BOLETIM EPIDEMIOLÓGICO DA REDE DE ALERTA DAS …

BOLETIM EPIDEMIOLÓGICO DA REDE DE ALERTA DAS VARIANTES DO SARS-COV-2

ESTADO DE SÃO PAULO - INSTITUTO BUTANTAN

Boletim elaborado a partir dos dados sequenciados até 2/7/2021

COMPONENTES DA REDE

> Hemocentro de Ribeirão Preto/FMRP-USP> FZEA-USP/Pirassununga

> Centro de Genômica Funcional (ESALQ-USP)/Piracicaba> Faculdade de Ciências Agronômicas –UNESP/Botucatu

> FAMERP – São José do Rio Preto> Mendelics (privado)

> Centro Analítico de Genômica e Proteômica, Instituto Butantan

BOLETIM EPIDEMIOLÓGICO DA REDE DE ALERTA DAS VARIANTES DO SARS-COV-2 | ESTADO DE SÃO PAULO - INSTITUTO BUTANTAN | DADOS SEQUENCIADOS ATÉ 2/7/2021

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HIGHLIGHTSIdentificadas 23 VARIANTESCIRCULANTES no estado

de São Paulo•••

As variantes mais incidentes no estado de São Paulo até o momento são a VOC* P.1 - GAMA - VARIANTE DO BRASIL(90,74%), seguida da VOC

B.1.1.7 - ALFA - VARIANTE DA INGLATERRA (3,02%) e da VARIANTE P.1.2 (2,91%)

•••

Além das VOC GAMA E ALFA, as VOC B.1.617.2 - DELTA - VARIANTE DA ÍNDIA e a B.1.351 - BETA - VARIANTE DA ÁFRICA DO SUL também já foram identificadas no estado de São Paulo (incidência

de 0,03% e 0,02%, respectivamente), sendo um caso da VOC Delta no DRS 1 - Grande São Paulo e dois casos no DRS 17 - Taubaté, e um caso da VOC Beta no DRS 4 - Baixada Santista e um caso no DRS 16 - Sorocaba

•••

A VOI* P.2 - ZETA - VARIANTE DO BRASIL já foi identificada em todos os DRS do estado de São Paulo, exceto no DRS 16 - Sorocaba, representando um total de 0,60% das variantes do estado até o momento. A VOI C.37 - LAMBDA - VARIANTE DO PERU já foi identificada nos DRS 1 - Grande São Paulo, 4 - Baixada Santista e 13 - Ribeirão Preto, com apenas um caso em cada DRS

•••

Na 26a SEMANA EPIDEMIOLÓGICA, verificamos uma DIMINUIÇÃO DA INCIDÊNCIA DE

SARS-COV-2 em todos os DRS do estado de São Paulo

•••

*VOC = Variant of concern (variante de preocupação) / VOI = Variant of interest (variante de interesse)


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CONTEXTUALIZAÇÃO E AMOSTRA

A rede genômica coordenada pelo Instituto Butantan reúne laboratórios do estado de São Paulo, a saber, Hemocentro de Ribeirão Preto/FMRP-USP, FZEA-USP/Pirassununga, Centro de Genômica Funcional (ESALQ USP)/Piracicaba, Faculdade de Ciências Agronômicas –UNESP/Botucatu, FAMERP – São José do Rio Preto, Mendelics (privado) e Centro Analítico de Genômica e Proteômica, Instituto Butantan, com o objetivo de identificar as linhagens do SARS-CoV-2. As nomenclaturas das variantes são definidas de acordo com a Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages – Pango lineages, disponível em HTTPS://COV-LINEAGES.ORG/LINEAGES.HTML. Os metadados foram extraídos do Gerenciador de Ambiente Laboratorial (GAL) do estado de São Paulo, onde há o registro das testagens de SARS-CoV-2 da maioria das cidades paulistas.

As amostras semanais genotipadas foram distribuídas de acordo com a fração amostral do total de resultados positivos de cada DRS do estado de São Paulo, com seleção amostral randomizada entre as cidades que compõem os respectivos DRS. A variabilidade do percentual do sequenciamento genômico por DRS foi decorrente do número de amostras disponíveis e do seu controle de qualidade. O sequenciamento genômico iniciou-se no mês de janeiro de 2021 e até a 26a semana epidemiológica já foram sequenciados 11.662 (1,15%) genomas completos de 1.012.363 (38,6%) casos positivos.


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O número de amostras sequenciadas variou de acordo com a semana epidemiológica, em que arepresentatividade percentual foi de 0,1% a 6% (Gráfico 1).

Secretaria de Estado da SaúdeCoordenadoria de Ciência, Tecnologia e

Insumos Estratégicos de SaúdeInstituto Butantan

Gráfico 1. Número de resultados positivos pelo RT-PCR para SARS-CoV-2 e percentual de sequenciamento genômico realizado (linha), segundo a semana epidemiológica do Estado de São Paulo – Instituto Butantan, 2021.

CONTEXTUALIZAÇÃO E AMOSTRA

A rede genômica coordenada pelo Instituto Butantan reúne laboratórios do Estado de São Paulo, a saber,Hemocentro de Ribeirão Preto/FMRP-USP, FZEA-USP/Pirassununga, Centro de Genômica Funcional (ESALQ-USP)/Piracicaba, Faculdade de Ciências Agrônomas –UNESP/Botucatu, FAMERP – São José do Rio Preto, Mendelics(privado) e Centro Analítico de Genômica e Proteômica, Instituto Butantan, com o objetivo de identificar as linhagens doSARS-CoV-2. As nomenclaturas das variantes são definidas de acordo com a Phylogenetic Assignment of Named GlobalOutbreak Lineages – Pango lineages, disponível em https://cov-lineages.org/lineages.html. Os metadados foram extraídosdo Gerenciador de Ambiente Laboratorial (GAL) do Estado de São Paulo, onde há o registro das testagens de SARS-CoV-2da maioria das cidades paulistas.

