2. Participation in international networks relevant for the study programme (excellence networks, Erasmus networks, etc.).

Um member of teaching staff in the mobility program ERASMUS

6.4. Eventual informação adicional sobre resultados.

6.4. Eventual informação adicional sobre resultados. O nível de mobilidade internacional discente e docente é ainda incipiente. O reforço da mobilidade poderá ser incrementado através

de acções concertadas quer ao nível das unidades orgânicas que suportam o curso quer ao nível da Reitoria. Essas acções deverãoincluir facilitação do serviço docente no caso dos docentes, apoio logístico, e divulgação pelos canais habituais passando a incluirvisibilidade relevante nas principais redes socais. A divulgação informal de forma rápida e em larga escala é hoje uma práticainevitável na promoção de iniciativas de mobilidade.

É de registar no entanto a crescente procura por parte de estudantes do Brasil. A efetivação da matrícula é muitas vezescomprometida por condicionantes sócio-económicas.

6.4. Eventual additional information on results.

The level of international mobility is still sparse. To increase the international mobility some concerted actions should possibility beundertaken both at the supporting departments and at the Rectory itself. These actions should include facilitation of teaching duties (incase of teaching staff), logistic support and information spread through institutional channels and also with a relevant visibility withinthe major social networks. Informal dissemination is currently an unavoidable asset in fast and large scale mobility programspromotion.

Particularly, in this study cycle there is already enough evidence that there is an increasing trend of Brazilian candidates. The actualenrolment is often compromised by socio-economic constraints.

7. Organização interna e mecanismos de garantia da qualidade7.1 Existe um sistema interno de garantia da qualidade certificado pela A3ES

7.1. Existe um sistema interno de garantia da qualidade certificado pela A3ES (S/N)? Se a resposta for afirmativa, a Instituição tem apenas que preencher os itens 7.1.1 e 7.1.2, ficando dispensada de preencher as secções

7.2.



Se a resposta for negativa, a Instituição tem que preencher a secção 7.2, podendo ainda, se o desejar, proceder ao preenchimentofacultativo dos itens 7.1.1 e/ou 7.1.2.

Sim

7.1.1. Hiperligação ao Manual da Qualidade.

https://www.ua.pt/sigq/page/22105 7.1.2. Anexar ficheiro PDF com o último relatório de autoavaliação do ciclo de estudos elaborado no âmbito do sistema interno de garantia

da qualidade (PDF, máx. 500kB). 7.1.2._RelCurso_9251_2017_2018.pdf

7.2 Garantia da Qualidade

7.2.1. Mecanismos de garantia da qualidade dos ciclos de estudos e das atividades desenvolvidas pelos Serviços ou estruturas de apoioaos processos de ensino e aprendizagem, designadamente quanto aos procedimentos destinados à recolha de informação (incluindo osresultados dos inquéritos aos estudantes e os resultados da monitorização do sucesso escolar), ao acompanhamento e avaliaçãoperiódica dos ciclos de estudos, à discussão e utilização dos resultados dessas avaliações na definição de medidas de melhoria e aoacompanhamento da implementação dessas medidas.

<sem resposta>

7.2.1. Mechanisms for quality assurance of the study programmes and the activities promoted by the services or structures supportingthe teaching and learning processes, namely regarding the procedures for information collection (including the results of student surveysand the results of academic success monitoring), the monitoring and periodic assessment of the study programmes, the discussion anduse of the results of these assessments to define improvement measures, and the monitoring of their implementation.

<no answer>

7.2.2. Indicação da(s) estrutura(s) e do cargo da(s) pessoa(s) responsável(eis) pela implementação dos mecanismos de garantia daqualidade dos ciclos de estudos.

<sem resposta>

7.2.2. Structure(s) and job role of person(s) responsible for implementing the quality assurance mechanisms of the study programmes.

<no answer>

7.2.3. Procedimentos de avaliação do desempenho do pessoal docente e medidas conducentes à sua permanente atualização edesenvolvimento profissional.

<sem resposta>

7.2.3. Procedures for the assessment of teaching staff performance and measures for their continuous updating and professionaldevelopment.

<no answer>

7.2.3.1. Hiperligação facultativa ao Regulamento de Avaliação de Desempenho do Pessoal Docente.

<sem resposta>

7.2.4. Procedimentos de avaliação do pessoal não-docente e medidas conducentes à sua permanente atualização e desenvolvimentoprofissional.

<sem resposta>

7.2.4. Procedures for the assessment of non-academic staff performance and measures for their continuous updating and professionaldevelopment.

<no answer>

7.2.5. Forma de prestação de informação pública sobre o ciclo de estudos.

<sem resposta>

7.2.5. Means of providing public information on the study programme.

<no answer>

7.2.6. Outras vias de avaliação/acreditação nos últimos 5 anos.

<sem resposta>

7.2.6. Other assessment/accreditation activities over the last 5 years.

<no answer>

8. Análise SWOT do ciclo de estudos e proposta de ações de melhoria

https://www.ua.pt/sigq/page/22105

https://www.a3es.pt/si/iportal.php/process_form/download/formId/9d728e2f-8595-9e17-6de3-5be2c232333b/questionId/2214d93d-f15b-2b68-0bcf-5bc5adbcb115



8.1 Análise SWOT global do ciclo de estudos

8.1.1. Pontos fortes A Universidade de Aveiro (UA ) tem reputação consolidada no ensino, investigação e desenvolvimento nas áreas científicas queconformam esta proposta.

É uma proposta para pós-graduação universitária reunindo as melhores e mais relevantes valências multi-departamentais da UA. Ocariz universitário é claramente apelativo e diferenciador face a propostas afins quer nacionais quer internacionais.

O desenho tri-semestral é apelativo para uma parte significativa do público alvo com licenciaturas de 240 ECTS de cariz politécnicona área da imagem médica e radioterapia e que, dada a rápida evolução tecnológica, necessitam de atualização oportuna.

A aposta na vertente tecnológica é comprovadamente pertinente e diferenciadora tomando como referência o êxito à entrada e àsaída das atuais formações de primeiro ciclo nas áreas de Imagem Médica e Radioterapia bem como a procura sistemática por partede alunos já profissionais

O corpo docente apresenta um perfil coerente, quase integralmente doutorado, experiente na lecionação dos conteúdos aquipropostos bem como na supervisão de trabalhos finais (dissertações, projetos e estágios). Por outro os docentes são tambéminvestigadores associados às várias unidades de investigação (UIs) da UA com atividade relevante na área biomédica

Está garantido o acesso a recursos computacionais topo de gama para processamento de imagem médica. Está garantido o acesso intra-institucional a sistemas de aquisição de imagem médica para efeitos de prática laboratorial.

