Table of Contents - Foster Open Science2.7 - Plataformas Colaborativas 2.8 - Revisão por Pares...

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1.1 1.2 1.3 1.3.1 1.3.2 1.3.3 1.3.4 1.3.5 1.3.6 1.3.7 1.3.8 1.3.9 1.3.10 1.3.11 1.3.12 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 Table of Contents Manual de Formação em Ciência Aberta 1 - Introdução ao Manual 2 - Introdução à Ciência Aberta 2.1 - Conceito e Princípios da Ciência Aberta 2.2 - Dados e Materiais de Investigação Abertos 2.3 - Software Aberto na Investigação 2.4 - Investigação Reprodutível e Análise de Dados 2.5 - Acesso Aberto a Publicações 2.6 - Licenciamento Aberto e Formatos de Ficheiro 2.7 - Plataformas Colaborativas 2.8 - Revisão por Pares Aberta, Métricas e Avaliação 2.9 - Políticas de Ciência Aberta 2.10 - Ciência Cidadã 2.11 - Recursos Educativos Abertos 2.11 - Defesa e Promoção da Ciência Aberta 3 - Sobre Aprendizagem e Formação 4 - Aspetos Organizativos 5 - Exemplos e Orientação Prática 6 - Glossário 7 - Referências 8 - Ficha Técnica 1

Transcript of Table of Contents - Foster Open Science2.7 - Plataformas Colaborativas 2.8 - Revisão por Pares...

  • 1.1

    1.2

    1.3

    1.3.1

    1.3.2

    1.3.3

    1.3.4

    1.3.5

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    1.7

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    1.9

    TableofContentsManualdeFormaçãoemCiênciaAberta

    1-IntroduçãoaoManual

    2-IntroduçãoàCiênciaAberta

    2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    2.5-AcessoAbertoaPublicações

    2.6-LicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiro

    2.7-PlataformasColaborativas

    2.8-RevisãoporParesAberta,MétricaseAvaliação

    2.9-PolíticasdeCiênciaAberta

    2.10-CiênciaCidadã

    2.11-RecursosEducativosAbertos

    2.11-DefesaePromoçãodaCiênciaAberta

    3-SobreAprendizagemeFormação

    4-AspetosOrganizativos

    5-ExemploseOrientaçãoPrática

    6-Glossário

    7-Referências

    8-FichaTécnica

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  • ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta

    Emfevereirode2018,umgrupodecatorzeautoresreuniram-senaBibliotecaNacionalAlemãdeCiênciaeTecnologia(TechnischeInformationsbibliothek-TIB),emHanover,paracriarummanualabertoevivosobreformaçãoemCiênciaAberta.AsformaçõesdeelevadaqualidadesãofundamentaisquandosepretendeumamudançaculturalemdireçãoàimplementaçãodosprincípiosdaCiênciaAberta.Osrecursosdeformaçãosãoumsuportefundamentalparainstrutoreseformadores.OManualdeFormaçãoemCiênciaAbertaseráumrecursochaveeumprimeiropassoparaodesenvolvimentodeprogramascurricularesenaeducaçãocontínuaemAcessoAbertoeCiênciaAberta.ApoiandoeinterligandoumacomunidadeemergentenaáreadaCiênciaAbertaquedesejatransmitiroseusaberefuncionarcomomultiplicadoradoconhecimento,estemanualiráenriquecerasatividadesdeformaçãoedesbloquearopotencialdestacomunidade.

    AopartilharasuaexperiênciaeperícianadifusãodosprincípiosdaCiênciaAberta,osautores(verabaixo)produziramumrecursoeducativoabertoorientadoparaoensinoprático.OobjetivofundamentaldestenovomanualnãoédivulgarasideiasdaCiênciaAbertamasmostrarcomodivulgarestasideiasdeformaeficaz.Oformatodeumlivroelaboradorápidaecolaborativamente(booksprint)maximizouacriatividadeeainovaçãoeassegurouaproduçãodeumrecursovaliosoemapenasalgunsdias.

    EstemanualpretendeapoiarosformadoresemCiênciaAbertajuntandoumconjuntodemétodos,técnicasepráticas.OresultadopretendidoéquesejaumguiaútilemcomodivulgaroconhecimentosobreosprincípiosdaCiênciaAbertaàsnossasredes,instituições,colegaseestudantes.Iráigualmenteinstruireinspirarosformadoresparaacriaçãodesessõesenvolventesedegrandequalidade.Abordandodesafiosefornecendosoluções,iráfortaleceracomunidadedeformadoresemCiênciaAbertaqueseencontramnumprocessodeautoeducação,autoinformaçãoeautoinspiração.

    Ajude-nosamelhoraromanualAgradecemososcomentárioseopiniõesdetodasaspessoas,independentementedasuaáreadecompetênciaouformação.Aformamaisfácildeofazerécontactar-nos.Poderáaindausarafuncionalidade“Pullrequest”(queequivaleapropormodificações)dentrodowebsiteouaplicaçãoGitbook,oucomoutraaplicação.OconteúdodomanualémantidonorepositórioGitHub.

    VamosfazerjuntosumaformaçãosobreCiênciaAbertaEstáinteressadoemorganizarouparticiparemformaçõesouwebinarsquetirampartidodoManualdeFormaçãoemCiê[email protected]–adoraríamosreceberoseucontacto.

    ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta

    2

    mailto:[email protected]://github.com/Open-Science-Training-Handbook/Open-Science-Training-Handbook_PTmailto:[email protected]

  • Comoreferenciaromanual

    Porfavorconsiderefazerareferênciabibliográficaquandousaroconteúdodestemanual.Parareferenciarestemanualrecomendamosamençãoa:https://doi.org/10.5281/zenodo.1212496,queéaformacitávelcomoDOIatravésdareferênciaaoarquivo(menoscompreensível)dolivro.

    Osautores,colaboradoresetradutoresdestemanualcolaborativo

    Saibamaissobreosautoresefacilitadoresdolivro,suasexperiênciasefontesdeinspiração,suaafiliação,informaçãodecontacto,perfisTwittereORCID,bemcomosobreostradutoreserevisoresdestaversãoportuguesanoúltimocapítulodoManual.

    Agradecimentos

    GwenFranck(EIFL,Bélgica)pelacoberturadosmeiosdecomunicaçãosocialduranteaelaboraçãodomanualepornosmantermotivadoscomdinâmicasdegrupoPatrickHochstenbach(UniversidadedeGent,Bélgica)pelodesigndosfantásticosdesenhosanimadosedasimagensVassoKalaitzi(LIBER,PaísesBaixos)porgravarosótimosvídeosMatteoCancellieri(UniversidadeAberta,ReinoUnido)peloapoiofornecidoemquestõestécnicasenacriaçãodogitbookSimonWorthington(TIB,Hannover,Alemanha)pelosconselhosdemanutençãoeconversãodosmetadadosbibliográficos

    Declaraçãodedireitosdeautor

    OManualdeFormaçãoemCiênciaAbertaéumRecursoEducativoAberto,peloqueédisponibilizadosobalicençaCreativeCommonsDedicaçãoaoDomínioPúblico(CC01.0Universal).Nãoénecessárioobterpermissãoparareutilizarecopiarinformaçãodestemanual.Noentanto,algunsmateriaisreferidosnestelivropoderãoestarprotegidospordireitosdeautor–nessescasosserádadaindicaçãonotexto.Tentámosreferenciartodasasnossasfontes,masseporalgummotivonosesquecemosdeatribuiroscréditosdevidos,talnãofoifeitocomintençãomaliciosa.Poderácontactar-nospeloendereçoeletró[email protected]çõesafazer.

    ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta

    3

    https://foster.gitbook.io/manual-de-formacao-em-ciencia-aberta/https://legacy.gitbook.com/download/pdf/book/open-science-training-handbook/bookhttps://legacy.gitbook.com/download/epub/book/open-science-training-handbook/bookhttps://legacy.gitbook.com/download/mobi/book/open-science-training-handbook/bookhttps://doi.org/10.5281/zenodo.1212496https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/mailto:[email protected]

  • Financiamento

    EsteprojetofoifinanciadopeloprogramadeinvestigaçãoeinovaçãoHorizonte2020daUniãoEuropeia,projetoFOSTERPlus(FosteringthepracticalimplementationofOpenScienceinHorizon2020andbeyond),soboacordodesubvençãonúmero741839.

    ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta

    4

    https://www.fosteropenscience.eu/about

  • ObjetivodoManual"QuandotodososinvestigadoresestãocientesdoqueéaCiênciaAberta,esãoformados,apoiadoseorientadosemtodasasetapasdasuacarreirapararealizarCiênciaAberta,opotencialestáláparamudarfundamentalmenteaformacomoapesquisaérealizadaedisseminada,fomentandoumecossistemacientíficoemqueapesquisaganhemaiorvisibilidade,sejacompartilhadadeformamaiseficienteerealizadadeformamaisintegra."OpenScienceSkillsWorkingGroupReport(2017)

    ACiênciaAbertaéomovimentoparaproduzirprodutoseprocessoscientíficosacessíveisereutilizáveisportodos,nãosónoquedizrespeitoàculturadoconhecimentomastambémàstecnologiaseserviços.Convencerosinvestigadoresdosbenefíciosdamudançadassuaspráticaseproporcionar-lhescompetências,ferramentaseconhecimentoparaaplicarestatransformaçãotorna-seumatarefadamaiorimportância.

    EstemanualofereceorientaçõeserecursosnãosóparainstrutoreseformadoresnoâmbitodaCiênciaAberta,mastambémparatodasaspessoasinteressadasemmelhorarosseusníveisdetransparênciaeparticipaçãonaspráticasdepesquisaeinvestigação.DeformaaapoiareinterligaracomunidadeemergentenaconjunturadaCiênciaAberta,quepretendepartilharoseuconhecimento,opresentemanualpropõeatividadesdeformaçãoquepodemseradaptadasavárioscontextosepúblicos-alvo.Omanualfornecemétodos,instruções,exemplosdeexercícioseideiasaosformadoresparaconcretizaremosseusprópriosplanosdeformaçãosobreaCiênciaAberta.FacultaaindaapromoçãoedefesadaCiênciaAbertadeformauniversalcomumKnow-howbaseadonosprincípiosdaCiênciaAbertadeformaaauxiliarnãosóinvestigadores,mastambémosprofissionaisdeapoioaestasáreas.Oqueresulta?Oquenãoresulta?Comotiraromáximopartidocomrecursoslimitados?Atravésdesteguiaencontraráumasériederecursosqueoajudarãoaconstruirassuasprópriasformações.

    Construídocombasenaexperiênciaacumuladadosautores,mastambémnassuascompetênciasaníveldatransmissãodosprincípiosdaCiênciaAberta,estemanualéorientadoparaoensinopráticodoconhecimentoabertoemambienteeducacional.Poroutraspalavras,ofocodestemanualnãosefundamentanaideiadedivulgaraCiênciaAberta,massimapoiardeformaeficazaspráticasdaCiênciaAberta.

    ParaQueméEsteManual?

    1-IntroduçãoaoManual

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    https://ec.europa.eu/research/openscience/pdf/os_skills_wgreport_final.pdf#view=fit&pagemode=none

  • Estemanualdestina-seaqualquerpessoaquedesejeorganizareacolherformaçõessobreaCiênciaAbertamastambémtemafinalidadede,emsessõesdeformaçãodirecionadasapúblicosespecíficos,promoveraadoçãodepráticasdepesquisaabertas,mostrandoosconceitosdaCiênciaAberta.Istoengloba,investigadores,bibliotecários,administradoresdeinfraestruturas,colaboradoresdeapoioàpesquisa,financiadoresedecisorespolíticos.Estemanualédestinadoaindaatodosaquelesquetêmumcontactoregular,oumesmoocasional,cominvestigadores(eoutrosstakeholders)equedesejampartilharosseusconhecimentossobreCiênciaAberta,sejaemcontextoprofissionaloucomouminvestimentoextradoseutempo.Oimportanteéquesejaútilparatodososquedesejamacolhersessõesdeformaçãoparapromoverareutilização,aparticipação,aeficiência,aequidadeeapartilhadepesquisas,independentementedeatribuírem(oudesejaremutilizar)otermoCiênciaAberta.

    Nestemanual,“Formador“,independentementedoseuníveldeexperiência,édefinidocomoqualquerpessoaquedesejeorientarformaçõessobreCiênciaAberta.Éimportantereferirqueestaquestãoincluitodosaquelesquesesentemmenosconfortáveis,ouquenãopretendemutilizarorótulodeCiênciaAberta,nassuassessõesdeformação.Omanualcontémaconselhamentoconcretomastambémconceitossobreoensinodecompetênciasparaaperfeiçoarotrabalhodosinvestigadores.Eapesardamaioriadostermosestardebaixodograndechapéude“CiênciaAberta”elesnãoprecisamdeserlecionadoscomotal.Énecessárioteralgumacautelaaoutilizarorótulode“CiênciaAberta”emcontextodeformação,vistoque“CiênciaAberta”podeatrairapenasumsegmentoespecíficodeinvestigadores,enquantoautilizaçãodotermo“Comopublicarosseusdados”temgrandesprobabilidadesdeatrairumgrupomaisdiversificado.Partedotrabalhodeumformadorédefiniroseupúblico-alvoeencontrarasmelhoresestratégiasparaalcança-lo,eamelhorpessoaparatomarestetipodedecisõeséopróprioformador.