As amostras semanais genotipadas foram distribuídas de acordo com a fração amostral do total de resultadospositivos de cada DRS do Estado de São Paulo, com seleção amostral randomizada entre as cidades que compõe osrespectivos DRS. A variabilidade do percentual do sequenciamento genômico por DRS foi decorrente do número deamostras disponíveis e do seu controle de qualidade. O sequenciamento genômico iniciou-se no mês de janeiro de 2021 eaté a 26ª semana epidemiológica já foram sequenciados 11.662 (1,15%) genomas completos de 1.012.363 (38,6%) casospositivos. O número de amostras sequenciadas variou de acordo com a semana epidemiológica, em que arepresentatividade percentual foi de 0,1% a 6% (Gráfico 1).

43K 39K

34K 31K

26K 25K

27K

36K

44K

54K

59K

53K

36K 35K 32K

29K 32K

35K 39K

45K 47K 48K 48K

39K

33K

24K

17K

1K 0,1% 0,1% 0,2% 0,2%

0,8% 0,8%

2,0%

1,4%

2,4%2,0%

0,8%

1,4%

2,0% 2,1% 2,0%1,7%

2,4%

3,8%

6,0%

0,0%

2%

4%

6%

8%

10%

0 K

10 K

20 K

30 K

40 K

50 K

60 K

70 K

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 31

Percentual de sequenciamento genôm

ico

Amos

tras

Pos

itiva

s

Semana Epidemiológica

Amostras Positivas x Sequenciadas (%)

Positivas % Sequenciadas

Para acessar os gráficos interativos, CLIQUE AQUI e entre na seção TESTAGEM E SEQUENCIAMENTO / PERCENTUAL DE SEQUENCIAMENTO

https://butantan.gov.br/covid/boletim-epidemiologico


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ESTADO DE SÃO PAULO

Até o momento, já foram identificadas 23 variantes circulantes no estado de São Paulo, sendo estas descritas na Tabela 1, de acordo com os Departamentos Regionais de Saúde (DRS) do estado de São Paulo. No DRS 1 – Grande São Paulo já foram identificadas 16 variantes diferentes, seguido pelo DRS 7 – Campinas e DRS 16 – Sorocaba com 10 variantes diferentes cada. A VOC P.1 - Gama foi predominante em todos os DRS, representando 90,74% das variantes identificadas, seguida pela VOC B.1.1.7 - Alfa (3,07%) e pela variante P.1.2 (2,91%).


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Tabela 1. Frequências absolutas e relativas das linhagens do SARS-CoV-2 dos Departamentos Regionais de Saúde (DRS) do Estado de São Paulo – Instituto Butantan, 2021.Rótulos de Coluna

Variantes n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n % n %

P.1 3.422 95,13% 226 93,00% 301 90,66% 402 88,74% 165 87,77% 604 83,08% 939 87,84% 222 88,45% 510 91,07% 564 88,82% 351 89,77% 72 94,74% 420 91,30% 308 85,56% 938 88,66% 709 92,44% 429 86,67%

B.1.1.7 60 1,67% 9 3,70% 11 3,31% 6 1,32% 4 2,13% 74 10,18% 54 5,05% 16 6,37% 16 2,86% 19 2,99% 9 2,30% 5 1,09% 10 2,78% 8 0,76% 9 1,17% 42 8,48%

P.1.2 63 1,75% 4 1,65% 1 0,30% 18 3,97% 12 6,38% 35 4,81% 30 2,81% 1 0,40% 15 2,68% 8 1,26% 25 6,39% 14 3,04% 3 0,83% 94 8,88% 13 1,69% 3 0,61%

B.1.1.28 13 0,36% 2 0,82% 10 3,01% 20 4,42% 4 2,13% 4 0,55% 29 2,71% 6 2,39% 8 1,43% 26 4,09% 3 0,77% 3 3,95% 5 1,09% 26 7,22% 9 0,85% 22 2,87% 14 2,83%

P.2 9 0,25% 1 0,41% 5 1,51% 4 0,88% 2 1,06% 2 0,28% 4 0,37% 6 2,39% 9 1,61% 4 0,63% 2 0,51% 1 1,32% 11 2,39% 2 0,56% 5 0,47% 3 0,61%