Há suporte das UIs para a concretização de projetos nas áreas científicas do curso com destaque para a UC de Projeto/Estágio nosemestre final.

Há colaboração protocolada com centros de excelência clínica e/ou de investigação: eg. CHVNG/Espinho, Lenitudes MedicalResearch Center, ICNAS – Fac. Medicina da Universidade de Coimbra, IPO, (Coimbra e Porto).

O desenho curricular desta proposta permite e fomenta a interação com parceiros industriais em múltiplas instâncias. O desenho curricular desta proposta é sucifientemente flexível para uma adequação conveniente em termos de contéudos e

métodos a novos desafios emergentes na área imagem médica.

8.1.1. Strengths

The University of Aveiro (UA) has a solid reputation in education, research and development in the scientific areas that support thisproposal.

It is a university post-graduate degree gathering the best and most relevant multi-departmental resources of the University of Aveiro.This type of post-graduation proposal combining updated solid and broad conceptual teaching with practical and quantitative skills isa factor of increased appeal when compared to similar national or international graduation initiatives.

The emphasis on the technological perspective is taken as adequate and distinguishing with practical evidence on the input andoutput success of the actual first cycle degrees in the areas of Medical Imaging and Radiotherapy (240 ECTS).

The teaching staff has a coherent profile, it is highly graduate and experienced in teaching the proposed contents as well insupervising final works (theses, projects). Moreover, most of the teaching staff is involved in research within the several units at theUA with relevant activities in the biomedical area.

State of the art computational resources are granted for medical image processing. Medical image acquisition equipment is available for laboratory practice.

The supporting research units may actively convey opportunities to foster final work proposals There are collaboration protocols with leading clinical and research: CHVNG/Espinho, Lenitudes Medical Research Center, ICNAS –

Fac. Medicina da Universidade de Coimbra, IPO, (Coimbra e Porto). Interaction with industry partners is made possible through a flexible curricular structure.

The flexible curricular structure will be able to cope with and teaching and learning challenges associated with rapidly emerging topicsin the medical imaging area.

8.1.2. Pontos fracos

A natureza transdisciplinar do ciclo de estudos implica uma articulação pedagógica e científica entre todos os atores do processoensino aprendizagem que não é trivial.

A abrangência de públicos de formação inicial com latitudes diferentes implica um esforço de equalização pedagógica e científicaarriscado que pode ir além do que a oferta de UCs opcionais propõe.

UCs opcionais de 12 ECTS levantam problemas de concretização letiva. Dado o perfil mais comum dos alunos tal levanta questõesde adequação horária nem sempre exequíveis. O curso nesse sentido deve ser reconfigurado para melhor se adaptar ao perfil maiscomum dos alunos.

A Universidade de Aveiro possui hoje valências de ensino e investigação na área da imagem médica e ou biomédica que não estãoainda refletidas no curso e que podem incrementar a sua visiblilidade.

O número de alunos que conclui o curso ao fim de exatamente 3 semestres letivos é ainda reduzido.Trata-se duma consequência dosestudantes serem muitas vezes profissionais e terem dificuldades de compromisso com o seu projeto final. Impõem-se entretantomedidas que visem minimizar esta situação.

A UC final Projeto/Estágio deveria ter formalmente reconhecida como Dissertação/Projeto/Estágio. A mobilidade internacional ao nível docente e discente é ainda incipiente.

8.1.2. Weaknesses

The trans-disicplinary nature of this study cycle implies a non-trivial pedagogical and scientific articulation among all the actors of thelearning and teaching process.

The wide latitude of scientific background of the potential candidates requires an effort of pedagogical and scientific equalization thatis risky and may go, eventually, beyond what is offered by the optional courses.

Optional curricular units of 12 ECTS raise academic implementation issues. The common profile of the students is often unsuited tothe demanding schedules of these units. Thus there is an implicit requirement to adjust the offer of optional curricular units in thesecond semester.

Currently the University of Aveiro gathers more teaching and research resources in the medical or biomedical imaging area that arenot yet reflected in this course and might contribute to increase the audience and overall attractiveness of the course.

The number of students that graduate by the end of the exact 3 semester period is still scarce. In most of the cases,this a direct aconsequence of the difficulty in managing professional schedules and the commitment to the final semester project.

Preventive actions should be implemented in order to minimize this situation.



The last Curricular Unit Project/Traineeship should formally be recognised as Thesis/Project/Traineeship. The international mobility is still sparse.

8.1.3. Oportunidades

1 - A oferta deste curso corresponde à oportunidade da UA demonstrar uma visão moderna, abrangente e diferenciada na formaçãouniversitária pós-graduada na área das tecnologias de imagem médica.

2 - Oportunidade de interagir mais de perto com parceiros industriais e institucionais responsáveis pela formação clínica pós-graduada. Trata-se duma abordagem que vai no sentido de facilitar o acesso ao mercado de trabalho dos nossos formandos.

3 - Oportunidade de estreitar formação pós-graduada de nível elevado com investigação científica que se desenvolve nas UIs desuporte e, portanto, abrir o caminho para percursos doutorais nesta área.

4 - A implementação deste ciclo de estudos ficará naturalmente sob escrutínio de entidades idóneas no que respeita à acreditaçãopedagógica e científica. No pressuposto do sucesso da implementação cremos estarem reunidas as condições para se procuraremoutros níveis de acreditação nomeadamente junto de entidades sócio-profissionais nacionais e internacionais relevantes nesta área.

5 - Oportunidade de também nesta área incrementar a atratividade internacional da UA.

8.1.3. Opportunities

1 - This of this study cycle is indeed an opportunity for the UA to exhibit a modern, wide scope, and distinguishing vision about post-graduate education at the university level in the medical imaging area.

2 - This degree is designed to promote the interaction with industry partners and or other institutional partners responsible for high-level clinical education. We believe there is an implicit potential to facilitate the access to employment for our students.

3 - This degree will be lectured in tight cooperation with the supporting research units and we have legitimate expectations that newPhD students will thus be attracted to work in this area.

4 -This degree will be under the scrutiny of the proper official entities concerning pedagogical and scientific performance. Upon theassumption of successful implementation, we believe there will be conditions to seek other levels of accreditation manly within themost relevant national and international and professional societies.

5 - This course will contribute to increase the international attractiveness level of the University of Aveiro.

8.1.4. Constrangimentos

Há evidências informais que conjunturas socioeconómicas adversas podem em última instância constituir um óbice para afluênciaque se deseja para um curso destes.

