Biofísica Celular

download Biofísica Celular

of 29

description

Biofísica CelularDifusãoTransportadores

Transcript of Biofísica Celular

  • BIOFSICA CELULAR 2015/16

    Professores: Rosa Maria Santos e Lus Martinho do Rosrio

    TEMAS PRINCIPAIS

    1. Difuso e permeabilidade em membranas (LMR)

    2. Transporte activo: bombas e trocadores (LMR)

    3. Transduo de sinais (LMR)

    4. Canais inicos (RMS)

    5. Electrognese da excitabilidade celular e propagao de sinais elctricos (RMS)

  • Clula

    Membrana plasmtica

    Citoplasma

    Organelos

    Citoesqueleto

    Citossol

  • Membrana plasmtica

    - Compartimentalizao

    - Transporte (transportadores)

    - Reconhecimento (receptores)

    - Actividade enzimtica (enzimas)

    - Excitabilidade (canais inicos, etc)

    - Exocitose, endocitose

  • TEMA 1: Difuso e permeabilidade

    em membranas

  • Fluxo num meio homogneo Primeira lei de difuso de Fick e coeficiente de difuso Distncia mdia percorrida por difuso e lapso de tempo difusional Difuso atravs de uma barreira / bicamada lipdica Coeficiente de permeabilidade membranar e coeficiente de partio Difuso facilitada e transportadores de glicose Difuso facilitada de ies e ionforos

    Bibliografia recomendada para o TEMA 1

    Sperelakis (Caps. 1, 5 e 11)

    Hille (Cap. 11)

    Atkins (Cap. 24)

    Fontes complementares* (no mencionadas na bibliografia geral recomendada)

    Eckert (Cap. 4)

    Vander (Cap. 6)

    Gil Ferreira (Caps. 3 e 5)

    *Human Physiology - The Mechanisms of Body Function (A.J. Vander, J.H. Sherman, D.S. Luciano - McGraw-Hill, Inc.)

    *The Biophysical Basis of Excitability (H. Gil Ferreira, M.W. Marshall - Cambridge University Press)

  • FLUXO DE PARTCULAS NUM MEIO HOMOGNEO

    Fluxo (J) : quantidade de matria que fli por unidade de reapor unidade de tempo

    Gradiente de concentrao

    (dN/dz)

    Experimentalmente: J prop. dN/dz

    N = n de partculas por unidade de volume

    dN/dz < 0, J > 0 J = -D dN/dzPrimeira Lei de Difuso de Fick

    D = constante ou coeficiente de difuso

    Em fase condensada (soluo):

    J = -D dC/dz

    C = concentrao do soluto

    [J] = mole.cm-2.s-1

    [D] = cm2.s-1

    BC/#01

  • ASPECTOS TEMPORAIS DA DIFUSO EM SOLUO LIVRE

    Equao de difuso

    (segunda lei de difuso de Fick)

    Problema unidimensional (x)

    C/t = D 2C/x2

    C = C(x,t)

    x

    gua

    camada de acar

    (t = 0)

    CA/n0

    x

    Dt = 0.05

    0.1

    0.3

    1.0

    C = n0/A (Dt)-1/2 exp(-x2/4Dt)

    A = rea da base do vaso

    n0 = nmero total de molculas deacar

    BC/#02

  • DISTNCIA MDIA PERCORRIDA POR DIFUSO

    (problema unidireccional)

    Difuso nos dois sentidos a partir

    da origem

    2Dt

    = distncia ao quadrado mdiapercorrida por difuso

    t = lapso de tempo difusional

    t 2/2D

    = distncia mdia percorridapor difuso

    Terminal nervoso

    Clula muscular

    ACh

    20 nmD (ACh) = 7.6x10-6 cm2.s-1

    t 0.3 s

    glicose

    capilar

    fenda

    sinptica

    tecido

    D (gli) = 6.7x10-6 cm2.s-1

    t 70 ms

    neurnio

    glicose

    ??

    ?

    glicose

    ? ?

    1 cm

    t 21 horas !!

    BC/#03

  • Exerccios

    1 verdadeira ou falsa a seguinte afirmao? Porqu?O tempo mdio que uma molcula demora a percorrer por difuso simples uma distncia de 30 m trs vezes superior ao quedemora a percorrer 10 m

    2 Calcule o lapso de tempo difusional para a glicose ao longo de um internodo (segmento entre nodos de Ranvier consecutivos) num

    axnio mielinizado. Como ocorre a distribuio de transportadores

    de glicose nestes axnios e qual a possvel consequncia desta

    distribuio? Formule uma hiptese.