    OqueéaCiênciaAberta?

    DeacordocomFOSTERtaxonomy,"ACiênciaAbertaéomovimentoparatornarapesquisacientífica,osdadoseasuadisseminaçãoacessíveisatodososníveisdeumasociedadeobservadora."Epodeserdefinidaatravésdeumconjuntodeprincípiosepráticas:

    Principios:ACiênciaAbertapretendeincrementartransparência,reutilização,participação,cooperação,responsabilidadeereprodutibilidadenoprocessodeinvestigação.Temcomoobjetivomelhoraraqualidadeeafiabilidadedapesquisaatravésdeprincípioscomoinclusão,justiça,equidadeepartilha.ACiênciaAbertapodeservistacomoumapesquisasimplesdevidamenteefetuadaeestende-seatravésdasCiênciasdaFísicaedaVida,Engenharia,Matemática,CiênciasSociaiseHumanidades.(OpenScienceMOOC).Praticas:ACiênciaAbertacontémmudançasnaformacomoaciênciaérealizada–incluindooacessoabertoapublicaçõescientificas,ocompartilhamentodedados,cadernosabertos,transparêncianaavaliaçãodepesquisas,garantirareprodutibilidadedapesquisa(quandopossível),atransparêncianosmétodosdepesquisa,nocódigo-fonteaberto,nosoftwareeinfraestruturas,naciênciacidadãenosrecursoseducacionaisabertos.

    Umnotasobrealinguagem:Comoapalavrainglesa"ciência"tradicionalmentenãoincluiasciênciashumanasesociais,ostermosmaisconcretoseparticularescomo"bolsadeestudoaberta"ou"pesquisaaberta"sãousadosdeformafrequentementeparacaracterizaressalacuna.Como“CiênciaAberta”éotermomaiscomum,vamosutilizá-loaqui,masdeveserlidocomoreferênciaàpesquisadetodasasdisciplinasacadémicas.

    1-IntroduçãoaoManual

    6

    https://www.fosteropenscience.eu/taxonomy/term/7https://docs.google.com/document/d/1KuTSECSYHXZmZX15GDjyD65pJ90eRMhHVEZ-1trsw30/edit?usp=sharing

  • ComoutilizaroManual?

    Estemanualfoiconcebidodeformamodular.Sinta-seàvontadeparaescolhercapítulosesaltaroutrosquepossamnãoserrelevantesparasiouparaasuaformação.

    OCapítulo2centra-senoconteúdodasuaformação.TodosostópicosrelativosàCiênciaAbertasãoapresentadoseexplicadosnestapartedomanual.Jáestáfamiliarizadocomumoudoistópicos?Ótimo,analiseseexistemoutrostópicosquepodeaindanãoconhecer.Mesmoquenãoestejaaplanearformaçõessobreessestópicosiráperceberqueosmesmosserãoúteis,vistoqueexistealgumasobreposiçãoentreostópicossobreaCiênciaAberta.

    Setempoucoounenhumtipodeconhecimentopréviosobreformaçãoemgeral,porfavorconsulteoCapítulo3:SobreAprendizagemeFormação.Estecapítuloofereceumavisãogeraldastécnicasdeformação,alémdedicaspráticasparaconstruiroseuplanodeformação.Sejátemalgumaexperiência,podetambémutilizá-lonãosóparareciclarosseusconhecimentos,mastambémparaconheceroutrostiposdeabordagemaoníveldoensino.

    Workshopseeventosdecarizinformativodemaioresdimensõespodemexigirmuitapreparação.Paraqueoseueventosejabem-sucedido,teráquetomardiversasdecisões,desdeasmaispequenasatéàsmaiores,tendosempreemconsideraçãoquesãosuscetíveisaquestõestemporais.OCapítulo4forneceinformaçõesúteissobreaspetosorganizacionaisedisponibilizaaindaumachecklistbastanteútilparaajudarnoplaneamentodaformação.

    Asformaçõeseeventosdenaturezainterativarequerematividadesatrativasedeenvolvimento.Osnossosexemplosdeexercícioseadisponibilizaçãoderecursosadicionaisirãoajudarnoenvolvimentodopúblico-alvo,nãosóatravésdeinformaçõespráticassobretópicosteóricos,mastambématravésdofeedbackdosparticipantes.OCapítulo5ofereceumavariedadedeexercícioserecursostestadoseaprovadosporespecialistasemformaçãosobreCiênciaAberta.Sinta-selivreparaostestar,adaptarereutilizar!

    Comoqualqueroutraáreaemergente,aCiênciaAbertautilizaumaterminologiaporvezesdifícil,comtermosqueeventualmentepodenãoconhecer.Nãodesanime!OGlossárioexplicaráamaioriadostermoseconceitosquelhesãomenosfamiliares.

    Estemanualfoicriadoparaserumrecursovivo,oquesignificaqueseráatualizadocomregularidadedevidoaosprogressosnaCiênciaAberta,mastambémcomorespostaàssugestõesefeedbackdeoutrosformadoresnaáreadaCiênciaAberta,assimcomodopúblicoemgeral.Sinta-selivredeadicionarepartilharassuasmelhorespráticas,exemplos,recursos,opiniõesouexperiênciasatravésdoGitBook.

    Esperamosquedesfrutedaleituradestemanualedesejamos-lheomaiorsucessonassuasfuturasformaçõessobreCiênciaAberta.

    LicençaAbertaeCréditos

    1-IntroduçãoaoManual

    7

  • OManualdeFormaçãoemCiênciaAbertafoielaboradocomoumRecursoEducativoAbertoparapermitirautilizaçãodomesmodamelhorformapossível.Estetrabalhoé,portanto,disponibilizadosobalicençaCreativeCommonsDedicaçãoaoDomínioPúblico(CC01.0Universal).Nãoénecessáriopedirautorizaçãoparareutilizarecopiarinformaçõescontidasnestemanual.Sinta-selivreparautilizarainformaçãoeosseusconteúdos,paraelaborarslidesouimagensquelhepareçamadequadasàssuassessõesdeformação.Tomenotaquealgunsdosmateriaiscitadosnestemanualpodemestarprotegidospordireitosdeautoredireitosconexos.Nessescasos,essainformaçãoseráindicadanotexto.Pedimosque,seutilizarconteúdodestemanual,citeasuafonte.

    Fizemostodososesforçosparareferenciarasfontesqueutilizamos.Seporalgummotivonãoascitámos,issonãoaconteceudeformamaldosa.Sinta-selivreparanoscontactarparaelearning@fosteropenscience.eunocasodesernecessárioefetuarqualquertipodecorreção.

    1-IntroduçãoaoManual

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    https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/deed.ptmailto:[email protected]

  • IntroduçãoàCiênciaAbertaEstecapítulotemcomoobjetivocontextualizareapresentarospontosprincipaisdoscomponentesmaisrelevantesdaCiênciaAberta.TendocomopontodepartidaosconceitoseosprincípiosfundamentaisdaCiênciaAberta,ocapítulotambémabordaoutroselementostaiscomoDadosdeInvestigaçãoAbertos,AcessoAberto,RevisãoporParesAbertaePolíticasdeCiênciaAberta,referindo,simultaneamente,aspetosmaispráticostaiscomoInvestigaçãoReprodutível,SoftwareAberto,LicenciamentoAbertoeFormatodeArquivos.

    Cadasecçãoestáestruturadademodoaincluirumabrevedescriçãodotópico,umaexplicaçãodasuarelevânciaparaaCiênciaAberta,osprincipaisobjetivosdeaprendizagemquedevemserconsideradosemcontextoformativo,osprincipaiscomponentes(conhecimentosecompetências)quedevemserimplicados,algumasperguntas/obstáculos/equívocosmaisfrequentesnoâmbitodessetópicoe,finalmente,osresultadosesperadosdeumasessãodeformaçãoealgumassugestõesdeleituraadicional.

    Capítulos

    1.ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta2.DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos3.SoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto4.InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados5.AcessoAbertoaPublicações6.LicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiros7.PlataformasColaborativas8.RevisãoporParesAberta,MétricaseAvaliação9.PolíticasdeCiênciaAberta10.CiênciaCidadã11.RecursosEducativosAbertos12.DefesaepromoçãodaCiênciaAberta

    2-IntroduçãoàCiênciaAberta

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  • 1.ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

    Oqueé?

    ACiênciaAbertaéapráticacientíficaquepermitequeoutrospossamcolaborarecontribuir,ondeosdadosdainvestigação,asnotaslaboratoriaiseoutrosprocessosinvestigativossãolivrementedisponibilizados,sobcondiçõesquepossibilitemoreuso,aredistribuiçãoeareproduçãodainvestigaçãoedosdadosemétodossubjacentes(FOSTEROpenScienceDefinition).Emsuma,aCiênciaAbertaéoconhecimentotransparenteeacessívelqueépartilhadoedesenvolvidoatravésderedesdetrabalhocolaborativas(Vicente-Sáez&Martínez-Fuentes2018).

    ACiênciaAbertaimplicaaumentarorigor,aresponsabilidadeeareprodutibilidadedainvestigação.Baseia-seemprincípiosdeinclusão,justiça,equidadeepartilhae,emúltimainstância,procuramudaromodocomoainvestigaçãoérealizada,quemestáenvolvidoecomoévalorizada.Oobjetivoétornarainvestigaçãomaisabertaàparticipação,àrevisão/refutação,àmelhoriaeaoseu(re)usoparabenefíciodetodos.

    Existemváriasdefiniçõesde“abertura”noquedizrespeitoàciência;aOpenDefinitiondefine-aassim:“Osdadoseconteúdosabertospodemserusadoslivremente,modificadosepartilhadosporqualquerpessoaparaqualquerfim”.ACiênciaAbertaenglobaumasériedepráticas,normalmenteincluindoáreascomooacessoabertoàspublicações,dadosdeinvestigaçãoabertos,softwareeferramentasdecódigoaberto,fluxosdetrabalhoabertos,ciênciacidadã,recursoseducativosabertosemétodosalternativosparaavaliarainvestigação,incluindoarevisãopelosparesaberta(Pontikaetal.,2015).

    Pontikaetal.(2015)

    2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

    10

    https://www.fosteropenscience.eu/foster-taxonomy/open-science-definitionhttp://opendefinition.org/https://f1000research.com/articles/6-588/v2#ref-59

  • OsobjetivoseospressupostossubjacentesaoimpulsoparaimplementarestasváriaspráticasforamanalisadosporFecher&Friesike(2013),cujarevisãodaliteraturaidentificoucincomaiorespreocupaçõesou“escolasdepensamento”.Sãoelas:

    EscolaDemocrática:Acreditandoqueháumadistribuiçãodesigualdoacessoaoconhecimento,estaáreaestápreocupadaemtornaroconhecimentoacadémico(incluindopublicaçõesedados)disponívelparatodos.

    EscolaPragmática:Seguindooprincípioqueaproduçãodoconhecimentoémaiseficienteseforassentenacolaboraçãoefortalecidaatravésdacrítica,estaáreaprocuraaproveitarosefeitosdaredeestabelecendoaligaçãoentreinvestigadoresetornandoosmétodosinvestigativostransparentes.

    EscoladeInfraestruturas:Estalinhaémotivadapelasuposiçãodequeainvestigaçãoeficienterequerplataformasfacilmenteacessíveis,ferramentaseserviçosparadisseminaçãoecolaboração.

    EscolaPública:Combasenoreconhecimentodequeoverdadeiroimpactosocialrequercompromissosocialnainvestigaçãoenacomunicaçãodosresultadoscientíficosfacilmentecompreensível,estaáreapretendeimplicaropúbliconaconstruçãodoconhecimentoatravésdaciênciacidadã,etornaroconhecimentomaisfacilmentecompreensívelatravésderesumosnumalinguagemacessível,blogseoutrosmeiosdecomunicaçãomenosformais.

    EscoladeAvaliação:Motivadopeloreconhecimentodequeasmétricastradicionaisparamediroimpactocientíficosetêmmostradoproblemáticas(porsefocaremdemasiadonaspublicações,muitasvezesapenasaoníveldasrevistas,porexemplo),estavertenteprocura"métricasalternativas"quepossamfazerusodasnovaspossibilidadesdeferramentasdigitaisemredepararastrearemediroimpactodainvestigaçãoatravésdeatividadesanteriormenteinvisíveis.

    Fundamentação

    ACiênciaAberta,comodefinidaanteriormente,englobaumgrandenúmerodepotenciaismudançasestruturaisnapráticacientífica,cujaculturapodeser,muitasvezes,hierárquicaeconservadora.Alémdisso,mesmoquandoosinvestigadoressimpatizamcomosobjetivosdaCiênciaAberta,épossívelqueaindanãopercebamautilidadedeosadotar,umavezqueosmecanismosdeincentivoexistentesaindanãorefletemessanovaculturadeaberturaecolaboração.Comoconsequência,convencerosinvestigadoresdanecessidadedemudarassuaspráticasexigiráumbomentendimentonãosódosbenefícioséticos,sociaiseacadémicos,mastambémdequemaneira,aoadotaraspráticasdeCiênciaAberta,issorealmentepoderácontribuirparaosucessodasuainvestigação.Estaseçãodescreveráalgunsdosprincipaisconceitos,princípios,atoresepráticasdaCiênciaAbertaecomoestesseencaixamnumecossistemadeinvestigaçãomaisamplo.