É ainda evidente a falta de clarificação por parte dos empregadores que a pós-graduação nesta área deve conduzir e contribuir paraum efetivo progresso na carreira profissional.

8.1.4. Threats

There is informal evidence that adverse socio-economic conditions may be a factor that may ultimately prevent the students tocommit with post-graduation even with moderate to low tuition fees.

There is still a lack of practical and effective recognition by employers that post-graduate qualifications should lead and contribute tocareer progress is also a factor that still undermines the attendance for post-graduate education.

8.2. Proposta de ações de melhoria


8.2.1. Ação de melhoria Reconfigurar a oferta de UCs no 2 semestre:

12 ECTS optativas passam a 6 ECTS obrigatórios para a UC Processamento Digital de Imagem Médica + 6 ECTS para Opção II. Opção II: Imagem Biomédica ou Aplicações Clínicas (Radioterapia) ou outras que num futuro próximo decorram de interesse

científico e pedagógico associados a tópicos emergentes: ( por exemplop: Radiomics, Inteligência Artificial e Imagem Médica)

Justificação: Ver secção 4 para mais detalhes

8.2.1. Improvement measure

Reconfigure the course layout in the second semester. 12 optional ECTS are reconfigured into 6 mandatory ECTS: Digital Medical Image Processing) and 6 optional ECTS for optional

curricular unit II: Biomedical Imaging, or Clinical Applications (Radiotherapy) or other that, in a near future, associated with emergingtopics (eg. Radiomics, Artificial Intelligence in Medical Imaging).

Refer to section 4 for a more detailed justification.

8.2.2. Prioridade (alta, média, baixa) e tempo de implementação da medida

Alta. A ser implementada de imediato

8.2.2. Priority (high, medium, low) and implementation time.

High. Immediate implementation.

8.1.3. Indicadores de implementação

Receptividade dos alunos. Inquéritos pedagógicos



Quantidade e qualidade de trabalhos finais na área

8.1.3. Implementation indicator(s)

Student appreciation. Pedagogical quality control.

Quantity and quality of final projects in the area


8.2.1. Ação de melhoria Reforço do acompanhamento dos alunos profissionais a realizarem o projeto final.

Incrementar a prática de sessões de apoio online.


Reinforcement of the supervision of professional students in their final project. Increase the level of online support sessions.


Alta. Implementação imediata


High. Immediate implementation


Decréscimo do atraso médio na conclusão do trabalho final bem na redação da tese ou relatório de projeto ou estágio


Decrease of the average delay in the conclusion of the final work as well as the respective written components in the form of thethesis, project or traineeship report


8.2.1. Ação de melhoria Mudar o nome da UC Projeto/Estágio para Dissertação/Projeto/Estágio

Justificação: Ver secção 1 ponto 2.


Change the name of the curricular unit Project/Estágio to Thesis/Projet/Traineeship Refer to section 1 number 2.


Alta. Implementação imediata


High. Immediate implementation


<sem resposta>


<no answer>

9. Proposta de reestruturação curricular (facultativo)9.1. Alterações à estrutura curricular

9.1. Síntese das alterações pretendidas e respectiva fundamentação No momento da criação deste Mestrado a área científica predominante era Ciências e Tecnologias da Saúde (CTS) refletindo opendor tecnológico deste curso. Entretanto a Universidade de Aveiro alterou o mapa oficial das suas áreas científicas impondo-se,portanto a devida adaptação. Assim todas as UCs associadas à área científica CTS passam, por proximidade científica, a estarassociadas à área Ciências da Saúde (CSAU) mantendo-se, no entanto, toda a vertente tecnológica. Mantêm-se os ECTS obrigatóriosem CSAU e sugerem-se algumas alterações menores em áreas científicas complementares que pretendem melhor ajustar os atuais



recursos da UA e as disponibilidades e interesses dos alunos. Genericamente o curso passa a ter uma matriz de 54 ECTSobrigatórios em CSAU, 24 ECTS obrigatórios em áreas científicas complementares e 12 ECTS opcionais em UCs de qualquer dasáreas científicas contempladas no curso.

O plano de estudos é alterado apenas no 2º semestre numa carga letiva correspondente a 12 ECTS atualmente opcionais, mas quese propõe que se reconfigurem do seguinte modo: Uma UC obrigatória: Processamento Digital de Imagem Médica (6 ECTS), uma deduas UCS opcionais (6 ECTS): Imagem Biomédica ou Aplicações Clínicas.

A prática demonstra que uma UC ligada ao Processamento de Imagem Médica deve ter estatuto obrigatório. A UC “ImagemBiomédica” na área científica das Ciências Biomédicas decorre do atual interesse e importância que a imagem de microscopiacelular tem no contexto da Biomedicina. Havendo recursos humanos e materiais por parte do Departamento de Ciências Médicas(DCM) da UA julgou-se pertinente propor uma UC que permitisse ao público alvo do mestrado, através de aprendizagem baseada emcasos de estudo, o contacto conceptual e laboratorial com as diversas valências da Imagem Biomédica. Serão privilegiadas astécnicas de microscopia de transmissão e fluorescência assim como os workflows daí resultantes com ênfase para análisecomputorizada das imagens.

A UC Aplicações Clínicas instancia a importância das tecnologias da imagem médica num contexto clínico específico. Assim surgeuma proposta focada na Radioterapia (RT) onde o objetivo principal será entender o papel da imagem em todas as etapas da RT, doplaneamento ao tratamento, fornecendo ferramentas para o desenvolvimento de competências de análise e manipulação dasimagens envolvidas no processo. Aproveitam-se os recursos humanos e logísticos existentes na UA (Laboratório com Workstationsde Planeamento em RT) assim como as parcerias existentes com centros clínicos de referência (Lenitudes Medical and ResearchCenter, S. M. Feira, IPO ). A evolução tecnológica tem demonstrado o papel acrescido das tecnologias de imagem na terapêutica porRT, onde o conhecimento e o domínio de técnicas de processamento são determinantes nos workflows cada vez maispersonalizados que caracterizam os processos terapêuticos em RT.

A UC Projeto/Estágio deverá adotar a designação Dissertação/Projeto/Estágio

9.1. Synthesis of the proposed changes and justification.

At the time of the creation of this MSc, its predominant scientific area was Health Sciences and Technologies (Ciências e Tecnologiasda Saúde - CTS), reflecting the technological tendency of this course. In the meanwhile, the University of Aveiro changed its officialmap of scientific areas, being necessary an adjustment. All the Curricular Units (CU) in the CTS scientific area are now associated tothe Health Sciences area (Ciências da Saúde - CSAU), keeping up with all the technological aspects. The mandatory ECTS in CSAUare kept and some minor changes are suggested in the complementary scientific areas for a better adjustment to the resources ofUA and the availability and interest of the students. In general terms, the course will have 54 mandatory ECTS in CSAU area, 24mandatory ECTS in complementary areas and 12 optional ECTS in CU in any of the scientific areas of the course.