    BC/Q1

  • Clculo para molculas

    com D = 5x10-6 cm2.s-1

    A difuso simples um processo:

    rpido escala microscpica

    lento escala macroscpica

    Mistura por conveco Fluxo sanguneo distncia Irrigao capilar de tecidos Tamanho das clulas

    Recuperao de um episdio isqumico

    no se efectua por difuso de O2 e

    nutrientes

    BC/#4

  • DIFUSO ATRAVS DE UMA BARREIRA PERMEVEL

    AO SOLUTO E SOLVENTE

    C1

    C2

    Barreira(ex: papel de filtro)

    Perfil linear de variao da concentrao

    do soluto na barreira dC/dz = cte

    J = -D C/ = D/ (C1 C2)

    P = D/: constante ou coeficiente de permeabilidade

    [P] = cm.s-1

    BC/#5

  • Exerccios

    1 Derive formalmente a equao de fluxo em BC/#5

    Sugesto: aplique condies-fronteira variao linear da concentrao

    BC/Q2

  • DIFUSO SIMPLES ATRAVS DE UMA MEMBRANA(BICAMADA LIPDICA)

    C1

    C2

    k1k1

    k-1k-1

    (1)(3)

    (2)

    (1) Partio entre a fase aquosa (comp.1) e lipdica

    K = k1/k-1: coeficiente de partio

    (2) Difuso atravs da membrana

    Dm: coeficiente de difuso membranar

    (3) Partio entre a fase lipdica e aquosa (comp.2)

    Considerando (2) como o passo determinante,

    J = DmK/ (C1 C2)

    Pm = DmK/ : coeficiente de permeabilidadeda membrana

    [Pm] = cm.s-1

    BC/#6

  • RELAO ENTRE A PERMEABILIDADE DA MEMBRANA

    E O COEFICIENTE DE PARTIO

    Pm = DmK/

    Pm radioistopos K e Dm simulao utilizando outros lpidos

    K = (conc. soluto em lpido)/(conc. soluto em gua)

    microscopia electrnica ou medio da capacidade elctrica da membrana

    Equao de Stokes-Einstein

    Dm = kT/6a

    viscosidade raio da partcula

    hidratada

    Glicerol C3H8O3 MW=92

    muito polar (=42.5)

    Uretano NH2COOC2H5 MW=89

    pouco polar (=3.2)

    BC/#7

  • Exerccios

    1 Proponha um mtodo para determinar experimentalmente o coeficiente de partio

    2 Demonstre que o influxo inicial de uma molcula que atravessa a membrana celular por difuso simples directamente proporcional

    sua concentrao extracelular, assumindo que esta se mantm

    constante ao longo da experincia

    BC/Q3

    Ci

    Co > Ci influxo

    Ci

    Tempo

    Ci = C0

    Co = 0

    J(influxo

    inicial)

    Co

  • TRANSPORTE MEDIADO

    Transportadores

    Molculas ou ies transportados

    Factores que determinam a magnitude do fluxo:

    - Concentrao, afinidade

    - Nmero de transportadores

    - Velocidade da alterao conformacional

    difuso simples

    transporte

    mediadoTransporte mediado

    Difuso facilitada: transporte de acordo como gradiente electroqumico

    Transporte activo: transporte contra o gradiente electroqumico (fonte de energia)

    BC/#8

  • DIFUSO FACILITADA

    Transportadores de monossacardeos,aminocidos, cidos gordos, gua,

    ies, etc

    Transportadores de glicose

    [glicose]i < [glicose]o (metabolismo)

    Isoformas: GLUT-1, 2, 3, 4, 5, etc

    Diferem em (i) km (afinidade); (ii) Vmax(capacidade); (iii) regulao

    GLUT-1: tr. basal (crebro, eritrcitos, etc)

    GLUT-2: tr. vs. homeostasia (hepatcitos,clula )

    GLUT-4: tr. vs. homeostasia, dep. insulina(adipcitos, msculo esqueltico)

    Substratos (GLUT-1): hexoses (ex:D-glicose, D-manose, D-galactose);

    pentoses (ex: D-xilose, L-arabinose,

    D-ribose)

    No-substratos: L-glicose, L-galactose,L-xilose

    Inibidores: competitivos (substratos); no-competitivos (citocalasina B,

    floretina)

    BC/#9

  • REGULAO DE GLUT-4 POR INSULINA

    Regulao por recrutamento de

    transportadores para a membrana

    Rpida (ocorre em minutos)

    No requer sntese de novos transportadores

    Essencial para a homeostasia da glicose

    Artigos de reviso: Watson & Pessin (2006) Trends Biochem. Sci. 31: 215-222Chang et al. (2004) Mol. Medicine 10: 7-12

    BC/#10

  • TRANSLOCAO DE GLUT-4 E ACTIVAO DO RECEPTOR DE INSULINA

    Myc: an engineered epitope tag

    EGFP: enhanced green fluorescent protein

    Adipcito

    via TC10 via PPIn 3-cinase

    IRS: insulin receptor substrate

    PDK1: phosphoinositide-dependent kinase 1

    Watson & Pessin (2006) Bridging the gap between insulin signaling and GLUT4 translocation.

