Temas de mestrado - CEF

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Temas para Mestrado - 2011/2013

1. BIODIVERSIDADE E EVOLUÇÃO

Micromorfologia das Plantas Tóxicas de Portugal Continental

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: António Xavier Pereira Coutinho & Augusto Manuel Ferreira Dinis

Breve Descrição: O objectivo deste trabalho é estudar, com recurso a microscopia óptica de campo claro e a

microscopia electrónica de varrimento, bem como a tratamentos estatísticos adequados, a micromorfologia

(pólen, sementes, epidermes foliares e carpológicas) de um número significativo das plantas vasculares tóxicas

existentes em Portugal Continental.

Palinotaxonomia do género Orobanche L. (Orobanchaceae) na Bacia do Mediterrâneo

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: António Xavier Pereira Coutinho & Augusto Manuel Ferreira Dinis

Breve Descrição: Neste trabalho pretende-se estudar (com recurso a microscopia óptica de campo claro e a

microscopia electrónica de varrimento, bem como a uma análise estatística adequada) a morfologia polínica de

um número significativo de espécies de Orobanche, contribuindo, assim, para um melhor conhecimento da

Taxonomia e da Filogenia deste importante género de plantas parasitas, que inclui diversas pragas de cultivos

agrícolas.

Estudos Florísticos e de Educação Ambiental em Parques e Jardins de Portugal

Continental

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: António Xavier Pereira Coutinho

Breve Descrição: Os objectivos deste trabalho são: 1) realizar o inventário florístico exaustivo dos Vegetais

Vasculares de Parques e Jardins relevantes, do ponto de vista da biodiversidade, de Portugal Continental; 2)

incrementar o seu valor natural mediante a elaboração de percursos das suas plantas notáveis. Durante este

estudo serão utilizadas, entre outras, técnicas modernas de georreferenciação e de aferição de vegetais.

Certificação Florestal

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: António Xavier Pereira Coutinho

Breve Descrição: O comércio internacional solicita, cada vez mais, a necessidade da utilização de madeira

certificada, sendo indispensável a definição de áreas de conservação e de protecção. Abrem-se, assim, novas

oportunidades de emprego para biólogos com conhecimentos no campo da Biodiversidade Vegetal. Em

colaboração com uma empresa nacional prestigiada da área do abastecimento de madeiras, pretende-se dotar os

mestrandos de conhecimentos aprofundados sobre o tema em causa, numa especialidade de investigação em

que o trabalho de campo e a educação ambiental dos produtores serão fundamentais

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Camellia japonica e C. sasanqua nos jardins históricos portugueses

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Fátima Sales & Eduarda Paz

Breve Descrição: Projecto que tem como objectivo a avaliação do património histórico

ligado ao cultivo de camélias ornamentais em Portugal. Um dos pólos de cultivo de

camélia em Portugal é Sintra; outro abrange o norte do país. Este património é

geneticamente muito rico e envolve vários cultivares criados em Portugal ao longo de

mais de um século. Urge fazer uma base de dados das espécies e plantas existentes, do

seu estado de conservação e potencial para biotecnologia. Este projecto é um primeiro

passo para outros mais vastos que envolvem a determinação do parentesco entre as árvores existentes em

Portugal (DNA) e a história do cultivo da camélia no país. A segunda orientadora é especialista em conservação

de jardins históricos e paisagem.

Flora do Geopark Arouca (UNESCO): percurso pedestre interpretado

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Fátima Sales & Eduarda Paz

Breve Descrição: Projecto que tem como objectivo a avaliação da vegetação de

uma área seleccionada do Geopak Arouca e o desenvolvimento de percursos

pedestres focados em temas florísticos. O Geopark está integrado na rede

internacional de geoparques. É uma zona muito vasta que possui 3 áreas

classificadas Rede Natura 2000: parte do rio Paiva, Serra da Freita e Arade e uma

parte da serra de Montemuro. Possui semelhanças florísticas com o Parque Natural

da Serra da Estrela (PNSE) as quais serão investigadas neste projecto. A orientadora principal tem projectos no

PNSE e a segunda orientadora é especialista em conservação de jardins históricos e paisagens.