    2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

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    https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=2272036

  • ObjetivosdeAprendizagem

    1. Compreenderosconceitoseosprincípiossociais,económicos,legaiseéticosquesustentamaCiênciaAberta.

    2. Familiarizar-secomahistóriadaCiênciaAberta,bemcomocomadisparidadeediversidadedeperspetivasoriundasdediferentescomunidadesdeinvestigação,disciplinaseculturas.

    3. ConhecerosdesenvolvimentosemtornodaCiênciaAbertaedoimpactopessoalqueaquelespodemtersobreosinvestigadores,ainvestigaçãoe,numaperspetivamaisalargada,nasociedade.

    Componentes-chave

    ConhecimentoseCompetências

    2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

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  • ACiênciaAbertaéomovimentoqueajudaatornarosresultadosdainvestigaçãoacadémicamaisacessíveis,incluindocódigo,dadoseartigoscientíficos.

    Abrangemuitosaspetosdiferentes,masmuitasvezesrelacionados,queafetamtodoociclodevidadainvestigação,incluindopublicaçãoaberta,dadosabertos,softwaredecódigoaberto,registoscientíficosabertos,revisãoporparesaberta,disseminaçãoabertaemateriaisabertos(veroglossárioparadefinições).

    HistóriadaCiênciaAbertaeasmotivaçõespordetrásdomovimento.

    AsorigensdapublicaçãoacadémicaremontamaoséculoXVIIcomasprimeirasrevistasacadémicas.

    Crescentemotivaçãoparapartilharrecursosentreasdiferentesdisciplinas,bemcomooaumentodatransparênciaparaobtermaiseficiência,rigor,responsabilidade,sustentabilidadeparafuturasgeraçõesereprodutibilidade.

    Casoséticospelosquaisoaumentodatransparênciapodereduzirfraudes,manipulaçãodedadoseapresentaçãoseletivaderesultados.

    Oestadoatualsurgiudapressãoporpartedascomunidadesacadémicasedosgovernosparaqueasinvestigaçõesfinanciadascomfundospúblicosfossempartilhadasmaisabertamente,muitasvezescomopropósitodeacelerarocrescimentoeconómicoesocialeainovação.

    Osresultadosdainvestigaçãofinanciadacomfundospúblicosdevemestarpublicamenteacessíveis.

    Énecessáriolevaracaboumamudançaculturalnainvestigaçãoeentreosinvestigadores.

    AdotarferramentasdaWebetecnologiasparafacilitaracolaboraçãocientífica.

    Diferençasepontoscomunsnoâmbitodaspráticas,princípiosecomunidadesdeCiênciaAberta.*

    ÉgeralmenteaceitequeaCiênciaAbertaconduzaummaiorimpactoassociadoaumapartilhaereutilizaçãomaisamplos\porexemplo,achamada"openaccesscitationadvantage").

    ACiênciaAbertapodeaumentaraconfiançanaciênciaenafiabilidadedosresultadoscientíficos.

    CiênciaAbertaesuarelaçãocomlicençasedireitosdeautor.

    Normalmente,osresultadosdainvestigaçãoabertasãolicenciadosabertamenteparamaximizarareutilização,permitindoqueoautormantenhaapropriedadeerecebacréditopeloseutrabalho.

    Perguntas,obstáculoseequívocoscomuns

    Q:"QualadiferençaentreCiênciaAbertae'ciência'?"

    A:CiênciaAbertaimplicafazerciênciatradicionalcommaistransparêncianassuasváriasfases,porexemplopartilhandodeformaabertacódigoedados.Muitosinvestigadoresjáfazemistoatualmente,masnãolhechamamCiênciaAberta.

    Q:"ACiênciaAbertaexcluíasCiênciasSociaseHumanas?

    A:Não,otermoCiênciaAbertaéinclusivo.Naverdade,oqueaconteceéqueporvezesaCiênciaAbertaégenericamentereferidacomo"InvestigaçãoAberta"ou"InvestigaçãoAcadémicaAberta"(de"OpenScholarship")parasermaisinclusivaaoutrasdisciplinas,princípiosepráticas.Noentanto,CiênciaAbertaéumtermocomumenteusadoemváriosníveise,portanto,fazsentidoadotá-loparafinsdecomunicação,comacondiçãoqueincluitodasasdisciplinasdainvestigação.

    2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

    13

    https://sparceurope.org/what-we-do/open-access/sparc-europe-open-access-resources/open-access-citation-advantage-service-oaca/oaca-list/

  • Q:"ACiênciaAbertaconduzaousoindevidoouincompreensãodainvestigação?"

    A:Não,aaplicaçãodosprincípiosdaCiênciaAbertaé,defato,umaproteçãocontraousoindevidooumal-entendido.Atransparênciageraconfiançaepermitequeoutraspessoasverifiquemevalidemoprocessodeinvestigação.

    Q:"ACiênciaAbertairáprovocarumasobrecargadeinformação?"

    A:Émelhortermuitainformaçãoelidarcomisso,doquetermuitopoucaevivercomoriscodeperderaspartesimportantes.EhátecnologiascomoRSSfeeds,aprendizagemautomáticaoudemáquinaeinteligênciaartificialquefacilitamaagregaçãodeconteúdo.

    Resultadosdeaprendizagem

    1. Sercapazdeexplicarosprincípioseconceitosacadémicos,económicosesociaiscentraisquesustentamaCiênciaAberta,eporquerazãoissoéimportanteemtermosdeimpactosmaisalargados.

    2. DesenvolverumacompreensãodasnumerosasdimensõesdaCiênciaAbertaedealgumasdasferramentasepráticasenvolvidas.

    3. EstarfamiliarizadocomoestadoatualdaCiênciaAbertaecomadiversidadedeperspetivasqueissoengloba.

    Leituraadicional

    EuropeanCommission'sDirectorate-GeneralforResearch&Innovation(RTD)(2016).Openinnovation,OpenScience,opentotheworld-avisionforEurope.ec.europa.eu/digital-single-market/en/news/open-innovation-open-science-open-world-vision-europe

    FecherandFriesike(2014).OpenScience:OneTerm,FiveSchoolsofThought.doi.org/10.1007/978-3-319-00026-8_2

    HighLevelGroup(2017).Europe'sfuture.Openinnovation,OpenScience,opentotheworld:reflectionsoftheResearch,InnovationandSciencePolicyExperts(RISE).doi.org/10.2777/79895

    MasuzzoandMartens(2017).DoyouspeakOpenScience?Resourcesandtipstolearnthelanguage.doi.org/10.7287/peerj.preprints.2689v1

    Watson(2015).Whenwill‘OpenScience’becomesimply‘science’?.doi.org/10.1186/s13059-015-0669-2

    2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta

    14

    https://ec.europa.eu/digital-single-market/en/news/open-innovation-open-science-open-world-vision-europehttps://doi.org/10.1007/978-3-319-00026-8_2https://doi.org/10.2777/79895https://doi.org/10.7287/peerj.preprints.2689v1https://doi.org/10.1186/s13059-015-0669-2

  • 2.DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    Oquesão?

    Dadosdeinvestigaçãoabertossãodadosquepodemserlivrementeacedidos,reutilizados,remisturadoseredistribuídos,paraefeitosdeinvestigaçãoacadémicaeensinoeoutrosfins.Idealmente,osdadosabertosnãotêmrestriçõesdereutilizaçãoouredistribuição,etêmlicençasapropriadasparatal.Emcasosexcecionais,porexemploparaproteçãodeidentidadedepessoas,sãoestabelecidasrestriçõesespeciaisoulimitadasdeacesso.Partilharabertamenteosdadosexpõe-nosàinspeção,oqueconstituiabaseparaaverificaçãoereprodutibilidadedainvestigação,eabreocaminhoparaamaisamplacolaboração.Nomáximo,osdadosabertospodemestarsujeitosaorequisitodeatribuiçãoepartilhademodoigual(verOpenDataHandbook).

    Fundamentação

    Osdadosdeinvestigaçãosãofrequentementeoresultadomaisvaliosodemuitosprojetosdeinvestigação,sãousadoscomofontesprimáriasquesustentamainvestigaçãocientíficaepossibilitamaderivaçãodedescobertasteóricasouaplicadas.Deformaatornardescobertas/estudosreplicáveis,oupelomenosreprodutíveloureutilizável(referênciaàInvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados)dequalqueroutraforma,arecomendaçãodeboaspráticasparaosdadosdeinvestigaçãoéseremomaisabertoseFAIRpossíveis,tendoemcontaosconstrangimentoséticos,comerciaisedeprivacidadededadossensíveisoudadosproprietários.

    Objetivosdeaprendizagem

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    15

    http://opendatahandbook.org/guide/en/what-is-open-datahttps://www.force11.org/fairprinciples

  • 1. CompreenderascaracterísticaseprincípiosbásicosdosdadosdeinvestigaçãoabertoseFAIR,incluindooempacotamentoedocumentaçãoapropriados,parapermitirqueoutrosentendem,reproduzam,ereutilizemdeformasalternativas.

    2. Familiaridadecomostiposdedadosquepodemserconsideradossensíveis,easrestriçõesouconstrangimentosdeospartilharabertamente.

    3. Sercapazdeconverterumconjuntodedados'fechados'em'aberto'implementandoasmedidasnecessáriasnumplanodegestãodedados,comaadministraçãodosdadosemetadadosapropriados.

    4. Sercapazdeusarplanosdegestãodedadosetornarosseusresultadosdeinvestigaçãolocalizáveiseacessíveis,mesmoquecontenhamdadossensíveis.

    5. Compreenderosprósecontrasdepartilharabertamentediferentestiposdedados(ex.,privacidade,sensibilidade,anonimização,acessomediado).

    6. Compreenderaimportânciademetadadosapropriadosparaoarquivosustentáveldosdadosdeinvestigação.

    7. Compreenderosfluxosdetrabalhobásicoseasferramentasparapartilhadedadosdeinvestigação.

    Componentes-chave

    Conhecimento&Capacidades

    PrincípiosFAIR

    Em2014,foielaboradoumconjuntodeprincípiosbásicosdeformaaotimizarareutilizaçãodedadosdeinvestigação,aquefoidadosonomedePrincípiosparaDadosFAIR.RepresentamumconjuntodenormaseboaspráticasdesenvolvidaspelacomunidadeparaassegurarqueosdadosouqualquerobjetodigitalsãoFindable(localizáveis),Accessible(acessíveis),Interoperable(interoperáveis)eRe-usable(reutilizáveis):

    Findable:Oprimeirorequisitoparatornarosdadosreutilizáveiséapossibilidadedeosencontrar.Deveserfácilencontrarosdadoseosmetadadostantoparahumanoscomoparacomputadores.Adescobertaautomáticaefiáveldeconjuntosdedadoseserviçosdependedeidentificadorespersistenteslegíveispormáquinas(PIDs)edemetadados.

    Accessible:Os(meta)dadosdevemserrecuperáveispeloseuidentificadorutilizandoumprotocolodecomunicaçõespadronizadoeaberto,possivelmenteincluindoautenticaçãoeautorização.Alémdisso,osmetadadosdevemestardisponíveismesmoquandoosdadosjánãoestão.

    Interoperable:Osdadosdevempodersercombinadoseusadoscomoutrosdadosouferramentas.Oformatodosdadosdeveserabertoeinterpretávelporváriasferramentas,incluindooutrosregistosdedados.Oconceitodeinteroperabilidadeaplica-setantoaosdadoscomoaosmetadados.Porexemplo,os(meta)dadosdevemusarvocabuláriosquesigamosprincípiosFAIR.

    Re-usable:Emúltimainstância,FAIRtemoobjetivodeotimizarareutilizaçãodosdados.Paraisso,osmetadadoseosdadosdevemestarbemdescritosparaquepossamserreplicadose/oucombinadosemdiferentescontextos.Alémdisso,areutilizaçãodos(meta)dadosdeveestardeclaradaatravésde(uma)licença(s)clara(s)eacessível(eis).

    Aocontráriodeiniciativassimilaresqueseconcentramnoinvestigador,osprincípiosFAIRdãoênfaseaoaumentodacapacidadedasmáquinasautomaticamenteencontraremeusaremosdadosouqualquerobjetodigital,alémdeapoiarasuareutilizaçãoporpessoas.OsprincípiosFAIRsãoprincípiosorientadores,nãonormas.OsFAIRdescrevemqualidadesoucomportamentosnecessáriosparatornarosdadosreutilizáveisaomáximo.(ex.,descrição,citação).Estasqualidadespodemseratingidasatravésdediferentesnormas.

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    16

    https://www.force11.org/group/fairgroup/fairprinciples

  • Publicaçãodedados

    AmaioriadosinvestigadoresestámaisoumenosfamiliarizadacomapublicaçãoemAcessoAbertodeartigosdeinvestigaçãoedelivros(vercapítulo5).Maisrecentemente,epelasrazõesmencionadasacima,apublicaçãodedadosganhouumaatençãocrescente.Cadavezmaisfinanciadoresesperamqueosdadosproduzidosemprojetosdeinvestigaçãoquefinanciamfiquemlocalizáveis,acessíveisetãoabertosquantopossível.