B.1.1 10 0,28% 1 0,3% 3 0,41% 1 0,09% 1 0,2% 2 0,56% 1 0,09% 7 0,91% 1 0,20%

P.1.1 4 0,11% 1 0,30% 9 0,84% 1 0,18% 1 0,26% 1 0,22% 4 1,11% 1 0,1% 1 0,13% 1 0,20%

P.4 4 0,11% 1 0,30% 1 0,53% 1 0,1% 11 1,7% 1 0,22% 5 1,39%

B.1 3 0,08% 1 0,4% 1 0,30% 1 0,2% 2 0,3% 1 0,09% 1 0,18% 1 0,1% 1 0,1%

N.9 1 0,03% 2 0,28% 2 0,43% 1 0,1%

C.37 1 0,03% 1 0,22% 1 0,2%

B.1.617.2 1 0,03% 2 0,4%

B.1.566 3 0,39%

B.1.1.318 2 0,06%

B.1.1.187 2 0,06%

B.1.351 1 0,22% 1 0,13%

N.10 1 0,09%

B.1.620 1 0,14%

B.1.1.58 1 0,03%

B.1.332 1 0,13%

B.1.1.33 1 0,2%

B.1.1.332 1 0,16%

DRS 13 - Ribeirão Preto

DRS 14 - São João da Boa

Vista

DRS 15 - São José do Rio Preto

DRS 16 - Sorocaba

DRS 17 - TaubatéDRS 1 - Grande

São PauloDRS 2 -

AraçatubaDRS 3 -

AraraquaraDRS 4 - Baixada

SantistaDRS 5 -

BarretosDRS 6 - Bauru

DRS 7 - Campinas

DRS 8 - Franca DRS 9 - MaríliaDRS 10 -

Piracicaba

DRS 11 - Presidente Prudente

DRS 12 - Registro

TABELA 1. FREQUÊNCIAS ABSOLUTAS E RELATIVAS DAS LINHAGENS DO SARS-COV-2 DOS DEPARTAMENTOS REGIONAIS DE SAÚDE (DRS) DO ESTADO DE SÃO PAULO – INSTITUTO BUTANTAN, 2021



B.1.1.34 1 0,03%

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7

É apresentada no Gráfico 2 a evolução das seis variantes mais incidentes por grupo de DRS, em que observamos predominância da VOC P.1 - Gama em todos os grupos até o momento (Grupo 1=95,13%, Grupo 2=88,18%, Grupo 3=87,30%, Grupo 4=89,25%, Grupo 5=90,41% e Grupo 6=89,01%). No mês de julho verificamos uma incidência da VOC Alfa - B.1.1.7 de 12,5% no Grupo 6.

Ainda no mês de julho, a incidência da variante P.1.2 no Grupo 1 foi de 1,27%, no Grupo 2=6,33%, no Grupo 3=6,15%, no Grupo 5=2,28% e no Grupo 6=12,50%; da variante B.1.1.28 no Grupo 1 foi de 1,27%, no Grupo 2=1,33% e no Grupo 3=0,42%; e da variante B.1.1 no Grupo 3 de 0,14% e no Grupo 5=0,33% (Gráfico 2).



GRUPO 1 - DRS 1

ESTADO DE SÃO PAULO

É apresentada no Gráfico 2 a evolução das seis variantes mais incidentes por grupo de DRS, em que observamos predominância da VOC P.1 - Gama em todos os grupos até o momento (Grupo 1=95,13%, Grupo 2=88,18%, Grupo 3=87,30%, Grupo 4=89,25%, Grupo 5=90,41% e Grupo 6=89,01%). No mês de julho verificamos uma incidência da VOC Alfa - B.1.1.7 de 12,5% no Grupo 6. Ainda no mês de julho, a incidência da variante P.1.2 no Grupo 1 foi de 1,27%, no Grupo 2=6,33%, no Grupo 3=6,15%, no Grupo 5=2,28% e no Grupo 6=12,50%; da variante B.1.1.28 no Grupo 1 foi de 1,27%, no Grupo 2=1,33% e no Grupo 3=0,42%; e da variante B.1.1 no Grupo 3 de 0,14% e no Grupo 5=0,33% (Gráfico 2).

84,6% 95,2% 96,4% 94,9% 96,2%

11,5% 3,0% 1,4% 0,8%2,9%

1,3%0,1%1,3%

0,3%

0%

50%

100%

1-JAN 3-MAR 4-ABR 5-MAI 6-JUN 7-JUL2-FEV

1-P.1 2-B.1.1.7 3-P.1.2 4-B.1.1.28 5-P.2 6-B.1.1

Gráfico 2. Distribuição das principais variantes de SARS-CoV-2 por DRS do estado de São Paulo – Instituto Butantan, 2021.

Para acessar os gráficos interativos, CLIQUE AQUI e entre na seção SEQUENCIAMENTO GRÁFICO DE BARRAS POR GRUPO / LINHAGENS DO SARS-COV 2



8

Gráfico 2. Distribuição das principais variantes de SARS-CoV-2 por DRS do estado de São Paulo – Instituto Butantan, 2021