Atlas da flora portuguesa

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Fátima Sales & Paula Castro

Breve Descrição: Projecto-piloto para o mapeamento da flora portuguesa. O primeiro

passo é trabalhar a informação existente em Herbários. Foi escolhida a família

Poaceae porque está totalmente informatizada no Herbário de Coimbra, cada espécie

associada a uma imagem, e não está ainda tratada na Flora iberica (uma mais valia

científica para este projecto). Será necessária a familiarização com software

SPECIFY e SIG. Pretende-se (i) o estabelecimento de metodologia para o

desenvolvimento de um projecto à escala nacional; (ii)o desenvolvimento de mapas

para as espécies de Poaceae do Herbário COI; e (iii) disponibilizar a informação em (ii) no site de COI. A

segunda orientadora é especialista em SIG aplicado à ecologia.

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Flora de altitude do Parque Natural da Serra da Estrela: o complexo

Aira/Corynephorus

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Fátima Sales & João Loureiro

Breve Descrição: Projecto que tem como objectivo estudar as relações evolutivas dentro

dos 5 géneros de gramíneas que constituem o complexo Aira/Corynephorus que existe

nos prados húmidos, lagoachos (reserva biogenética) e zonas áridas de altitude do

PNSE. Implicações do ponto de vista de conservação.

Colecções biológicas: o desenvolvimento de uma base de dados internacional histórica

online

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Fátima Sales

Breve Descrição: Projecto que tem como objectivo desenvolver uma base de dados

em SPECIFY dos colectores do Herbário Histórico de Moritz Willkomm, bem como

da sua escrita e tipo de etiquetas e disponibilizar a informação de uma forma visual

no site do Herbário COI. O Herbário de Willkomm é de importância fundamental

para a investigação da flora da Península Ibérica e para a elaboração da Flora iberica, projecto que está sediado

Quanto "pesa" um genoma? Exploração das relações entre o tamanho do genoma e a tolerância

aos solos serpentínicos em pares co-genéricos de plantas vasculares

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: João Loureiro & Susana Gonçalves

Breve Descrição: Projecto com o objectivo de, por citometria de fluxo, avaliar diferenças no tamanho do

genoma entre espécies vegetais tolerantes a solos serpentínicos e pares co-genéricos não tolerantes àqueles solos

e, assim, testar a teoria nucleotípica (adaptativa) da evolução do tamanho do genoma.

Variação do tamanho do genoma do fungo Cenococcum geophilum

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Susana Gonçalves & João Loureiro

Breve Descrição: Projecto com o objectivo de, por citometria de fluxo, estimar o tamanho do genoma e a sua

variação em populações de C. geophilum. Este projecto constitui o primeiro passo no processo de sequenciação

completa do genoma desta espécie no âmbito do projecto de investigação CENECOGEN (IR: Ludo Muller;

Freie Universität Berlin).

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Cenococcum geophilum em ambiente extremo: tolerância nova ou inata?

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Susana Gonçalves & Helena Freitas

Breve Descrição: Simulação in vitro de uma experiência de transplante recíproco com populações do fungo

ectomicorrízico C. geophilum provenientes de solos serpentínicos/solos não serpentínicos de modo a testar a

hipótese de evolução adaptativa desta espécie àquele ambiente extremo. Este projecto insere-se no âmbito do

projecto de investigação CENECOGEN (IR: Ludo Muller; Freie Universität Berlin).

Evolução do tamanho do genoma do género Alyssum na Península Ibérica

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: João Loureiro & Teresa Gonçalves

Breve Descrição: Projecto com o objectivo de avaliar a contribuição do tamanho do genoma na evolução e

taxonomia das várias espécies de Alyssum que ocorrem na Península Ibérica.

