Universidade da Beira InteriorLicenciatura em Ciências Biomédicas

Bioinformática

“Prosite” – base de dados

Proteínas

» Segundo a análise da estrutura primária sabemos que uma proteína é constituída por uma sequência de aminoácidos.

» Para análise da função da proteína e visualização dos respetivos domínios usa-se a forma tridimensional.

O que é o “Prosite”?

» A base de dados PROSITE contém sequências modelo de aminoácidos associadas aos membros de famílias de proteínas, funções específicas de proteínas e modificações pós-traducionais.

» O prosite possui várias ferramentas tais como:ScanProsite, PRATT, MyDomains-Image Creator

Criada em 1988 por Amos Bairoch e Philipp Bucher (investigadores no Instituto Suíço da Bioinformática);

SWISS-PROT & PROSITE;

Base de dados mais antiga e conhecida.

História

Evolução …1988 1994 2006 2012

0500

10001500200025003000350040004500

Variação no número de registos ao longo dos anos

Para que serve?

» Esta base dados é usada para descobrir informações acerca da “nova proteína” como por exemplo: função, estrutura 3D da proteína;

» Também é usada para descobrir modificações numa proteína;

Demonstração prática

http://prosite.expasy.org/

Obrigado pela atenção!!!!

Alexandra Soares a24016Cátia Rocha a23054 Vanessa Conde a23586

FIM