GRUPO 2 - DRS 4, 12 e 17

GRUPO 6 - DRS 7, 10, 14 e 16

GRUPO 5 - DRS 3, 8 e 13

GRUPO 4 - DRS 2, 5 e 15

GRUPO 3 - DRS 6, 9 e 11

58,5%86,8% 92,6% 86,1% 89,7% 100,0%

4,9%

4,1%2,3%

11,9% 1,7%0,8% 6,3%

26,8%

5,8%1,2% 1,3%

7,3%3,3%

0,3%

0%

50%

100%

1-JAN 2-FEV 3-MAR 4-ABR 5-MAI 6-JUN 7-JUL

1-P.1 2-B.1.1.7 3-P.1.2 4-B.1.1.28 5-P.2 6-B.1.1

72,2%87,8% 89,0% 88,5% 80,0%

13,0%8,7% 5,4%

4,3%

4,5%6,2% 20,0%6,1%

1,9% 0,4%0,0% 0,1%

0%

50%

100%

1-JAN 2-FEV 3-MAR 4-ABR 6-JUN 7-JUL

1-P.1 2-B.1.1.7 3-P.1.2 4-B.1.1.28 5-P.2

5-MAI

6-B.1.1 99-OUTROS

92,0% 93,9% 93,9% 84,1%

2,9% 2,0% 0,9%1,2%

4,5%13,4%

2,9%

0,2%0,4%

1,7%

0,2% 0,3% 0,0%

0%

50%

100%


1-P.1 2-B.1.1.7 3-P.1.2 4-B.1.1.28 5-P.2

5-MAI

6-B.1.1 99-OUTROS

75,0%92,7% 89,5% 94,8% 94,1%

2,1% 2,3%5,9%

6,7%0,4%

3,4%

0,3%

0,0% 0,3%

0%

50%

100%


1-P.1 2-B.1.1.7 3-P.1.2 4-B.1.1.28 5-P.2

5-MAI

6-B.1.1 99-OUTROS

100,0%78,4% 90,3% 94,1% 88,3% 75,0%

2,7%

3,4% 2,0%4,1%

12,5%

1,8%3,8% 12,5%

13,2% 5,2% 1,4% 1,0%6,7%0,4% 3,4% 0,3%0,0% 0,3%

0%

50%

100%


1-P.1 2-B.1.1.7 3-P.1.2 4-B.1.1.28 5-P.2

5-MAI

6-B.1.1 99-OUTROS

Para acessar os gráficos interativos, CLIQUE AQUI e entre na seção SEQUENCIAMENTO GRÁFICO DE BARRAS POR GRUPO / LINHAGENS DO SARS-COV 2



9



713941

269230

3597 SEQUENCIADOS

3.597 (1,3%)

Gráfico 3.1. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 01 - Grande São Paulo e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

DRS 1 – GRANDE SÃO PAULO

A incidência de SARS-CoV-2 no DRS 1 até a 26ª semana epidemiológica foi de 37,7%, em que já foram sequenciados um total de 1,3% dos casos positivos (Figura 1.1).

TESTES REALIZADOS

713.941

POSITIVOS

269.230 (37,7%)

Figura 1.1. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 1 - Grande São Paulo até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante P.4 foi 0,16%, da variante P.1.2 foi de 2,42%, da VOI P.2 - Zeta foi de 0,49%, da variante P.1.2 foi de 3,58% e da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 0,65%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.1).

96,3079,17 80,65

94,21 95,45 96,34 94,39 97,47 96,79 97,37 95,58 95,37 96,79 95,00 95,45 93,66

3,70

12,5016,13

4,21 1,52 2,85 3,06 1,27 2,56 0,53

1,561,42 1,43 0,71 0,41 0,65

1,05

1,562,49 1,07 3,57 2,69 3,58

0,53 0,520,36 0,36

0,210,49

0,26 0,41 0,160,36

0,00

5000,00

10000,00

15000,00

20000,00

25000,00

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2

Semanas Epidemiológicas

P.1 B.1.1.7 P.1.2 B.1.1.28 N.9 B.1.1 P.2 B.1.1.187

P.1.1 B.1.1.318 B.1 P.4 B.1.1.58 C.37 B.1.617.2 B.1.1.34

B.1.1.332 B.1.351 B.1.1.33 B.1.566 N.10 B.1.332 B.1.620 POSITIVOS

DRS 1 – GRANDE SÃO PAULO

Evolução temporal da incidência das diferentes variantes nos Departamentos Regionais de Saúde do estado de São Paulo

Gráfico 3.1. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 1 - Grande São Paulo e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


10



60896

21556

243 SEQUENCIADOS

243 (1,1%)

Gráfico 3.2. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 02 - Araçatuba e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.2. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 2 - Araçatuba até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante da 12ª à 26ª semana epidemiológica. Na 26ª semana epidemiológica, apenas a VOC P.1 - Gama foi identificada. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.2).

21.556 (35,4%)

DRS 2 – ARAÇATUBA


TESTES REALIZADOS

60.896

POSITIVOS

50,00

100,00 93,75 92,31100,00 100,00 100,00 100,00 100,00

90,91

55,56

92,3192,86 88,89

100,00

50,00

6,25 9,09

33,33

7,693,70

11,11 7,417,69 7,14

0

200

400

600

800

1.000

1.200

1.400

1.600

1.800

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 B.1.1.7 P.1.2 P.2 B.1 B.1.1.58 B.1.1.332

P.1.1 B.1.1.187 P.4 B.1.351 B.1.1 B.1.566 B.1.1.318 B.1.617.2

B.1.332 C.37 B.1.1.33 N.10 N.9 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 2 – ARAÇATUBA


Gráfico 3.2. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 2 - Araçatuba e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


11



113336

31199

332 SEQUENCIADOS

332 (1,1%)

Gráfico 3.3. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 03 - Araraquara e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.3. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 3 - Araraquara até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante B.1.1 foi de 5,88%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.3).

31.199 (27,5%)

DRS 3 – ARARAQUARA


TESTES REALIZADOS

113.336

POSITIVOS

66,67100,00

70,00

84,62

81,82

83,33100,00

100,00100,00

73,81

90,91 95,24 92,59 95,12 100,00 94,12

33,337,69 9,09 5,56

9,52

4,55 3,70 2,44

20,00

9,09 11,1111,90

10,00 4,764,55 3,70

7,69 5,882,442,38

2,38

02004006008001.0001.2001.4001.6001.8002.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

10 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.7 B.1.1.28 P.2 P.1.1 B.1.1 P.1.2 P.4

B.1 B.1.1.58 B.1.1.33 B.1.332 B.1.617.2 B.1.1.332 C.37 B.1.1.187

N.10 B.1.351 N.9 B.1.566 B.1.1.318 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 3 – ARARAQUARA


Gráfico 3.3. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 3 - Araraquara e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


12



105946

45678

453 SEQUENCIADOS

453 (1,0%)

Gráfico 3.4. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 04 – Baixada Santista e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.4. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 4 – Baixada Santista até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante P.1.2 foi de 24,24%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.4).