    Existemváriasformasdetornarosdadosdeinvestigaçãoacessíveis,incluindo(Wikipedia):

    Publicarosdadoscomomaterialsuplementarassociadoaumartigodeinvestigação,geralmentecomosficheirosdedadosdisponíveisjuntodoartigonositedaeditora.

    Inserirosdadosnumsitedisponívelpublicamente,comosficheirosdisponíveisparadownload.

    Depositarosdadosnumrepositórioquetenhasidodesenvolvidoparaapoiarapublicaçãodedados,ex.,Dataverse,Dryad),Figshare,Zenodo.

    Existeumgrandenúmeroderepositóriosgeraisoudedomíniosespecíficosquepodemfornecerapoioadicionalaosinvestigadoresnoprocessodedepósitodosseusdados.

    Publicarumartigodedadossobreoconjuntodedados,quepodeserpublicadocomopreprint,numarevistacientífica,ounumarevistadedadosqueédedicadaaartigosdedados.Osdadospodemseralojadosnarevistaouseparadamentenumrepositóriodedados.ExemplosderevistasdedadosincluemScientificData(daSpringerNature)eDataScienceJournal(daCODATA).Paraumarevisãoabrangentedasrevistasdedados,verCandelaetal.

    OCESSDAERICExperttourguideonDataManagementforneceumavisãogeraldosprósecontrasdediferentesviasdepublicaçãodedados.Porvezes,oseufinanciadorououtraentidadeexternarequerequeuseumrepositórioespecífico.Setiverliberdadedeescolha,podeconsideraraordemdepreferêncianasrecomendaçõesdoOpenAIRE:

    1. Useumarquivodedadosexternoouumrepositóriojáestabelecidoparaasuaáreadeinvestigaçãoparapreservarosdadosdeacordocomospadrõesreconhecidosnasuadisciplinaoudomíniodeinvestigação.

    2. Sedisponível,useumrepositórioinstitucionaldedadosdeinvestigação,ouosrecursosdegestãodedadosestabelecidospeloseugrupodeinvestigação.

    3. UseumrepositóriodedadosgratuitotalcomoDataverse,Dryad,figshareouZenodo.4. Procureoutrosrepositóriosdedadosemre3data.Nãoexisteumfiltroúniconore3dataquecubraosprincípiosFAIR,mas

    considereasseguintesopçõesdefiltrosparaoajudaraencontrarrepositórioscompatíveiscomosprincípiosFAIR:categoriasdeacesso,licençasdeusodosdados,repositóriosdedadosconfiáveis(comcertificadooucomadesãoexplícitaapadrõesdearquivo)eseorepositórioatribuiumidentificadorpersistente(PID)aosdados.Outroaspetoaconsideraréseorepositóriosuportaversionamento.

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    17

    https://en.wikipedia.org/wiki/Data_publishinghttps://en.wikipedia.org/wiki/Research_articlehttps://en.wikipedia.org/wiki/Dataversehttps://en.wikipedia.org/wiki/Dryad_(repositoryhttps://en.wikipedia.org/wiki/Figsharehttps://en.wikipedia.org/wiki/Zenodohttps://www.nature.com/sdata/http://www.codata.org/publications/data-science-journalhttps://doi.org/10.1002%2Fasi.23358https://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/6.-Archive-Publish/Data-publishing-routeshttps://www.openaire.eu/opendatapilot-repository-guidehttps://dataverse.org/https://datadryad.org/pages/faq#depositing-costhttps://figshare.com/https://zenodo.org/https://www.re3data.org/

  • Deveconsiderarondedepositarepublicarosseusdadoslogonoseuplanodegestãodedados.OCESSDAoferecealgumasquestõespráticas,queserecomendaconsiderar.Porexemplo:Quedadosemetadadosassociados,documentaçãoecódigoserãodepositados?Quantotempoénecessárioconservarosdados?Porquantotempoosdadosdevempermanecerreutilizáveis?Comovãoestardisponíveisosdados?Quecategoriadeacessovaiescolher?ParamaisquestõesvejaAdaptyourDMP:part6.Poroutrolado,nãoseesqueçadeverificarseorepositórioqueescolheupreencheosrequisitosdasuainvestigaçãoedoseufinanciador.Algunsrepositóriosobtiveramcertificação,talcomoCoreTrustSeal,quecertificaosrepositórioscomoconfiáveisequepreenchemosrequisitosdeCoreTrustworthyDataRepositories.Valeapenamencionarquealgunsrepositóriosdisciplinaresdeáreasespecíficaspodemaceitarapenasdadoscomaltaqualidadecompotencialdereutilizaçãoequepodemserpartilhadospublicamente.

    Umavezqueexistemváriosformasdepublicarosseusdados,devenotarqueparaumconjuntodedados"contar"comoumapublicação,deveseguirumprocessodepublicaçãosimilaraodeumartigo(Braseetal.,2009)edeveser:

    Devidamentedocumentadocommetadados;

    Revistoquantoàqualidade,ex.conteúdodoestudo,metodologia,relevância,consistêncialegaledocumentaçãodemateriais;

    Pesquisávelelocalizávelemcatálogos(oubasesdedados);

    Citávelemartigos.

    Citaçãodedados

    Serviçosdecitaçãodedadosajudamascomunidadesdeinvestigaçãoaencontrar,identificarecitardadosdeinvestigação(efrequentementeoutrosobjetosdeinvestigação)comconfiança.NormalmenteistoenvolveacriaçãoeatribuiçãodeDigitalObjectIdentifiers(DOIs),edosmetadadosqueosacompanhamatravésdeserviçoscomoDataCite(https://www.datacite.org),epodeserintegradonosfluxosdetrabalhoepadrõesdeinvestigação.Esteéumcampoemergente,eenvolveaspetoscomotransmitiraoseditoresderevistascientíficasaimportânciadacitaçãodedadosapropriadanosartigos,bemcomopermitirqueosartigoscientíficossejamligadosaquaisquerdadossubjacentesquelhederamorigem.Atravésdisto,osdadoscitáveistornam-secontribuiçõeslegítimasparaoprocessodecomunicaçãoacadémica,epodemajudarapavimentarocaminhoparanovasmétricasemodelosdepublicaçãoquereconheçamepremeiemapartilhadedados.

    Comopassoinicialemdireçãoàsboaspráticasparaacitaçãodedados,oDataCitationSynthesisGroupdaFORCE11apresentouaJointDeclarationofDataCitationPrinciples,direcionadotantoparainvestigadorescomoparafornecedoresdeserviçosdedados.Aoaderiraestesprincípios,osrepositóriosdedadosgeralmenteoferecemaosinvestigadoresumareferênciaquepodemusaraoreferir-seaumdeterminadoconjuntodedados.

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    18

    https://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-Tour-Guide-on-Data-Management/6.-Archive-Publish/Adapt-your-DMP-part-6https://doi.org/10.3233/ISU-2009-0595https://www.datacite.orghttps://doi.org/10.25490/a97f-egyk

  • Empacotamentodedados

    Pacotesdedadossãorecipientesparaadescriçãoepartilhadosficheirosdedadosacompanhantes,egeralmenteincluemumficheirodemetadadosdescrevendoascaracterísticasecontextodeumconjuntodedados.Istopodeincluiraspetoscomoinformaçãodacriação,proveniência,tamanho,formato,definiçõesdaárea,bemcomoquaisquerficheiroscontextuaisrelevantes,comoscriptsdecriaçãodedadosoudocumentaçãotextual.DoDataPackagingGuide:

    Osdadossãoeternos:osconjuntosdedadossobrevivemaoseupropósitooriginal.Limitaçõesdosdadospodemseróbviasnoseucontextooriginal,talcomoumcatálogodebiblioteca,maspodemnãoserevidentesquandoosdadossãoseparadosdaaplicaçãoemqueforamcriados.

    Osdadosnãosãosuficientesporsipróprios:Informaçãosobreocontextoeproveniênciadosdados--comoeporqueforamcriados,queobjetosdomundorealeconceitosrepresentam,asrestriçõesdevalores--énecessáriaparaajudarosconsumidoresainterpretá-losdeformaresponsável.

    Estruturarmetadadossobreconjuntosdedadosdeumafor,mapadronizadaelegívelpormáquinasencorajaapromoção,partilha,ereutilizaçãodosdados.

    Partilhardadossensíveisedadosproprietários

    Comumplanodegestãodedadosapropriadomuitosdadossensíveiseproprietáriospodemserpartilhados,reutilizados,etornadosFAIR.Osmetadadospodemquasesempreserpartilhados.Asorientaçõeseboaspráticasparapartilhadedadossensíveissãonecessariamenteespecíficosdecadaregiãodevidoadiferentesregulamentações(verporexemploUKDS’CompanionmaterialforManagingandSharingResearchDatahandbook).AInternationalAssociationforSocialScienceInformationServicesandTechnologytemumalistadeorientaçõesinternacionaisemgestãodedadosqueéumbompontodepartida.Existemváriasabordagenseiniciativasparaajudarosinvestigadoresaalcançaresteobjetivo.AferramentaDMPonlinedoDCCincluiváriosmodelosparaosfinanciadores.OCESSDAExpertTourGuideonDataManagementforneceinformaçãoeexemplospráticosdecomopartilhardadospessoaisesobrequestõesdedireitosdeautorebasesdedadosnospaíseseuropeus.OTourGuideofereceaindaumavisãogeraldoimpactodoRGPDqueharmonizaalegislaçãorelativaaosdadospessoaisnaEuropa(Maiode2018),eforneceumavisãoatualizadasobreadiversidadedeproteçãodedadosnaUE.

    Intermediáriosdedados

    Intermediáriosdedados(databrokers)sãoentidadesespecializadaseindependentesqueagemcomoadministradoresdedadosparadadossensíveis.Osinvestigadorespodemtransferirosseusdadossensíveiseajurisdiçãosobreoacessoaessesdadosparaointermediário.Istoéespecialmentecomumnosdadosaoníveldopacienteemestudosclínicos.Osintermediáriosfornecemumnívelde

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    19

    https://github.com/saverkamp/beyond-open-data/blob/master/DataGuide.mdhttps://www.ukdataservice.ac.uk/manage-data/handbookhttp://www.iassistdata.org/resources/data-management/best-practiceshttp://www.dcc.ac.uk/dmponlinehttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Ethics-and-data-protectionhttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Processing-personal-data/Diversity-in-data-protectionhttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Processing-personal-data/Diversity-in-data-protection

  • independêncianaavaliaçãodequaispedidosdedadossãocientificamenteválidosenãoirãoviolaraprivacidadedosparticipantesnainvestigação.ExemplosdeintermediáriosdedadosincluemoProjetoYODA,ClinicalStudyDataRequest.com,NationalSleepResearchResourceeSupportingOpenAccessforResearchers(SOAR).

    Portaisdeanálise

    Portaisdeanálisessãoplataformasquepermitemanálisededadosaprovadasempermitiracessocompleto(visualizaçãooudownload)oucontrolarondeequemtemacesso.Algunsintermediáriosdedadostambémusamestesportaisdeanálise.Osportaisdeanálisecontrolamqueconjuntosdedadosadicionaispodemseragrupadoscomosdadossensíveis,bemcomoqueanálisespodemserexecutadasparaassegurarqueasinformaçõespessoaisnãosãoreveladasduranteareanálise.ExemplosdeportaisdeanálisevirtuaisincluemProjectDataSphere,Vivli,RAIRD,Corpuscle,eINESS.

    Osinvestigadoresdeciênciassociaiseoutrosinvestigadorescomdadossensíveisusamumportaldeanálisedelocalizaçãosingularqueapenaspermiteoacessodeformacontrolada.Osinvestigadoresaprovadospodemacederaosdadosinsitu,numasalasegura,parapropósitoscientíficos.Noentanto,osmetadadosquedescrevemosdadosdevemestardisponíveisabertamenteecumprirosprincípiosFAIR.

    Dadosanonimizadosesintéticos

    Muitosconjuntosdedadoscontendoinformaçãoprivadadosparticipantespodemserpartilhadosassimqueosconjuntosdedadosforemanonimizados(MétodoSafeHarbour)ouumespecialistativerdeterminadoqueoconjuntodedadosnãopermiteaidentificaçãoindividual(MétodoExpertDetermination).ConsulteoseuConselhodeÉticaemInvestigação/ConselhodeRevisãoInstitucionalparasabermaissobrecomoprocederdestaformacomosseusdados.TambémrecomendamosoCESSDAExpertTourGuideonDataManagement,queforneceinformaçãoeexemplospráticossobrecomopartilhardadospessoais.Noentanto,algunsconjuntosdedadosnãopodemseranonimizadosepartilhadosdeformasegura.Osinvestigadorespodemaindaassimmelhoraraaberturadainvestigaçãonestetipodedadosaocriarepartilhardadossintéticos.Osdadossintéticostêmumaestrutura,conteúdo,edistribuiçãosimilaresaosdadosreaisevisamatingira"validadeanalítica":aanáliseestatísticaobteráosmesmosresultadosparaosdadossintéticoscomoparaosdadosreais.ODepartamentodeCensosdosEstadosUnidos,porexemplo,usadadossintéticoseportaisdeanáliseemcombinaçãocomapermissãodereutilizaçãodedadosaltamentesensíveis.