    Trends Biochem. Sci. 31: 215-222BC/#11

  • DIFUSO FACILITADA DE IES

    P = DK/

    D = uRT/zF

    u = mobilidade do io(m2.s-1.V-1)

    s = uE

    velocidade do io

    em soluo

    campo elctrico

    Para a bicamada lipdica

    u 0 e K 0 (H2O) 80 >> (lpidos) 2-5

    K e u podem ser aumentados:

    fisiologicamente (canais inicos nativos) artificialmente (ionforos)

    K+

    Ionforos difusveis

    Ex: valinomicina(antibitico macrocclico polipeptdico)

    Cavidade hidroflica

    Exterior hidrofbico

    Altamente selectivo para K+

    (K+ >> Na+ > H+)

    Outros exemplos: desacopladores

    mitocondriais (FCCP, DNP) BC/#12

  • IONFOROS-CANAIS

    ies e H2O

    Mon.1 Mon.2

    cadeias laterais

    de AAs (hidrofbicas)

    poro hidroflico

    ( 4A)

    Gramicidina A

    Bacillus brevis

    Poro: 2 hemicanais, ligados topo

    a topo por ligaes H

    Hemicanal: 15 AAs neutros

    Sequncia de selectividade

    (solues simtricas):

    H+ > Cs+ Rb+ > NH4+ > Tl+ > Na+ > Li+

    9.31 2.06 2.07 1.96 1.98 1.33 1.03

    D (x10-5 cm2/s)

    Selectivo para caties

    = 100 mV fluxo de ~ 4x106 ies/s

    Outros ionforos-canais:

    Nistatina (caties monovalentes e anies)

    Alameticina (K+, Na+ e Cl-)

    BC/#13

  • Tema de suporte

    Polaridade da gua e de

    biomolculas

  • gua como solvente biolgico Polaridade e momento dipolar permanente. Unidades Polarizao do dielctrico por aco de um campo elctrico: polarizao

    por orientao e induo

    Momento dipolar induzido e polarizabilidade Permissividade do meio e constante dielctrica Relao entre momento dipolar e constante dielctrica Constante dielctrica da gua e dissoluo de sais e molculas polares

    Bibliografia recomendada para este tema

    Sperelakis (Caps. 1, 3 e 4)

    Hille (Caps. 1 e 10)

    Fontes complementares* (no mencionadas na bibliografia geral recomendada)

    Eckert (Caps. 2 e 4)

    Atkins (Caps. 22 e 24)

    Moore (Caps. 10 e 15)

    *Animal Physiology: Mechanisms and Adaptations (R. Eckert, D. Randall e G. Augustine

    - W.H. Freeman)

    *Physical Chemistry (P.W. Atkins - Oxford University Press)

    *Physical Chemistry (W.J. Moore - Longman Group limited)

  • Citossol

    - Solubilizao / acumulao de ies, molculas polares

    - Gradientes ( exterior, organelos)- Papel central da gua

  • Aglomerados lbeis

    Ligaes de hidrognio

    Momento dipolar

    permanente,

    d

    -q

    = q.d

    e d = 0.1 nm

    qe = 4.8x10-10 esu

    = 4.8x10-18 esu.cm1 D = 10-18 esu.cm

    = 4.8 D

    [D = debye] (D)

    H2O 1.85

    CH3OH 1.71

    NH3 1.47

    HCl 1.08

    CHCl3 1.01

    HI 0.42

    CCl4 0

    O

    H

    H

    2-

    +

    +

    +q

  • Questes

    1 Qual a razo por que o momento dipolar do tetracloreto de carbono nulo?

    2 Por que razo que os momentos dipolares dos cidos clordrico e ioddrico so to diferentes?

  • E=0- +

    Cl- Na+

    -P+PCl- Na+

    Dielctrico

    Polarizao do dielctrico

    por aco de um campo

    elctrico (par Na+/Cl-)P

    P: Polarizao do dielctrico

    (momento dipolar mdio por

    unidade de volume)

    E>0

    Reduz a fora do campo E em

    qualquer ponto do dielctrico

    dq-

    Cl- Na+

    Lei de Coulomb

    Vcuo:

    Soluo:

    0 = permissividade do vcuo = permissividade do meio

    Constante dielctrica(ou permissividade relativa)

    r = /0>0

    q+

  • Lei de Coulomb para o par Na+/Cl-

    num dielctrico

    F = q+q-/(40rd2)

    0 = permissividade do vcuor = constante dielctrica

    perm (D) r

    Vcuo - 1

    Ar - 1.00054

    Benzeno 0 2.28

    CHCl3 1.01 4.8

    NH3 1.47 16.9

    Etanol 1.69 24.3

    CH3OH 1.71 32.6

    H2O 1.85 78.5 r

    r reflecte a atenuao da intensidade de Ecausada pela polarizao por orientao ( perm)e pela polarizao induzida ( ind)

    ind = .E = polarizabilidade da molcula

  • Questes

    1 - Por que razo que molculas simtricas (ex: benzeno) tm uma

    constante dielctrica diferente de zero?

    Exerccios

    1 Proponha um mtodo para determinar experimentalmente a constantedielctrica