45.678 (43,1%)

DRS 4 – BAIXADA SANTISTA

A incidência de SARS-CoV-2 no DRS 4 até a 26ª semana epidemiológica foi de 43,1%, em que já foram sequenciados um total de 1% dos casos positivos (Figura 1.4).

TESTES REALIZADOS

105.946

POSITIVOS

54,29

81,82 85,7175,00

95,24 94,12 90,00 95,83 97,14 100,00 100,0089,47 93,33

100,00 100,0088,89

96,88

76,47 75,76

28,57

18,18 14,2925,00

5,88

2,50

10,53 11,116,67 3,13

20,59 24,245,71

4,765,00

2,868,57

4,172,942,86 2,50

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

3.000

3.500

4.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 P.1.2 B.1.1.7 P.2 B.1 C.37 B.1.351

B.1.1.318 B.1.1 B.1.1.187 B.1.1.58 B.1.566 P.1.1 B.1.617.2 B.1.1.332

B.1.332 P.4 B.1.1.33 N.10 N.9 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 4 – BAIXADA SANTISTA


Gráfico 3.4. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 4 – Baixada Santista e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


13



35393

16312

188 SEQUENCIADOS

188 (1,2%)

Gráfico 3.5. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 05 – Barretos e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.5. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 5 – Barretos até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 11ª semana, quando foi 50%, e na 9ª semana, em que apenas a variante B.1.1.28 foi identificada. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante P.1.2 foi de 10%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.5).

16.312 (46,1%)

DRS 5 – BARRETOS


TESTES REALIZADOS

35.393

POSITIVOS

83,33

50,00

96,3084,62

92,86 87,50100,00 100,00 100,00 100,00

66,67

88,89 93,75

33,33

81,82

100,0090,00

100,00

7,697,14

11,11

33,33

11,11

55,56

9,09

10,0016,67

50,00

3,7012,50 6,25 9,09

01002003004005006007008009001.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 P.1.2 B.1.1.7 P.2 P.4 N.9 C.37

P.1.1 B.1.1.187 N.10 B.1.1.332 B.1.1 B.1.1.318 B.1.1.58 B.1.617.2

B.1.332 B.1.351 B.1.1.33 B.1.566 B.1 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 5 – BARRETOS


Gráfico 3.5. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 5 – Barretos e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


14



228423

78719

727 SEQUENCIADOS

727 (0,9%)

Gráfico 3.6. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 06 – Bauru e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.6. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 6 – Bauru até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas analisadas, exceto na 13ª semana epidemiológica, em que a predominante foi a VOC B.1.1.7 - Alfa (73,33%). Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante B.1 foi de 1,89%, da variante P.1.2 foi de 11,32% e da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 1,89%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.6).

78.719 (34,5%)

DRS 6 – BAURU


TESTES REALIZADOS

228.423

POSITIVOS

80,00 80,00

26,67

63,64

80,7766,67

94,0078,95

94,44 91,78 90,6381,61 86,59

76,71 82,35 84,91

15,00

73,33

30,3011,54 33,33

6,0021,05

2,78 6,85 6,258,05

6,1013,70 5,88 1,89

1,371,56

8,056,10

8,22 10,59 11,3220,006,06

1,187,695,00 1,56 2,30 1,37 1,892,78

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

3.000

3.500

4.000

4.500

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.7 P.1.2 B.1.1.28 N.9 P.2 B.1.1 B.1

B.1.620 B.1.1.187 B.1.1.33 B.1.332 B.1.1.318 B.1.1.34 C.37 B.1.351

N.10 P.4 B.1.1.332 B.1.617.2 B.1.1.58 B.1.566 P.1.1 POSITIVOS

DRS 6 – BAURU


Gráfico 3.6. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 6 – Bauru e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


15



324925

120552

1069 SEQUENCIADOS

1.069 (0,9%)

Figura 1.7. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 7 – Campinas até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante P.1.2 foi de 4,35%, da variante B.1.1.28 foi de 1,45% e da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 13,77%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.7).

Gráfico 3.7. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 07 – Campinas e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

120.552 (37,1%)

DRS 7 – CAMPINAS


TESTES REALIZADOS

324.925

POSITIVOS

66,6778,57 81,82 87,50 92,68

82,93

100,0084,00

98,31 95,24 92,50 93,69 93,51 88,2472,55

90,09 90,5979,71

7,14

18,18 2,08 2,448,54 8,00

2,387,50 2,60

1,47

1,96

5,41 2,3513,7733,33

14,29 4,174,88 6,10

2,00

2,38 4,50

5,88

0,901,45

3,907,35

11,76

2,707,06 4,352,44 6,00 7,84

6,25 0,901,47

0

1.000

2.000

3.000

4.000

5.000

6.000

7.000

8.000

9.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.7 B.1.1.28 P.1.2 P.1.1 P.2 N.10 B.1.1

B.1 P.4 B.1.351 B.1.1.58 B.1.1.33 C.37 B.1.1.187 B.1.1.318

B.1.617.2 B.1.332 N.9 B.1.566 B.1.1.332 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 7 – CAMPINAS


Gráfico 3.7. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 7 – Campinas e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


16



37337

15602

251 SEQUENCIADOS

251 (1,6%)

Figura 1.8. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 8 – Franca até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto nas 10ª e 11ª semanas, que foi 50%. Na 26ª semana epidemiológica, apenas a VOC P.1 - Gama foi identificada, e na última semana epidemiológica verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.8).