The course structure will change just in the 2nd semester: 12 ECTS currently optional will be reorganized in two CU: one mandatory(Medical Image Digital Processing - 6 ECTS) and two optional (Biomedical Imaging - 6 ECTS, and Clinical Applications - 6 ECTS).

Practice demonstrates that a CU of Medical Image Digital Processing should be mandatory. The CU of Biomedical Imaging, in thescientific area of Biomedical Sciences, results from the interest and relevance that cellular microscopy imaging has in theBiomedicine context. Since the Department of Medical Sciences (DCM) has the necessary human and material resources, the UAconsiders adequate to propose this CU in order to provide the target public of the MSc, through case study-based learning, theconceptual and laboratorial contact with different aspects of biomedical imaging. Transmission and fluorescence microscopytechniques as well as the resulting workflows will be naturally privileged, with emphasis on computerized image analysis.

The CU of Clinical Applications is intended to instantiate the importance of medical imaging in a specific clinical context. In this sense,a proposal focused on Radiotherapy (RT) is presented, being the main goal to understand the imaging role in the all the stages of RT,from planning to treatment, offering tools for the development of skills in analysis and manipulation of the images involved in theprocess. The UA human and logistics resources will be availed (laboratory equipped with Varian RT planning workstations), as wellas existing partnerships with reference clinical centres (Lenitudes Medical and Research Center, S. M. Feira, Portuguese Institute ofOncology). The fast technologic evolution has shown the rising role of medical imaging technologies in RT, being important theknowledge and domain of processing techniques which are determinant in the personalized workflows characterizing the therapeuticprocess in RT.

The final CU Project/Traineeship should be named Thesis/Project/Traineeship.

9.2. Nova estrutura curricular pretendida (apenas os percursos em que são propostas alterações)

9.2. Estrutura única

9.2.1. Ramo, opção, perfil, maior/menor ou outra (se aplicável): Estrutura única

9.2.1. Branch, option, profile, major/minor or other (if applicable).

Single structure

9.2.2. Áreas científicas e créditos necessários à obtenção do grau / Scientific areas and number of credits to award the degree

Área Científica / Scientific Area Sigla / Acronym ECTS Obrigatórios /Mandatory ECTS

ECTS Optativos / OptionalECTS*


Ciências da Saúde CSAU 54 0Informática I 6 0Gestão GES 6 0Física FIS 6 0Electrotecnia ELE 6 0Electrotecnia/Física/Ciências da Saúde/CiênciasBiomédicas ELE/FIS/CSA/CBM 0 12

(6 Items) 78 12



9.3. Plano de estudos

9.3. Plano de estudos - - 1º Ano / 1º Semestre

9.3.1. Ramo, variante, área de especialização do mestrado ou especialidade do doutoramento (se aplicável): <sem resposta>

9.3.1. Branch, option, specialization area of the master or speciality of the PhD (if applicable):

<no answer>

9.3.2. Ano/semestre/trimestre curricular:

1º Ano / 1º Semestre

9.3.2. Curricular year/semester/trimester:

1st Year / 1st Semester

9.3.3 Plano de estudos / Study plan

Unidades Curriculares /Curricular Units

Área Científica /Scientific Area (1)

Duração /Duration (2)

Horas Trabalho /Working Hours (3)

Horas Contacto /Contact Hours (4) ECTS Observações /

Observations (5)

Redes e Serviços em Imagiologia I Semestral 162 TP-45 6Informática na Medicina e naInvestigação Clínica CSAU Semestral 162 TP-45 6

Organização e Gestão emImagiologia GES Semestral 162 TP-45 6

Instrumentação para FísicaMédica FIS Semestral 162 TP-45 6

Opção I ELE/FIS/CSAU Semestral 162 TP-45 6 OP(5 Items)

9.3. Plano de estudos - - 1º ano / 2º semestre



<no answer>


1º ano / 2º semestre


1st year / 2nd semester







Observations (5)

Tópicos Avançados emImagiologia CSAU Semestral 162 TP-45 6

Processamento Digital deImagem Médica ELE Semestral 162 TP-45 6

Seminário CSAU Semestral 324 S-30 12Opção II CBM/CSAU Semestral 162 TP-45 6 OP(4 Items)

9.3. Plano de estudos - - 2º ano / 1º semestre



<no answer>




2º ano / 1º semestre


2nd year/ 1st semester







Observations (5)

Dissertação / Projeto / Estágio CSAU Semestral 810 OT-20 30(1 Item)

9.3. Plano de estudos - - 1º Ano / 1º Semestre - UCs opcionais



<no answer>


1º Ano / 1º Semestre - UCs opcionais


1st Year / 1st Semester - Optional CUs







Observations (5)

Conceitos em AnatomiaImagiológica CSAU Semestral 162 TP-45 6 OP

Modalidades de ImagemMédica CSAU Semestral 162 TP-45 6 OP

Física da Radiação FIS Semestral 162 TP-45 6 OPSistemas e Sinais emImagiologia ELE Semestral 162 TP-45 6 OP

(4 Items)

9.3. Plano de estudos - - 1º ano / 2º semestre - UCs Opcionais



<no answer>


1º ano / 2º semestre - UCs Opcionais


1º year / 2nd semester - Optional CUs







Observations (5)

Imagem Biomédica CBM Semestral 162 TP-45 6 OPAplicações Clínicas CSAU Semestral 162 TP-45 6 OP



(2 Items)

9.4. Fichas de Unidade Curricular

Anexo II - Imagem Biomédica

9.4.1.1. Designação da unidade curricular: Imagem Biomédica

9.4.1.1. Title of curricular unit:

Biomedical Imaging

9.4.1.2. Sigla da área científica em que se insere:

CBM

9.4.1.3. Duração:

Semestral

9.4.1.4. Horas de trabalho:

162

9.4.1.5. Horas de contacto:

TP-45

9.4.1.6. ECTS:

6

9.4.1.7. Observações:

Opcional

9.4.1.7. Observations:

Optional

9.4.2. Docente responsável e respetiva carga lectiva na unidade curricular (preencher o nome completo):

Sandra Isabel Moreira Pinto Vieira (7.5 TP)

9.4.3. Outros docentes e respetivas cargas lectivas na unidade curricular:

Maria de Lourdes Gomes Pereira (7.5 TP) Carla Alexandra Nunes (7.5 TP)

Daniela Maria Oliveira Gandra Ribeiro (7.5 TP) Augusto Silva (7.5 TP)

Silvia De Francesco (7.5 TP)

9.4.4. Objetivos de aprendizagem (conhecimentos, aptidões e competências a desenvolver pelos estudantes):

OA1. Identificar diferentes tipos de amostras biológicas e conhecer conceitos básicos de histologia e patologia. OA2. Aplicar técnicas de histologia, histoquímica e marcação colorimétrica.

