(Postdeirid neuroblast) Exemplos de defeitos heterocrônicos no desenvolvimento Ambros, Curr. Opin....
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(Postdeirid neuroblast)
Exemplos de defeitos heterocrônicos no desenvolvimento
Ambros, Curr. Opin. Genet Develop. 10, 428-433, 2000
VPC
lf
G1
lin-4
Ambros, Curr. Opin. Genet Develop. 10, 428-433, 2000
Atividades estágio específicas da via heterocrônica
Genes heterocrônicos de C. elegans e seus produtos
Processos afetados por ncRNAs
Storz, Science 296, 1260-1263, 2002
Modificação de nucleotídeos de rRNA
Shine-Dalgarno Box
RNA polimerase reconhece o RNA 6S como um promotor aberto
tmRNA mimetiza um mRNA e um tRNAOs ncRNAs podem funcionar como parte de um complexo proteico maior, como ocorre com o SRP
Storz, Science 296, 1260-1263, 2002
Diferentes mecanismos dos ncRNAS
Prováveis alvos de miR-277 de Drosophila
Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060
Comparação dos UTR 3´ com os sítios de ligação dos miRNA
Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060
REGIÕES CONSERVADAS
Locais de pareamento dos miRNA
Z = desvio padrão acima da média dos matches de fundo. Selecionaram Z 3 como cuttoff.
Z como medida da probabilidade de ligação do miRNA ao alvo
Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060
Enzimas da via metabólica de degradação de Val, Leu e Ile provavelmente controladas por miR-277
Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060
Z>3
Z>2 em Anopheles
Enzimas detectadas em Drosophila
Modelo para regulação sucessiva das atividades gênicas heterocrônicas por lin-4 e let-7
Reinhart e cols., Nature 403, 901-906, 2000
O micro RNA (miRNA) lin-4 é processado a partir do transcrito primário por Dicer
Ambros, Cell 107, 823-826, 2001
As vias de RNAi e stRNA possuem uma intersecção
Hutvágner e cols. Science 293, 834-838, 2001
Ambros, Cell 107, 823-826, 2001
Regulação da estrutura e função do RNP por um miRNA genérico
Karazian Jr, Science 303, 1626-1632, 2004
ITR = inverted terminal repeatsDRs = short direct repeats
Transposão tipo Tc1/mariner
Sijen & Plasterk, Nature 426, 310-314, 2003
Detecção de dsRNA por "RNase protection assay"
tot = sem pré-tratamentods = pré-tratamento com alto sal- = pré-tratamento com baixo sal (degrada dsRNA e ssRNA)
fragmentos protegidos, correspondentes a dsRNA