Diferentes entre iguais: diversidade genética do cogumelo Amanita muscaria

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Susana Gonçalves & António Portugal

Breve Descrição: De acordo com dados moleculares recentes, Amanita muscaria não é afinal apenas uma

espécie, mas várias! Este projecto tem como objectivo detectar a presença de espécies crípticas deste cogumelo

em Portugal por sequenciação da região ITS (Internal Transcribed Spacer, que fornece um “código de barras”

único para cada espécie fúngica). Pretende-se também estudar a relação entre tipos ITS e hospedeiros

preferenciais (e.g. Pinus vs. Quercus).

Cogumelos na cidade: a biodiversidade à nossa volta e (quase sempre) escondida

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução/Ecologia e Sociedade

Orientadores: Susana Gonçalves & M. Teresa Gonçalves

Breve descrição: Em parceria com a plataforma Biodiversity4all (http://www.biodiversity4all.org/), este

projecto tem como objectivo criar uma base de dados geo-referenciada dos macrofungos na área urbana de

Coimbra, contribuindo para o conhecimento do número de espécies existentes, sua distribuição, abundância e

fenologia. Insere-se no âmbito de uma proposta para a criação de um "Observatório dos Cogumelos” a nível

nacional (IR: Susana Gonçalves, CFE).

Estudo da flora da Reserva da Faia Brava: contributo para a sua gestão e conservação

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Paula Castro & António Xavier Pereira Coutinho

Breve Descrição: Pretende-se com este trabalho: a) realizar o inventário florístico na Reserva da Faia Brava

(Beira Alta); b) cartografar espécies e habitats; c) integrar a informação num Sistema de Informação Geográfica

e d) contribuir para acções de gestão e conservação da biodiversidade neste espaço natural.

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Porquê escolher um sexo quando se pode ter os dois? Efeito da posição da flor na especialização

sexual

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Rubén Torices, Sílvia Castro & João Loureiro

Breve Descrição: Apesar da maioria das Angiospérmicas serem hermafroditas (i.e., as flores são bissexuais),

algumas espécies possuem flores masculinas e femininas unissexuais, assim como flores hermafroditas no

mesmo individuo. Nas Asteraceae, quando presentes, as flores unissexuais estão sempre dispostas na mesma

posição: flores femininas no exterior enquanto as masculinas estão no interior do capítulo. O objectivo principal

deste projecto é explorar de que forma a posição da flor influencia as características florais e do fruto e

consequentemente, de que forma poderão dirigir a evolução das flores unissexuais na maior família das plantas

com flor.

Efeito das características florais no isolamento reprodutivo: cenário na zona de hibridização

entre Anacyclus clavatus e A. valentinus

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Rubén Torices, Sílvia Castro & João Loureiro

Breve Descrição: As zonas de hibridização oferecem laboratórios naturais para investigar processos evolutivos

de origem e manutenção da biodiversidade, especialmente através da ocorrência de barreiras ao fluxo de genes e

pressões selectivas sobre características fenotípicas. Neste projecto utilizamos a zona de hibridização entre duas

espécies de Anacyclus (A. clavatus e A. valentinus, Asteraceae) na qual foram detectados fenótipos intermédios

entre os dois taxa. O objectivo do projecto é avaliar o papel das características florais no isolamento reprodutivo

entre as duas espécies e os respectivos híbridos, i.e., características que poderão estar envolvidas e constituir

uma barreira à troca de genes restringindo a formação e manutenção de híbridos.

Escape evolutivo às alterações climáticas: efeito da duplicação do genoma na variação de

características funcionais

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: Lucía DeSoto, João Loureiro & Rubén Torices

Breve Descrição: Actualmente, a biodiversidade encontra-se seriamente ameaçada pelas alterações climáticas.

Assim, revela-se fundamental avaliar a capacidade que os organismos possuem para se adaptar aos câmbios

climáticos e evolutivamente escaparem à extinção. A poliploidização (duplicação do genoma) pode originar

alterações imediatas no êxito do indivíduo e poderá permitir a ocorrência de um estado evolutivo transitório

anteriormente inexistente. Neste projecto propomos estudar as comunidades entomófilas de plantas de alta

montanha, fortemente ameaçadas pelas alterações climáticas que se têm registado, com o objectivo principal de

avaliar características funcionais ao nível vegetativo e reprodutor e testar se grupos poliploides apresentam uma

variabilidade fenotípica superior que permita gerir melhor com as alterações devidas ao aquecimento global.

