Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals

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Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals Pablo Salvanha (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected] Leandro Halle Najm (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected] Pedro Luiz P. Correa (USP, São Paulo, Brazil) - [email protected] Antonio Mauro Saraiva (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected]

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Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals

Pablo Salvanha (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected] Halle Najm (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected] Luiz P. Correa (USP, São Paulo, Brazil) - [email protected] Mauro Saraiva (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected]

AgendaIntroduçãoPortais de Biodiversidade

◦Portal IABINFerramenta de Coleta - SpecifyModelo DarwinCoreModelo de InteraçãoConclusãoReferencias Bibliográficas

IntroduçãoImportância do estudo;Cenário atual para

armazenamento de dados de biodiversidade;

Informatização e distribuição da informação

Controle e replicação;Armazenamento distribuído /

centralizado;

Portais de BiodiversidadeGBIF (Global Biodiversity

Information Facility)IABIN (Inter American

Biodiversity Information Network)NBII (National Biological

Information Infrastructure)WebBee (Rede de Informações

sobre Diversidade Brasileira em Abelhas)

Portal IABIN

Ferramenta de Coleta - SpecifyFacilidade na utilização;Personalização da interface e

dados de entrada;Suporte aos protocolos atuais;Padronização no gerenciamento

de coleções;

Ferramenta de Coleta - Specify

Modelo DarwinCoreSingularidade da informação;Padronização dos campos a

serem distribuídos;Protocolos de acoplamento

(DiGIR / TAPIR)Compatibilidade com atuais

portais de biodiversidade (GBIF, IABIN, ...)

Modelo DarwinCore

Modelo de InteraçãoComplemento ao cenário atual;Compatibilidade com os atuais

protocolos;Suporte aos dados de interação;Checagem da integridade entre

as ligações dos dados;

Processo de Harvest

ImplementaçãoAdaptação do software de coleta

(Specify);Uso do protocolo TAPIR para o modelo

DarwinCore e para o modelo de interação;

Alteração no processo de Harvest para suporte ao modelo de interação;◦Checagem da integridade das informações

Alteração na camada de apresentação do portal para exibição e consulta de dados de interação;

ConclusãoCompatibilidade com as aplicações que

utilizam somente modelo DarwinCore;Informatização no processo de coleta

usando ferramenta adaptativa e gratuita;

Fácil adequação para fornecimento de dados de interação;

Distribuição de informação de polinizadores em portais, facilitando assim a consulta dos pesquisadores;

Referências Bibliográficas J.L. Schnase, J. Cushing, and J.A. Smith, Biodiversity and ecosystem informatics,” J. Intell. Inf. Syst. 29, 1,

August 2007.

J. Soberon: “Linking biodiversity information sources,” Tree Elsevier Science, vol. 14, n.7, p.291, 7 July 1999.

Specify, http://www.specifysoftware.org/Specify/specify

N.A. Van House: Trust and epistemic communities in biodiversity data sharing,” 2nd ACM/IEEE-CS Joint Conference on Digital Libraries. Portland, Oregon, USA, July 2002.

P.L.P. Corrêa, A.M. Saraiva, C.E. Cugnasca, and A.R. Hirakawa: “Uma arquitetura de sistemas voltada para a integração de bases de dados distribuídas de biodiversidade,” Revista Brasileira de Agroinformática, São Paulo, v. 6, n. 1, p. 1-20, 2004.

IABIN, http://www.iabin.net

Darwincore Schema, http://www.tdwg.org/activities/darwincore/

DiGIR Protocol, www.digir.net

GBIF, http://www.gbif.org

Tapir Protocol, http://www.tdwg.org/activities/tapir/

R. Sundaravadivelu, R.J. White, A.C. Jones, and W.A Gray: “Web based middleware framework for interoperability between heterogeneous, distributed biodiversity data resources,” 25th Conference on IASTED international Multi-Conference: Software Engineering. Innsbruck, Austria, February 2007.

TDWG, www.digir.net

PlinianCore schema, http://www.pliniancore.org/

Interaction Extension, http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/InteractionExtension

E.A.J. Cartolano, A.M. Saraiva, P.L.P. Corrêa, T.C. Giannini, and R. Giovanni: “Uma proposta de esquema de dados de relacionamento entre espécimes,” XXXIII Conferencia Latinoamericana de Informática – CLEI, San Jose 2007.

M. T. Özsu, P. Valduriez: “Distributed Database Systems,” Prentice Hall. 22-23, 1999.

Pollination Extension, http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/PollinationExtension