Gráfico 3.8. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 08 – Franca e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

15.602 (41,8%)

DRS 8 – FRANCA


TESTES REALIZADOS

37.337

POSITIVOS

50,00 50,00

67,35

100,0087,18

100,0085,71

96,88 100,00 100,00 100,00 100,00 100,00 100,00 100,0090,91

100,0016,67

50,00 14,29

10,26 14,293,13

33,33 8,16

10,202,56 9,09

0

100

200

300

400

500

600

700

800

900

0%

20%

40%

60%

80%

100%

10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.7 B.1.1.28 P.2 P.1.2 B.1.1.332 B.1.617.2 P.1.1

B.1.1.58 C.37 N.10 N.9 B.1.1 B.1.1.187 B.1.1.318 P.4


DRS 8 – FRANCA


Gráfico 3.8. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 8 – Franca e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


17



92126

36838

560 SEQUENCIADOS

560 (1,5%)

Gráfico 3.9. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 09 – Marília e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.9. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 9 – Marília até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 11ª semana que a variante B.1.1.28 foi predominante (66,67%). Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 2,74%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.9).

36.838 (40,0%)

DRS 9 – MARÍLIA

A incidência de SARS-CoV-2 no DRS 9 até a 26ª semana epidemiológica foi de 40%, em que já foram sequenciados um total de 1,5% dos casos positivos (Figura 1.9).

TESTES REALIZADOS

92.126

POSITIVOS

33,33

72,73

91,30 86,3695,65 91,67 90,00

81,2592,00 94,74 94,29

87,04 87,10 90,00 95,71 97,26

66,67

4,354,55

4,35

2,78 6,45

4,354,55 2,78 10,00

18,754,00 1,75 5,71

4,002,74

27,27

4,55 2,78 4,00 3,51

11,11 3,236,00 4,29

3,231,85

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

3.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 B.1.1.7 P.2 P.1.2 P.1.1 B.1 B.1.1

B.1.332 B.1.1.332 B.1.351 B.1.1.33 B.1.566 B.1.1.318 B.1.617.2 B.1.1.58

C.37 P.4 N.10 B.1.1.187 N.9 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 9 – MARÍLIA


Gráfico 3.9. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 9 – Marília e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


18



106705

42049

635 SEQUENCIADOS

635 (1,5%)

Figura 1.10. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 10 – Piracicaba até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 11ª semana, que foi 40%. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante P.1.2 foi de 11,36%, da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 6,82% e da variante B.1.1.28 foi de 4,55%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.10).

Gráfico 3.10. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 10 – Piracicaba e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

42.049 (39,4%)

DRS 10 – PIRACICABA


TESTES REALIZADOS

106.705

POSITIVOS

100,00 100,00

40,00

75,0083,33

96,88

78,7989,19 90,57 94,44 96,55 91,30 97,50

84,09 89,47 94,59 98,28

77,27

20,00

12,50

16,6713,64

5,41 7,55 2,90

4,55

3,13 6,06 5,41 1,89 5,56 2,90 2,50

1,755,41 1,72

6,8215,91 7,02

20,00

20,003,45

2,9011,3612,50

1,52

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

0%

20%

40%

60%

80%

100%

8 9 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 B.1.1.7 P.4 B.1.1.332 B.1.1.33 P.1.2 P.2

B.1.1 B.1.1.58 B.1.1.318 N.9 B.1.1.187 B.1.351 P.1.1 B.1.617.2

B.1.332 C.37 N.10 B.1.566 B.1 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 10 – PIRACICABA


Gráfico 3.10. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 10 – Piracicaba e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


19



69397

30627

391 SEQUENCIADOS

391 (1,3%)

Figura 1.11. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 11 – Presidente Prudente até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 11ª semana, que foi 50%. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante P.1.2 também foi de 14,63%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.11).

Gráfico 3.11. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 11 – Presidente Prudente e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

30.627 (44,1%)

DRS 11 – PRESIDENTE PRUDENTE


TESTES REALIZADOS

69.397

POSITIVOS

50,00

72,22

100,00 100,00 95,45 92,86100,00

87,23 87,5094,59 95,92

70,97

94,8785,37

8,51 12,505,41 2,04

19,35

2,5614,63

50,00

4,55 7,14 4,262,04

9,68

2,56

16,67

11,11

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 P.1.2 P.1.1 B.1.1.7 B.1.1.28 P.2 N.9 C.37

B.1.617.2 B.1.1 N.10 B.1.1.187 B.1.1.58 B.1.1.332 B.1.1.318 P.4


DRS 11 – PRESIDENTE PRUDENTE


Gráfico 3.11. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 11 – Presidente Prudente e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


20



13131

6504

76 SEQUENCIADOS

76 (1,2%)

Figura 1.12. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 12 – Registro até a 25ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 15ª semana, que foi 50%. Na 25ª semana epidemiológica, houve uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2, sendo que desde a 16ª semana epidemiológica apenas a VOC P.1 - Gama foi identificada (Gráfico 3.12).

Gráfico 3.12. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 12 – Registro e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

6.504 (49,5%)

DRS 12 – REGISTRO


TESTES REALIZADOS

13.131

POSITIVOS

100,0087,50

100,0088,89

50,00

100,00 100,00 100,00 100,00 100,00 100,00

11,11

50,00

12,50

0

50

100

150

200

250

300

350

400

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 14 15 16 17 19 20 21 25

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 P.2 N.10 B.1.617.2 P.1.1 B.1.1.187 P.4

B.1.1.318 C.37 B.1.1.332 B.1.1 N.9 B.1.1.58 P.1.2 B.1.1.7


DRS 12 – REGISTRO


Gráfico 3.12. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 12 – Registro e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


21



121628

48721

460 SEQUENCIADOS

460 (0,9%)

Figura 1.13. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 13 – Ribeirão Preto até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 2,33% e da variante P.1.2 foi de 2,33%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição da incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.13).