OA3. Manipular microscópios ópticos de luz transmitida e saber adquirir bioimagens de histologia. OA4. Obter bioimagens por técnicas de citoquímica e de microscopia de fluorescência

OA5. Identificar a relevância da análise qualitativa e quantitativa de imagens de histologia e citologia em biomedicina OA6. Adquirir competências no domínio do processamento de imagem biomédica orientado para a extração de informação

qualitativa e quantitativa de bioimagens

9.4.4. Learning outcomes of the curricular unit:

LO1. To identify different types of biological samples and know basic concepts of histology and pathology. LO 2. To apply techniques of histology, histochemistry and colorimetric staining.

LO 3. To manipulate optical microscopes of transmitted light and know how to acquire histologic bioimages LO4. To obtain bioimages by cytochemistry and fluorescence microscopy techniques

LO5. To identify the relevance of qualitative and quantitative analyses of histologic and cytological images in biomedicine LO6. To acquire competences in the field of biomedical image processing aimed at the extraction of qualitative and quantitative

information

9.4.5. Conteúdos programáticos:

Módulo 1 – Histologia Microscopia de transmissão Tipos de amostras biológicas e conceitos básicos de histologia e patologia

Técnicas de histologia e marcação colorimétrica Princípios básicos de microscopia de luz transmitida e aquisição de bioimagens.



Aplicação de imagens histológicas em investigação e diagnóstico clinico – extração de informação qualitativa e quantitativa (case-studies).

Módulo 2 – Citoquímica e Microscopia de fluorescência Cultura de células e suas imagens em investigação médica

Princípios básicos e execução prática de técnicas de citoquímica Princípios de microscopia de fluorescência e aquisição prática de imagens

Aplicação de imagens de citologia a questões científicas e de diagnóstico (Journal club) Módulo 3 – Processamento de Bioimagem

Demografia: contagem e clustering Morfologia celular

Seguimento de estruturas celulares Co-localização

Reconhecimento e/ou interpretação com base em técnicas de “machine learning” Plataformas de SW: ImageJ, ilastik, icy

9.4.5. Syllabus:

Module 1 - Histology & Transmitted Light Microscopy Types of biological samples and basic concepts of histology and pathology

Histology and colorimetric techniques Basic principles of transmitted light microscopy and acquisition of bioimages

Application of histological images to research and clinical diagnosis - extraction of qualitative and quantitative information (case-studies).

Module 2 - Cytochemistry and Fluorescence Microscopy

Cell culture and cell culture images in medical research Basic principles and practical implementation of cytochemistry techniques

Principles of fluorescence microscopy and image acquisition (practical) Application of cytological images to scientific and diagnostic questions (Journal club)

Module 3 - Bioimages Processing Demography: counting and clustering

Cellular morphology Follow-up of cellular structures

Co-localization Recognition and/or interpretation based on "machine learning" techniques

SW Platforms: ImageJ, ilastik, icy

9.4.6. Demonstração da coerência dos conteúdos programáticos com os objetivos de aprendizagem da unidade curricular

Nos módulos 1 e 2, os estudantes começarão por adquirir conceitos de histologia, histoquímica e marcação colorimétrica, e demanipulação de microscópios ópticos de luz transmitida - o conhecimento necessário para a obtenção de bioimagens de histologia(OAs1-3). Prosseguirão para a apreensão de conceitos básicos de cultura de células de mamífero e de técnicas de sua marcaçãousando sondas fluorescentes (OA4). Estes conceitos serão aplicados, em ambiente laboratorial, à geração de bioimagens dehistologia e citologia utilizando a microscopia óptica de luz transmitida e de fluorescência (OA2, OA3 e OA4). As aulas TP de jornal-club/case-studies ajudarão os estudantes a atingir o OA5. No terceiro módulo os estudantes adquirirão competências do domínio doprocessamento da imagem biomédica tendo em conta a pertinência da sua aplicação no âmbito dos módulos 1 e 2. O recurso a SWatual e de amplo reconhecimento será o veículo fundamental para se atingirem e consolidarem os OA5 e OA6

9.4.6. Demonstration of the syllabus coherence with the curricular unit's learning objectives.

In modules 1 and 2, students will begin by acquiring concepts of histology, histochemistry and colorimetric staining, and manipulationof optical microscopes using transmitted light methodologies - the knowledge needed to obtain histologic bioimages (LOs1-3).Subsequently, they will apprehend basic concepts on mammalian cell culture and labelling techniques using fluorescent probes(LO4). These concepts will be applied, under a laboratory environment, to the generation of histology and cytology bioimages usingtransmitted and fluorescence light microscopy (LOs 2-4). TP classes from journal club/case-studies will help students to achieve LO5.In the third module students will acquire competences in the field of biomedical image processing, taking into account the relevanceof their application in the scope of modules 1 and 2. The use of current and widely recognized SW will be a fundamental vehicle forreaching and consolidating LO5 and LO6.

9.4.7. Metodologias de ensino (avaliação incluída):

A metodologia de aprendizagem usada centra-se no estudante, e inclui seminários e aulas TP onde a relevância dos conceitosapreendidos e problemáticas científicas associadas são discutidos em formato ‘journal club’. A UC terá uma componente de ‘hands-on’, em contexto laboratorial, envolvendo técnicas de histologia e de citologia e de microscopia ótica, complementadas por mini-projetos de processamento de bioimagem.

A avaliação, de carácter contínuo, inclui as seguintes ferramentas:

Módulo 1: 30% Apresentação de um artigo em ‘journal club’ 15% (em grupo)

Mini-teste sobre histologia e suas bioimagens 15% (individual)

Módulo 2: 30% Apresentação de um artigo em ‘journal club’ 15% (em grupo)

Mini-teste sobre citoquímica e suas bioimagens 15% (individual)

Módulo 3: 40% Mini-projeto em processamento de bioimagem 40% (individual)



9.4.7. Teaching methodologies (including evaluation):

The learning methodology used focuses on the student and includes seminars and TP classes where the relevance of theapprehended concepts and associated scientific problems are discussed in journal club format. The UC will have a hands-oncomponent, in laboratory context, involving histology, cytology and optical microscopy techniques, complemented by mini-bioimagingprocessing projects.