    DataTags

    DataTagséumaestruturaquepermiteavaliaçõesassistidasporcomputadorderestriçõeslegais,contratuaisepolíticasqueregemasdecisõessobreapartilhadedados.OsistemaDataTagsperguntaaoutilizadorumasériedequestõesparaextrairaspropriedadesprincipaisdeumdadoconjuntodedadoseaplicaregrasinferidasparadeterminarqueleis,contratos,eboaspráticassãoaplicáveis.OresultadoéumconjuntodeDataTagsrecomendadas,ouetiquetassimpleseicónicasquerepresentamumapolíticadedadoslegívelporhumanoseacionávelpormáquinas,eumalicençaqueéfabricadaparaumconjuntodedadosespecífico.OsistemadeDataTagstemsidodesenhadoparaserintegradocomosoftwaresderepositóriosdedados,efuncionarátambémcomoferramentaindependente.DataTagsestáaserdesenvolvidonaUniversidadedeHarvard.NaEuropa,aDANSestáatrabalharemajustarDataTagsàlegislaçãoEuropeia/RegulamentoGeraldeProteçãodeDados(RGPD)(cf.DANSRGPDDataTags).

    Comofoireferidoanteriormente,oderradeiroobjetivodapartilhadedadosdasuainvestigaçãoétorná-losreutilizáveisaomáximo.Paraatingiresseobjetivo,antesdepartilharosdadosteráqueosgerirdeacordocomasboaspráticas.Istoinclui,entreoutrascoisas,documentaçãoeescolhadeformatosdeficheirosabertoselicenças.PodelermaissobreesteassuntonoCapítulo2.4:InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDadosbemcomonoCapítulo2.6:LicençasAbertaseFormatosdeFicheiros.

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    20

    http://yoda.yale.edu/https://www.clinicalstudydatarequest.com/https://sleepdata.org/https://dcri.org/our-approach/data-sharing/https://www.projectdatasphere.org/projectdatasphere/html/homehttp://vivli.org/http://raird.no/http://clarino.uib.no/korpuskel/pagehttp://clarino.uib.no/iness/pagehttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Ethics-and-data-protectionhttps://census.gov/content/dam/Census/programs-surveys/sipp/methodology/SSBdescribe_nontechnical.pdfhttps://datatags.org/https://www.eugdpr.org/https://zingtree.com/host.php?style=buttons&tree_id=442670046&persist_names=Restart&persist_node_ids=58#58

  • MateriaisAbertos

    Alémdapartilhadosdados,aaberturadainvestigaçãodependedapartilhademateriais.Osmateriaisqueosinvestigadoresusamsãoespecíficosparacadadisciplinaeporvezesexclusivosdeumlaboratório.Abaixoencontraráexemplosdemateriaisquepodepartilhar,apesardesempredeverconsultaroscolegasdasuaáreadeconhecimentosobrequerepositóriossãoutilizados.Quandotivermateriais,dados,epublicaçõesdomesmoprojetodeinvestigaçãopartilhadosemdiferentesrepositórios,assegure-sedefazerreferênciacruzadacomumaligaçãoeumidentificadorúnicoparaquepossamserfacilmentelocalizados.

    Reagentes

    Umreagenteéumasubstância,compostooumisturaquepodeseradicionadoaumsistemadeformaacriarumareaçãoquímicaououtra.OsreagentespodemserdepositadosemrepositórioscomoAddgene,TheBloomingtonDrosophilaStockCenter,eATCCparatorná-losfacilmenteacessíveisporoutrosinvestigadores.Atribua-lhesumalicençaparaquepossamserreutilizadosporoutrosinvestigadores.

    Protocolos

    Umprotocolodescreveumregistoformalouoficialdeobservaçõescientíficasexperimentaisnumformatoestruturado.Depositeprotocolosvirtuaisparacitação,adaptação,ereutilizaçãousandoProtocols.io.

    Notebooks,containers,software,ehardware

    Asanálisesreprodutíveissãofacilitadaspelousodeprogramaçãodocumentada,tecnologiadecontainers,evirtualização.Alémdepartilharoseucódigoeosseusdados,tambémpodepartilharosseusnotebooksJupyter,imagensDocker,ououtrosmateriaisdeanáliseoudependênciasdesoftware.Partilhenotebooksatravésdeserviçosabertoscomomybinderquepermitevisualizaçãopúblicaeexecuçãodetodoonotebookemrecursospartilhados.ContainersenotebookspodemserpartilhadoscomRockerouCodeOcean.SoftwareehardwareusadosnasuainvestigaçãodevemserpartilhadosseguindoasboaspráticasparadocumentaçãocomofoidefinidonoCapítulo2.3.OsprotocolosapenasparaleituradevemserdepositadosnoregistodasuaáreadoconhecimentostalcomoClinicalTrials.goveSocialScienceRegistry](https://www.socialscienceregistry.org/)ouemumregistogeralcomoOpenScienceFramework.Váriasrevistascientíficas,comoaTrials,aJMIRResearchProtocols,ouaBio-Protocol,irãopublicaroseuprotocolo.Asboaspráticasparaapublicaçãoemacessoabertodoseuprotocolosãoasmesmasqueparapublicaroseurelatórioemacessoaberto(verCapítulo2.5).

    Perguntas,obstáculos,eequívocoscomuns

    P:"Ésuficientedisponibilizarosmeusdadosemacessoaberto?"

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    21

    https://www.addgene.org/https://bdsc.indiana.edu/https://www.atcc.org/https://www.protocols.io/https://www.protocols.io/http://mybinder.orghttps://arxiv.org/abs/1710.03675https://codeocean.com/https://clinicaltrials.gov/https://osf.io/https://trialsjournal.biomedcentral.com/https://www.researchprotocols.org/https://bio-protocol.org/

  • R:"Não—aaberturaéumacondiçãonecessáriamasnãosuficienteparaareutilizaçãomáxima.Osdadosalémdeseremabertos,têmdeserFAIR."

    P:"Oquesignificam/implicamosprincípiosFAIRparadiferentespartesinteressadas/públicos?"

    R:"Esseéumexcelenteassuntoparadiscussão!"

    Obstáculo:OsInvestigadorespodemsentir-sehesitantesapartilharosseusdadosporquetêmmedoqueoutrososreutilizemantesqueelespossamextrairomáximousopossíveldosseusdados,ouqueoutrospossamnãoentendercompletamenteosdadoseosqueutilizemdeformaincorreta.

    (sugerido)R:Podepublicarosseusdadosetorná-losacessíveisatravésdemetadados,masatribua-lhesumperíododeembargoparaseassegurarquepublicao(s)seu(s)artigo(s)primeiro.

    P:"TornarosmeusdadosFAIRconstituitrabalhoextra?"

    R:"Nãonecessariamente!TornarosdadosFAIRnãoéresponsabilidadesódosinvestigadorescomoindivíduosmasdetodoogrupo.Amelhorformadeassegurar-sequeosseusdadossãoFAIRécriarumPlanodeGestãodeDadoseplaneartudodeantemão.Durantearecolhadosdadoseoprocessamentodosdadossigaosnormasdasuaáreadeconhecimentoeasmedidasrecomendadasporumrepositório.

    P:"Euqueropartilharosmeusdados.Quelicençadevoatribuir-lhes?"

    R:"Essaéumaboapergunta.Emprimeirolugarpense:queméoproprietáriodosdados?Umfinanciadordeinvestigaçãoouainstituiçãoparaquemtrabalha?Depois,pensenaautoridade.Aplicaralicençaadequadaaosseusdadosécrucialparaostornarreutilizáveis.Paramaisinformaçãosobrelicenças,veja6.LicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiros.

    P:"Eunãopossotornarosmeusdadosdisponíveisdiretamente—sãomuitograndesparapartilhardeformaconveniente/têmrestriçõesrelacionadascomquestõesdeprivacidade.Comodevoproceder?"

    R:"Deveconversarcomespecialistasemrepositóriosdasuaáreadoconhecimentosobrecomofornecerinstruçõessuficienteparatornarosseusdadoslocalizáveiseacessíveis."

    Resultadosdaaprendizagem

    1. Compreenderascaracterísticasdedadosabertos,emespecialosprincípiosFAIR.

    2. Ficarfamiliarizadocomalgunsargumentosafavorecontraosdadosabertos.

    3. SercapazdediferenciareabordardadossensíveisedadosFAIR;estasduascategoriasnãosãonecessariamenteincompatíveis.

    4. Sercapazdetransformarumconjuntodedadosdeformaaquefiquepreparadoparapartilhadeformaaberta(formatosnãoproprietários),cumpraospadrõesdosprincípiosFAIR,esejadesenhadosparaaacessibilidade,transparênciaereutilizaçãomaximizadaatravésdofornecimentodemetadadossuficientes.

    5. Saberadiferençaentredadosembrutoseprocessados(oulimpos),eaimportânciadasetiquetasdasversões.

    6. Conhecerformatosdeficheirosfrequentementeutilizadosepadrõesdacomunidadeparaamáximareutilização.

    7. Sercapazderedigirumplanodegestãodedados.

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    22

  • Leituraadicional

    Averkampetal.(2018).Datapackagingguide.github.com/saverkamp/beyond-open-data/blob/master/DataGuide.md.

    Barendetal.(2017).Cloudy,increasinglyFAIR;revisitingtheFAIRDataguidingprinciplesfortheEuropeanOpenScienceCloud.doi.org/10.3233/ISU-170824

    Braseetal.(2009).Approachforajointglobalregistrationagencyforresearchdata.doi.org/10.3233/ISU-2009-0595

    Candelaetal.(2015).Datajournals:Asurvey.doi.org/10.1002/asi.23358

    CESSDATrainingWorkingGroup(2017-2018a).CESSDADataManagementExpertGuide.Bergen,Norway:CESSDAERIC.cessda.eu/DMGuide

    CESSDATrainingWorkingGroup(2017-2018b).CESSDADataManagementExpertGuide:Citingyourdata.Bergen,Norway:CESSDAERIC.cessda.eu/DMGuide/citingdata

    FAIRsharing.org(2016).FAIR.TheFAIRPrinciples.doi.org/10.25504/FAIRsharing.WWI10U

    Force11(n.y.).GuidingprinciplesforFindable,Accessible,Interoperable,andRe-usabledatapublishingVersionB1.0.force11.org/fairprinciples

    Gorgolewskietal.(2013).Makingdatasharingcount:apublication-basedsolution.doi.org/10.3389/fnins.2013.00009

    KratzandStrasser(2015).MakingDataCount.doi.org/10.1038/sdata.2015.39

    PiwowarandVision(2013).Datareuseandtheopendatacitationadvantage.doi.org/10.7717/peerj.175

    Wilkinsonetal.(2016).TheFAIRGuidingPrinciplesforscientificdatamanagementandstewardship.doi.org/10.1038/sdata.2016.18

    Wilkinsonetal.(2918).AdesignframeworkandexemplarmetricsforFAIRness.doi.org/10.1038/sdata.2018.118

    Iniciativaseprojetos

    DANSGDPRDataTags.zingtree.com

    FAIRMetrics.fairmetrics.org

    GOFAIRInitiative.go-fair.org

    TheFAIRDataPrinciplesexplained.go-fair.org

    5★OPENDATA.5stardata.info

    2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos

    23

    https://github.com/saverkamp/beyond-open-data/blob/master/DataGuide.mdhttps://doi.org/10.3233/ISU-170824https://doi.org/10.3233/ISU-2009-0595https://doi.org/10.1002/asi.23358https://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Managementhttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/6.-Archive-Publish/Publishing-with-CESSDA-archives/Citing-your-datahttps://doi.org/10.25504/FAIRsharing.WWI10Uhttps://www.force11.org/fairprincipleshttps://doi.org/10.3389/fnins.2013.00009https://www.nature.com/articles/sdata201539https://doi.org/10.7717/peerj.175https://doi.org/10.1038/sdata.2016.18https://doi.org/10.1038/sdata.2018.118https://zingtree.com/host.php?style=buttons&tree_id=442670046&persist_names=Restart&persist_node_ids=58#58http://fairmetrics.org/https://www.go-fair.org/https://www.go-fair.org/fair-principles/http://5stardata.info/en/

  • 3.SoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto

    Oqueé?

    Osoftwareabertousadonainvestigaçãoousoftwaredecódigoabertousadonainvestigaçãorefere-seaousoedesenvolvimentodesoftwareparaanálise,simulação,visualização,etc.,ondeocódigofonteestádisponível.Adicionalmente,deacordocomaDefiniçãodeCódigoAberto,osoftwaredecódigoabertodeveserdistribuídonaformadecódigofontee/oudeformacompilada(comocódigoabertodisponívelnosegundocaso),edeveráserpartilhadosobumalicençaquepermitemodificação,derivações,eredistribuição.

    Fundamentação

    Ainvestigaçãoatualdependedesoftwareeotrabalhorealizadoapartirdessabase-ouasuareprodução-necessitadoacessoàtotalidadedocódigofontepordetrásdessesoftware(Barnes,2010;Morinetal.,2012;Inceetal.,2012;Prinsetal.2015;Lowndesetal.,2018).ComorefereBuckheiteDonoho,parafraseandoJonClaerbout,‘‘Anarticleaboutacomputationalresultisadvertising,notscholarship.Theactualscholarshipisthefullsoftwareenvironment,codeanddata,thatproducedtheresult’’(Buckheit&Donoho,1995).Oacessoabertoaocódigofontenosoftwareusadonainvestigaçãotambémajudaamelhoraroimpactodessainvestigação(Vandewalle,2012).