Gráfico 3.13. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 13 – Ribeirão Preto e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

48.721 (40,1%)

DRS 13 – RIBEIRÃO PRETO


TESTES REALIZADOS

121.628

POSITIVOS

100,00 100,00

80,0090,00

100,00 100,00 97,44 100,00 100,0091,89

82,86 84,21 87,1097,73 98,00 93,02

5,41

2,8610,53 6,45

2,27 2,002,33

10,00

2,70

8,5710,00

2,56 2,8610,00

1,902,63 3,23

2,333,232,63

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

3.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

9 11 12 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 P.1.2 P.2 B.1.1.28 N.9 B.1.1.7 P.1.1 P.4

C.37 B.1.1.318 N.10 B.1.1.332 B.1.1 B.1.1.187 B.1.1.58 B.1.617.2


DRS 13 – RIBEIRÃO PRETO


Gráfico 3.13. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 13 – Ribeirão Preto e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


22



56721

23145

360 SEQUENCIADOS

360 (1,6%)

Gráfico 3.14. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 14 – São João da Boa Vista e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.14. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 14 – São João da Boa Vista até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em quase todas as semanas epidemiológicas avaliadas, exceto na 9ª, 11ª e 13ª semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, apenas a VOC P.1 - Gama foi identificada. Na última semana epidemiológica, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.14).

23.145 (40,8%)

DRS 14 – SÃO JOÃO DA BOA VISTA


TESTES REALIZADOS

56.721

POSITIVOS

25,00

50,00

73,91

33,33

63,6476,92 80,95

100,00 100,00 100,00 96,43 100,0088,46

77,7894,12

85,48100,00

25,00

50,00

21,74

66,67

36,36 11,5414,29

3,57

3,7050,00

7,417,69

4,763,85 7,41

6,45

7,69 4,843,85 5,883,70 3,23

4,35

0

200

400

600

800

1.000

1.200

1.400

0%

20%

40%

60%

80%

100%

9 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 P.1.1 B.1.1.7 P.4 B.1.1 P.1.2 P.2

C.37 B.1.1.332 N.10 N.9 B.1.1.58 B.1.1.187 B.1.1.318 B.1.617.2


DRS 14 – SÃO JOÃO DA BOA VISTA


Gráfico 3.14. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 14 – São João da Boa Vista e casos positivos deSARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


23



222135

82189

1058 SEQUENCIADOS

1.058 (1,3%)

Gráfico 3.15. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 15 – São José do Rio Preto e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.15. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 15 – São José do Rio Preto até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas. Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante N.9 foi de 0,72% e da variante P.1.2 foi de 16,67%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.15).

82.189 (37,0%)

DRS 15 – SÃO JOSÉ DO RIO PRETO

A incidência de SARS-CoV-2 no DRS 15 até a 26ª semana epidemiológica foi de 37%, em que já foram sequenciados um total de 1,3% dos casos positivos (Figura 1.15).

TESTES REALIZADOS

222.135

POSITIVOS

100,00 95,0880,00

94,44

92,31 87,76

95,12 94,31 93,75 96,94 91,46 84,75 79,57 82,61

4,885,21 3,06 3,66

13,56 20,43 16,676,67

3,85 8,162,44

2,441,64

6,67

3,854,08

2,442,44

3,286,67 5,56 1,04 0,85 0,72

0

1.000

2.000

3.000

4.000

5.000

6.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

11 12 13 14 15 16 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 P.1.2 B.1.1.28 B.1.1.7 P.2 P.1.1 B.1 B.1.1

N.9 B.1.1.332 B.1.1.33 B.1.332 B.1.617.2 B.1.1.318 C.37 B.1.1.58

N.10 P.4 B.1.1.187 B.1.566 B.1.351 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 15 – SÃO JOSÉ DO RIO PRETO


Gráfico 3.15. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 15 – São José do Rio Preto e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


24



175904

79501

767 SEQUENCIADOS

767 (1,0%)

Gráfico 3.16. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 16 – Sorocaba e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.16. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 16 – Sorocaba até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 9ª semana, em que a variante B.1.1.28 foi predominante (40%). Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da variante B.1.1 foi de 2,75% e da variante P.1.2 foi de 4,59%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição da incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.16).

79.501 (45,2%)

DRS 16 – SOROCABA

A incidência de SARS-CoV-2 no DRS 16 até a 26ª semana epidemiológica foi de 45,2%, em que já foram sequenciados um total de 1% dos casos positivos (Figura 1.16).

TESTES REALIZADOS

175.904

POSITIVOS

30,00

57,89

80,00

100,00 93,62 94,70

91,18 100,00

100,00 97,37 95,65 100,00 96,20 92,50 92,42 85,71 91,7440,00

15,79

20,004,26 3,97 5,88 3,03

30,00

2,50

14,29 4,59

5,26

2,13 1,32 2,944,35 1,27

2,501,52

10,53

2,63 2,50 2,75

5,265,26

0

1.000

2.000

3.000

4.000

5.000

6.000

0%

20%

40%

60%

80%

100%

9 10 11 12 13 14 15 16 17 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


P.1 B.1.1.28 B.1.566 P.1.2 B.1.1.7 B.1.1 P.1.1 B.1.351

B.1.332 B.1 P.2 B.1.617.2 P.4 C.37 B.1.1.318 N.10

B.1.1.332 N.9 B.1.1.33 B.1.1.58 B.1.1.187 B.1.1.34 B.1.620 POSITIVOS

DRS 16 – SOROCABA


Gráfico 3.16. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 16 – Sorocaba e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


25



144512

63941

495 SEQUENCIADOS

495 (0,8%)

Gráfico 3.17. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 17 – Taubaté e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha)– Instituto Butantan, 2021.