Evolução e variação do tamanho do genoma das macroalgas portuguesas

Área de Investigação: Biodiversidade e Evolução

Orientadores: João Loureiro & Leonel Pereira

Breve Descrição: O tamanho do genoma é uma característica intrínseca dos organismos, sendo considerada

uma ferramenta cada vez mais importante na taxonomia e ecologia. Até ao momento, existe pouca informação

acerca da variação do tamanho do genoma em algas, em particular em macroalgas. Este projecto pretende

contribuir com informação acerca do tamanho de genoma das macroalgas portuguesas e de que forma esta

característica se pode correlacionar com atributos taxonómicos e ecológicos deste conjunto de organismos.

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2. ECOLOGIA DAS INVASÕES E INTERACÇÕES BIÓTICAS

Análise de Risco de Plantas Exóticas e Invasoras de Portugal

Área de investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Elizabete Marchante, Hélia Marchante, Sofia Costa & António Gouveia

Breve Descrição: Muitas das plantas que nos rodeiam não são nativas, mas sim plantas exóticas vindas de

outras floras e/ou continentes. Algumas não comportam risco ecológico, mas outras apresentam comportamento

invasor. Neste projecto pretende-se fazer uma análise de risco das espécies exóticas presentes em Portugal,

recorrendo a recolha de informação bibliográfica e recolha/medição de parâmetros funcionais e

morfológicos em exemplares de plantas vivas e eventualmente outros parâmetros ecológicos. O resultado final

será uma lista de espécies onde seja possível distinguir plantas exóticas sem risco de plantas exóticas com

comportamento invasor.

Mais informações: Elizabete Marchante ([email protected])

Controlo biológico de Acacia longifolia e interacções indirectas em redes ecológicas

Área de investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Elizabete Marchante & Hélia Marchante

Breve Descrição: Acacia longifolia é uma das plantas invasoras mais dispersa ao longo das dunas costeiras em

Portugal. Trichilogaster acaciaelongifoliae é uma vespa australiana formadora de galhas, usada como agente de

controlo biológico de A. longifolia na África-do-Sul, cuja introdução em Portugal está a ser considerada. Com

este projecto, pretende-se estudar as comunidades associadas a insectos formadores de galhas, nomeadamente

plantas, insectos formadores de galhas, parasitóides de galhas e inquilinos de galhas – um “mini-ecossistema” a

descobrir em cada galha! -, de forma a construir redes ecológicas que permitam avaliar potenciais efeitos

indirectos deste agente de controlo biológico nas comunidades e redes ecológicas nativas. Este projecto será um

importante contributo para a gestão dos problemas causados por A. longifolia em Portugal.

Mais informações: Elizabete Marchante ([email protected])

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Gestão de Plantas Invasoras no Jardim Botânico da Universidade de Coimbra

Área de investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas / Ecologia e Sociedade

Orientadores: Elizabete Marchante, Catarina Schreck Reis* e Paula Castro

*Centro de Investigação Didáctica e Tecnologia na Formação de Formadores da Universidade de Aveiro

Breve Descrição: Na Mata do Jardim Botânico da Universidade de Coimbra (JBUC) encontram-se algumas

plantas exóticas com comportamento invasor, causando problemas a nível da conservação do Jardim. Assim, é

importante gerir de forma sustentável as áreas invadidas por estas plantas.

Este mestrado tem como objectivo contribuir para a gestão das plantas invasoras no JBUC, passando por: 1)

inventariação e cartografia das plantas invasoras presentes; 2) avaliação de risco das plantas exóticas e 3)

elaboração de um plano de gestão das plantas invasoras do JBUC, incluindo, entre outras fases, a prevenção,

através de desenvolvimento de acções de sensibilização e divulgação desta problemática e ensaio de

metodologias de controlo para Ailanthus altissima (umas das plantas invasoras mais problemática na Mata do

JBUC).