The evaluation, on a continuous basis, includes the following tools:

Module 1: 30% Presentation of a manuscript in ‘journal club’ 15% (group work)

Mini-exam about histology and bioimaging 15% (individual)

Module 2: 30% Presentation of a manuscript in ‘journal club’ 15% (group work)

Mini-exam about cytology and bioimaging 15% (individual)

Module 3: 40% Mini-project in bioimaging processing 40% (individual)

9.4.8. Demonstração da coerência das metodologias de ensino com os objetivos de aprendizagem da unidade curricular.

De forma a compreender como se obtêm bioimagens de histologia e de cultura de células por técnicas de histoquímica e citoquímicae de microscopia óptica de luz transmitida e microscopia de fluorescência (OA1-OA4), os estudantes irão ser introduzidos aosprincípios básicos destas técnicas por seminários com peritos, e irão integrar e aplicar esses conhecimentos em aulas em contextolaboratorial. De seguida irão discutir a informação que se pode extrair dessas bioimagens de forma a responder a questõescientíficas, baseando-se quer nas bioimagens obtidas em contexto laboratorial quer na literatura que irão debater em aula TP emformato journal club. Irão assim identificar a relevância da análise qualitativa e quantitativa destas bioimagens em biomedicina.Nesse sentido, os estudantes irão explorar técnicas de processamento de bioimagem recorrendo a SW de prototipagem rápida desoluções de análise e reconhecimento. A utilização destas ferramentas computacionais em modo “problema-based” contribuirá,paralelamente, para a consolidação conceptual associada aos OA5 e OA6

9.4.8. Demonstration of the coherence between the teaching methodologies and the learning outcomes.

In order to understand how histology and cell culture bioimages are obtained through histochemistry and cytochemistry techniquesas well as transmitted light optical microscopy and fluorescence microscopy (OA1-OA4), the students will be introduced to the basicprinciples of these techniques by seminars with experts and will apply this knowledge in practical laboratory classes. They will thendiscuss the information that can be extracted from these bioimages in order to answer scientific questions, based both on the imagingobtained in laboratory context and on the literature that will be debated in TP classes in journal club format. They will thus identify therelevance of qualitative and quantitative analysis of these bioimages in biomedicine. In that sense, students will explore bioimagingtechniques using rapid prototyping SW analysis and recognition solutions. The use of these computational tools in "problem-based"mode will contribute, in parallel, to the conceptual consolidation associated with OA5 and OA6.

9.4.9. Bibliografia de consulta/existência obrigatória:

1. Shorte, Spencer L., Frischknecht, Friedrich (Eds.), Imaging Cellular and Molecular Biological Functions, Springer, 2007 2. Winnok H. De Vos Sebastian Munck Jean-Pierre Timmermans Eds, Focus on Bio-Image Informatics, Springer 2016

3. Qiang Wu, Fatima Merchant, Kenneth Castleman, Microscope Image Processing, Academic Press, 2008. 4. Sommer, C., & Gerlich, D. W., Machine learning in cell biology – teaching computers to recognize phenotypes. Journal of Cell

Science, 126(24), 5529–5539. 2013. https://doi.org/10.1242/jcs.123604 5. Kan, A., Machine learning applications in cell image analysis. Immunology and Cell Biology, 95, 525–530. 2017,

https://doi.org/10.1038/icb.2017.16 8. Rangaraj M. Rangayyan, Biomedical Image Analysis, CRC Press, 2005.

9. Richard W. Burry, “Immunocytochemistry: A Practical Guide for Biomedical Research”, Springer-Verlag New York, 2010.

Anexo II - Processamento Digital de Imagem Médica

9.4.1.1. Designação da unidade curricular: Processamento Digital de Imagem Médica


Digital Medical Image Processing


ELE

9.4.1.3. Duração:

Semestral


162


45



9.4.1.6. ECTS:

6


<sem resposta>


<no answer>


Augusto Marques Ferreira da Silva (15 TP)


Silvia De Francesco (15 TP) Ana Maria Perfeito Tomé (10 TP)

Lara Filipa das Neves Dias Carramate (5 TP)


Apresentar as principais classes de problemas no Processamento de Imagem Médica Introduzir hierarquicamente os diferentes níveis de processamento

Apresentar as principais técnicas de processamento Introduzir os alunos na perspectiva do utilizador a diferentes ambientes computacionais de processamento

Competências: Saber manipular imagens médicas nos vários formatos existentes

Saber avaliar comparativamente as funcionalidades de plataformas de computação e visualização de imagem médica Conhecer e executar procedimentos de processamento de forma encadeada


Objectives: Introduce the main classes of problems that can be solved by Image Processing techniques

Introduce the notion of hierarchical processing Present the core processing techniques

Make the students aware and user proficient with several processing SW platforms

Skills: Know how to handle medical images in the various existing formats

Be able to make comparative functional assessments about medical imaging computing and visualization platforms Be able to prepare and execute chained image processing procedures in diverse problem-solving instances


Conceitos e desafios no Processamento de Imagem Médica Plataformas computacionais para processamento de imagem médica

Principais formatos de arquivo de imagem médica Estruturas de Dados fundamentais

Melhoria de Imagem Morfologia Matemática

Segmentação Extracção de Características

Classificação Co-registo

Aplicações

9.4.5. Syllabus:

Concepts and challenges in Medical Image Processing Computational platforms for medical image processing Important archival formats for medical images

Fundamental data structure Image enhancement

Mathematical Morphology Image segmentation

Feature extraction Classification

Image co-registration Applications


O processamento de imagem no contexto médico enfrenta uma série vasta de problemas que requerem o domínio teórico e práticodum elenco alargado de técnicas. A complexidade morfológica e funcional dos objectos de estudo, os problemas inerentes àslimitações físicas dos processos de aquisição impõem abordagens hierárquicas com o recurso aos vários níveis e técnicas deprocessamento. É precisamente esse o foco da parte inicial do programa. Seguindo então uma hierarquia que vai do processamento



de baixo nível até ao nível mais abstracto da classificação de achados imagiológicos segue-se a apresentação conceptual de tópicostradicionais de processamento de imagem, mas devidamente enquadrados no contexto clínico: melhoria de imagem, morfologiamatemática, segmentação, extracção de características e classificação. Na parte final apresentam-se, dada a sua crescenteimportância, técnicas de co-registo e algumas aplicações paradigmáticas.