    Apartilhadosoftwareusadonainvestigação(quersejadenaturezacomputacionalouquedependadeumaanálise/interpretaçãoproduzidaporumsoftware)éumacondiçãonecessária,emboranãosuficiente,paraareprodutibilidade.Istoédevidoàambiguidadeinevitávelquesurgequandotentamosdescreverdetalhadamenteumsoftwareatravésdelinguagemnatural,porexemplo,numartigo(Inceetal.,2012).Alémdisso,muitosprogramasdesoftware(senãomesmotodos)podemconteralgunserrosnãodetetadosinicialmente(Soergel,2015),peloquemesmoumadescrição“perfeita”dosoftwarenãopermitiriadarcontadetodososresultados.

    Adicionalmenteàreprodutibilidade,apartilhalivredesoftwarepermiteaosprogramadoresseremreconhecidospelosseusesforçosaolongodasuacarreira,queratravésdecitaçõesdiretas(Smithetal.,2016)queratravésdapublicaçãodemeta-artigosdecódigoemrevistascomooJournalofOpenResearchSoftwareouJournalofOpenSourceSoftware(Smithetal.,2018).NeilChueHongmantémumalistaderevistasdeváriasáreasespecíficasquepublicamartigosdesoftware.

    Objetivosdeaprendizagem

    1. Conhecerascaracterísticasdosoftwareaberto;compreenderosargumentoséticos,legais,económicosedeimpactonainvestigação,afavorecontraosoftwareabertoecompreendermelhorosrequisitosdequalidadedocódigoaberto.

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    24

    https://opensource.org/osdhttp://openresearchsoftware.metajnl.comhttp://joss.theoj.orghttps://www.software.ac.uk/which-journals-should-i-publish-my-software

  • 2. Aprenderausarosoftwareabertojáexistenteeaatribuí-lo(citá-lo)apropriadamente.

    3. Aprenderausarferramentaseserviçoshabituaisparapartilharabertamenteoscódigosdeinvestigação.

    4. Sercapazdeescolheralicençaapropriadaparaoseusoftware,ecompreenderasdiferençasentrelicençaspermissivasenãopermissivas.

    Componentes-chave

    Conhecimento

    Hádiferentestiposdeplataformasquesuportamapartilhaabertaeacolaboraçãoemsoftware,investigaçãoououtros.Emprimeirolugar,podeusaraseguintelistadeverificaçãoparaavaliarograudeaberturadosoftwareusadonainvestigação:

    Osoftwareestádisponívelparaserdescarregadoeinstalado?

    Osoftwarepodeserfacilmenteinstaladoemdiferentesplataformas?

    Osoftwaretemcondiçõesparaasuautilização?

    Ocódigofonteestádisponívelparapoderserinspecionado?

    Ohistorialcompletodocódigofonteestádisponívelparaserinspecionadoatravésdeumaversãodisponívelpublicamente?

    Asdependênciasdosoftware(softwareehardware)estãodescritasapropriadamente?Estasdependênciaexigemapenasumesforçomínimorazoávelparaseremobtidaseusadas?

    EstasqualidadesestãorelacionadasesãoconstruídasapartirdaOpenSourceDefinition.

    OGitéumaferramentapopularquepermiteocontrolodeversões:gestãoerevisãodemudançasnumapeçadesoftwareemparticular.ServiçoscomooGitHub,GitLab,Bitbucket,eoutros,proporcionamuminterfaceparaaferramentabemcomoserviçosdearmazenamentoremotoquepodemserusadosparamanter,partilharecolaborarsoftwareusadoeminvestigação.Estaplataformaestábastantedivulgadae,apesardesernecessárioumprocessodeaprendizagem,jáprovousermuitovaliosaparaestabelecerumfluxodeinvestigaçãoreprodutível.

    TerosoftwaredeinvestigaçãonoGitHubésóaprimeiraparte;éigualmenteimportanteterumidentificadoroficialepermanenteassociado,talcomoumDOI.HáváriasformasdeassociarumDOIaumrepositórioGitHub.AformamaisfáciléusaroZenodo(umrepositóriogratuito,abertoegenéricocriadopeloOpenAIREepeloCERN)pararealizaraatribuição,apesardeexistiremoutrosrepositóriosparaarquivarsoftwareeobterumDOI,talcomooFigshare.OZenodointegra-secomoGitHubdeformaaarquivarosoftwareeprovidenciarumDOIquandoosprogramadoreslançaremformalmenteumaversãonoGitHub.

    Qualquersoftwarepartilhadopublicamentenãoéverdadeiramentesoftwaredecódigoabertoanãoserquesejaacompanhadodeumalicençaadequada,umavezque,pordefeito,osdireitosdeautordosoftware(juntamentecomqualqueroutrotipodetrabalhocriativo)pertencemaosseuscriadores,oquesignificaquemaisninguémpodeusar,copiar,distribuiroumodificar(choosealicense.com).(Serealmentepretendepartilharoseucódigosemqualquertipoderestrições,podetorná-lodedomíniopúblico.)Emalternativa,deveráescolherumalicençaapropriadaparaoseusoftwarebaseadonoquedesejarqueasoutraspessoasfaçamcomoseucódigo(ounoquedesejarimpedir);owebsitechoosealicense.orgéumrecursoútilparasaberasdiferençasentreasváriaslicenças,apesardenãoincluirtodasaslicençasdecódigoabertodisponíveisoumaispopulares.Quandoselecionarumalicença,coloqueotexto-editadoparaincluironomedo(s)autor(es)eoano-norepositóriodesoftwarecomoficheirodetextosimplesintituladoLICENSE.

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    25

    https://opensource.org/osdhttps://guides.github.com/activities/citable-code/https://choosealicense.com/no-permission/https://choosealicense.com/licenses/#unlicensehttps://choosealicense.comhttps://opensource.org/licenses

  • Apesardeapartilhadesoftwareemqualquerformatosermelhorquenãoopartilhar,oseusoftwareterámaisimpactoeserámaisfacilmenteusadoporoutros–eatémesmoporsinofuturo!-seincluirdocumentação.Estadocumentaçãopodeincluircomentáriosúteisnocódigoqueexpliquemoporquêdeterfeitoalgo(emvezdeapenasoquefoifeito,queporsijáéevidente),umficheiroREADMEquedescrevaoqueosoftwarefazequedêinformaçãoútil(ex.:comoinstalar,comocitar,comoexecutar,dependênciasimportantes),tutoriais/exemplose/oudocumentaçãoAPI(quepoderáserautomaticamentegeradaatravésdecomentárioscorretamenteformatadosnocódigo).

    Asbarreirasmaiscomunsàreutilizaçãoereprodutibilidadesãoainexistênciaouinacessibilidadededependências,oudocumentaçãoinsuficientesobreoambientecomputacional.Umahipóteseparalidarcomestasbarreirasépartilharoseucódigojuntamentecomoambientecomputacionalusandoatecnologiadecontentores.Oscontentoresempacotamocódigocomasrespetivasdependênciaseambientecomputacional,deformaaqueoutrospossammaisfacilmenteexecutarasuaanálise.ORocker,Binder,eoCodeOceansãoexemplodeimplementaçãodecontentoresnainvestigação.

    Quandousarumsoftware–querotenhaescritoououtrapessoaotenhafeitoeotenhadisponibilizado–arespetivacitaçãoapropriadaéimportanteparaefeitosdereprodutibilidade(discutidonoCapítulo2.4;emresumo,aversãousadapoderámudarosseusresultadosouasuainterpretação)ecomoreconhecimentoaosprogramadoresdosoftware(Niemeyer2016,Smith2016).Adecisãodequandocitarosoftwareésuacomoinvestigador,masrecomendamosumacitaçãosemprequeosoftwaretenhacontribuídoparaosseusresultados,interpretaçãoouconclusões.AmelhorformadetornaroseucódigofacilmentecitáveléusaraintegraçãoGitHub-ZenododescritaanteriormenteeprovidenciaroDOIresultantenumsítioóbviotalcomooREADMEdosoftware,incluindotalvezumasugestãodeformatodereferenciação.Semprequereferenciarumsoftwaredeveráincluirnomínimoo(s)nome(s)do(s)autor(es),otítulodosoftware,onúmerodaversãoeoidentificador/localizadorúnico(Smith2016).SeusarsoftwaredeoutrapessoaeesteproporcionaumDOI,poderáfacilmenteusá-loparaidentificareapontarparaosoftware;seosautoresnãoarquivaramosoftware,entãodeveráincluiroURLdolocalondeosoftwarepodeserencontradoeonúmerodaversãoou,porexemplo,umregistodemudançasnoficheiro(commithash).

    Adicionalmente,háconceitosmaiscomplicadosqueincluemtestesautomáticoseintegraçãocontinuadesoftware,empacotamentodosoftwareemformatosbinários,egovernaçãoegestãodeprojetosdocódigoabertocomváriosparticipantes(ex.:códigosdeconduta,guiasparacontribuição).AlgunsdestestópicossãodescritosporScopatzandHuff(2015).Wilsonetal.(2017)tambémprovidenciamumguiapráticodeboaspráticasdecomputaçãocientíficaqueincluiconselhosespecíficosparaodesenvolvimentodesoftwareusadoeminvestigação.

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    26

    https://arxiv.org/abs/1710.03675https://mybinder.readthedocs.io/en/latest/https://codeocean.com/

  • HardwaredeCódigoAberto

    Osprincípiosdecódigoabertodescritosanteriormenteestendem-seaohardware.Osinvestigadoresusammuitasvezesinstrumentosouhardwareproprietáriosnasuainvestigaçãoequenãosãogratuitamenteacessíveis,reutilizáveisouadaptáveis.Ohardwarecientíficoincluitudodesdeferramentasdesequenciamentoemicroscópiosatéequipamentoespecialpararealizaçãodetesteseaceleradoresdepartículas.AcomunidadeHardwaredeCiênciaAberta(OScHeminglês),porexemplo,estáaincentivarparaqueomovimentodecódigoabertoincluainstrumentoscientíficos,hardwareeinfraestruturasdeinvestigaçãoatravésdoseuGlobalOpenScienceHardwareRoadmap.

    Competências

    CriarumrepositórionoGitHubepermitiraintegraçãocomoZenodo.UseosoftwareMintcomoferramentaanalíticaparaaprimeiraversãodosoftware.

    Escolherumalicençadesoftwareusando,porexemplo,choosealicenseouOpenSourceInitiative.

    Criardocumentaçãoparaumpacotedesoftware,incluindoumficheiroREADME,comentárioseexemplos..

    Referenciarapropriadamenteosoftwareusadonumartigo.

    Questões,obstáculoseequívocoscomuns

    Q:“Nãopossopartilharomeusoftware–estámuitoconfuso/nãotemumaboadocumentação/nãodeixeibonscomentários!”

    R:Oscriadoresdesoftwareusadoeminvestigaçãoportodoomundoidentificam-secomestesentimento–aspessoasraramentesentemqueoseucódigoestá“pronto”paraserpartilhadopublicamenteouqueestá“terminado”.Contudo,comorefereBarnes(2010),“ifyourcodeisgoodenoughtodothejob,thenitisgoodenoughtorelease—andreleasingitwillhelpyourresearchandyourfield.”Poroutraspalavras,sesesentesuficientementeconfortávelcomoseusoftwareparapublicarumestudoouumrelatóriocomosresultados,entãoo

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    27

    http://openhardware.science/global-open-science-hardware-roadmap/https://choosealicense.comhttps://opensource.org/licenses

  • códigoestásuficientementedesenvolvidoparaserpartilhadocomosseuscolegas(poroutrolado,senãosesenteconfortávelem

    partilharoseucódigo,entãotalvezprecisedesermaisdesenvolvidooutestadoantesdeserusadonumapublicação).Adicionalmente,partilharoseucódigoirápermitirqueoutrosomelhoremeconstruamalgoapartirdele,permitindoumimpactoeinovaçãoaindamaior(ecitaçõesparasi!).

    Q:"Esealguémseapropriadocódigoqueeupartilheieusa-oparafinsnefastos,ouafirmaqueoescreveu?"

    A:Aseleçãodeumalicençaapropriadaparaoseusoftwareajudá-lo-áaproteger-sedequalquerusodessesoftwareporoutraspessoas;porexemplo,alicençacomumLicençaMITincluilimitaçõesderesponsabilidadeeestabelecequenãoseproporcionanenhumagarantia.Sealguémtentarreclamaraautoriadoseusoftwarequedisponibilizou,podeassinalarasmarcasdetempo(timestamps)noseurepositórioouversõesarquivadascomoprovadoseutrabalhoanterior.

    Q:Seeupartilharomeucódigonumrepositórioonlinesereiinundado(a)depedidosdeapoioaoutilizador.”

    R:Apesardeospotenciaisutilizadorespoderempedir-lheajuda,querporemailouviarepositórioonline,nãotemqualquerobrigaçãodeprovidenciarajudaseescolhernãoofazerousenãopuder.Umalicençaapropriadapodeatéproporcionar-lheproteçãolegalparaisso(ex.:cláusuladeexclusãodegarantiadaLicençaMIT).