Mais informações: [email protected] (Paula Castro)

Evolução da capacidade competitiva e barreiras reprodutivas na planta invasora Centaurea

solstitialis

Área de Investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Daniel Montesinos; Sílvia Castro e Susana Rodríguez-Echeverría

Breve Descrição: As plantas invasoras desenvolvem adaptações e evoluem nos novos ambientes que

colonizam. Este projecto tem dois objectivos principais: 1) estudar a existência de adaptações ao novo habitat

invadido através de transplantes recíprocos em Espanha e Califórnia (em colaboração com universidades

americanas); e 2) estudar barreiras reprodutivas entre plantas das áreas nativa vs. invasora realizando

cruzamentos controlados entre plantas a crescer em estufa.

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Biologia reprodutiva dos cogumelos Amanita phalloides e A. muscaria

Área de Investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Susana Gonçalves e M. Teresa Gonçalves

Breve descrição: Algumas características relacionadas com o estabelecimento e a dispersão destas espécies

podem ajudar a explicar porque são agora invasoras em algumas partes do mundo. Este projecto pretende

avaliar essas características no habitat nativo destes fungos para posterior comparação com dados semelhantes

recolhidos nos habitats de introdução e realiza-se no âmbito do projecto de investigação AMANITA (IR:

Susana Gonçalves; CFE) em colaboração com Anne Pringle (Harvard University, USA).

Hospedeiros associados a Amanita phalloides em Portugal

Área de Investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Susana Gonçalves, M. Teresa Gonçalves e António Portugal

Breve descrição: Para que um fungo ectomicorrízico se torne invasor quando introduzido em novas áreas

geográficas deverá ser necessário um elevado nível de “promiscuidade” na simbiose com os hospedeiros. Com

este projecto pretende-se, através de técnicas moleculares, avaliar rigorosamente quais os hospedeiros

associados a Amanita phalloides (espécie nativa da Europa e invasora na costa oeste da América do norte) em

Portugal de modo a testar a hipótese de que este fungo tem a capacidade de se associar a um grupo alargado de

hospedeiros na sua área de distribuição nativa. Este trabalho realiza-se no âmbito do projecto de investigação

AMANITA (IR: Susana Gonçalves; CFE) em colaboração com Anne Pringle (Harvard University, USA).

Fungos ectomicorrízicos associados à invasora Acacia dealbata

Área de Investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Susana Gonçalves, António Portugal e Susana Rodríguez Echeverría

Breve descrição: Acacia dealbata estabelece simbiose com bactérias fixadoras de azoto e esta associação

mostrou exercer um papel importante no processo de invasão de novas áreas geográficas por esta leguminosa.

Este projecto pretende explorar a existência de outra simbiose: entre Acacia dealbata e fungos ectomicorrízicos.

Através da realização de bio-ensaios, análise morfológica e técnicas moleculares, pretende-se determinar a

ocorrência de ectomicorrizas e avaliar a diversidade de fungos ectomicorrízicos associada à espécie invasora

Acacia dealbata em Portugal.

Diversidade e ecologia de macrofungos na Mata Nacional do Bussaco

Área de Investigação: Ecologia das Invasões e Interacções Bióticas

Orientadores: Anabela Marisa Azul ([email protected]) e Paula Castro

Breve Descrição: Projecto com o objectivo de estudar a diversidade e ecologia dos macrofungos na Mata

Nacional do Bussaco, com vista a criar um catálogo possível de ficar disponível em plataformas digitais e uma

base de informação integrada num sistema de informação geográfica. Pretende-se, ainda, contribuir para a

elaboração de acções de sensibilização e educação ambiental com vista à gestão e conservação deste património

natural.