Medical image processing deals with wide scope of problems that requires a theoretical and practical know-how of a vast core ofconcepts and techniques. The human morphological and functional complexity, the problems associated with the limitations of theimage acquisition processes impose hierarchical approaches through the several levels of processing techniques. This is the focusof the introductory part of the syllabus. Following a pyramidal hierarchy from the lowest and pixel-oriented processing level to themore abstract processing level related with classification of imaging findings we present the core concepts of the traditionalsequence of topics of image processing topics instanced within the medical context: image enhancement, mathematical morphology,image segmentation, feature extraction and classification. The final part of the syllabus addresses image registration and presentssome case study applications.


Ensino teórico-prático com uma forte componente laboratorial. Esta será orientada para a resolução de problemas e implementaçãode casos de estudo envolvendo os seguintes recursos computacionais: MATLAB, ImageJ, MEVISLAB, Aplicações SIEMENSresidentes em estações de trabalho profissionais, permitindo assim aos alunos contactar com diferentes paradigmas deimplementação de técnicas de processamento. Através de casos de estudo preparados com dados reais, pretende-se que os alunosadquiram na prática a percepção dos limites e potencialidades dos instrumentos de processamento face às especificidades dosproblemas que enfrentam.

A avaliação será mista com base com num teste escrito (tipicamente 50%) e numa série de trabalhos práticos compatíveis com acarga de ECTS da UC realizados ao longo de semestre promovendo o trabalho regular ao longo do semestre e permitindo tambémimplementar um processo de avaliação progressivo.


The course will be balanced between classical theoretical lectures with lab-oriented sessions. Strong emphasis will be given to theusage of processing tools such as Matlab, ImageJ MevisLab and SIEMENS applications available at professional workstations.Specially crafted case studies using real data will be used within the different platforms making the students aware of the limits andpotential of each processing tool when facing a specific image processing problem

Grading will be based on final written exam (50% typically) and a series of lab projects matched to the overall ECTS workloadassociated with this course and performed throughout the whole semester promoting a continuous and regular effort from thestudents as well as progressive assessment.


Esta UC comporta um repositório conceptual compatível com a leccionação expositiva clássica. Por outro lado, procura-se com aforte componente laboratorial estimular os alunos para resolução de problemas de natureza quantitativa e promover a sua autonomiano que respeita à utilização das ferramentas de processamento e visualização já referidas. O desenvolvimento dum conjunto depequenos trabalhos práticos em computador compatível com a carga de ECTS atribuída a esta UC será um veículo privilegiado paraos alunos irem demonstrando na prática a correcta compreensão dos conteúdos conceptuais apresentados na componenteexpositiva ao mesmo tempo que desenvolvem as suas competências instrumentais


The core conceptual framework about medical image processing is best presented in standard expositive lectures. A strong labcomponent is sought to stimulate students to use the above mentioned processing tools reinforcing autonomy and instrumental skills.Engaging the students with a specially crafted series of small computer projects compatible with the course workload is a privilegedway for them to show in practice how deeply they apprehend the conceptual core presented in the standard lectures


1. “Image Processing, Analysis, and Machine Vision”, Milan Sonka, Vaclav Hlavac, Roger Boyle, 4ED, CL-Engineering, 2014 2. “Digital Image Processing”, Gonzalez, Woods, 4ED, Prentice Hall, 2017

3. “Digital Image Processing Using Matlab”, Woods, Gonzalez, 2ED, Prentice Hall, 2010 4. "Handbook of Medical Imaging, Volume 2. Medical Image Processing and Analysis ", J. Fitzpatrick, Milan Sonka (Eds), SPIE Press,

2000 5. "Digital Image Processing for Medical Applications", Geoff Dougherty, Cambridge University Press, 2009

6. “Pattern Recognition”- Sergio Theodoridis, Konstantinos Koutroumbas, 4Ed, Academic Press, 200

Anexo II - Aplicações Clínicas

9.4.1.1. Designação da unidade curricular: Aplicações Clínicas


Clinical Applications


CSAU



9.4.1.3. Duração:

Semestral


162


TP-45

9.4.1.6. ECTS:

6


UC opcional


Optional curricular unit


Serafim Filipe Cunha Pinto (22.5 TP)


Joana Vale Ferreira da Silva (22.5 TP)


Nesta Unidade Curricular, pretende-se instanciar a importância das tecnologias da imagem médica num contexto clínico muitoespecífico. Apresenta-se, neste sentido, a seguinte proposta focada na Radioterapia (RT).

O objetivo principal será entender o papel da imagem em todas as etapas da RT, do planeamento ao tratamento, fornecendoferramentas para o desenvolvimento de competências de análise e manipulação das imagens envolvidas no processo.

No final da UC, o aluno deverá ser capaz de: - Implementar protocolos de aquisição de imagem

- Analisar criteriosamente o co-registo de imagem e a sua importância para o processo de planeamento em RT - Interpretar as imagens de verificação de posicionamento e entender a sua aplicabilidade na terapêutica com radiações ionizantes

- Perceber as implicações da dose de radiação associada às imagens em RT e abordar métodos de redução da dose - Analisar os movimentos do paciente e os desvios de posicionamento no tratamento para criar padrões de atuação.


This Curricular Unit is intended to focus the importance of medical imaging technologies in a very specific clinical context. In thissense we present the following proposal focused on Radiotherapy.

The main goal will be to understand the role of imaging in all the stages, from planning to treatment, of Radiotherapy, providing tools todevelop skills in analysis and manipulation of the images involved in the process.

At the end of the Curricular Unit, the student should be able to; 1. Implement image acquisition protocols

2. Wisely analyze image co-registration and its importance Radiotherapy planning process 3. Interpret positioning verification images and understand their applicability in therapy with ionizing radiation

4. Understand the consequences of radiation dose related to images in Radiotherapy and address dose reduction methods 5. Analyze patient movements and positioning deviations during treatment to set up intervention patterns


1. Protocolos de TC em Radioterapia (RT) Princípios físicos

Aquisição da TC em RT Adequação da aquisição à localização anatómica

2. Processamento e co-registo de imagem (PET-TC, RM e Angiografia) em RT PET-TC – princípios físicos e utilização em RT

RM – princípios físicos e utilização em RT Angiografia – princípios físicos e utilização em tumores cerebrais e de cabeça e pescoço.

