MPI I/O

MPI I/O Introdução

Definição de um conjunto de rotinas para transferência de dados, de e para, meios externos de armazenamento.

O MPI I/O oferece várias vantagens sobre as tradicionais linguagens de I/O.

MPI I/O VantagensFlexibilidade - MPI I/O fornece

mecanismos para o acesso coletivo (muitos processos coletivamente lêem e escrevem em um único arquivo, I/O assíncrono e acesso stridedstrided.

Portabilidade - Muitas plataformas suportam a interface MPI I/O

Arquivos escritos pelo MPI I/O são portáveis entre plataformas.

MPI I/O Conceitos Fundamentais Um arquivo MPI é uma lista ordenada de

estruturas de dados MPI (MPI_CHAR, MPI_INT, etc) As rotinas MPI I/O suportam acesso seqüencial ou

randomico. Um arquivo pode ser aberto por qualquer

processo MPI. Qualquer operação de I/O pode ser executada pelo pelos processos MPI relacionados, ou seja, este arquivo é visível para o conjunto de processos.

MPI I/O ViewsUma view define como os dados são

visiveis para cada processo.

Uma view é composta de: Deslocamento etype (Tipo elementar) Filetype

MPI I/O Views - Estrutura Deslocamento: um

deslocamento medido em bytes, do inicio do arquivo.

ETYPE: define a unidade dos dados acessados. Pode ser predefinido ou derivado do MPI

FILETYPE: define um “molde” para o acesso ao arquivo.

MPI I/O Views - Filetype Consiste em um número de etypes e “furos” (os

quais são de tamanhos múltiplos do etype) Um filetype básico, repete estas estruturas várias

vezes, criando regiões de acesso permitidas (onde etypes são definidos) e regiões de acesso negado (onde os “furos” são definidos)

MPI I/O Views - Filetype É possível para diferentes processos definir

diferentes filetypes, com diferentes views. Ex:

MPI I/O Rotinas Básicas

MPI I/O Rotinas Básicas

MPI I/O Rotinas Básicas

MPI I/O Rotinas de Acesso

MPI I/O Rotinas de Acesso

MPI I/O Rotinas de Gerais

MPI I/O Link’s http://www.mcs.anl.gov/romio http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/ http://www.mpi-forum.org/docs/mpi20html/mpi2-

report.html http://www.mpi-forum.org/docs/docs.html http://wwwunix.mcs.anl.gov/romio/papers.html http://hpcf.nersc.gov/software/libs/io/mpiio.html