Figura 1.17. Número de testes realizados e incidência de SARS-CoV-2 no DRS 17 – Taubaté até a 26ª semana epidemiológica – Instituto Butantan, 2021.

A variante de preocupação (VOC) P.1 - Gama foi predominante em todas as semanas epidemiológicas, exceto na 10ª semana, que foi 100% da variante B.1.1.28, e na 20ª semana epidemiológica, que a predominante foi a VOC B.1.1.7 - Alfa (71,79%). Na 26ª semana epidemiológica, a incidência da VOC B.1.617.2 - Delta foi de 2,20%, da variante P.1.2 foi de 3,30% e da VOC B.1.1.7 - Alfa foi de 2,20%. Nas últimas semanas epidemiológicas, verificamos uma diminuição na incidência de SARS-CoV-2 (Gráfico 3.17).

63.941 (44,2%)

DRS 17 – TAUBATÉ


TESTES REALIZADOS

144.512

POSITIVOS

100,00

81,25 84,6297,30

85,29 93,48

88,10100,00

28,21

88,24 95,12 94,44 100,0088,89 92,31

100,00

7,69

2,70

5,88 2,17 9,52 5,882,44 5,56

3,709,38

7,69 5,88 2,172,38

71,79

5,88 2,447,41

2,209,38 3,30

2,94 2,202,17

0

500

1.000

1.500

2.000

2.500

3.000

3.500

0%

20%

40%

60%

80%

100%

10 11 12 13 14 15 16 17 19 20 21 22 23 24 25 26

nº d

e ca

sos p

ositi

vos

Dis

trib

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o SA

RS-C

oV-2


P.1 B.1.1.28 B.1.1.7 P.2 P.1.2 P.1.1 B.1.617.2 B.1.1

B.1.1.58 N.9 N.10 B.1.1.318 B.1.1.187 B.1.1.332 C.37 P.4


DRS 17 – TAUBATÉ


Gráfico 3.17. Variantes de SARS-CoV-2 por semana epidemiológica no DRS 17 – Taubaté e casos positivos de SARS-CoV-2 (linha) – Instituto Butantan, 2021.

Dist

ribui

ção

das v

aria

ntes

do

SARS

-CoV

-2


26

Local de identificação

(mês-ano)

Reino Unido

Setembro-2020

África do Sul

Maio-2020

Brasil

Novembro-2020

Índia VOI: 4/4/21

Outubro-2020 VOC: 11/5/21

Local de identificação

(mês-ano)

Estados Unidos

Março-2020

Brasil

Abril-2020

Vários países

Dezembro-2020

Filipinas

Janeiro-2021

Estados Unidos

Novembro-2020

Índia

Outubro-2020

Data de designação

Alfa B.1.1.7 GRY (formerly GR/501Y.V1) 18/12/20

Épsilon B.1.427/B.1.429 GH/452R.V1 5/3/21

Delta B.1.617.2 G/452R.V3

GR 17/3/21

Eta B.1.525 G/484K.V3 17/3/21

Capa B.1.617.1 G/452R.V3 4/4/21

Pango

Pango

Teta P.3 GR 24/3/21

Iota B.1.526 GH 24/3/21

Dzeta P.2

GLOSSÁRIO

Variantes de preocupação - VOC (Variants of concern)

Variantes de interesse - VOI (Variants of interest)

GISAID Organização Mundial da Saúde Data de designação

Beta B.1.351 GH/501Y.V2 18/12/20

Gama P.1 GR/501Y.V3 11/1/21

Organização Mundial da Saúde GISAID

Peru

Agosto-2020 Lambda C.37 14/6/21 GR/452Q.V1


27

SECRETARIA DE ESTADO DA SAÚDE Coordenadoria de Ciência, Tecnologia e Insumos Estratégicos de Saúde

INSTITUTO BUTANTAN

Boletim Epidemiológico elaborado por Antonio Jorge Martins, Claudia Renata dos S. Barros, David Schlesinger, Debora Botequio Moretti, Dimas Tadeu Covas, Durval de Moraes Jr, Elaine Cristina Marqueze, Heidge Fukumasu, Jayme Augusto de Souza-Neto, Jose Salvatore Leister Patane, Maurício Lacerda Nogueira, Luiz Carlos Junior de Alcantara, Luiz Lehmann Coutinho, Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga, Rafael dos Santos Bezerra, Raul Machado Neto, Rejane Maria Tommasini Grotto, Ricardo Haddad, Sandra Coccuzzo Sampaio Vessoni, Simone Kashima, Svetoslav Nanev Slavov, Vincent

Louis Viala Rede de Alerta das Variantes da Covid-19 - Estado de São Paulo – Instituto Butantan.

Arte: #comunicaçãobutantan

Tecnologia da Informação: Antonio Filipo de Mozer Namur, Claudia Anania Santos da Silva, Cristiano A. Silva, Flávio Berbel Caruso, Gabriela Mauric Frossard Ribeiro, Gustavo Baccan Gomes, Leonardo Fachin Araujo de Freitas Ramires.

INSTITUTO BUTANTANAvenida Vital Brasil, 1500Butantã, São Paulo/SPCEP: 05503-900

CENTRO ADMINISTRATIVOAvenida da Universidade, 210Butantã, São Paulo/SPCEP: 05508-040

BOLETIM EPIDEMIOLÓGICO DA REDE DE ALERTA DAS …

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