Processamento de imagem com vista ao co-registo Co-registo rígido e deformável

Ferramentas de avaliação do co-registo 3. RT Guiada por Imagem (IGRT)

TC 4D; Sistema de Gating; ConeBeam TC; Imagem Portal – kV e MV; Video based motion management Princípios físicos

Equipamento Aquisição

Análise e manipulação da imagem 4. Imagem associada a técnicas avançadas em RT

Protocolos de aquisição CT para técnicas avançadas Protocolos de verificação de posicionamento em técnicas avançadas



5. Proteção Radiológica em Imagem em RT Doses associadas e métodos de otimização da dose na imagem em RT

6. Big Data em RT

9.4.5. Syllabus:

1. Computed Tomography (CT) protocols in Radiotherapy (RT) Physical principles

CT acquisition in RT Adjustment of CT acquisition to anatomic localization

2. Image processing and co-registration in RT (PET-CT, MRI and angiography) PET-CT – physical principles and application in RT

MRI – physical principles and application in RT Angiography – physical principles and application in head and neck tumors

Image processing for co-registration Rigid and deformable co-registration Tools for co-registration evaluation

3. Image Guided RT (IGRT) 4D CT; gating system; Cone-Beam CT; portal imaging – kV and MV; video-based motion management

Physical principles Equipment

Acquisition Image analysis and manipulation

4. Imaging in RT advanced techniques CT acquisition protocol for advanced techniques

Positioning verification protocols for advanced techniques 5. Radiologic protection in imaging for RT

Radiation associated with imaging for RT and dose optimization methods 6. Big Data in RT


A UC aborda aspetos relacionados com a imagem e o funcionamento dos equipamentos de imagem em RT. São abordadas as especificidades dos protocolos de TC para RT e alterações no protocolo em função da região anatómica.

As diferentes modalidades de imagem complementam a informação da TC para uma melhor delineação dos volumes a tratar, sendo oco-registo fundamental para o sucesso do tratamento. A IGRT é essencial para uma correta administração do tratamento. Éfundamental compreender os princípios físicos e equipamentos utilizados e entender a importância da análise das imagens obtidas esua aplicabilidade em RT. A dose associada à aquisição de imagem em RT tem vindo a aumentar. A optimização dos protocolos deaquisição permite um melhor controlo da dose ao longo do processo de RT. Ao longo do processo de RT é gerada uma grandequantidade de dados que, irá popular repositórios de objetos DICOM de grandes dimensões. A exploração destes respositórios é damaior pertinência


The curricular unit approaches aspects related with imaging and imaging equipment operation in RT. The specificities of CT protocols for RT as well as protocol adjustment depending on the anatomical region are approached.

Different imaging modalities complement CT data for a more correct delineation of volumes to be treated, being co-registrationfundamental for treatment success.

IGRT is essential for a correct treatment delivery. It is fundamental to comprehend physical principles and equipment used, as well tounderstand the importance of obtained images analysis and their application in RT,

Radiation dose associated to image acquisition in RT has been rising. Knowledge of involved doses and acquisition protocoloptimization allow a better dose control along RT Process.

During RT process an enormous quantity of data is produced. These data will populate large repositories of RT related DICOMobjects. The BIG data trends in RT should be assessed within these data repositories.


Aulas TP Aulas expositivas seguidas de sessões interativas de resolução de questões e problemas.

Utilização de equipamentos disponibilizados aos estudantes, em ambiente laboratorial (workstations de processamento de imagem,planeamento em Radioterapia)

Seminários para temas específicos. Ensino em ambiente clínico, baseado em instituições com equipamentos tecnologicamente avançados e recursos humanos

qualificados, com protocolos estabelecidos com a Universidade de Aveiro. Avaliação

Avaliação contínua e modular baseada nas competências a adquirir com análise expositiva de artigos e trabalhos escritos para cadaum dos módulos.


TP classes Expositive classes followed by interactive sessions for the resolution of questions and problems.

Use of the equipment available to the students in laboratorial environment (image processing and RT treatment planningworkstations).

Seminars on specific themes. Teaching in clinical environment, in institutions with technically advanced equipment and qualified human resources, with

interinstitutional agreement with the University of Aveiro.

Evaluation



Continuous and modular evaluation based on the competences to be acquired with expositive analysis of papers and written worksfor each module.


As metodologias de ensino/aprendizagem, assim como a metodologia de avaliação por competências, decorrem dos objetivos da UC.A natureza teórico/prática dos objetivos da UC reflete-se nas metodologias de ensino/aprendizagem assim como nos elementos deavaliação.


The learning/teaching methodologies, as well as evaluation methodology based on competences, are closely follow the objectives ofthe UC. The theoretical and practical nature of the objectives of the Curricular Unit is reflected in learning/teaching methodologies aswell as in the evaluation elements.


Arimura, H. (2017). Image-based computer-assisted radiation therapy. Image-based computer-assisted radiation therapy (pp. 1-381)doi:10.1007/978-981-10-2945-5

Kelsey, C. A., Heintz, P. H., Sandoval, D. J., Chambers, G. D., Adolphi, N. L., & Paffett, K. S. (2014). Radiation biology of medical imaging.Radiation biology of medical imaging (pp. 1-315) doi:10.1002/9781118517154

Gouliamos, A. D., Andreou, J. A., & Kosmidis, P. A. (2014). Imaging in clinical oncology. Imaging in clinical oncology (pp. 1-609)doi:10.1007/978-88-470-5385-4

Schmidt-Richberg, A. (2014). Registration methods for pulmonary image analysis: Integration of morphological and physiologicalknowledge (pp. 1-168) doi:10.1007/978-3-658-01662-3

Brock, Kristy K. (2013). Image Processing in Radiation Therapy (pp. 1-286) ISBN-10: 9781439830178

Bourland, J Daniel (2012). Image Guided Radiation Therapy (pp. 1-256) ISBN-10: 9781439802731

9.5. Fichas curriculares de docente

Anexo III - Sandra Isabel Moreira Pinto Vieira

9.5.1. Nome do docente (preencher o nome completo): Sandra Isabel Moreira Pinto Vieira

9.5.2. Ficha curricular de docente:

Mostrar dados da Ficha Curricular

Anexo III - Daniela Maria Oliveira Gandra Ribeiro

9.5.1. Nome do docente (preencher o nome completo): Daniela Maria Oliveira Gandra Ribeiro



Anexo III - Maria de Lourdes Gomes Pereira

9.5.1. Nome do docente (preencher o nome completo): Maria de Lourdes Gomes Pereira



Anexo III - Carla Alexandra Pina da Cruz Nunes

9.5.1. Nome do docente (preencher o nome completo): Carla Alexandra Pina da Cruz Nunes



Anexo III - Lara Filipa das Neves Dias Carramate

9.5.1. Nome do docente (preencher o nome completo): Lara Filipa das Neves Dias Carramate


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Anexo III - Joana Vale Ferreira da Silva

9.5.1. Nome do docente (preencher o nome completo): Joana Vale Ferreira da Silva



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NCE/12/00161 — Apresentação do pedido - Novo ciclo de estudos · A7. Número de créditos ECTS...

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