Mais informações: [email protected] ; [email protected] (Anabela Marisa Azul)

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3. ECOFISIOLOGIA

Análise da Dendroecologia e propriedades dos vasos dos arbustos Mediterrânicos como

ferramenta em decisões de restauração de sistemas semi-áridos

Área de Investigação: Ecofisiologia

Orientadores: Cristina Nabais, Jordi Cortina (Departamento de Ecología, Universidad de Alicante. Spain) e

Lucía DeSoto.

Breve Descrição: Núcleos de Quercus coccifera, Pistacia lentiscus ou Rhamnus lycioides são componentes

chave dos ecossistemas semi-áridos Mediterrânicos afectando a composição das comunidades e aos processos

ecológicos, sendo assim estas espécies frequentemente usadas na restauração de estepes degradadas. Não

obstante, a dinâmica destas espécies a longo prazo assim como a capacidade para superar condiciones

climáticas futuras são ainda pouco conhecidas. Os objectivos deste projecto são (i) estudar os padrões de

crescimento individual e a estrutura e dinâmica das populações, e (ii) determinar de que forma as condições

climáticas afectam as características dos vasos do xilema das diferentes espécies chave.

Os jovens reproduzem-se melhor em condições extremas? Influência da idade na alocação de

recursos à reprodução e no êxito reprodutivo de arbustos em solos de gessos

Área de Investigação: Ecofisiologia

Orientadores: Lucía DeSoto, Cristina F. Aragón (Dep. Ecology & Evolutionary Biology. University of

California Santa. USA), Marcos Méndez (Área de Biodiversidad y Conservación. Universidad Rey Juan Carlos.

Spain) e Susana Rodríguez-Echeverría.

Breve Descrição: Dado que a reprodução implica um custo de recursos, a maioria das prantas necessita de

alcançar um tamanho mínimo para ser capaz de se reproduzir eficientemente; assim, a alocação de recursos para

a reprodução dependeria da relação entre ganho e competição por recursos, assim como do tamanho e da idade

do indivíduo. O objectivo principal deste projecto é determinar o efeito da idade e do crescimento dos anéis

sobre a reprodução em arbustos perenes (Heliantemun spp.) em ambientes extremos (solos de gesso); para isso

será analisado (i) se existe um tamanho/idade de maturação sexual, (ii) a influença do tamanho/idade na

alocação de recurso à reprodução e êxito reprodutivo, e (iii) se o crescimento dos anéis e a reprodução

competem por recursos.

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4. ECOLOGIA E SOCIEDADE

Divulgação de Ciência no Banco de Sementes do Jardim Botânico da Universidade de Coimbra

Área de investigação: Ecologia e Sociedade

Orientadores: Catarina Schreck Reis* e António Xavier Pereira Coutinho

*Centro de Investigação Didáctica e Tecnologia na Formação de Formadores da Universidade de Aveiro

Breve Descrição: O projecto visa a investigação, promoção e desenvolvimento de actividades de educação e

divulgação científica no contexto único que é o Banco de Sementes do Jardim Botânico da Universidade de

Coimbra, existente desde 1868. Embora nem sempre reconhecido e devidamente explorado, as sementes

revestem-se de um enorme potencial no ensino de diversas áreas da ciência experimental, tanto em ambientes

formais como informais. Pretende-se com este trabalho contribuir para a divulgação da botânica e o aumento da

literacia científica junto de diferentes públicos.

Mais informações: [email protected] ou [email protected]

Cogumelos na cidade: a biodiversidade à nossa volta e (quase sempre) escondida

Área de Investigação: Diversidade e Evolução de Plantas e Fungos/Ecologia e Sociedade

Orientadores: Susana Gonçalves e M. Teresa Gonçalves

Breve descrição: Em parceria com a plataforma Biodiversity4all (http://www.biodiversity4all.org/), este

projecto tem como objectivo criar uma base de dados geo-referenciada dos macrofungos na área urbana de

Coimbra, contribuindo para o conhecimento do número de espécies existentes, sua distribuição, abundância e

fenologia. Insere-se no âmbito de uma proposta para a criação de um "Observatório dos Cogumelos” a nível

nacional (IR: Susana Gonçalves, CFE).