Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals
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Model of management and sharing distributed information of pollinators using biodiversity portals
Pablo Salvanha (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected] Halle Najm (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected] Luiz P. Correa (USP, São Paulo, Brazil) - [email protected] Mauro Saraiva (USP, São Paulo, Brazil) – [email protected]
AgendaIntroduçãoPortais de Biodiversidade
◦Portal IABINFerramenta de Coleta - SpecifyModelo DarwinCoreModelo de InteraçãoConclusãoReferencias Bibliográficas
IntroduçãoImportância do estudo;Cenário atual para
armazenamento de dados de biodiversidade;
Informatização e distribuição da informação
Controle e replicação;Armazenamento distribuído /
centralizado;
Portais de BiodiversidadeGBIF (Global Biodiversity
Information Facility)IABIN (Inter American
Biodiversity Information Network)NBII (National Biological
Information Infrastructure)WebBee (Rede de Informações
sobre Diversidade Brasileira em Abelhas)
Ferramenta de Coleta - SpecifyFacilidade na utilização;Personalização da interface e
dados de entrada;Suporte aos protocolos atuais;Padronização no gerenciamento
de coleções;
Modelo DarwinCoreSingularidade da informação;Padronização dos campos a
serem distribuídos;Protocolos de acoplamento
(DiGIR / TAPIR)Compatibilidade com atuais
portais de biodiversidade (GBIF, IABIN, ...)
Modelo de InteraçãoComplemento ao cenário atual;Compatibilidade com os atuais
protocolos;Suporte aos dados de interação;Checagem da integridade entre
as ligações dos dados;
ImplementaçãoAdaptação do software de coleta
(Specify);Uso do protocolo TAPIR para o modelo
DarwinCore e para o modelo de interação;
Alteração no processo de Harvest para suporte ao modelo de interação;◦Checagem da integridade das informações
Alteração na camada de apresentação do portal para exibição e consulta de dados de interação;
ConclusãoCompatibilidade com as aplicações que
utilizam somente modelo DarwinCore;Informatização no processo de coleta
usando ferramenta adaptativa e gratuita;
Fácil adequação para fornecimento de dados de interação;
Distribuição de informação de polinizadores em portais, facilitando assim a consulta dos pesquisadores;
Referências Bibliográficas J.L. Schnase, J. Cushing, and J.A. Smith, Biodiversity and ecosystem informatics,” J. Intell. Inf. Syst. 29, 1,
August 2007.
J. Soberon: “Linking biodiversity information sources,” Tree Elsevier Science, vol. 14, n.7, p.291, 7 July 1999.
Specify, http://www.specifysoftware.org/Specify/specify
N.A. Van House: Trust and epistemic communities in biodiversity data sharing,” 2nd ACM/IEEE-CS Joint Conference on Digital Libraries. Portland, Oregon, USA, July 2002.
P.L.P. Corrêa, A.M. Saraiva, C.E. Cugnasca, and A.R. Hirakawa: “Uma arquitetura de sistemas voltada para a integração de bases de dados distribuídas de biodiversidade,” Revista Brasileira de Agroinformática, São Paulo, v. 6, n. 1, p. 1-20, 2004.
IABIN, http://www.iabin.net
Darwincore Schema, http://www.tdwg.org/activities/darwincore/
DiGIR Protocol, www.digir.net
GBIF, http://www.gbif.org
Tapir Protocol, http://www.tdwg.org/activities/tapir/
R. Sundaravadivelu, R.J. White, A.C. Jones, and W.A Gray: “Web based middleware framework for interoperability between heterogeneous, distributed biodiversity data resources,” 25th Conference on IASTED international Multi-Conference: Software Engineering. Innsbruck, Austria, February 2007.
TDWG, www.digir.net
PlinianCore schema, http://www.pliniancore.org/
Interaction Extension, http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/InteractionExtension
E.A.J. Cartolano, A.M. Saraiva, P.L.P. Corrêa, T.C. Giannini, and R. Giovanni: “Uma proposta de esquema de dados de relacionamento entre espécimes,” XXXIII Conferencia Latinoamericana de Informática – CLEI, San Jose 2007.
M. T. Özsu, P. Valduriez: “Distributed Database Systems,” Prentice Hall. 22-23, 1999.
Pollination Extension, http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/PollinationExtension