TranscriTranscriççãoão

ObjetivosObjetivos

RNA polimeraseRNA polimerase

Uma vez que o processo de transcrição é extremante conservado dentre todas as espécies estudadas, os padrões destas proteínas também são conservados. Isto quer dizer que existem muitas semelhanças em seqüência e estrutura nestas proteínas quando comparamos proteínas de diversas espécies. Na figura a seguir portanto é mostrada a semelhança em estrutura de enzimas procariota e eucariota.

Características da RNA polimerase

O sítio ativo da enzima é capaz de reconhecer especificamente os rNTPs (ribonucleotideos trifosfatados), não reconhecendo portanto os dNTPs (desoxinucleotideos trifosfatados presentes no DNA.Contudo similarmente a DNA polimerase a RNA polimerase também possui dois domínios de ligação a íons metálicos divalentes. Estes íons possuem a mesma função encontrada na DNA polimerase, ou seja, atacar o hidroxila 3’ livre do nucleotideo no final da cadeia, facilitando o ataque nucleofílico do radical hidroxila ao fosfato alfa do nulceotídeo entrante e assim formar a liagação fosfodiester.

Nucleotídeos trifosfato (rNTPs)

Radical hidroxila presente no carbono 2 do açúcar, no caso ribose

A transcrição pode ser dividida didaticamente em três fases1 – Inicio2 - Elongação3 – Término

No inicio de transcrição o fator sigma (σ) se liga a RNA polimerase. É o fator sigma que se liga à região promotora posicionando a enzima de forma correta para inicio de transcrição. Esta precisão é necessária porque não pode haver dúvida sobre qual fita deve ser transcrita. Na transcrição somente uma fita do DNA é transcrita. No esquema mostrado a fita a ser transcrita seria aquela esquematizada de vermelho.

Etapas da elongaEtapas da elongaççãoão

Atividade exonucleasica da RNA polimerase (correAtividade exonucleasica da RNA polimerase (correçção de bases ão de bases polimerizadas erradamente).polimerizadas erradamente).

Assim como a DNA polimerase a RNA polimerase também possui a capacidade de perceber mudanças conformacionais decorrentes da adição de nucleotídeos errados.A RNA polimerase possui um mecanismo de correção menos eficiente do que a DNA polimerase, em média a DNA polimerase incorpora um nucleotídeo errado a cada 10 milhões de bases (1x107) e a RNA polimerase incorpora um nucleotídeo errado a cada dez mil bases (1x104).Similarmente a DNA polimerase, a RNA polimerase abaixa bastante sua velocidade após perceber o nucleotídeo errado. A retirada do nucleotídeo errado pode ser feita de duas maneiras. A) pelo mecanismo de edição fosforolítica que implica na retirada do nucleotídeo errado pela atividade exonucleasica. Para isto a enzima volta uma base e cliva o nucleotídeo. B) Edição hidrolítica, neste mecanismo a RNA polimerase faz uma varredura de 1 ou mais nucleotídeos estimulada (em bactérias) pela proteína Fator GE que promove também a elongação.

OBS: note que as regiões repetidas invertidas irão se ligar por complementariedade quando forem transcritas

Região repetidainvertida

Região repetidainvertida