    Equívococomum:colocarsimplesmenteocódigoonlinetorna-osoftwaredecódigoaberto.Defacto,anãoserquesejaacompanhadodeumalicençaquedêpermissãoparaqueoutrosousem,copiem,modifiqueme/oudistribuam,entãoo(s)criador(es)retem(êm)osdireitosdeautorexclusivos.Osoftwareprecisadeseracompanhadodeumalicençadecódigoabertoparaquesejaconsideradosoftwaredecódigoaberto.

    Resultadosdeaprendizagem

    1. Sercapazdepartilharsoftwareusandoalicençamaisapropriada(ouseja,querasferramentas,queralicença).

    2. Sercapazdecarregar,atribuirversõeseregistarumalinhadecódigoatravésdeumidentificadorpermanente.

    3. Sercapazdecitarsoftwareusadonumartigodeinvestigação.

    Leituraadicional

    Balasegarametal.(2017).Anopensourcepharmaroadmap.doi.org/10.1371/journal.pmed.1002276

    Drydenetal.(2017).UpontheShouldersofGiants:Open-SourceHardwareandSoftwareinAnalyticalChemistry.doi.org/10.1021/acs.analchem.7b00485

    Inceetal.(2012).Thecaseforopencomputerprograms.doi.org/10.1038/nature10836

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    28

    https://choosealicense.com/licenses/mit/https://choosealicense.com/licenses/mit/https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1002276https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.analchem.7b00485https://doi.org/10.1038/nature10836

  • IskoujinaandRoberts(2015).Knowledgesharinginopensourcesoftwarecommunities:motivationsandmanagement.PDF

    Jiménezetal.(2017).Foursimplerecommendationstoencouragebestpracticesinresearchsoftware.doi.org/10.12688/f1000research.11407.1

    Martinez-TorresandDiaz-Fernandez(2013).Currentissuesandresearchtrendsonopen-sourcesoftwarecommunitiesPDF

    Morinetal.(2012).ShiningLightintoBlackBoxes.PDF

    Oishietal.(2018).PerspectivesonReproducibilityandSustainabilityofOpen-SourceScientificSoftwarefromSevenYearsoftheDedalusProject.arXiv:1801.08200v1[astro-ph.IM]

    Scacchi(2010).TheFutureofResearchinFree/OpenSourceSoftwareDevelopment.PDF

    Sandveetal.(2013).Tensimplerulesforreproduciblecomputationalresearchdoi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285

    Shamiretal.(2013).Practicesinsourcecodesharinginastrophysics.arXiv:1304.6780v1[astro-ph.IM]

    Steinmacheretal.(2014).Asystematicliteraturereviewonthebarriersfacedbynewcomerstoopensourcesoftwareprojects.PDF

    Stodden(2010).TheScientificMethodinPractice:ReproducibilityintheComputationalSciences.PDF

    Vandewalle(2012).CodeSharingIsAssociatedwithResearchImpactinImageProcessing.PDF

    2.3-SoftwareAbertonaInvestigação

    29

    https://pdfs.semanticscholar.org/f2a2/c5129cf5656af7acc7ffaf84c9c9bafe72c5.pdfhttps://doi.org/10.12688/f1000research.11407.1https://idus.us.es/xmlui/bitstream/handle/11441/32245/Current%20issues%20and%20research%20trends.pdf?sequence=1https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4203337/pdf/nihms588981.pdfhttps://arxiv.org/abs/1801.08200http://www.ics.uci.edu/~wscacchi/Papers/New/FoSER-Scacchi-2010.pdfhttps://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285https://arxiv.org/abs/1304.6780http://igor.pro.br/publica/papers/IST_SysReview_PrePrint.pdfhttp://datascienceassn.org/sites/default/files/The%20Scientific%20Method%20in%20Practice%20-%20Reproducibility%20in%20the%20Computational%20Sciences.pdfhttps://infoscience.epfl.ch/record/206184/files/Vandewalle12.pdf

  • 4.Investigaçãoreprodutíveleanálisededados

    Oqueé?

    Reprodutibilidadesignificaqueosdadosdainvestigaçãoeocódigosãodisponibilizadosdeformaaqueoutrospossamatingirosmesmosresultadosquesãodeclaradosemresultadoscientíficos(comoaspublicações).Estreitamenterelacionadoestáoconceitodereplicabilidade,oatoderepetirumametodologiacientíficaparaatingirconclusõessemelhantes.Estesconceitossãoelementoschavedainvestigaçãoempírica.

    Melhorarareprodutibilidadelevaaummaiorrigorequalidadedosresultadoscientíficose,portanto,aumamaiorconfiançanaciência.Temhavidoumacrescentenecessidadeevontadedeexporosfluxosdetrabalhodeinvestigaçãodesdeoiníciodeumprojetoerecolhadedadosatéàinterpretaçãoerelatoderesultados.Essesdesenvolvimentosacarretamumconjuntodedesafios,incluindoacriaçãodefluxosdetrabalhodeinvestigaçãointegradosquepodemseradotadospeloscolaboradores,mantendoaltospadrõesdeintegridade.

    Oconceitodereprodutibilidadeédiretamenteaplicadoaométodocientífico,apedraangulardaCiência,eparticularmenteaos5passosseguintes:

    1. Formularahipótese

    2. Desenharoestudo

    3. Executaroestudoerecolherosdados

    4. Analisarosdados

    5. Relataroestudo

    Cadaumdestespassosdeveserrelatadodeformaclara,fornecendodocumentaçãoclaraeaberta,tornandooestudotransparenteereprodutível.

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    30

  • Fundamentação

    Fatoresdecarátergeraledominantepodemcontribuiraindamaisparaascausasdanão-reprodutibilidade,mastambémpodemimpulsionaraimplementaçãodemedidasespecíficasparalidarcomessascausas.Aculturaeoambienteemqueainvestigaçãotemlugarsãoimportantesfatoresdominantestop-down.Deumaperspetivabottom-up,aeducaçãoeformaçãopermanentedosinvestigadorespodeaumentaraconscientizaçãoedisseminarboaspráticas.

    Emboraacompreensãodetodososfatoresquecontribuemparaareprodutibilidadesejaimportante,tambémpodeserdifícildecomporessesfatoresemetapasquepossamserimediatamenteadotadasporumprogramadeinvestigaçãoexistenteemelhorarimediatamenteasuareprodutibilidade.Umdosprimeirospassosadaréavaliarasituaçãoatualeacompanharamelhoriaàmedidaquesãodadospassosparaaumentaraindamaisareprodutibilidade.Algunsdosproblemascomunscomareprodutibilidadedainvestigaçãosãomostradosnafiguraseguinte.

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    31

  • Fonte:Reproducibilityandreliabilityofbiomedicalresearch:improvingresearchpractice.

    Goodman,Fanelli,&Ioannidis(2016)notamquenaepidemiologia,biologiacomputacional,economiaetestesclínicos,areprodutibilidadeéfrequentementedefinidacomo:

    theabilityofaresearchertoduplicatetheresultsofapriorstudyusingthesamematerialsaswereusedbytheoriginalinvestigator.Thatis,asecondresearchermightusethesamerawdatatobuildthesameanalysisfilesandimplementthesamestatisticalanalysisinanattempttoyieldthesameresults.

    Istoédistintodereplicabilidade:

    whichreferstotheabilityofaresearchertoduplicatetheresultsofapriorstudyifthesameproceduresarefollowedbutnewdataarecollected.

    Umaformasimplesdepensarsobreistopodeserqueareprodutibilidadeéorientadaaosmétodos,enquantoareplicabilidadeéorientadaaosresultados.

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    32

    https://acmedsci.ac.uk/viewFile/56314e40aac61.pdf

  • Areprodutibilidadepodeseravaliadaadiferentesníveis:aoníveldeumprojetoindividual(ex.,umartigo,umaexperiência,ummétodoouumconjuntodedados),uminvestigadorindividual,umlaboratórioougrupodeinvestigação,umainstituição,oumesmoumaáreadeinvestigação.Critériosepontosdeavaliaçãoligeiramentediferentespodemaplicar-seaessesdiferentesníveis.Porexemplo,umainstituiçãodefendeaspráticasdereprodutibilidadeseinstituirpolíticasquerecompensemosinvestigadoresquerealizeminvestigaçãoreprodutível.Poroutrolado,umcampodeinvestigaçãopodeserconsideradocomotendoumnívelmaiselevadodereprodutibilidadesedesenvolverrecursosmantidospelacomunidadequepromovamepermitampráticasdepesquisareproduzíveis,comorepositóriosdedadosounormativasparapartilhadedados.

    Objectivosdeaprendizagem

    Existemtrêsobjetivosprincipaisquetêmqueabordadosaqui:

    1. Compreenderoimportanteimpactodecriarinvestigaçãoreprodutível.

    2. Compreenderaconfiguraçãogeraldainvestigaçãoreprodutível(incluindoodesenhodefluxosdetrabalho,gestãodedadoserelatóriodinâmico).

    3. Estarconscientedospassosindividuaisnoprocessodereprodutibilidade,bemcomoosrespetivosrecursosquepodemserutilizados.

    Componentes-chave

    Conhecimento

    Segue-seumalistaindicativadeideiasaretersobrereprodutibilidade:

    Oqueéa"crisedereprodutibilidade"easmeta-análisesdereprodutibilidade.

    Princípiosdereprodutibilidade,integridadeeéticanainvestigação.

    Quaissãoasopçõeseambientesdecomputaçãoquepermitemummeiocolaborativoereprodutível.

    Fatoresqueafetamareprodutibilidadedainvestigação.

    Documentaçãodeanálisededadosefluxosdetrabalhodeinvestigaçãoaberta.

    Ambientesdeanálisereprodutíveis(virtualização).

    AbordarosResearcherDegreesofFreedomWichertsetal.,2016.

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    33

    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpsyg.2016.01832/full

  • Competências

    Existemváriasdicaspráticasparaareprodutibilidadequedevemosteremcontaquandodefinimosascompetênciasespecíficasnecessáriasparaagarantir.AsboaspráticasemreprodutibilidadeutilizamaspráticasdaCiênciaAbertanogeral,masasuaintegraçãooferecebenefíciosaoinvestigadorindividual,querescolhapartilharasuainvestigaçãoounão.Arazãopelaqualintegrarasboaspráticasdareprodutibilidadebeneficiaoinvestigadorindividualéporqueestasmelhoramoplaneamento,aorganizaçãoeadocumentaçãodainvestigação.Embaixodescrevemosumexemplodeimplementaçãodereprodutibilidadenumfluxodetrabalhodeinvestigaçãocomreferênciasaestaspráticasnomanual.

    1.Planeieareprodutibilidadeantesdecomeçar

    Crieumplanodeestudoouprotocolo.

    Comeceadocumentarnoiníciodoestudoescrevendoumplanodeestudoouprotocoloqueincluaodesenhoemétodosdoestudoproposto.UseumguiaderelatóriodoEquatorNetworkseaplicável.Registeasalteraçõesaoplanodeestudoouprotocolousandoumversãodecontrolo(referênciaaControlodeVersões).Calculeoalcanceoutamanhodaamostranecessáriaerelateestecálculonoseuprotocolo,poisestudoscompoucoalcancesãopropensosàirreprodutibilidade.

    Escolhaferramentasemateriaisreprodutíveis

    EscolhaanticorposquefuncionemusandoummotordepesquisadeanticorposcomoCiteAb.EviteairreprodutibilidadeatravésdelinhascelularesmalidentificadasescolhendoasqueestãoautenticadaspelaInternationalCellLineAuthenticationCommittee.Semprequepossível,escolhaferramentasdesoftwareehardwarenasquaisretenhaapropriedadedasuainvestigaçãoequepermitamaexportaçãodasuainvestigaçãoparaforadaplataformaparasuareutilização-vejaSoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto.

    Estabeleçaumprojetoreprodutível

    Centralizeeorganizeagestãodoseuprojetousandoumplataformaonline,umrepositóriocentral,oupastaparatodososficheirosdainvestigação.PodeusaroGitHubcomolocalparaarmazenartodososficheirosdoprojetoougerirtudousandoumnotebookcomoBenchling,Labguru,ouSciNote.Dentrodoprojetocentralizado,sigaasboaspráticasseparandoosseusdadosdocódigoempastasdiferentes.Torneosseusdadosnãotratadoscomoapenasdeleituraemantenha-osseparadosdosdadosprocessados-vejaDadoseMateriaisdeInvestigacaoAbertos.

    Aogravarearquivarosseusficheirosdeinvestigação,useformatosenomesdeficheirosinformativosquepermitamareutilização.Osnomesdosficheirosdevemserlegíveisparamáquinasehumanos.(referênciaaGestãodeDados).Nasuaanáliseecódigodesoftwareusecaminhosrelativos.Eviteformatosdeficheirosproprietárioseuseformatosdeficheiroabertos-vejaLicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiros.

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    34

    http://www.equator-network.org/https://www.citeab.com/http://iclac.org/https://benchling.com/https://www.labguru.com/https://scinote.net/

  • 2.Mantenhaumregisto

    Registo

    Façaumpré-registodeinformaçãoimportantedodesenhoeanálisedoestudoparaaumentaratransparênciaecombateroviésdapublicaçãoderesultadosnegativos.FerramentasgratuitasquepodemajudarafazeroprimeiroregistoincluemAsPredicted,OpenScienceFramework,eRegisteredReports.EstudosclínicosdevemusarClinicaltrials.gov.

    Controlodeversões

    Registeasalteraçõesaosseusficheiros,especialmenteocódigodeanálise,usandoumcontrolodeversõesvejaSoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto.

    Documentação

    Documentetudooquefoifeito,manualmente,numficheiroREADME.Crieumdicionáriodedados(tambémconhecidocomolivrodecódigo)paradescreverinformaçãoimportantesobreosseusdados.Paraumaintroduçãosimples,use:KarlBroman’sDataOrganizationmoduleeconsulteDadoseMateriaisdeInvestigacaoAbertos.

    Programaçãodocumentada

    ConsidereusarJupyterNotebooks,KnitR,Sweave,ououtrasabordagensdeprogramaçãodocumentadaparaintegraroseucódigocomasuanarrativaedocumentação.

    3.Partilheelicencieasuainvestigação

    Dados

    Eviteficheirossuplementares,decidaporumlicençapermissivaaceitável,epartilheosseusdadosusandoumrepositório.SigaasboaspráticasdescritasnocapítuloDadoseMateriaisdeInvestigacaoAbertos.

    Materiais

    Partilheosseusmateriaisdeformaaquepossamserreutilizados.DepositeosreagentesemrepositórioscomoAddgene,TheBloomingtonDrosophilaStockCenter,eATCCparaostornarfacilmenteacessíveisaoutrosinvestigadores.Paramaisinformação,vejaasubsecçãoMateriaisAbertosdocapítuloDadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos.

    Software,notebooks,econtentores

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    35

    https://aspredicted.org/https://osf.io/https://cos.io/rr/https://clinicaltrials.gov/http://kbroman.org/dataorg/pages/dictionary.htmlhttp://jupyter.org/https://yihui.name/knitr/https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552056-Using-Sweave-and-knitrhttps://www.addgene.org/https://bdsc.indiana.edu/https://www.atcc.org/

  • Licencieoseucódigoparainformarcomoestepodeser(re)utilizado.Partilheosnotebookscomserviçoscomomybinderquepermitamavisualizaçãopúblicaeexecuçãodetodoonotebookemrecursospartilhados.PartilheoscontentoresounotebookscomserviçoscomoRockerouCodeOcean.SigaasboaspráticasdescritasemSoftwareabertousadoeminvestigaçãoeSoftwaredecódigoaberto.

    4.Reporteasuainvestigaçãodeformatransparente

    Reporteepubliqueosseusmétodoseintervençõesdeformaexplícitaetransparenteecompletaparapermitirsuareplicação.AsdirectrizesdeEquatorNetwork,ferramentascomoProtocols.io,ouprocessoscomoRegisteredReportspodemajudá-loareportardeformareprodutível.Lembre-sedepublicarosresultadosnasuaplataformapúblicaderegisto(talcomoClinicalTrials.govouSocialScienceRegistry)atéumanoapósterminaroseuestudosejaqualforanaturezaoudireçãodosseusresultados.

    Questões,obstáculos,eequívocoscomuns

    P:"Tudoestánoartigo,qualquerpessoapodereproduziristoapartirdali!"

    R:Esteéumdosequívocosmaiscomuns.Mesmoumadescriçãoextremamentedetalhadadosmétodosefluxosdetrabalhousadosparaatingiroresultadofinal,namaioriadoscasosnãoserásuficienteparaoreproduzir.Istopodedever-seaváriosaspetos,incluindoambientescomputacionaisdiferentes,versõesdesoftwarediferentes,viésimplícitosquenãoforamdefinidosdeformaclara,etc.

    P:"Nãotenhotempoparaaprendereestabelecerumfluxodetrabalhoreprodutível"

    R:Alémdeumnúmerosignificativodeserviçosonlinedisponíveislivrementequepodemsercombinadosefacilitaraconfiguraçãodeumfluxodetrabalho,gastartempoeesforçoaafazê-loaumentanãosóavalidadecientíficadosresultadosfinais,mastambémminimizaráotemponecessárioparaarepetiçãoouextensãoemestudosfuturos.

    P:"Terminologiasquedescrevamareprodutibilidadesãodesafiantes."

    R:VerBarba(2018)paraumadiscussãosobreterminologiadescrevendoreprodutibilidadeereplicabilidade.

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    36

    http://mybinder.orghttps://arxiv.org/abs/1710.03675https://codeocean.com/http://www.equator-network.org/https://www.protocols.io/https://cos.io/rr/https://www.socialscienceregistry.org/https://www.socialscienceregistry.org/

  • Resultadosdaaprendizagem

    1. Compreenderanecessidadedainvestigaçãoreprodutíveleosuaracionalidade.

    2. Sercapazdeestabelecerumfluxodetrabalhoreprodutívelnocontextodeumatarefaexemplo.

    3. Conhecerferramentasquepodemapoiarainvestigaçãoreprodutível.

    Leituraadicional

    Buttonetal.(2013).Powerfailure:whysmallsamplesizeunderminesthereliabilityofneuroscience.doi.org/10.1038/nrn3475

    KarlBroman(n.y.).DataOrganization.Choosegoodnamesforthings.kbroman.org

    2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados

    37

    https://doi.org/10.1038/nrn3475http://kbroman.org/dataorg/pages/names.html

  • 5.AcessoAbertoaPublicações

    Oqueé?

    OAcessoAbertosignificaquepublicaçõesresultantesdeinvestigaçãocomoartigoselivrospodemseracedidosemlinha,isentosdepagamentoporqualquerutilizador,semobstáculostécnicos(comooregistoobrigatórioouaidentificaçãoemplataformasespecíficas).Nomínimo,essaspublicaçõespodemserlidasemlinha,descarregadaseimpressas.Idealmente,devemserconcedidosdireitosadicionais,comoodireitoacopiar,distribuir,pesquisar,referenciar,rastreareextrairtextoedados.OAcessoAbertopodeserconcretizadoatravésdeduasviasprincipaisnãoexclusivas:

    AcessoAbertoVerde(autoarquivo):Aversãopublicadaouomanuscritofinalrevistoporpares,quefoiaceiteparapublicação,édisponibilizadodeformalivreeabertapeloautor,ouporumseurepresentante,numrepositório.AlgunseditoresexigemqueoAcessoAbertosósejapermitidoapósumperíododeembargo.Esteperíododeembargopodedurarentreváriosmeseseváriosanos.Parapublicaçõesqueforamdepositadasnumrepositório,masqueestãosobembargo,normalmentepelomenososmetadadosestãoacessíveisdemodoaberto.

    AcessoAbertoDourado(publicaçãoemAcessoAberto):OtrabalhopublicadoédisponibilizadoemAcessoAbertopeloeditorlogoquepublicado.Omodelodenegóciomaiscomumébaseadonopagamentofeitopelosautores(designadoAPCs-taxadeprocessamentodoartigo,ouBPCs-taxadeprocessamentodolivro).QuandoosconteúdosdoAcessoAbertosecombinamcomconteúdosquerequeremassinaturaouaquisição,particularmentenocasoderevistas,atasdeconferênciasouvolumeseditados,designa-seporAcessoAbertohíbrido.

    Fundamentação

    Umadasformasmaiscomunsdedivulgarosresultadosdeinvestigaçãoéescreverumtextoepublicá-lonumarevista,ematasdeconferênciasounumlivro.Durantemuitosanosestaspublicaçõesforamdisponibilizadasaopúblicomediantepagamentoatravésdeumaassinaturaoudeformaindividual.Contudo,noiníciodoséculoXXIsurgiuumnovomovimentocomumobjetivoclaro:tornartodososresultadosdeinvestigaçãodisponíveisparaopúblicosemquaisquerrestrições.EstemovimentoadotouonomedeAcessoAbertoeestabeleceuduasestratégiasiniciaisparaaobtençãodoresultadopretendido.Aprimeiraestratégiafoiadefornecerferramentaseassistênciaaosacadémicosparaodepósitodosseusartigoscomrevisãoporparesemrepositórioseletrónicosabertos.Asegundafoidesenvolverumanovageraçãoderevistasqueusamosdireitosdeautoreoutrosinstrumentosparagarantiroacessoabertopermanenteatodososartigosquepublicam.Comoresultadodaprimeiraestratégiadeparamo-noscomaspráticasdeautoarquivo:osinvestigadoresdepositamedivulgamosseusartigosemrepositóriosinstitucionaisoutemáticos.Ecomoresultadodasegundaestratégiaobserva-seacriaçãoderevistasdeacessoabertoqueprovidenciamoacessogratuitoaosleitoreseautorizamareutilizaçãodamaioriadosseusconteúdosquasesemrestrições.

    ParaalémdestasduasestratégiasestabelecidasnaBudapestOpenAccessInitiativeem2002,assistiu-seaonascimentodenovosmétodosdedivulgação.Entreeles,encontra-seapublicaçãodepreprintsemrepositóriosinstitucionaiseemservidoresdepreprints.Ospreprintssãofrequentementeutilizadosnafísicaeemergemagoranasciênciasdavidaenoutroscampos.Ospreprintssãodocumentosquenãoforamrevistosporparesmasquesãoconsideradoscomoumapublicaçãocientíficacompletanumaetapainicial.Algunsservidoresdepreprintsincluemserviçosderevisãoporparesabertaetambémpossibilitamapublicaçãodenovasversõesdo

    2.5-AcessoAbertoaPublicações

    38

    http://www.budapestopenaccessinitiative.org/read

  • documentoinicialapósarevisãoporpares.Seguindoestatendênciadeinclusãodeprocessosderevisãoporparesabertanosservidoresdepreprints,assiste-seaodesenvolvimentodenovasplataformasdepublicação,suportadaspelosfinanciadores,comoaWellcomeTrustouaBillandMelindaGatesFoundation.TambémaComissãoEuropeiaplaneialançarumaplataformadepublicaçãoparaosprojetosfinanciadosdoHorizonte2020.

    Aescolhadeumarevistaoudeumaplataformadepublicaçãopodeafetaradisponibilidadeeaacessibilidadedosresultadosdeinvestigação.Existemváriasopçõesparaosinvestigadoresquandodecidemonde,quandoecomopublicarosseusresultados.Éfundamentalconhecertodasasimplicaçõesparaevitarproblemasfuturos.

    Oaparecimentodemuitosmodelosdenegócioemtornodasrevistasdeacessoabertoapresentaumconjuntodemalentendidosedeincertezasparaosinvestigadoresnomomentodedecidirondepublicar.Alémdisso,asrevistasdesubscriçãodisponibilizammodelosindividuaisdeacessoaberto,oschamadosmodeloshíbridos,queacarretammaiorcomplexidadeàdecisãodeondeecomopublicar.

    Quantoaoautoarquivo,osinvestigadoresficamconfusoscomosdiferentesrequisitosdefinidospeloseditoresnoqueserefereàversãodoartigoquepodemdepositarnumrepositórioequandoéqueestaversãopodeficardisponívelaopúblico.Esteatrasonapermissãodoacessopúblicoaotextocompletoéfrequentementedesignadoporperíododeembargoenãoéuniformeemtodasasrevistas.Asinstituiçõesquedisponibilizamumrepositórioaosseusinvestigadoresdevemfacilitaraspráticasdeautoarquivo,processandotodosestesrequisitosdepublicação.

    Objetivosdeaprendizagem

    1. Conhecerasdiferentesopçõesqueuminvestigadortemquandodecidepublicarumartigo,incluindorequisitosdefinanciamento.

    2. Estaraptoadecidirseumartigopodeserpublicadoantesdarevisão,porexemplonumservidordepreprints.Osformandosaprenderãoadeterminarqueopçõesestãodisponíveisdeacordocomaspolíticasdasuadisciplina/revistaesepoderãoexistirconsequênciasqueprejudiquemapublicaçãofinalnumarevistacomrevisãoporpares.

    3. Osformandosaprenderãoadistinguirasdiferençasentreaspolíticasderevisãoporparesdasrevistas,especialmentequandosesubmeteumdocumentojádisponívelnumaversãopreprint.Aprenderãoasdiferençasentreasrevistasdeacessoaberto,comoporexemplo,quaisasqueexigemumpagamentoparasubmissão/publicaçãoequelicençasutilizão.

    4. Osformandosaprenderãoacercadasimplicaçõesdepublicaremrevistasdesubscriçãoparaumfuturoautoarquivonumrepositório,bemcomoosrequisitosdoseditoresemtermosdeversãoeembargo.Aprenderãoigualmentesobreasrevistasdeacessoabertohíbrido.

    5. (optionaldependingonaudience)Osformandosaprenderãosobreasoportunidadesdoacessoabertoquandosepublicaemlivros,umavezqueestaéaviaprincipaldedivulgaçãoparaalgumasdisciplinas.

    6. Osformandosaprenderãosobreosdiferentesmodelosdenegóciousadospelasrevistasdeacessoabertoesobreasoportunidadesdeobtençãodefinanciamento,quandonecessário,paraapoioàpublicação.

    Componentes-chave

    2.5-AcessoAbertoaPublicações

    39

    https://wellcomeopenresearch.org/https://gatesopenresearch.org/https://ec.europa.eu/research/openscience/pdf/information_note_platform_public.pdf

  • Conhecimento

    Repositórioseautoarquivo

    Noiníciode2018maisde4.600repositóriosestavamdi